Выявление грибов рода Malassezia в микропланктоне и на рыбах в северной бухте Севастополя (Россия)

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

В рамках данного исследования была оценена микобиота микропланктона и рыб в Северной бухте г. Севастополя с использованием метода ПЦР в реальном времени. Пробы микропланктона были собраны с помощью установки последовательной фильтрации Biber-2, образцы микробиоты получены с поверхности рыб (ставрида Trachurus mediterraneus и окунь Spicara smaris). ДНК выделяли методом щелочного лизиса в ходе высокотемпературного инкубирования и анализировали на наличие 13 видов возбудителей грибных инфекций родов Candida, Malassezia, Saccharomyces и Debaryomyces. Получен положительный результат для Malassezia spp. в планктонной фракции (150–300 мкм) и сигнал с поверхности ставриды. Остальные возбудители грибных инфекций, включая Candida albicans, Debaryomyces hansenii и Meyerozyma guilliermondii, не выявлены. Результаты подчеркивают роль микропланктона и рыб как потенциальных резервуаров грибных патогенов в морских экосистемах.

Об авторах

Н. М. Колбасов

Севастопольский государственный университет

Email: kiku200@yandex.ru
299053 Севастополь, Россия

Ю. К. Подкидышева

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н. И. Пирогова

117997 Москва, Россия

А. В. Шевырев

Компания “ДНК-Технология”

117246 Москва, Россия

А. В. Кузнецов

Севастопольский государственный университет; Институт биологии южных морей им. А. О. Ковалевского РАН

