Фено-генотипическая характеристика энтеромикробиоты диких и зоопарковых животных как природного резервуара антибиотикорезистентных штаммов микроорганизмов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Обоснование. Повышенное внимание ученых вызывает увеличение количества случаев обнаружения бактерий с антимикробной резистентностью в  дикой природе. Дикие животные участвуют в передаче антибиотикорезистентных микроорганизмов. Генетические детерминанты устойчивости возникли в микроорганизмах окружающей среды, поэтому необходим тщательный анализ их мест обитания для прогнозирования процессов эволюции и распространения данного феномена.

Цель – изучение фено-генотипического профиля антибиотикорезистентности микроорганизмов, выделенных из энтеромикробиоты диких и содержащихся в неволе (зоопарковых) животных.

Материалы и методы. Для идентификации микроорганизмов использовали бактериологический метод и времяпролетную масс-спектрометрию. Детекцию генетических детерминант антибиотикорезистентности осуществляли методом ПЦР.

Результаты. Установлено, что микробиота пищеварительного тракта диких и содержащихся в зоопарках животных, представлена 5 семействами, в частности Streptococcaceae, Enterobacteriaceae, Bacillaceae, Staphylococcaceae и Pseudomonadaceae. Определена высокая резистентность некоторых видов бактерий (E. coli, Klebsiella pneumonia, Enterococcus faecalis и др.) к препаратам группы биосинтетических пенициллинов и ингибиторам β-лактамаз. У половины изолятов E. coli обнаружен ген blaCTX-М, кодирующий β-лактомазу расширенного спектра действия, у 15,2% E. coli - ген blaOXA10, который кодирует β-лактамазы класса D.

Заключение. Анализ фактических данных микробиологического и молекулярно-генетического мониторинга может служить важной и эффективной оценкой распространения клинически значимой микрофлоры, устойчивой к антимикробным препаратам среди диких животных.

Об авторах

Валентина Ивановна Плешакова

ФГБОУ ВО Омский ГАУ

Автор, ответственный за переписку.
Email: vi.pleshakova@omgau.org
ORCID iD: 0000-0001-7896-2339
SPIN-код: 4372-5742
Scopus Author ID: 57214335417
ResearcherId: ABG-9332-2021

профессор, доктор ветеринарных наук, профессор

 

Россия, Институтская площадь, 1, г. Омск, 644008, Российская Федерация

Надежда Алексеевна Лещёва

ФГБОУ ВО Омский ГАУ

Email: na.lescheva@omgau.org
ORCID iD: 0000-0001-6334-0422
SPIN-код: 1482-8172
Scopus Author ID: 57223669914
ResearcherId: AIF-2193-22

зав. кафедрой, кандидат ветеринарных наук, доцент

 

Россия, Институтская площадь, 1, г. Омск, 644008, Российская Федерация

Татьяна Иосифовна Лоренгель

ФГБОУ ВО Омский ГАУ

Email: ti.lorengel@omgau.org
SPIN-код: 4352-5240
Scopus Author ID: 57214329921

доцент, кандидат ветеринарных наук

 

