RESEARCH ELECTRONIC DATA CAPTURE (REDCAP) FOR BUILDING AND MANAGING DATABASES FOR POPULATION-BASED BIOMEDICAL STUDIES


Cite item

Full Text

Abstract

The paper presents the main principles of applying Research Electronic Data Capture (REDCap) system to data collection and data storage in population-based biomedical studies. Advantages and limitations of using REDCap as well as possibilities for obtaining intermediate reports, descriptive statistics and data management are presented from the point of view of research project logistics using the Eastern Siberia PCOS Epidemiology & Phenotype (ESPEP) population-based study as an example.

About the authors

V V Atalyan

Scientific Center for Family Health and Human Reproduction Problems

Irkutsk, Russia

L I Kolesnikova

Scientific Center for Family Health and Human Reproduction Problems

Irkutsk, Russia

S I Kolesnikov

Northern State Medical University; Al-Farabi Kazakh National University; West Kazakhstan Marat Ospanov Medical University; North-Eastern Federal University

Irkutsk, Russia; Moscow, Russia

A M Grjibovski

Northern State Medical University; Al-Farabi Kazakh National University; West Kazakhstan Marat Ospanov Medical University; North-Eastern Federal University

Email: Andrej.Grjibovski@gmail.com
доктор медицины, заведующий ЦНИЛ; профессор; почетный профессор; почетный доктор, визитинг-профессор Arkhangelsk, Russia; Almaty, Kazakhstan; Aktobe, Kazakhstan; Yakutsk, Russia

