Members of the Uncultured Taxon OP1 (“Acetothermia”) Predominate in the Microbial Community of an Alkaline Hot Spring at East-Tuvinian Upland


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

The thermophilic microbial community of a hydrotherm at East-Tuvinian upland is described. High-throughput profiling of the 16S rRNA gene and sequencing of the complete metagenome were used to characterize the phylogenetic and metabolic diversity of the microbial community of the Dikij Arjaan alkaline thermal spring of Ush-Bel’dir mineral water deposit in Tyva, Russia. Members of the uncultured phylum “Acetothermia” (candidate division OP1) predominated in the microbial community of the spring. While this phylum has already been detected in many thermal ecosystems, it never formed the main component of their microbial communities. Apart from “Acetothermia”, members of Nitrospirae and Chloroflexi comprised a significant part of the microbial community. Comparative analysis of our geochemical data on the spring and the previously published data on in silico reconstruction of “Acetothermia” metabolism led us to the suggestion that carbonate and bicarbonate can serve as the major carbon sources for the dominant bacterial group and that “Acetothermia” act as the primary producers in this ecosystem. Analysis of the functional genes also revealed the presence of physiological groups of denitrifyers, iron reducers, carboxydotrophs and diazotrophs. This is the first report on a thermophilic microbial community of a hydrotherm from the southwestern extremity of the Baikal rift zone. Moreover, microbial communities with predominance of uncultured “Acetothermia” have not been reported previously in terrestrial hydrotherms.

Об авторах

A. Korzhenkov

Immanuel Kant Baltic Federal University

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Kaliningrad

A. Teplyuk

Immanuel Kant Baltic Federal University

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Kaliningrad

A. Lebedinsky

Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology, Russian Academy of Sciences

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Moscow

A. Khvashchevskaya

Tomsk Polytechnic University

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Tomsk

Yu. Kopylova

Tomsk Polytechnic University

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Tomsk

K. Arakchaa

Research Institute of Medico-Social Problems of Tyva Republic

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Kyzyl

P. Golyshin

Bangor University

Email: sngavrilov@gmail.com
Великобритания, Gwynedd

E. Lunev

Immanuel Kant Baltic Federal University

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Kaliningrad

O. Golyshina

Bangor University

Email: sngavrilov@gmail.com
Великобритания, Gwynedd

I. Kublanov

Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology, Russian Academy of Sciences

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Moscow

S. Toshchakov

Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology, Russian Academy of Sciences

Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Moscow

S. Gavrilov

Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology, Russian Academy of Sciences

Автор, ответственный за переписку.
Email: sngavrilov@gmail.com
Россия, Moscow

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Ltd., 2018

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».