Летучие мыши субтропической зоны Краснодарского края России как возможный резервуар зоонозных вирусных инфекций

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Новые и возвращающиеся инфекции представляют серьёзную угрозу для мирового здравоохранения. Появление вируса SARS-CoV-2 и вызванная им пандемия COVID-19 продемонстрировали важность изучения и контроля зоонозных вирусных агентов непосредственно в природных очагах. Для SARS-подобных коронавирусов, а также множества других возбудителей зоонозов, включая геморрагические лихорадки и бешенство, основным резервуаром являются подковоносые летучие мыши (ЛМ) (Rhinolophus spp.), широко распространённые в Евразии и Африке. Ареал их захватывает также южные регионы России, включая Северный Кавказ и Крым. Большие колонии этих животных располагаются на территории Сочинского национального парка (СНП; субтропическая зона Краснодарского края, район Большого Сочи, Северный Кавказ). Всего по данным многолетних наблюдений здесь насчитывается до 23 видов ЛМ, включая большого (Rh. ferrumequinum), малого (Rh. hipposideros) и южного (Rh. euryale) подковоносов.
В настоящем обзоре приведены сведения о зоонозных вирусах, которые ассоциированы с видами ЛМ, обитающих на территории субтропической зоны Краснодарского края Российской Федерации, и проведён анализ возможной роли представителей семейства рукокрылых (Chiroptera) как природного резервуара новых и возвращающихся инфекций. Изучение циркуляции зоонозных вирусов в популяциях ЛМ служит важным элементом мониторинга вирусных популяций в естественных очагах.

Об авторах

С. В. Леншин

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт медицинской приматологии» Министерства науки и высшего образования (Минобрнауки) России

Email: lenshin-s@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6815-2869

Леншин Сергей Викторович, научный сотрудник, лаборатории инфекционных вирусов

354376, Сочи

Россия

А. В. Ромашин

ФГБУ «Сочинский национальный парк» Министерства природных ресурсов и экологии (Минприроды) России

Email: romashin@sochi.com
ORCID iD: 0000-0003-4751-1484

Ромашин Алексей Владимирович, канд. биол. наук, ведущ. научн. сотр.

354002, Сочи

Россия

О. И. Вышемирский

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт медицинской приматологии» Министерства науки и высшего образования (Минобрнауки) России

Email: olegvyshem@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5345-8926

Вышемирский Олег Иванович, кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории инфекционной вирусологии

354376, Сочи

Россия

Д. К. Львов

ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: dk_lvov@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-8176-6582

Львов Дмитрий Константинович, Академик РАН, профессор, доктор медицинских наук, заведующий отделом экологии вирусов с научнопрактическим центром по экологии и эпидемиологии гриппа, Институт вирусологии им. Д. И. Ивановского

123098, Москва

Россия

С. В. Альховский

ФГБУ «Национальный центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: salkh@ya.ru

Альховский Сергей Владимирович, доктор биологических наук, руководитель лаборатории биотехнологии, Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского

