Генетические нарушения рака полости рта, ассоциированные с прогрессированием заболевания в молодом возрасте

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Плоскоклеточная карцинома полости рта (ПКПР) в молодом возрасте является агрессивным и быстропрогрессирующим заболеванием и не связана с такими традиционными факторами риска, как курение, употребление алкоголя или инфицирование вирусом папилломы человека (ВПЧ). Цель исследования – выявить генетические нарушения, связанные с прогрессированием ПКПР у молодых пациентов. В исследование вошли 25 молодых больных ПКПР, проживающих на территории РФ. Проведено полноэкзомное секвенирование образцов первичной опухоли и периферической крови с использованием набора для подготовки ДНК-библиотек SureSelect XT v8.0 на платформе Genolab M. Анализ однонуклеотидных вариантов (SNVs) и инсерций и делеций (indels) проводился с помощью пайплайна GATK; фильтрацию генетических вариантов в опухоли относительно таковых в периферической крови проводили с помощью пайплайна Mutect2; аннотацию мутаций проводили с помощью ANNOVAR. Статистическая обработка данных проводилась с использованием пакета компьютерной программы IBM SPSS Statistics 20. Для проверки мутаций, показавших статистически значимый результат в отношении безрецидивной, безметастатической и общей выживаемости, использовались данные Атласа генома рака (The Cancer Genome Atlas, N = 127). Выявлена прогностическая значимость соматических мутаций генов: TAF1L, CUL7, PRPS1L1 и CDKN2A – для безрецидивной выживаемости (p = 0.003, p = 0.003, p = 0.003 и p = 0.004 соответственно), PLEC и TEP1 – для безметастатической выживаемости (p < 0.001 и p = 0.007 соответственно) и ADGRL3, PREX1 и CDKN2A – для общей выживаемости (p = 0.023, p = 0.023 и p < 0.001 соответственно). Обнаружено, что все мутации в гене CDKN2A были со сдвигом рамки считывания или приводили к появлению стоп-кодона, был найден патогенный вариант rs121913387. Для гена CUL7 вариант rs369167170 был повторяющимся для пациентов с рецидивами, а для гена PLEC вариант в регионе 7:18027430 C>A был повторяющимся для пациентов с метастазами. Анализ данных Атласа генома рака подтвердил связь только мутаций гена CDKN2A с прогрессированием ПКПР в возрасте до 45 лет (N = 18, p = 0.049), но не у пациентов старшего возраста (N = 109). Выявлены генетические нарушения, связанные с прогрессированием ПКПР в молодом возрасте, которые требуют подтверждения своей значимости на большей выборке больных и оценки функциональной значимости.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Е. С. Колегова

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

А. А. Коробейникова

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

Р. С. Воробьев

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

И. К. Федорова

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

Д. Е. Кульбакин

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

Г. А. Кононова

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

Л. Д. Жуйкова

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

А. П. Поляков

Московский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. Герцена – филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 125284

А. В. Мордовский

Московский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. Герцена – филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 125284

И. В. Новикова

Московский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. Герцена – филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 125284

А. Д. Каприн

Московский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. Герцена – филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 125284

П. А. Шаталов

Московский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. Герцена – филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 125284

П. В. Шегай

Московский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. Герцена – филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 125284

Л. П. Яковлева

Московский клинический научно-практический центр им. А.С. Логинова Департамента здравоохранения города Москвы

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 111123

А. С. Вялов

Московский клинический научно-практический центр им. А.С. Логинова Департамента здравоохранения города Москвы

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 111123

В. Т. Циклаури

Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 115522

О. А. Саприна

Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 115522

М. А. Кропотов

Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 115522

Н. Г. Сучкова

Главный военный клинический госпиталь им. Н.Н. Бурденко Минобороны России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 105094

Н. С. Сукорцева

Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 119048

С. И. Самойлова

Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 119048

И. В. Решетов

Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Москва, 119048

Е. Л. Чойнзонов

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

Е. В. Денисов

Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук

Email: elenakolegova@oncology.tomsk.ru

Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»

