Мицелиальные грибы донных отложений Черного моря

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Материал для исследования грибов донных отложений Черного моря собирали в рейсах НИС “Профессор Водяницкий” (2013, 2016, 2017 гг.) на 64 станциях в диапазоне глубин 18–2080 м. Грибы выделяли культуральным методом. Идентифицировано 42 вида терригенных грибов, наиболее представлены семейства Aspergillaceae и Pleosporaceae – 52.4% общего числа видов (17 и 5 видов соответственно). Зафиксирована низкая численность и частота встречаемости всех видов, наиболее часто отмечали Stachybotrys chartarum (29.7%). Из образцов на питательные среды выделяли 1–16 таксонов, численность варьировала в пределах 12–25363 (в среднем 2579 ± 4882) КОЕ/г сухого грунта. Выявлены видовой состав и структура микокомплексов отложений различных глубин и различного гранулометрического состава. Наибольшие показатели видового богатства и численности зарегистрированы на глубинах <100 м и в илистых осадках. Подтверждено сохранение жизнеспособности грибов в осадках сероводородной зоны. Не установлено влияние глубины залегания отложений, температуры и солености воды на структуру микокомплексов.

Об авторах

Н. И. Копытина

Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина Российской академии наук; ФИЦ Институт биологии южных морей им. А.О. Ковалевского Российской академии наук

Email: kopytina_n@mail.ru
пос. Борок, Некоузский р-н, Ярославская обл., Россия; Севастополь, Россия

Е. А. Бочарова

ФИЦ Институт биологии южных морей им. А.О. Ковалевского Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: kopytina_n@mail.ru
Севастополь, Россия