123098, Москва

Россия

Список литературы

  1. Simmons N.B. Order Chiroptera. In: Wilson D.E., Reeder D.M., eds. Mammal Species World a Taxon and Geographic Reference. Baltimore: Johns Hopkins University Press; 2005: 312–529. https://doi.org/10.1093/acprof:osobl/9780199207114.003.0001.
  2. Racey P.A. The prolonged storage and survival of spermatozoa in Chiroptera. J. Reprod. Fertil. 1979; 56(1): 391–402. https://doi.org/10.1530/jrf.0.0560391.
  3. Cowled C., Stewart C.R., Likic V.A., Friedländer M.R., Tachedjian M., Jenkins K.A., et al. Characterization of novel microRNAs in the Black flying fox (Pteropus alecto) by deep sequencing. BMC Genomics. 2014; 15(1): 682. https://doi.org/10.1186/1471-2164-15-682.
  4. Banerjee A., Baker M.L., Kulcsar K., Misra V., Plowright R., Mossman K. Novel insights into immune systems of bats. Front. Immunol. 2020; 11: 26. https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.00026.
  5. Lagunas-Rangel F.A. Why do bats live so long? Possible molecular mechanisms. Biogerontology. 2020; 21(1): 1–11. https://doi.org/10.1007/s10522-019-09840-3.
  6. Крускоп С.В. Отряд Chiroptera. В кн.: Павлинов И.Я., Лисовский А.А., ред. Млекопитающие России: Систематико-географический справочник. Сборник трудов Зоологического музея МГУ. Выпуск 52. Москва: КМК; 2012: 73–126.
  7. Baloun D.E., Guglielmo C.G. Energetics of migratory bats during stopover: a test of the torpor-assisted migration hypothesis. J. Exp. Biol. 2019; 222: jeb196691. https://doi.org/10.1242/jeb.196691.
  8. Khan M.S., Hossain J., Gurley E.S., Nahar N., Sultana R., Luby S.P. Use of infrared camera to understand bats’ access to date palm sap: implications for preventing Nipah virus transmission. Ecohealth. 2010; 7(4): 517–25. https://doi.org/10.1007/s10393-010-0366-2.
  9. Calisher C.H., Childs J.E., Field H.E., Holmes K.V., Schountz T. Bats: Important reservoir hosts of emerging viruses. Clin. Microbiol. Rev. 2006; 19(3): 531–45. https://doi.org/10.1128/CMR.00017-06.
  10. Wang L., Cowled C. Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases. New York: John Wiley & Sons, Inc; 2015: 23–45. https://doi.org/10.1002/9781118818824.
  11. Ang B.S.P., Lim T.C.C., Wang L. Nipah Virus Infection. J. Clin. Microbiol. 2018; 56: e01875-17. https://doi.org/10.1128/jcm.01875-17.
  12. Selvey L., Sheridan J. Outbreak of severe respiratory disease in humans and horses due to a previously unrecognized paramyxovirus. J. Travel. Med. 1995; 2(4): 275. https://doi.org/10.1111/j.1708-8305.1995.tb00679.x.
  13. Hasan S., Ahmad S.A., Masood R., Saeed S. Ebola virus: A global public health menace: A narrative review. J. Family Med. Prim. Care. 2019; 8(7): 2189–201. https://doi.org/10.4103/jfmpc.jfmpc_297_19.
  14. Singh R.K., Dhama K., Chakraborty S., Tiwari R., Natesan S., Khandia R., et al. Nipah virus: epidemiology, pathology, immunobiology and advances in diagnosis, vaccine designing and control strategies – a comprehensive review. Vet. Q. 2019; 39(1): 26–55. https://doi.org/10.1080/01652176.2019.1580827.
  15. L’vov D.K., Tsyrkin Y.M., Karas F.R., Timopheev E.M., Gromashevski V.L., Veselovskaya O.V., et al. “Sokuluk” virus, a new group B arbovirus isolated from Vespertilio pipistrellus Schreber, 1775, bat in the Kirghiz S.S.R. Arch. Gesamte Virusforsch. 1973; 41(3): 170–4. https://doi.org/10.1007/bf01252762.
  16. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г., Щетинин А.М., Самохвалов Е.И., и др. Генетическая характеристика вируса Узун-Агач (UZAV – Uzun-Agach virus) (Bunyaviridae, Nairovirus), изолированного в Казахстане от остроухой ночницы Myotis blythii oxygnathus Monticelli, 1885 (Chiroptera; Vespertilionidae). Вопросы вирусологии. 2014; 59(5): 23–6.
  17. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Самохвалов Е.И., и др. Таксономия вируса Иссык-Куль (Issyk-Kul virus, ISKV; Bunyaviridae, Nairovirus), возбудителя Иссык-Кульской лихорадки, изолированного от летучих мышей (Vespertilionidae) и клещей Argas (Carios) vespertilionis (Latreille, 1796). Вопросы вирусологии. 2013; 58(5): 11–5.
