Транскрипционный анализ гена предполагаемого миристоилированного мембранного белка (ORF458R) вируса радужной окраски беспозвоночных 6 (IIV6)

Вирус радужной окраски беспозвоночных 6 (IIV6) относится к роду Iridovirus в семействе Iridoviridae. Полностью секвенированный двухцепочечный ДНК-геном, состоящий из 212 482 п.н., кодирует 215 потенциальных открытых рамок считывания (ORF). Предполагают, что ORF 458R кодирует миристоилированный мембранный белок. Анализ экспрессии ORF458R в присутствии ингибиторов репликации ДНК и синтеза белка показал, что транскрипция этого гена начинается на поздней фазе вирусного инфекционного цикла. По результатам временнóго анализа транскрипция гена ORF458R инициируется в интервале 12‒24 ч после инфекции и затем ее интенсивность начинает снижаться. Транскрипция ORF458R инициируется на 53 нуклеотида выше сайта начала трансляции и заканчивается через 40 нуклеотидов после стоп-кодона. По результатам двойного люциферазного теста сделан вывод, что последовательность между ‒61 и +18 нуклеотидами необходима для активности промотора. Интересно заметное снижение активности промотора в присутствии последовательности, находящейся между ‒299 и ‒143 нуклеотидами, из чего можно предположить наличие репрессорной активности в этой области. Нами показано, что ORF458R ‒ транскрипционно активная и отдельно расположенная последовательность, в восходящей области которой локализованы регуляторные участки: промоторный и репрессорный. Надеемся, что полученная нами информация по структурной организации ORF458R позволит лучше понять молекулярные механизмы репликации IIV6.