Россия, Томск, 634009

Список литературы

  1. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I. et al. Global cancer statistics 2018: Globocan estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries // CA Cancer J. Clin. 2018. V. 68. № 6. P. 394–424. https://doi.org/10.3322/caac.21492
  2. Sarode G., Maniyar N., Sarode S.C. et al. Epidemiologic aspects of oral cancer // Dis. Mon. 2020. V. 66. № 12. https://doi.org/10.1016/j.disamonth.2020.100988
  3. Kolegova E.S., Patysheva M.R., Larionova I.V. et al. Early-onset oral cancer as a clinical entity: aetiology and pathogenesis // Int. J. Oral Maxillofac. Surg. 2022. V. 51. № 12. P. 1497–1509. https://doi.org/10.1016/j.ijom.2022.04.005
  4. Ryu H.J., Kim E.K., Cho B.C., Yoon S.O. Characterization of head and neck squamous cell carcinoma arising in young patients: Particular focus on molecular alteration and tumor immunity // Head Neck. 2019. V. 41. № 1. P. 198–207. https://doi.org/10.1002/hed.25507
  5. Campbell B.R., Sanders C.B., Netterville J.L. et al. Early onset oral tongue squamous cell carcinoma: Associated factors and patient outcomes // Head Neck. 2019. V. 41. № 6. P. 1952–1960. https://doi.org/10.1002/hed.25650
  6. Mohideen K., Krithika C., Jeddy N. et al. Meta-analysis on risk factors of squamous cell carcinoma of the tongue in young adults // J. Oral Maxillofac. Pathol. 2019. V. 23. № 3. P. 450–457. https://doi.org/10.4103/jomfp
  7. Braakhuis B.J., Rietbergen M.M., Buijze M. et al. TP53 mutation and human papilloma virus status of oral squamous cell carcinomas in young adult patients // Oral Dis. 2014. V. 20. № 6. P. 602–608. https://doi.org/10.1111/odi.12178
  8. Rushatamukayanunt P., Morita K., Matsukawa S. et al. Lack of association between high-risk human papilloma viruses and oral squamous cell carcinoma in young Japanese patients // Asian Pac. J. Cancer Prev. 2014. V. 15. № 10. P. 4135–4141. https://doi.org/10.7314/apjcp.2014.15.10.4135
  9. Weckx A., Riekert M., Grandoch A. et al. Time to recurrence and patient survival in recurrent oral squamous cell carcinoma // Oral Oncol. 2019. V. 94. P. 8–13. https://doi.org/10.1016/j.oraloncology.2019.05.002
  10. Safi A.F., Kauke M., Grandoch A. et al. Analysis of clinicopathological risk factors for locoregional recurrence of oral squamous cell carcinoma – retrospective analysis of 517 patients // J. Craniomaxillofac. Surg. 2017. V. 45. № 10. P. 1749–1753. https://doi.org/10.1016/j.jcms.2017.07.012
  11. Sorensen D.M., Lewark T.M., Haney J.L. et al. Absence of p53 mutations in squamous carcinomas of the tongue in nonsmoking and nondrinking patients younger than 40 years // Arch. Otolaryngol. Head Neck Surg. 1997. V. 123. № 5. P. 503–506. https://doi.org/10.1001/archotol.1997.01900050051006
  12. Pickering C.R., Zhang J., Neskey D.M. et al. Squamous cell carcinoma of the oral tongue in young non-smokers is genomically similar to tumors in older smokers // Clin. Cancer Res. 2014. V. 20. № 14. P. 3842–3848. https://doi.org/10.1158/1078-0432.ccr-14-0565
  13. Lindenbergh-van der Plas M., Brakenhoff R.H., Kuik D.J. et al. Prognostic significance of truncating TP53 mutations in head and neck squamous cell carcinoma // Clin. Cancer Res. 2011. V. 17. № 11. P. 3733–3741. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-11-0183
  14. Zhou C., Shen Z., Ye D. et al. The association and clinical significance of CDKN2A promoter methylation in head and neck squamous cell carcinoma: a meta-analysis // Cell Physiol. Biochem. 2018. V. 50. № 3. P. 868–882. https://doi.org/10.1159/000494473
  15. Vettore A.L., Ramnarayanan K., Poore G. et al. Mutational landscapes of tongue carcinoma reveal recurrent mutations in genes of therapeutic and prognostic relevance // Genome Med. 2015. V. 7. № 1. P. 98. https://doi.org/10.1186/s13073-015-0219-2
  16. Nakagaki T., Tamura M., Kobashi K. et al. Profiling cancer-related gene mutations in oral squamous cell carcinoma from Japanese patients by targeted amplicon sequencing // Oncotarget. 2017. V. 8. № 35. P. 59113–59122. https://doi.org/10.18632/oncotarget.19262