Россия, Институтская площадь, 1, г. Омск, 644008, Российская Федерация

Список литературы

  1. Ерещенко, М. И., Денисенко, Т. Е., & Болтунов, А. Н. (2019). Биологические свойства микроорганизмов, выделенных от атлантического моржа. В Актуальные проблемы ветеринарной медицины, зоотехнии и биотехнологии: Сборник трудов, 453-454. EDN: https://elibrary.ru/vcxlox
  2. Землянко, О. М., Рогоза, Т. М., & Журавлева, Г. А. (2018). Механизмы множественной устойчивости бактерий к антибиотикам. Экологическая генетика, 16(3), 4-17. https://doi.org/10.17816/ecogen1634-17 EDN: https://elibrary.ru/ynfkb
  3. Лях, Ю. Г., Гринёк, А. Н., Сухоцкая, Е. А., & Солодкий, М. А. (2019). Значение диагностики, анализ носительства возбудителей бактериальных инфекций у охотничьих водоплавающих птиц Беларуси. В Зоологические чтения - 2019: Сборник статей международной научно-практической конференции, 172-174.
  4. Калашникова, В. А., & Демерчян, А. В. (2018). Антибиотикорезистентность бактерий, выделенных у обезьян при кишечных инфекциях. Ветеринарная клиника, (7), 12-15. EDN: https://elibrary.ru/rkmbvk
  5. Киселева, С. В., & Денисенко, Т. Е. (2017). Индикация антибиотикорезистентности штаммов стафилококков у различных видов домашних и диких животных. В Тезисы докладов 70-й Всероссийской конференции, 81-102. EDN: https://elibrary.ru/ysmkvk
  6. Ларцева, Л. В., & Истелюева, А. А. (2011). Геоэкологические особенности антибиотикорезистентности микрофлоры внутренних водотоков г. Астрахани. Геология, география и глобальная энергия, (3), 180-186. EDN: https://elibrary.ru/nykzkh
  7. Лыков, И. Н., & Битков, М. П. (2022). Антибиотикорезистентность микрофлоры кузнечиков. Международный научно-исследовательский журнал, (11), 11. https://doi.org/10.23670/IRJ.2022.125.107 EDN: https://elibrary.ru/wmdhsm
  8. Обухова, О. В., & Ларцева, Л. В. (2014). Особенности антибиотикорезистентности энтеробактерий в дельте р. Волги. Гигиена и санитария, (3), 21-23. EDN: https://elibrary.ru/sjsxoh
  9. Давидович, Н. В., Кукалевская, Н. Н., Башилова, Е. Н., & Бажукова, Т. А. (2020). Основные принципы эволюции антибиотикорезистентности у бактерий. Клиническая лабораторная диагностика, 65(6), 387-393. https://doi.org/10.18821/0869-2084-2020-65-6-387-393 EDN: https://elibrary.ru/ejuexx
  10. Манжурина, О. А., Скогорева, А. М., Ромашов, Б. В., & Ромашова, Н. Б. (2017). Современные тенденции антибиотикорезистентности микробиоты домашних и диких животных. Вестник Воронежского государственного аграрного университета, (1), 41-45. https://doi.org/10.17238/issn2071-2243.2017.1.41 EDN: https://elibrary.ru/yqunuv
  11. Устойчивость к противомикробным препаратам [Электронный ресурс]. Всемирная организация здравоохранения. URL: https://www.who.int/ru/health-topics/antimicrobial-resistance (дата обращения: 11.06.2024).
  12. Martinez, J. L., Fajardo, A., Garmendia, L., Hernandez, A., Linares, J. F., Martinez-Solano, L., & Sanchez, M. B. (n.d.). A global view of antibiotic resistance. FEMS Microbiol. Rev., 33, 44-65.
  13. Baquero, F., Alvarez-Ortega, C., & Martinez, J. L. (2009). Ecology and evolution of antibiotic resistance. Environ Microbiol Rep, 1(6), 469-476.
  14. Bonnedahl, J., & Järhult, J. D. (2014). Antibiotic resistance in wild birds. Ups J Med Sci, 119(2), 113-116.
  15. Koeck, R., Daniels-Haardt, I., Becker, K., Mellmann, A., Friedrich, A. W., Mevius, D., & Schwarz, S., Jurke, A. (2018). Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in wildlife, food-producing, and companion animals: a systematic review. Clin Microbiol Infect, 10, 441-449.
  16. Dolejska, M., & Literak, I. (2019). Wildlife is overlooked in the epidemiology of medically important antibiotic-resistant bacteria. Antimicrob Agents Chemother, 63(8), 142-151.
  17. Guenther, S., Ewers, C., & Wieler, L. H. (2011). Extended-spectrum beta-lactamases producing E. coli in wildlife, yet another form of environmental pollution? Front Microbiol, 128-158.
  18. Martínez, J. L. (2012). Natural antibiotic resistance and contamination by antibiotic resistance determinants: the two ages in the evolution of resistance to antimicrobials. Front Microbiol, 1-3.
  19. Wellington, E. M., Boxall, A. B., Cross, P., Feil, E. J., Gaze, W. H., Hawkey, P. M. et al. (2013). The role of the natural environment in the emergence of antibiotic resistance in gram-negative bacteria. Lancet Infect Dis, 13(2), 155-165.
  20. Furness, L. E., Campbell, A., Zhang, L., Gaze, W. H., & McDonald, R. A. (2017). Wild small mammals as sentinels for the environmental transmission of antimicrobial resistance. Environ Res, 3, 1121-1129.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML


Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».