Список литературы

  1. Алексанов В.В. 2017. Методы изучения биологического разнообразия. Калуга: ГБУ ДО КО ”ОЭБЦ”.
  2. Артемчук Н.Я. 1981. Микофлора морей СССР. М.: Наука.
  3. Багрій-Шахматова Л.М. 1991. Нові для Чорного моря види облігатно морських вищих грибів // Укр. бот. журн. Т. 48. № 4. С. 59.
  4. Билай В.И., Коваль Э.З. 1988. Аспергиллы. Киев: Наук. думка.
  5. Бубнова Е.Н. 2014. Грибы прибрежной зоны Черного моря в районе Голубой бухты (восточное побережье, окрестности г. Геленджика) // Микол. и фитопатол. Т. 48. Вып. 1. С. 20.
  6. Бубнова Е.Н., Коновалова О.П. 2018. Разнообразие мицелиальных грибов в грунтах литорали и сублиторали Баренцева моря (окрестности поселка Дальние Зеленцы) // Микол. и фитопатол. Т. 52. № 5. С. 319. https://doi.org/10.1134/S0026364818050021
  7. Воронин Л.В. 1984. Микофлора рыб дельты реки Дунай // Микол. и фитопатол. Т. 18. Вып. 3. С. 265.
  8. Зайцев Ю.П., Поликарпов Г.Г., Егоров В.Н. и др. 2007. Средоточие останков оксибионтов и банк живых спор высших грибов и диатомовых в донных отложениях сероводородной батиали Черного моря // Доповіді Національної Академії наук України. № 7. С. 159.
  9. Зайцев Ю.П., Поликарпов Г.Г., Егоров В.Н. др. 2008. Биологическое разнообразие оксибионтов (в виде жизнеспособных спор) и анаэробов в донных осадках сероводородной батиали Черного моря // Доповіді Національної Академії наук України. № 5. С. 168.
  10. Зелезинская Л.М. 1980. О микроскопических грибах прибрежных биотопов Одесского залива и некоторых лиманов // Гидробиол. журн. Т. 16. № 1. С. 20.
  11. Копытина Н.И. 2005. Распространение грибов рода Chaetomium Kze: Fr (Ascomycota) в северо-западной части Черного моря // Микол. и фитопатол. Т. 39. Вып. 5. С. 12.
  12. Копытина Н.И. 2018. Водные микроскопические грибы Понто-Каспийского бассейна (чек-лист, синонимика). Воронеж: ООО “Ковчег”.
  13. Копытина Н.И. 2020. Микобиота пелагиали Одесского региона северо-западной части Черного моря // Вестник Томского государственного университета. Биология. № 52. С. 140. https://doi.org/10.17223/19988591/52/8
  14. Копытина Н.И., Андреева Н.А., Сизова О.С. и др. 2023. Комплексы грибов на пластинах, покрытых противообрастающей краской, модифицированной наночастицами // Биология внутр. вод. № 4. С. 464. https://doi.org/10.31857/S0320965223040137
  15. Копытина Н.И., Бочарова Е.А. 2023. Комплексы грибов на целлюлозосодержащих субстратах в прибрежных и глубоководных районах Черного моря // Тр. Ин-та биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН. Вып. 103(106). С. 28. https://doi.org/10.47021/0320-3557-2023-28-39
  16. Копытина Н.И., Бочарова Е.А., Гулина Л.В. 2024. Новые находки культивируемых микромицетов в глубоководных отложениях Черного моря // Тр. Ин-та биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН. Вып. 105(108). С. 45. https://doi.org/10.47021/0320-3557-2024-45-53
  17. Копытина Н.И., Зайцев Ю.П. 2011. Микологические исследования в сероводородной зоне Черного моря (обзор) // Экологическая безопасность прибрежной и шельфовой зон и комплексное использование ресурсов шельфа. Вып. 25. С. 286.
  18. Копытина Н.И., Сергеева Н.Г. 2023. Ассоциации грибов и нематод в Черном море // Тр. Ин-та биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН. Вып. 102(105). С. 36. https://doi.org/10.47021/0320-3557-2023-36-46
  19. Копытина Н.И., Родионова Н.Ю., Бочарова. Е.А. 2023. Влияние абиотических факторов на структуру комплексов грибов в пелагиали Черного и Азовского морей летом 2019 г. // Вестн. Томск. гос. ун-та. Биология. № 62. С. 109. https://doi.org/10.17223/19988591/62/6
  20. Крисс А.Е. 1959. Морская микробиология (глубоководная). М.: Изд-во АН СССР.
  21. Методы экспериментальной микологии. Справочник. 1982. Киев: Наук. думка.
  22. Мирзоева Н.Ю., Гулин С.Б., Сидоров И.Г. и др. 2018. Оценка скорости седиментации и осадконакопления в прибрежных и глубоководных акваториях Черного моря с использованием природных и антропогенных (Чернобыльских) радионуклидов // Система Черного моря. М.: Науч. мир. https://doi.org/10.29006/978-5-91522-473-4.2018.659