  17. Zhang L., Zeng M., Fu B.M. Inhibition of endothelial nitric oxide synthase decreases breast cancer cell MDA-MB-231 adhesion to intact microvessels under physiological flows // Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2016. V. 310. № 11. P. H1735–1747. https://doi.org/10.1152/ajpheart.00109.2016
  18. Chen W.S., Bindra R.S., Mo A. et al. CDKN2A copy number loss is an independent prognostic factor in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma // Front. Oncol. 2018. V. 8. P. 95. https://doi.org/10.3389/fonc.2018.00095
  19. Fan K., Dong Y., Li T., Li Y. Cuproptosis-associated CDKN2A is targeted by plicamycin to regulate the microenvironment in patients with head and neck squamous cell carcinoma // Front. Genet. 2022. V. 13. https://doi.org/10.3389/fgene.2022.1036408
  20. Pickering C.R., Zhang J., Neskey D.M. et al. Squamous cell carcinoma of the oral tongue in young non-smokers is genomically similar to tumors in older smokers // Clin. Cancer Res. 2014. V. 20. № 14. P. 3842–3848. https://doi.org/10.1158/1078-0432
  21. Paderno A., Morello R., Piazza C. Tongue carcinoma in young adults: A review of the literature // Acta Otorhinolaryngol. Ital. 2018. V. 38. № 3. P. 175–180. https://doi.org/10.14639/0392-100X-1932
  22. Kimura J., Nguyen S.T., Liu H. et al. A functional genome-wide RNAi screen identifies TAF1 as a regulator for apoptosis in response to genotoxic stress // Nucl. Acids Res. 2008. V. 36. № 16. P. 5250–5259. https://doi.org/10.1093/nar/gkn506
  23. Gao K., Gao Z., Xia M. et al. Role of plectin and its interacting molecules in cancer // Med. Oncol. 2023. V. 40. № 10. P. 280. https://doi.org/10.1007/s12032-023-02132-4
  24. Pan Z.Q. Cullin-RING E3 ubiquitin ligase 7 in growth control and cancer // Adv. Exp. Med. Biol. 2020. V. 1217. P. 285–296. https://doi.org/10.1007/978-981-15-1025-0_17
  25. Xu J., Zhang Z., Qian M. et al. Cullin-7 (CUL7) is overexpressed in glioma cells and promotes tumorigenesis via NF-κB activation // J. Exp. Clin. Cancer Res. 2020. V. 39. № 1. P. 59. https://doi.org/10.1186/s13046-020-01553-7
  26. Jin D.H., Kim S., Kim D.H., Park J. Two genetic variants in telomerase-associated protein 1 are associated with stomach cancer risk // J. Hum. Genet. 2016. V. 61. № 10. P. 885–889. https://doi.org/10.1038/jhg.2016.71
  27. Gu C., Li Q., Zhu Y. et al. Genetic variants in the TEP1 gene are associated with prostate cancer risk and recurrence // Prostate Cancer Prostatic Dis. 2015. V. 18. № 4. P. 310–316. https://doi.org/10.1038/pcan.2015.27
  28. Avila-Zozaya M., Rodríguez-Hernández B., Monterrubio-Ledezma F. et al. Thwarting of lphn3 functions in cell motility and signaling by cancer-related GAIN domain somatic mutations // Cells. 2022. V. 11. № 12. https://doi.org/10.3390/cells11121913
  29. Zhang H., Okuyama H., Jain A. et al. PREX1 improves homeostatic proliferation to maintain a naive CD4+ T cell compartment in older age // JCI Insight. 2024. V. 9. № 5. https://doi.org/10.1172/jci.insight.172848
  30. Wan S.C., Wu H., Li H. et al. Overexpression of PREX1 in oral squamous cell carcinoma indicates poor prognosis // J. Mol. Histol. 2020. V. 51. № 5. P. 531–540. https://doi.org/10.1007/s10735-020-09901-9

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Дизайн исследования.

Скачать (457KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Показатели однолетней безрецидивной выживаемости молодых больных ПКПР в зависимости от мутаций в генах TAF1L, CUL7, PRPS1L1 и CDKN2A.

Скачать (391KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Показатели однолетней безметастатической выживаемости молодых больных ПКПР в зависимости от мутаций в генах PLEC и TEP1.

Скачать (211KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Показатели однолетней общей выживаемости молодых больных ПКПР в зависимости от мутаций в генах ADGRL3, PREX1 и CDKN2A.

Скачать (441KB)
Метаданные
6. Приложение
Скачать (13KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».