Comparative analysis of insertion DNA sequences in group B streptococci

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

This study presents the data about the restriction polymorphism of group B streptococcal insertion sequences (IS elements). A total of 29 out of 113 strains did not possess any of the IS elements studied. In other strains the number of different IS elements varied from 1 to 3. No strains with 4 different IS elements were discovered. A total of 6, 9, 13 and 38 different DNA restriction patterns, hybridizing with IS1548, IS861, ISSa4 and IS1381 probes, respectively, were found out among the strains tested. It was demonstrated that IS based typing together with serological typing could be effectively used for epidemiological assay.

About the authors

A. V. Dmitriyev

Institute of Experimental Medicine RAMS

Author for correspondence.
Email: shabanov@mail.rcom.ru
Russian Federation, St. Petersburg, 197376

A. D. Shen

Beijing Children Hospital

Email: shabanov@mail.rcom.ru
China, 100045, Beijing

Y. H. Yang

Beijing Children Hospital

Email: shabanov@mail.rcom.ru
China, 100045, Beijing

A. A. Totolyan

Institute of Experimental Medicine RAMS

Email: shabanov@mail.rcom.ru

академик РАМН

Russian Federation, 197376, St. Petersburg

References

  1. Дмитриев А. В., Шаклеина Е. В. Молекулярная эпидемиология патогенных стрептококков группы В // ЖМЭИ. 2003. № 1 (в печати).
  2. Colman G. Typing of Streptococcus agalactiae (Lancefield group B) // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1988. Vol. 7. P. 226-231.
  3. Chatellier S., Huet H., Kenzi S. et al. Genetic diversity of rRNA operons of unrelated Streptococcus agalactiae strains isolated from cerebrospinal fluid of neonates suffering from meningitis // J. Clin. Microbiol. 1996. Vol. 34. P. 2741-2747.
  4. Dmitriev A., Hu Y. Y, Shen A. D. et al. Chromosomal analysis of group В streptococcal clinical strains; bac gene positive strains are genetically homogenous // FEMS Microbiol. Lett. 2002. Vol. 208. P. 93-98.
  5. Dmitriev A., Shakleina E., Tkacikova L. et al. Genetic heterogeneity of the pathogenic potentials of human and bovine group В streptococci // Folia Microbiol. 2002. Vol. 47. P. 291-295.
  6. Ferretti J., McShan W., AJdic D. et al. Complete genome sequence of an Ml strain of Streptococcus pyogenes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. Vol. 98. P. 4658-1663.
  7. Granlund M., Oberg L., Sellin M. et al. Identification of a novel insertion element, IS 1548, in group В streptococci, predominantly in strains causing endocarditis // J. Infect. Dis. 1998. Vol. 177. P. 967-976.
  8. Gray В. M., Dillon H. C. GBS infections in mothers and their infants // Antiobiot. Chemother. 1985. Vol. 3 5. P. 225-23 6.
  9. Hauge M., Jespersgaard C., Poulsen K. et al. Population structure of Streptococcus agalactiae reveals an association between specific evolutionary lineages and putative virulence factors but not disease // Infect. Immun. 1996. Vol. 64. P. 919-925.
  10. Hoe N., Nakashima K., Grigsby D. et al. Rapid molecular genetic subtyping of serotype Ml group A Streptococcus strains // Emerg. Infect. Dis. 1999. Vol. 5. P. 254-263.
  11. Kong F., Gowan S., Martin D. et al. Molecular profiles of group B streptococcal surface protein antigen genes: relationship to molecular serotypes // J. Clin. Microbiol. 2002. Vol. 40. P. 620-626.
  12. Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor. NY, 1982.
  13. Mahillon J., Chandler M. Insertion sequences // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. Vol. 62. P. 725-774.
  14. Quentin R., Huet H., Wang F-S. et al. Characterization of Streptococcus agalactiae strains by multilocus enzyme genotype and serotype: identification of multiple virulent clone families that cause invasive neonatal diseases // J. Clin. Microbiol. 1995. Vol. 33. P. 2576-2581.
  15. Rolland K., Marois C., Siquier V. et al. Genetic features of Streptococcus agalactiae strains causing severe neonatal infections, as revealed by pulsed-field gel electrophoresis and hylB gene analysis // J. Clin. Microbiol. 1999. Vol. 37. P. 1892-1898.
  16. Rubens С. E., Heggen L. M. and Kuypers J. M. IS861, a group B streptococcal insertion sequence related to IS 150 and IS3 of Escherichia colU/E Bacteriol. 1989. Vol. 171. P. 5531-5535.
  17. Sanchez-Beato A. R., Garcia E., Lopez R. et al. Identification and characterization of IS 1381, a new insertion sequence in Streptococcus pneumoniae // J. Bacteriol. 1997. Vol. 179. P. 2459-2463.
  18. Spellerberg B., Martin S., Franken C. et al. Identification of a novel insertion sequence element in Streptococcus agalactiae // Gene. 2000. Vol. 241. P. 51-56.
  19. Tamura G. S., Herndon M., Przekwas J. et al. Analysis of restriction fragment length polymorphisms of the insertion sequence IS 1381 in group B streptococci // J. Infect. Dis. 2000. Vol. 181. P. 364-368.
  20. Tettelin H., Masignani V., Cieslewicz M. J. et al. Complete genome sequence and comparative genomic analysis of an emerging human pathogen, serotype V Streptococcus agalactiae II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. P. 123 91-123 96.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2003 Eco-Vector



Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».