Email: kuznet61@gmail.com
299053 Севастополь, Россия; 299011 Севастополь, Россия

Список литературы

  1. Amend A. From dandruff to deep-sea vents: Malassezia-like fungi are ecologically hyper-diverse. PLOS Pathog. 2014. V. 10 (8). Art. e1004277. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1004277
  2. Amend A. S., Burgaud G., Cunliffe M. et al. Fungi in the marine environment: open questions and unsolved problems. mBio. 2019. V. 10 (2). Art. e01189–18. https://doi.org/10.1128/mBio.01189-18
  3. Begerow D., Bauer R., Boekhout T. Phylogenetic placements of ustilaginomycetous anamorphs as deduced from nuclear LSU rDNA sequences. Mycol. Res. 2000. V. 104 (1). P. 53–60. https://doi.org/10.1017/S0953756299001161
  4. Bond R., Morris D. O., Guillot J. et al. Biology, diagnosis and treatment of Malassezia dermatitis in dogs and cats clinical consensus guidelines of the world association for veterinary dermatology. Vet. Dermatol. 2020. V. 31 (1). 27-e4. https://doi.org/10.1111/vde.12809
  5. Breyer E., Stix C., Kilker S., et al. The contribution of pelagic fungi to ocean biomass. Cell. 2025. V. 188. Is. 15. P. 3992–4002. https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.05.004
  6. Breyer E., Zhao Z., Herndl G. J., et al. Global contribution of pelagic fungi to protein degradation in the ocean. Microbiome. 2022. V. 10 (1). Art. 143. https://doi.org/10.1186/s40168-022-01329-5
  7. Chang H. J., Miller H. L., Watkins N. et al. An epidemic of Malassezia pachydermatis in an intensive care nursery associated with colonization of health care workers’ pet dogs. N. Engl. J. Med. 1998. V. 338 (11). P. 706–711. https://doi.org/10.1056/NEJM199803123381102
  8. DeAngelis Y.M., Gemmer C. M., Kaczvinsky J. R. et al. Three etiologic facets of dandruff and seborrheic dermatitis: Malassezia fungi, sebaceous lipids, and individual sensitivity. J. Investig. Dermatol. Symp. Proc. 2005. V. 10 (3). P. 295–297. https://doi.org/10.1111/j.1087-0024.2005.10119.x
  9. Ferrari J., Goncalves P., Campbell A. H. et al. Molecular analysis of a fungal disease in the habitat-forming brown macroalga Phyllospora comosa (Fucales) along a latitudinal gradient. J. Phycol. 2021. V. 57 (5). P. 1504–1516. https://doi.org/10.1111/jpy.13180
  10. Gaitanis G., Magiatis P., Hantschke M. et al. The Malassezia genus in skin and systemic diseases. Clin. Microbiol. Rev. 2012. V. 25 (1). P. 106–141. https://doi.org/10.1128/CMR.00021-11
  11. Gao Z., Li B., Zheng C. et al. Molecular detection of fungal communities in the Hawaiian marine sponges Suberites zeteki and Mycale armata. Appl. Environ. Microbiol. 2008. V. 74 (19). P. 6091–6101. https://doi.org/10.1128/AEM.01315-08
  12. Garcia-Bustos V., Cabaсero-Navalon M.D., Ruiz-Gaitón A. et al. Climate change, animals, and Candida auris: insights into the ecological niche of a new species from a One Health approach. Clin. Microbiol. Infect. 2023. V. 29 (7). P. 858–862. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2023.03.016
  13. Gladfelter A. S., James T. Y., Amend A. S. Marine fungi. Curr. Biol. 2019. V. 29 (6). R191–R195. https://doi.org/10.1016/j.cub.2019.02.009
  14. Guého E., Midgley G., Guillot J. The genus Malassezia with description of four new species. Antonie van Leeuwenhoek. 1996. V. 69 (4). P. 337–355. https://doi.org/10.1007/BF00399623
  15. Harada K., Saito M., Sugita T. et al. Malassezia species and their associated skin diseases. J. Dermatol. 2015. V. 42 (3). P. 250–257. https://doi.org/10.1111/1346-8138.12700
  16. Hyde K. D., Noorabadi M. T., Thiyagaraja V. et al. The 2024 Outline of Fungi and fungus-like taxa. Mycosphere. 2024. V. 15 (1). P. 5146–6239. https://doi.org/10.5943/mycosphere/15/1/25
  17. Kopytina N. I. Microscopic fungi of the Black Sea basin: research directions and prospects. Morskoy biologicheskiy zhurnal. 2019. V. 4 (4). P. 15–33. (In Russ.). https://doi.org/10.21072/mbj.2019.04.4.02
  18. Kopytina N. I., Dudka I. A. Taxonomic diversity of mycobiota of coastal waters of Crimea (Black Sea). Morskoy biologicheskiy zhurnal. 2016. V. 1 (2). (In Russ.). P. 27–38. https://doi.org/10.21072/mbj.2016.01.2.03
  19. Kriss A. E., Rukina E. A., Biryuzova V. I. Microzonality in the distribution of heterotrophic microorganisms in the Black Sea. Mikrobiologiya. 1951. V. 20 (3). P. 256–260. (In Russ.).
  20. Lauritano C., Galasso C. Microbial interactions between marine microalgae and fungi: from chemical ecology to biotechnological possible applications. Mar. Drugs. 2023. V. 21 (5). Art. 310. https://doi.org/10.3390/md21050310
  21. Meyers S. P., Ahearn D. G., Roth F. J. Mycological investigations of the Black Sea. Bull. Mar. Sci. 1967. V. 17 (3). P. 576–596.
  22. Mohamad Lal M. T., Seng Lim L., Lau L. M. et al. Fungal infections and control strategies in cultured marine finfish: a minireview. J. Microorg. Control. 2024. V. 29 (4). P. 127–132. https://doi.org/10.4265/jmc.29.4_127
  23. Op De Beeck M., Lievens B., Busschaert P. et al. Comparison and validation of some ITS primer pairs useful for fungal metabarcoding studies. PLOS One. 2014. V. 9 (6). Art. e97629. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0097629
  24. Pedrosa A. F., Lisboa C., Goncalves Rodrigues A. Malassezia infections: a medical conundrum. J. Am. Acad. Dermatol. 2014. V. 71(1). P. 170–176. https://doi.org/10.1016/j.jaad.2013.12.022
  25. Richards T. A., Jones M. D., Leonard G. et al. Marine fungi: their ecology and molecular diversity. Ann. Rev. Mar. Sci. 2012. V. 4. P. 495–522. https://doi.org/10.1146/annurev-marine-120710-100802
  26. Saunders C. W., Scheynius A., Heitman J. Malassezia fungi are specialized to live on skin and associated with dandruff, eczema, and other skin diseases. PLOS Pathog. 2012. V. 8 (6). Art. e1002701. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1002701
  27. Sen K., Sen B., Wang G. Diversity, abundance, and ecological roles of planktonic fungi in marine environments. J. Fungi. 2022. V. 8 (5). Art. 491. https://doi.org/10.3390/jof8050491
  28. Steinbach R. M., El Baidouri F., Mitchison-Field L.M.Y. et al. Malassezia is widespread and has undescribed diversity in the marine environment. Fungal Ecol. 2023. V. 65. Art. 101273. https://doi.org/10.1016/j.funeco.2023.101273
  29. Theelen B., Cafarchia C., Gaitanis G. et al. Malassezia ecology, pathophysiology, and treatment. Med. Mycol. 2018. V. 56 (Suppl. 1). P. S10–S25. https://doi.org/10.1093/mmy/myx134
  30. Velegraki A., Cafarchia C., Gaitanis G. et al. Malassezia infections in humans and animals: pathophysiology, detection, and treatment. PLOS Pathog. 2015. V. 11 (1). Art. e1004523. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1004523
  31. Wu G., Zhao H., Li C. et al. Genus-wide comparative genomics of Malassezia delineates its phylogeny, physiology, and niche adaptation on human skin. PLOS Genet. 2015. V. 11 (11). Art. e1005614. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1005614
  32. Копытина Н. И. (Kopytina) Микроскопические грибы бассейна Черного моря: направления и перспективы исследований // Морской биологический журнал. 2019. Т. 4. № 4. 15–33.
  33. Копытина Н.И, Дудка И. А. (Kopytina, Dudka) Таксономическое разнообразие микобиоты прибрежных вод Крыма (Черное море) // Морской биологический журнал. 2016. Т. 1. № 2. С. 27–38.
  34. Крисс А. Е., Рукина Е. А., Бирюзова В. И. (Kriss et al.) Микрозональность в распределении гетеротрофных микроорганизмов в Черном море // Микробиология. 1951. Т. 20. № 3. С. 256–260.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».