  23. Неврова Е.Л., Снигирева А.А., Петров А.Н., Ковалева Г.В. 2015. Руководство по изучению микрофитобентоса и его применению для контроля качества воды. Севастополь; Симферополь: Н. Орiанда.
  24. Пивкин М.В., Худякова Ю.В., Кузнецова Т.А. и др. 2005. Грибы аквапочв прибрежных акваторий Японского моря в южной части Приморского края // Микол. и фитопатол. Т. 39. Вып. 6. С. 50.
  25. Садогурский С.Е. 1999. Отмирание зарослей Zostera marina L. у Сары-Булатских островов (Каркинитский залив, Черное море) // Заповідна справа в Україні. Т. 5. Вип. 2. С. 17.
  26. Худякова Ю.В., Пивкин М.В., Кузнецова Т.А. и др. 2000. Грибы грунтов Японского моря (Российское побережье) и их биологически активные метаболиты // Микробиология. Т. 69. № 5. С. 722.
  27. Aleem A.A. 1975. Marine Fungi from Rumania // Rapp. Comm. int. Mer Medit. V. 23. № 2. P. 73.
  28. Âpas M. 1990. Observations sur le developpement du mycoplancton cotier de la Mer Noire lie au phenomene d'eutrophisation // Cercetӑri marine. IRCM. № 23. P. 73.
  29. Bubnova E.N., Grum-Grzhimaylo O.A., Kozlovsky V.V. 2020. Composition and structure of the community of mycelial fungi in the bottom sediments of the White Sea // Moscow university biological sciences bulletin. V. 75. № 3. P. 153. https://doi.org/10.3103/S0096392520030037
  30. Clarke K.R., Gorley R.N., Somerfield P.J., Warwickb R.M. 2014. Change In Marine Communities: An Approach to Statistical Analysis and Interpretation (3rd edition). PRIMER-E Ltd: Plymouth.
  31. Codreanu R., Codreanu-Balcescu D. 1981. On two Metschnikowia yeast species producing hemocoelic infections in Daphnia magna and Artemia salina (Crustacea, Phyllopoda) from Romania // J. Invertebrate Pathol. V. 37. Iss. 1. P. 22. https://doi.org/10.1016/0022-2011(81)90049-5
  32. Damare S., Raghukumar C., Raghukumar S. 2006. Fungi in deep-sea sediments of the Central Indian Basin // Deep Sea Research Part I. Oceanographic Research Papers. V. 53. № 1. P. 14. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2005.09.005
  33. De Hoog G.S., Guarro J., Gene J., Figueras M.J. 2000. Atlas of clinical fungi. Utrecht: CBS; Spain: Reus.
  34. Florio Furno M., Poli A., Ferrero D. et al. 2022. The culturable mycobiota of sediments and associated microplastics: from a harbor to a marine protected area, a comparative study // J. of fungi (Basel, Switzerland). V. 8. № 9. P. 927. https://doi.org/10.3390/jof8090927
  35. Jones E.B.G., Sakayaroj J., Suetrong S. et al. 2009. Classification of marine Ascomycota, anamorphic taxa and Basidiomycota // Fungal Diversity. V. 35. P. 1.
  36. Jones E.B.G., Suetrong S., Sakayaroj J. et al. 2015. Classification of marine Ascomycota, Basidiomycota, Blastocladiomycota and Chytridiomycota // Fungal Diversity. V. 73. PP. 1. https://doi: https://link.springer.com/article/10.1007/s13225-015-0339-4
  37. Khusnullina A.I., Bilanenko M.M., Kurakov A.V. 2018. Microscopic Fungi of White Sea Sediments // Contemp. Problems Ecol. V. 11. Р. 503. https://doi.org/10.1134/S1995425518050062
  38. Kirichuk N.N., Pivkin M.V., Polokhin O.V. 2012. Fungal assemblages of submarine soils of the Eastern Sakhalin Shelf // Rus. J. Mar. Biol. V. 38. № 5. P. 375. https://doi.org/10.1134/S1063074012050069
  39. Kohlmeyer J. 1977. New genera and species of higher fungi from the deep sea (1615–5315 m) // Rev. Mycol. V. 41. P. 189.
  40. Kohlmeyer J., Kohlmeyer E. 1979. Marine mycology: The higher fungi. New York: Academic.
  41. Dupont J., Magnin S., Rousseau F. et al. 2009. Molecular and ultrastructural characterization of two ascomycetes found on sunken wood off Vanuatu Islands in the deep Pacific Ocean // Mycol. Res. V. 113. P. 1351.
  42. Leonard D.R.P., Clarke K.R., Somerfield P.J., Warwick R.M. 2006. The application of an indicator based on taxonomic distinctness for UK marine biodiversity assessments // J. Environ. Manag. V. 78. P. 52.