  18. Kuz’min V., Botvinkin A.D., Poleschuk E.M., Orciari L.A., Rupprecht C.E. Bat rabies surveillance in the former Soviet Union. Dev. Biol. (Basel). 2006; 125: 273–82.
  19. Li W., Shi Z., Yu M., Ren W., Smith C., Epstein J. H. et al. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-like Coronaviruses. Science. 2005; 310(5748):676–79. doi: 10.1126/science.1118391.
  20. Drexler J.F., Corman V.M., Drosten C. Ecology, evolution and classification of bat coronaviruses in the aftermath of SARS. Antiviral Res. 2014; 101: 45–56. https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2013.10.013.
  21. Groot R.J., Baker S.C., Baric R., Enjuanes L., Gorbalenya A.E., Holmes K.V., et al. «Family Coronaviridae». In: King A.M., Adams M.J., Carstens E.B., Lefkowitz E.J., eds. Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Elsevier; 2012: 806–28.
  22. Woo P.C., Huang Y., Lau S.K., Yuen K.Y. Coronavirus genomics and bioinformatics analysis. Viruses. 2010; 2(8): 1804–20. https://doi.org/10.3390/v2081803.
  23. Львов Д.К., Гулюкин М.И., Забережный А.Д., Гулюкин А.М. Формирование популяционного генофонда потенциально угрожающих биобезопасности зоонозных вирусов. Вопросы вирусологии. 2020; 65(5): 243–58. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-5-1.
  24. Haake C., Cook S., Pusterla N., Murphy B. Coronavirus Infections in companion animals: virology, epidemiology, clinical and pathologic features. Viruses. 2020; 12(9): 1023. https://doi.org/10.3390/v12091023.
  25. Schulz L.L., Tonsor G.T. Assessment of the economic impacts of porcine epidemic diarrhea virus in the United States. J. Anim. Sci. 2015; 93(11): 5111–8. https://doi.org/10.2527/jas.2015-9136.
  26. Colvero L.P., Villarreal L.Y., Torres C.A., Brañdo P.E. Assessing the economic burden of avian infectious bronchitis on poultry farms in Brazil. Rev. Sci. Tech. 2015; 34(3): 993–9. https://doi.org/10.20506/rst.34.3.2411.
  27. Яцышина С.Б., Мамошина М.В., Шипулина О.Ю., Подколзин А.Т., Акимкин В.Г. Анализ циркуляции коронавирусов человека. Вопросы вирусологии. 2020; 65(5): 267–76. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-5-3.
  28. Львов Д.К., Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Федякина И.Т., Бовин Н.В., Игнатьева А.В. и др. Особенности циркуляции вирусов гриппа и ОРВИ в эпидемическом сезоне 2019–2020 гг. в отдельных регионах России. Вопросы вирусологии. 2020; 65(6): 335–49. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-6-4.
  29. Rabaan A.A., Al-Ahmed S.H., Haque S., Sah R., Tiwari R., Malik Y.S., et al. SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-COV: A comparative overview. Infez. Med. 2020; 28(2): 174–84.
  30. Fehr A.R., Perlman S. Coronaviruses: An Overview of Their Replication and Pathogenesis. Methods Mol. Biol. 2015; 1282: 1–23. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2438-7_1.
  31. Guan Y., Zheng B.J., He Y.Q., Liu X.L., Zhuang Z.X., Cheung C.L., et al. Isolation and characterization of viruses related to the SARS coronavirus from animals in Southern China. Science. 2003; 302: 276–8. https://doi.org/10.1126/science.1087139.
  32. Banerjee A., Kulcsar K., Misra V., Frieman M., Mossman K. Bats and coronaviruses. Viruses. 2019; 11(1): 41. https://doi.org/10.3390/v11010041.
  33. European Centre for Disease Prevention and Control. Distribution of confirmed cases of MERS-CoV by place of infection and month of onset. Available at: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/distribution-confirmed-cases-mers-cov-place-infectionand-month-onset-march-2012 (accessed January 14, 2021).
  34. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) – Republic of Korea. Available at: https://www.who.int/csr/don/01-june2015-mers-korea/en/ (accessed January 14, 2021).
  35. Falzarano D., Kamissoko B., de Wit E., Maïga O., Cronin J., Samaké K., et al. Dromedary camels in northern Mali have high seropositivity to MERS-CoV. One Health. 2017; 3: 41–3. https://doi.org/10.1016/j.onehlt.2017.03.003.
