Междоменные взаимодействия белка PCID2, одной из субъединиц комплекса экспорта mРНК TREX-2 у Drosophila melanogaster


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Комплекс TREX-2 отвечает за экспорт мРНК из ядра в цитоплазму и состоит из четырех белков. Недавно было показано, что за специфичное распознавание мРНК комплексом TREX-2 отвечает его субъединица PCID2. Большую часть белка составляет PCI-домен, который имеет поверхности для связывания РНК. PCI-домен включает центральную область белка, в которой располагается поверхность для неспецифичного связывания РНК, M-PCID2, и C-концевую часть PCI-домена и С-конца белка, C-PCID2, в которой расположена поверхность для специфичного распознавания РНК. В N-концевой части PCID2 находится район, функции которого не известны. Поскольку комплекс TREX-2 связывает только определенную мРНК и только на определенном этапе, мы предположили, что N-концевая часть PCID2 может модулировать связывание C-PCID2 с РНК, связываясь с ним и закрывая его домен связывания с РНК. Мы показали, что N-концевой район взаимодействует с C-PCID2. Связывание C-PCID2 РНК при этом не нарушается. Также связывание C-PCID2 с РНК не нарушает его взаимодействие с N-концевой частью белка (N-PCID2). Таким образом, C-PCID2 может взаимодействовать с N-PCID2 и РНК различными поверхностями. Данное внутрибелковое взаимодействие, вероятно, необходимо на одном из этапов работы комплекса TREX-2.

Ключевые слова

Об авторах

Ю. А. Вдовина

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта Российской академии наук, Москва, Российская Федерация

Email: d_dmitrieva@mail.ru
Москва, Российская Федерация

С. Г. Георгиева

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта Российской академии наук, Москва, Российская Федерация

Email: d_dmitrieva@mail.ru
Москва, Российская Федерация

Д. В. Копытова

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта Российской академии наук, Москва, Российская Федерация

Автор, ответственный за переписку.
Email: d_dmitrieva@mail.ru
Москва, Российская Федерация

Список литературы

  1. Fischer T. et al. The mRNA export machinery requires the novel Sac3p-Thp1p complex to dock at the nucleoplasmic entrance of the nuclear pores // The EMBO journal. England, 2002. Vol. 21, № 21. P. 5843–5852.
  2. Kurshakova M.M. et al. SAGA and a novel Drosophila export complex anchor efficient transcription and mRNA export to NPC // The EMBO journal. England, 2007. Vol. 26, № 24. P. 4956–4965.
  3. Lu Q. et al. Arabidopsis homolog of the yeast TREX-2 mRNA export complex: components and anchoring nucleoporin // The Plant journal: for cell and molecular biology. England, 2010. Vol. 61, № 2. P. 259–270.
  4. Luna R., Gonzalez-Aguilera C., Aguilera A. Transcription at the proximity of the nuclear pore: a role for the THP1-SAC3-SUS1-CDC31 (THSC) complex // RNA biology. United States, 2009. Vol. 6, № 2. P. 145–148.
  5. Wickramasinghe V.O. et al. mRNA export from mammalian cell nuclei is dependent on GANP // Current biology: CB. England, 2010. Vol. 20, № 1. P. 25–31.
  6. Wickramasinghe V.O. et al. Selective nuclear export of specific classes of mRNA from mammalian nuclei is promoted by GANP // Nucleic acids research. England, 2014. Vol. 42, № 8. P. 5059–5071.
  7. Vdovina Y.A. et al. PCID2 Subunit of the Drosophila TREX-2 Complex Has Two RNA-Binding Regions // Current issues in molecular biology. Switzerland, 2023. Vol. 45, № 7. P. 5662–5676.
  8. Glukhova A.A. et al. PCID2, a subunit of the Drosophila TREX-2 nuclear export complex, is essential for both mRNA nuclear export and its subsequent cytoplasmic trafficking // RNA Biology. United States, 2021. Vol. 18, № 11. P. 1969–1980.
  9. Ellisdon A.M. et al. Structural basis for the assembly and nucleic acid binding of the TREX-2 transcription-export complex // Nature structural & molecular biology. United States, 2012. Vol. 19, № 3. P. 328–336.
  10. Viphakone N. et al. TREX exposes the RNA-binding domain of Nxf1 to enable mRNA export // Nature communications. England, 2012. Vol. 3. P. 1006.
  11. Golovanov A.P. et al. The solution structure of REF2-I reveals interdomain interactions and regions involved in binding mRNA export factors and RNA // RNA (New York, NY). 2006. Vol. 12, № 11. P. 1933–1948.
  12. Hautbergue G.M. et al. Mutually exclusive interactions drive handover of mRNA from export adaptors to TAP // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. United States, 2008. Vol. 105, № 13. P. 5154–5159.
  13. Kopytova D. et al. ORC interacts with THSC/TREX-2 and its subunits promote Nxf1 association with mRNP and mRNA export in Drosophila // Nucleic acids research. 2016.
  14. Schneider M. et al. The Nuclear Pore-Associated TREX-2 Complex Employs Mediator to Regulate Gene Expression // Cell. United States, 2015. Vol. 162, № 5. P. 1016–1028.
  15. Aksenova V. et al. Nucleoporin TPR is an integral component of the TREX-2 mRNA export pathway // Nature communications. 2020. Vol. 11, № 1. P. 4577.
  16. Bensidoun P. et al. Nuclear mRNA metabolism drives selective basket assembly on a subset of nuclear pore complexes in budding yeast // Molecular cell. United States, 2022. Vol. 82, № 20. P. 3856–3871.e6.
  17. Jani D. et al. Functional and structural characterization of the mammalian TREX-2 complex that links transcription with nuclear messenger RNA export // Nucleic acids research. England, 2012. Vol. 40, № 10. P. 4562–4573.
  18. Umlauf D. et al. The human TREX-2 complex is stably associated with the nuclear pore basket // Journal of cell science. England, 2013. Vol. 126, № Pt 12. P. 2656–2667.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».