Preparation and Crystallization of Picornain 3C of Rhinovirus A28

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

Human rhinovirus picornain 3C is a high-value commercial cysteine protease, which is widely used to remove affinity tags and fusion proteins during the purification of the target proteins. A variant of rhinovirus A28 picornain 3C produced in this study is not annotated in the NCBI databases, shares 79% sequence identity in the PDB, and was not previously used in the protein engineering. A protocol was developed for the isolation and purification of the protein to use it in structural studies. The initial crystallization conditions were found. The determination and analysis of the structure of rhinovirus A28 picornain 3C will provide new possibilities for performing basic research on the evolution of proteolytic enzymes and for the design of the optimal variant of this protease.

作者简介

A. Tishin

State Research Center of Virology and Biotechnology “Vector,” Rospotrebnadzor, 630559, Koltsovo, Novosibirsk oblast, Russia

Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
Россия, Кольцово

A. Gladysheva

State Scientific Center of Virology and Biotechnology «Vector»

Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
ORCID iD: 0000-0002-7396-3954
SPIN 代码: 5214-3421
Scopus 作者 ID: 57194590629

Postgraduate student, Juniour Researcher, Department of Molecular Virology for Flaviviruses and Viral Hepatitis

俄罗斯联邦, 630559, Novosibirsk region, Koltsovo

L. Pyatavina

State Research Center of Virology and Biotechnology “Vector,” Rospotrebnadzor, 630559, Koltsovo, Novosibirsk oblast, Russia; Novosibirsk National Research State University, 630090, Novosibirsk, Russia

Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
Россия, Кольцово; Россия, Новосибирск

S. Olkin

State Research Center of Virology and Biotechnology “Vector,” Rospotrebnadzor, 630559, Koltsovo, Novosibirsk oblast, Russia

Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
Россия, Кольцово

A. Gladysheva

State Scientific Center of Virology and Biotechnology «Vector»; Novosibirsk National Research State University

Email: gladysheva_aa@vector.nsc.ru
ORCID iD: 0000-0002-9490-1939

Graduate student, Assistant, Department of Molecular Virology for Flaviviruses and Viral Hepatitis

俄罗斯联邦, 630559, Novosibirsk region, Koltsovo; 630090, Novosibirsk

I. Imatdionov

State Research Center of Virology and Biotechnology “Vector,” Rospotrebnadzor, 630559, Koltsovo, Novosibirsk oblast, Russia

Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
Россия, Кольцово

A. Vlaskina

National Research Centre “Kurchatov Institute”, 123098, Moscow, Russia

Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
Россия, Москва

A. Nikolaeva

National Research Centre “Kurchatov Institute”, 123098, Moscow, Russia

Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
Россия, Москва

V. Samygina

National Research Centre “Kurchatov Institute”, 123182, Moscow, Russia; Shubnikov Institute of Crystallography, Federal Scientific Research Centre “Crystallography and Photonics,” Russian Academy of Sciences, 119333, Moscow, Russia

Email: lera@crys.ras.ru
Россия, Москва; Россия, Москва

A. Agafonov

State Research Center of Virology and Biotechnology “Vector,” Rospotrebnadzor, 630559, Koltsovo, Novosibirsk oblast, Russia

编辑信件的主要联系方式.
Email: gladysheva_av@vector.nsc.ru
Россия, Кольцово

参考

  1. Bizot E., Bousquet A., Charpié M. et al. // Front. Pediatr. 2021. V. 22. P. 643219. https://doi.org/10.3389/fped.2021.643219
  2. Ljubin-Sternak S., Meštrović T. // Viruses. 2023. V. 15 (4). P. 825. https://doi.org/10.3390/v15040825
  3. Flather D., Nguyen J.H.C., Semler B.L., Gershon P.D. // PLoS Pathog. 2018. V. 14 (8). P. e1007277. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1007277
  4. Jensen L.M., Walker E.J., Jans D.A., Ghildyal R. // Methods Mol. Biol. 2015. V. 1221. P. 129. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-1571-2_10
  5. Matthews D.A., Dragovich P.S., Webber S.E. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. V. 96 (20). P. 11000. https://doi.org/10.1073/pnas.96.20.11000
  6. Bjorndahl T.C., Andrew L.C., Semenchenko V., Wishart D.S. // Biochemistry. 2007. V. 46 (45). P. 12945–58. https://doi.org/10.1021/bi7010866
  7. Cui S., Wang J., Fan T. et al. // J. Mol. Biol. 2011. V. 408 (3). P. 449. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2011.03.007
  8. Yuan S., Fan K., Chen Z. et al. // Virol. Sin. 2020. V. 35 (4). P. 445. https://doi.org/10.1007/s12250-020-00196-4
  9. Sun D., Chen S., Cheng A., Wang M. // Viruses. 2016. V. 8 (3) P. 82. https://doi.org/10.3390/v8030082
  10. Ullah R., Shah M.A., Tufail S. et al. // PLoS One. 2016. V. 11 (4) P. e0153436. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0153436
  11. Wanga Q.M., Chen S.H. // Curr. Protein Pept. Sci. 2007. V. 8 (1). P. 19. https://doi.org/10.2174/138920307779941523
  12. Jumper J., Evans R., Pritzel A. et al. // Nature. 2021. V. 596 (7873). P. 583. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2
  13. de Marco A. // Nat Protoc. 2006. V. 1 (3). P. 1538. https://doi.org/10.1038/nprot.2006.289
  14. Brunelle J.L., Green R. // Methods Enzymol. 2014. V. 541. P. 151. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-420119-4.00012-4
  15. Akaberi D., Båhlström A., Chinthakindi P.K. // Antiviral Res. 2021. V. 190. P. 105074. https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2021.105074
  16. Fan X., Li X., Zhou Y. et al. // ACS Chem Biol. 2020. V. 15 (1). P. 63. https://doi.org/10.1021/acschembio.9b00539
  17. Timofeev V., Samygina V. // Crystals. 2023. V. 13 P. 71. https://doi.org/10.3390/cryst13010071

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
2.

下载 (1MB)
3.

下载 (222KB)
4.

下载 (504KB)
5.

下载 (537KB)
6.

下载 (440KB)
7.

下载 (483KB)

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».