L V Suturina

Scientific Center for Family Health and Human Reproduction Problems

Irkutsk, Russia

References

  1. Абдуманонов А. А., Алиев Р. Э., Карабаев М. К., Хошимов В. Г. О проектировании медицинских баз данных и информационных систем для организации и управления лечебно-диагностических процессов // T-COMM: телекоммуникации и транспорт. 2016. Т. 10, № 1. С. 45-53.
  2. Бальжиева В. В., Баирова Т. А., Рычкова Л. В., Аюрова Ж. Г., Колесников С. И. Этногенетические аспекты ожирения у детей и подростков // Вопросы детской диетологии. 2017. Т. 15, № 5. С. 29-34.
  3. Гришин И. Ю., Тимиргалеева Р. Р., Скидан Р. А., Рябов А. М. База данных для проведения научных исследований «Моделирование процессов инновационного развития бальнеологических курортных территорий» // Вестник национального технического университета Харьковский политехнический институт. Серия: информатика и моделирование. 2016. Т. 44 (1216). С. 126-134.
  4. А. с. 2016621487 RU. Регистр пациенток с различными фенотипами СПКЯ (Фенотипы СПКЯ) / Данусевич И. Н., Наделяева Я. Г., Аталян А. В. // Официальный бюл. «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем». 2016. № 12.
  5. А. с. 2017620345 RU. Информационно-справочная система «Цитокиновый статус людей, пострадавших от присасываний клещей, инфицированных вирусом клещевого энцефалита» (ИСС «Цитокины-клещевой энцефалит») / Данчинова Г. А., Хаснатинов М. А., Ляпунов А. В., Болотова Н. А., Манзарова Э. Л., Соловаров И. С., Степанова Л. В., Петрова И. В. // Официальный бюл. «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем». 2017. № 4.
  6. Даренская М. А., Колесников С. И., Гребенкина Л. А., Данусевич И. Н., Лазарева Л. М., Наделяева Я. Г., Даржаев З. Ю., Никитина О. А., Базарова Т. А., Колесникова Л. И. Анализ про- и антиоксидантной активности крови у женщин с различными фенотипами синдрома поликистозных яичников и бесплодием // Акушерство и гинекология. 2017. № 8. С. 86-91.
  7. А. с. 2016621094 RU. База данных проспективного исследования девочек-подростков с дисфункцией гипоталамуса в пубертатном возрасте (от пубертатного периода до репродуктивного возраста) / Жуковец И. В., Лещенко О. Я., Аталян А. В. // Официальный бюл. «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем». 2016. № 9.
  8. Земцов А. Н., Болгов Н. В., Божко С. Н. Многокритериальный выбор оптимальной системы управления базы данных с помощью метода анализа иерархий // Инженерный вестник Дона. 2014. Т. 29, № 2. С. 47.
  9. Колесникова Л. И., Колесников С. И., Даренская М. А., Гребенкина Л. А., Никитина О. А., Лазарева Л. М., Сутурина Л. В., Данусевич И. Н., Дружинина Е. Б., Семендяев А. А. Активность процессов ПОЛ у женщин с синдромом поликистозных яичников и бесплодием // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2016. Т. 162, № 9. С. 300-303.
  10. Крамаренко Т. А., Деменков И. А., Михеев А. М. Выбор клиент-серверной СУБД для реализации информационной системы // Современные информационные технологии. 2016. Т. 24 (24). С. 11-15.
  11. А. с. 2017620351 RU. Регистр женщин репродуктивного возраста с факторами риска генитального туберкулеза / Лещенко О. Я., Маланова А. Б., Аталян А. В. // Официальный бюл. «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем». 2017. № 4.
  12. Попечителев Е. П. База данных по методам медикобиологических исследований // Известия ЮФУ. Технические науки. 2006. Т. 12 (67). С. 15-17.
  13. Савотченко С. Е., Стукалов В. А. Критерии выбора системы управления базами данных при разработке библиотечной информационной системы // Теория и практика общественного развития. 2012. № 10. С. 91-93.
  14. Сутурина Л. В. Синдром поликистозных яичников в XXI веке // Акушерство и гинекология: новости, мнения, обучение. 2017. Т. 3 (17). С. 86-91.
  15. А. с. 2017621028 RU. Медико-социальные характеристики онкологических больных, проживающих на территории Воронежской области / Сыч Г. В., Есауленко И. Э., Косолапов В. П. // Официальный бюл. «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем». 2017. № 9.
  16. А. с. 2013620611 RU. Информационно-аналитическая система «Мониторинг хантавирусов в Иркутской области» (ИАС «Хантавирусы») / Туник Т. В., Данчинова Г. А., Ляпунов А. В., Хаснатинов М. А., Арбатская Е. В., Петрова И. В., Гладкова Е. П. // Официальный бюл. «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем». 2013. № 2.
  17. Fauser B. C. J. M., Tarlatzis B. C., Rebar R. W., Legro R. S., Balen A. H., Lobo R., Carmina E., Chang J., Yildiz B. O., Laven J. S. E., Boivin J., Petraglia F., Wijeyeratne C. N., Norman R. J., Dunaif A., Franks S., Wild R. A., Dumesic D., Barnhart K. Consensus on women's health aspects of polycystic ovary syndrome (PCOS): the Amsterdam ESHRE/ASRM-Sponsored 3rd PCOS Consensus Workshop Group // Fertility and sterility. 2012. Vol. 97, N 1. P. 28-38.e25.
  18. Franklin J. D., Guidry A., Brinkley J. F. A partnership approach for Electronic Data Capture in small-scale clinical trials // Journal of biomedical informatics. 2011. Vol. 44, Suppl 1. P 103-108.
  19. Harris P. A., Taylor R., Thielke R., Payne J., Gonzalez N., Conde J. G. Research electronic data capture (REDCap)--a metadata-driven methodology and workflow process for providing translational research informatics support // Journal of biomedical informatics. 2009. Vol. 42, N 2. P. 377-381.
  20. Klipin M., Mare I., Hazelhurst S., Kramer B. The process of installing REDCap, a web based database supporting biomedical research: The first year // Applied clinical informatics. 2014. Vol. 5, N 4. P. 916-929.
  21. Suturina L., Lizneva D., Danusevich I., Lazareva L., Belenkaya L., Nadeliaeva I., Kovalenko I., Bazarova T., Khomyakova A., Natyaganova L., Dolgikh M., Kurashova N., Gavrilova O., Darzhaev Z., Sholohov L., Atalyan A., Rashidova M., Damdinova L., Rostovtseva L., Alekseeva L., Sharifulin E., Legro L., Stanczyk F., Yuldiz B., Chen Y. H., Kintziger K., Diamond M. P., Azziz R. The design, methodology, and recruitment rate for the Eastern Siberia PCOS epidemiology&phenotype (ES-PEP) Study // Abstracts of the 41st Annual Meeting of the Androgen Excess & PCOS Society (November, 10-12, 2016, Lorne, Victoria, Australia). P. 76.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2019 Human Ecology


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».