«Быстрая ДНК» — перспективы судебно-экспертного исследования ДНК с использованием генетических анализаторов полного цикла

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Обоснование. Технология «быстрой ДНК» в перспективе станет оперативной и высокоэффективной процедурой судебно-экспертного молекулярно-генетического исследования, направленного на получение генетической информации о принадлежности биологического материала конкретному лицу.

Цель исследования. Работа представляет собой часть комплексных исследований, проводимых ФГБУ РЦСМЭ Минздрава России, конечной целью которых является развитие новых высокоэффективных технологий молекулярно-генетической индивидуализации и внедрение их в сферу деятельности отечественной судебно-медицинской экспертизы.

Материал и методы. Методической основой работы является генотипирование полиморфных STR-локусов хромосомной ДНК (анализ полиморфизма длины амплифицированных фрагментов хромосомной ДНК) в объектах биологической природы с помощью высокотехнологичных автоматизированных генетических анализаторов полного цикла. В настоящей работе использованы станции IntegenX RapidHIT 200 (IntegenX, США) и RapidHIT ID (Thermo Fisher-IntegenX, США).

Результаты. В качестве валидационных тест-объектов, которые были проанализированы с помощью автоматизированных генетических анализаторов полного цикла, исследованы образцы буккального эпителия и крови как наиболее распространённые в судебно-медицинской практике. Далее были выполнены эксперименты с реальными объектами экспертного исследования: в качестве тест-образцов были исследованы сигаретные окурки, волосы, ногти, кости, жевательная резинка, смывы биоматериала с различных поверхностей. Полученные экспериментальные данные пригодны для судебно-экспертного молекулярно-генетического идентификационного анализа.

Заключение. На основании полученных данных можно констатировать, что технология «быстрой ДНК», реализованная в автоматизированных генетических анализаторах полного цикла, в целом отвечает представлению о целесообразности её внедрения в судебно-экспертную практику ДНК-идентификации.

Об авторах

Елена Юрьевна Земскова

Российский центр судебно-медицинской экспертизы

Email: zemskova@rc-sme.ru
ORCID iD: 0000-0002-2669-0877
SPIN-код: 5835-2788

к.м.н.

Россия

Наталья Робиковна Соколова

Российский центр судебно-медицинской экспертизы

Email: sokolova.n@rc-sme.ru
ORCID iD: 0000-0002-0481-7646
SPIN-код: 9381-3968

MD

Россия, 125284, Москва, ул. Поликарпова, д. 12/13

Сергей Владимирович Исупов

ООО «Лабиндекс»

Email: sergey.isupov@labindex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9437-4569
Россия, 125284, Москва, ул. Поликарпова, д. 12/13

Павел Леонидович Иванов

Российский центр судебно-медицинской экспертизы

Автор, ответственный за переписку.
Email: dna@rc-sme.ru
ORCID iD: 0000-0002-4753-3125

д.б.н., профессор

Россия, 125284, Москва, ул. Поликарпова, д. 12/13

Список литературы

  1. Hopwood A.J., Hurth C., Yang J., et al. Integrated microfluidic system for rapid forensic DNA analysis: sample collection to DNA profile // Anal Chem. 2010. Vol. 82, N 16. Р. 6991–6999. doi: 10.1021/ac101355r
  2. Liu P., Li X., Greenspoon S.A., et al. Integrated DNA purification, PCR, sample cleanup, and capillary electrophoresis microchip for forensic human identification // Lab Chip. 2011. Vol. 11, N 6. Р. 1041–1048. doi: 10.1039/c0lc00533a
  3. DiZinno J. 90 Minute DNA Profiles on a Fully Validated, Automated System // Proc. 7th International DNA Users’ Conference for Investigative Officers, 7 Nov 2013 Interpol Headquarters, Lyon, France. 2013.
  4. Gold S. RapidDNA: a game changer in the law enforcement identification stakes // Biometric Technology Today. 2013. N 1. Р. 7–10. doi: 10.1016/S0969-4765(13)70015-8
  5. LaRue B.L., Moore A., King J.L., et al. An evaluation of the RapidHIT® system for reliably genotyping reference samples // Forensic Sci Int Genet. 2014. Vol. 13. Р. 104–111. doi: 10.1016/j.fsigen.2014.06.012
  6. Date-Chong M., Hudlow W.R., Buoncristiani M.R. Evaluation of the RapidHIT™ 200 and RapidHIT GlobalFiler® Express kit for fully automated STR genotyping // Forensic Sci Int Genet. 2016. Vol. 23. Р. 1–8.
  7. GlobalFiler™ and GlobalFiler™ IQC PCR Amplification Kits [Internet]. Life Technologies Ltd. 7 Kingsland Grange. Woolston, Warrington WA1 4SR. United Kingdom. Режим доступа: https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/4477604.pdf. Дата обращения: 15.10.2021.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Генетические профили (электрофореграммы), полученные при помощи генетического анализатора RapidHIT 200: а ― образец буккального эпителия на стандартном аппликаторе; b ― образец крови на бумажном носителе (вырезка ⌀ 1,2 мм).

Скачать (574KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Генетические профили (фрагмент электрофореграммы), полученные для одного и того же образца буккального эпителия с использованием генетического анализатора полного цикла RapidHIT 200 (а) и по стандартной процедуре генотипирования с использованием генетического анализатора ABI 3500 (b).

Скачать (514KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Генетические профили (электрофореграммы), полученные с использованием генетического анализатора RapidHIT 200: а ― биологические следы на окурке сигареты; b ― биологические следы на крае кофейной чашки.

Скачать (615KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Генетические профили (фрагмент электрофореграммы), полученные для одного и того же тест-объекта (образец крови) с генотипической аллельной парой D1S1656 {16.3 ; 17} с использованием генетического анализатора полного цикла RapidHIT ID (а) и по стандартной процедуре генотипирования с использованием генетического анализатора ABI 3500 (b).

Скачать (252KB)
Метаданные

© Земскова Е.Ю., Соколова Н.Р., Исупов С.В., Иванов П.Л., 2021

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».