  43. Meyers S.P., Ahearn D.G., Roth F.J. 1967. Mycological investigations of the Black Sea // Bulletin of Marine Science. V. 17. № 3. P. 576.
  44. Nagano Y., Nagahama T., Hatada Y., Nunoura T. 2010. Fungal diversity in deep-sea sediments – the presence of novel fungal groups // Fungal Ecol. V. 3(4). P. 316. https://doi.org/10.1016/j.funeco.2010.01.002
  45. Pachiadaki M.G., Rédou V., Beaudoin D.J. et al. 2016. Fungal and prokaryotic activities in the marine subsurface biosphere at Peru Margin and Canterbury Basin inferred from RNA-based analyses and microscopy // Frontiers in Microbiology. V. 7. P. 846. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00846
  46. Padmanaban V.P., Verma P., Gopal D. 2019. Phylogenetic identification and metabolic potential of bacteria isolated from deep sea sediments of Bay of Bengal and Andaman Sea // Indian J. Exp. Biol. V. 57. P. 561.
  47. Raghukumar C., Raghukumar S. 1998. Barotolerance of fungi isolated from deep-sea sediments of the Indian Ocean // Aquat. Microb. Ecol. V. 15. P. 153.
  48. Rédou V., Ciobanu M.C., Pachiadaki M.G. et al. 2014. In-depth analyses of deep subsurface sediments using 454-pyrosequencing reveals a reservoir of buried fungal communities at record-breaking depths // FEMS Microbiol. Ecol. V. 90. № 3. P. 908. https://doi.org/10.1111/1574-6941.12447
  49. Rédou V., Navarri M., Meslet-Cladière L. et al. 2015. Species richness and adaptation of marine fungi from deep-subseafloor sediments // Appl. and Environ. Microbiol. V. 81. P. 3571. https://doi.org/10.1128/AEM.04064-14
  50. Rojas-Jimenez K., Grossart H.-P., Cordes E. 2020. Fungal Communities in Sediments Along a Depth Gradient in the Eastern Tropical Pacific // Frontiers in Microbiology. V. 11. P. 575207. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.575207
  51. Sergeeva N.G., Kopytina N.I. 2014. The first marine filamentous fungi discovered in the bottom sediments of the Oxic/Anoxic Interface and in the Bathyal Zone of the Black Sea // Turkish J. Fish and Aquat. Sci. V. 14. № 1–2. Р. 497. https://doi.org/10.4194/1303-2712-v14_2_21
  52. Singh P., Raghukumar C., Meena R. et al. 2012. Fungal diversity in deep-sea sediments revealed by culture-dependent and culture-independent approaches // Fungal Ecol. V. 5. P. 543. https://doi.org/10.1016/j.funeco.2012.01.001
  53. Spatafora J.W., Volkmann-Kohlmeyer B., Kohlmeyer J. 1998. Independent terrestrial origins of the Halosphaeriales (marine Ascomycota) // Amer. J. Bot. V. 85. № 11. P. 1569.
  54. Visagie C.M., Houbraken J., Frisvad J.C. et al. 2014. Identification and nomenclature of the genus Penicillium // Stud. Mycol. V. 78. P. 343. https://doi.org/10.1016/j.simyco.2014.09.001
  55. Wang Z.P., Liu Z.Z., Wang Y.L. et al. 2019. Fungal community analysis in seawater of the Mariana Trench as estimated by Illumina HiSeq. RSC advances. V. 9(12). P. 6956. https://doi.org/10.1039/c8ra10142f
  56. Xu W., Gao Y., Gong L. et al. 2019. Fungal diversity in the deep-sea hadal sediments of the Yap Trench by cultivation and high throughput sequencing methods based on ITS rRNA gene // Deep Sea Res. Part I: Oceanographic Research Papers. V. 145. P. 125. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2019.02.001
  57. Zaitsev Y.P., Polikarpov G.G. 2008. Recently discovered new biospheric pelocontour function in the Black Sea reductive Bathyal Zone // J. the Black Sea/Mediterranean Environ. V. 14. Iss. 3. P. 151.
  58. Zhang X.Y., Zhang Y., Xu X.Y. et al. 2013. Diverse deep-sea fungi from the South China Sea and their antimicrobial activity // Current Microbiol. V. 67(5). P. 525. https://doi.org/10.1007/s00284-013-0394-6
  59. Zhou Y., Gao X., Shi C. et al. 2021. Diversity and antiaflatoxigenic activities of culturable filamentous fungi from deep-sea sediments of the South Atlantic Ocean // Mycobiol. V. 49. P. 151. https://doi.org/10.1080/12298093.2020.1871175

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».