Молекулярное маркирование в селекции капусты белокочанной (Brassica oleracea L.) на устойчивость к фузариозному увяданию

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В настоящей статье приведены результаты исследований по определению информативных ДНК-маркерных систем, обеспечивающих надежный контроль наличия гена устойчивости к фузариозу Foc1 в селекционном материале капусты белокочанной. На начальном этапе работ 14 молекулярных маркеров, взятых из базы данных VegMarks и литературных источников, были апробированы на контрастных по резистентности к фузариозу изогенных линиях капусты белокочанной (устойчивая линия ДТ-46 и восприимчивая линия Кб1П). Установлено, что InDel-маркер M10 и SSR-маркеры Frg13 и Ol10-D01 выявляют полиморфизм между контрастными образцами капусты белокочанной. Также проведен ПЦР-анализ на растениях сегрегирующей F2 популяции гибридной комбинации ДТ-46 × Кб1П с помощью данных маркеров и выполнено фитопатологическое тестирование. В результате проведения статистического анализа расщепления обнаружено, что только SSR-маркер Ol10-D01 является сонаследуемым с признаком устойчивости к фузариозу, поскольку только по этому локусу наблюдается ожидаемая сегрегация растений F2 по генотипу 1 : 2 : 1 согласно закону Менделя. Установлено, что наименьшая частота рекомбинации – между геном устойчивости Foc1 и маркером O110-D01 (1.6%).

Об авторах

Е. В. Дубина

Федеральный научный центр риса; Кубанский государственный аграрный университет им. И.Т. Трубилина

Автор, ответственный за переписку.
Email: lenakrug1@rambler.ru
Россия, 350921, Краснодар, пос. Белозерный; Россия, 350044, Краснодар

Ю. А. Макуха

Федеральный научный центр риса

Email: lenakrug1@rambler.ru
Россия, 350921, Краснодар, пос. Белозерный

А. М. Артемьева

Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений
им. Н.И. Вавилова

Email: lenakrug1@rambler.ru
Россия, 190031, Санкт-Петербург

Д. А. Фатеев

Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений
им. Н.И. Вавилова

Email: lenakrug1@rambler.ru
Россия, 190031, Санкт-Петербург

С. В. Гаркуша

Федеральный научный центр риса

Email: lenakrug1@rambler.ru
Россия, 350921, Краснодар, пос. Белозерный

О. Л. Горун

Федеральный научный центр риса

Email: lenakrug1@rambler.ru
Россия, 350921, Краснодар, пос. Белозерный

С. А. Лесняк

Федеральный научный центр риса

Email: lenakrug1@rambler.ru
Россия, 350921, Краснодар, пос. Белозерный

Список литературы

  1. Pu Z., Shimizu M., Zhang Y. et al. Genetic mapping of a fusarium wilt resistance gene in Brassica oleracea // Mol. Breed. 2012. № 30. P. 809–818. https://doi.org/10.1007/s11032-011-9665-8
  2. Bosland P.W., Williams P.H., Morrison R.H. Influence of soil temperature on the expression of yellows and wilt of crucifers by Fusarium oxysporum // Plant Dis. 1988. № 72. P. 777–780. https://doi.org/10.1094/PD-72-0777
  3. Farnham M.W., Keinath A.P., Smith J.P. Characterization of fusarium yellows resistance in collard // Plant Dis. 2001. № 85. P. 890–894. https://doi.org/10.1094/PDIS.2001.85.8.890
  4. Berrocal-Lobo M., Molina A. Arabidopsis defense response against Fusarium oxysporum // Trends Plant Sci. 2007. № 13. P. 145–150. https://doi.org/10.1016/j.tplants.2007.12.004
  5. Королева С.В., Дякунчак С.А., Ситников С.В. Иммунологическая оценка селекционного материала при создании гибридов F1 белокочанной капусты с групповой устойчивостью к фузариозу и сосудистому бактериозу (методические рекомендации). М.: 2012. 16 с.
  6. Arden S. Fusarium Yellows of Cabbage and Related Crops. N.Y.: Vegetable Crops, 1979. 730 p.
  7. Keinath A.P., Farnham M.W., Smith P. Reactions of 26 cultivars of Brassica oleracea to yellows in naturally infested soil // Biol. Cult. Tests. 1998. № 13. 155 p.
  8. Collard B.C.Y., Jahufer M.Z.Z., Brouwer J.B., Pang E.C.K. An introduction to markers, quantitative trait loci (QTL) mapping and marker-assisted selection for crop improvement: The basic concepts // Euphytica. 2005. № 142. P. 169–196. https://doi.org/10.1007/s10681-005-1681-5
  9. Vali U., Brandstrom M., Johansson M., Ellegren H. Insertion-deletion polymorphisms (indels) as genetic markers in natural populations // BMC Genetic. 2008. № 9. https://doi.org/10.1186/1471-2156-9-8
  10. Lv H. Fang Z., Yang L. et al. Research on screening of resistant resources to fusarium wilt and inheritance of the resistant gene in cabbage // Acta Horticult. Sinica. 2011. V. 5. № 38. P. 875–885. https://doi.org/10.16420/j.issn.0513-353x.2011.05.001
  11. Дубина Е.B. ДНК-технологии (молекулярное маркирование) в селекции риса и семеноводстве овощных культур: Дис. … д-ра биοл. наук. Краснодар: ВНИИ риса, 2019. 275 с.
  12. Фесенко И.А., Куклев М.Ю., Карлов Г.И. Создание ДНК-маркера устойчивости томата к фузариозному увяданию // Известия ТСХА. № 1. 2007. С. 66–72.
  13. Lv H., Yang L., Kang J. et al. Development of InDel markers linked to fusarium wilt resistance in cabbage // Mol. Breed. 2013. V. 32. P. 961–967. https://doi.org/10.1007/s11032-013-9925-x
  14. Murray M.G., Thompson W.F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA // Nucl. Ac. Res. 1980. V. 10. P. 4321–4325.
  15. Liu X., Han F., Kong C. Rapid introgression of the fusarium wilt resistance gene into an elitecabbage line through the combined application of a microspore culture, genome background analysis, and disease resistance-specific marker assisted foreground selection // Front. in Plant Sci. 2017. V. 8. Article 11. https://doi.org/10.3389/fpls.2017.00354
  16. Кутлунина Н.А., Ермошин А.А. Молекулярно-генетические методы в исследовании растений. Екатеринбург, 2017. 142 с.
  17. Батин Н.В. Компьютерный статистический анализ данных. Минск, 2008. 160 с.
  18. Нгуен М.Л., Монахос Г.Ф., Комахин Р.А., Монахос С.Г. Новый локус устойчивости к киле в хромосоме А05 капусты пекинской (Brassica rapa L.) // Генетика. 2018. Т. 54. № 3. С. 306–315.
  19. Аджиева В.Ф., Некрашевич Н.А., Малышев С.В. и др. Сравнительный анализ полиморфизма микросателлитных маркеров генотипов томата (Solanum lycopersicum L.) белорусской и зарубежной селекции // Мол. и прикладная генетика. 2010. Т. 11. С. 7–11.
  20. Ramirez-Villupadua J., Endo R.M., Bosland P., Wiliams P.H. A new race of Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans that attacks cabbage with type A resistance // Plant Dis. 1985. № 69. P. 612–613.

Дополнительные файлы


© Е.В. Дубина, Ю.А. Макуха, А.М. Артемьева, Д.А. Фатеев, С.В. Гаркуша, О.Л. Горун, С.А. Лесняк, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».