  36. Alexandersen S., Kobinger G.P., Soule G., Wernery U. Middle East respiratory syndrome coronavirus antibody reactors among camels in Dubai, United Arab Emirates, in 2005. Transbound. Emerg. Dis. 2014; 61(2): 105–108. https://doi.org/10.1111/tbed.12212.
  37. Alshukairi A.N., Zheng J., Zhao J., Nehdi A., Baharoon S.A., Layqah L., et al. High prevalence of MERS-CoV infection in camel workers in Saudi Arabia. mBio. 2018; 9(5): e01985-18. https://doi.org/10.1128/mbio.01985-18.
  38. Anthony S.J., Gilardi K., Menachery V.D., Goldstein T., Ssebide B., Mbabazi R., et al. Further evidence for bats as the evolutionary source of middle east respiratory syndrome coronavirus. mBio. 2017; 8(2): e00373-17. https://doi.org/10.1128/mbio.00373-17.
  39. Reusken C.B., Messadi L., Feyisa A., Ularamu H., Godeke G.J., Danmarwa A., et al. Geographic distribution of MERS coronavirus among dromedary camels, Africa. Emerg. Infect. Dis. 2014; 20(8): 1370–4. https://doi.org/10.3201/eid2008.140590.
  40. Corman V.M., Jores J., Meyer B., Younan M., Liljander A., Said M.Y., et al. Antibodies against MERS coronavirus in dromedary camels, Kenya, 1992–2013. Emerg. Infect. Dis. 2014; 20(8): 1319–22. https://doi.org/10.3201/eid2008.140596.
  41. Zhu N., Zhang D., Wang W., Li X., Yang B., Song J., et al. A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. N. Engl. J. Med. 2020; 382(8): 727–33. https://doi.org/10.1056/nejmoa2001017.
  42. Li X., Wang W., Zhao X., Zai J., Zhao Q., Li Y., et al. Transmission dynamics and evolutionary history of 2019-nCoV. J. Med. Virol. 2020; 92(5): 501–11. https://doi.org/10.1002/jmv.25701.
  43. World Health Organization. Coronavirus disease (COVID-19) Situation Report – 146. Available at: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200614-covid-19-sitrep-146.pdf?sfvrsn=5b89bdad_4 (accessed January 14, 2021).
  44. Zhou P., Yang X.L., Wang X.G., Hu B., Zhang L., Zhang W., et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020; 579(7798): 270–3. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7.
  45. Львов Д.К., Альховский С.В., Колобухина Л.В., Бурцева Е.И. Этиология эпидемической вспышки COVID-19 в г. Ухань (провинция Хубэй, Китайская Народная Республика), ассоциированной с вирусом 2019-nCoV (Nidovirales, Coronaviridae, Coronavirinae, Betacoronavirus, подрод Sarbecovirus): уроки эпидемии SARS-CoV. Вопросы вирусологии. 2020; 65(1): 6–15. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-1-6-15.
  46. Львов Д.К., Альховский С.В. Истоки пандемии COVID-19: экология и генетика коронавирусов (Betacoronavirus: Coronaviridae) SARS-CoV, SARS-CoV-2 (подрод Sarbecovirus), MERS-CoV (подрод Merbecovirus). Вопросы вирусологии. 2020; 65(2): 62–70. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-2-62-70.
  47. Газарян С.В. Эколого-фаунистический анализ населения рукокрылых (Chiroptera) Западного Кавказа: Автореф. дис. … канд. биол. наук. Москва; 2002.
  48. Иванов С.П., Фатерыга А.В., ред. Красная книга Республики Крым. Животные. Симферополь: Ариал; 2015.
  49. Drexler J.F., Gloza-Rausch F., Glende J., Corman V.M., Muth D., Goettsche M., et al. Genomic characterization of severe acute respiratory syndrome-related coronavirus in european bats and classification of coronaviruses based on partial RNA-dependent RNA polymerase gene sequences. J. Virol. 2010; 84(21): 11336–49. https://doi.org/10.1128/jvi.00650-10.
  50. Rihtaric D., Hostnik P., Steyer A., Grom J., Toplak I. Identification of SARS-like coronaviruses in horseshoe bats (Rhinolophus hipposideros) in Slovenia. Arch. Virol. 2010; 155(4): 507–14. https://doi.org/10.1007/s00705-010-0612-5.
  51. Monchatre-Leroy E., Boué F., Boucher J.M., Renault C., Moutou F., Ar Gouilh M., et al. Identification of alpha and beta Coronavirus in wildlife species in France: bats, rodents, rabbits, and hedgehogs. Viruses. 2017; 9(12): 364. https://doi.org/10.3390/v9120364.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Леншин С.В., Ромашин А.В., Вышемирский О.И., Львов Д.К., Альховский С.В., 2021

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».