ASSOCIATION OF THE POLYMORPHISMS OF THE TCF7L2 GENES WITH TYPE 2 DIABETES

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

To study the association with diabetes mellitus type 2 we performed analysis of the distribution of frequencies of alleles and genotypes two polymorphic markers of TCF7L2 gene. The study included groups of T2DM patients and unrelated controls of Russian origin. Analysis of the distribution of frequencies of alleles and genotypes of the polymorphic marker rs7903146 of TCF7L2 gene showed the presence of association with T2DM in Russian population, while for the marker rs12255372 was not found statistically significant associations with type 2 diabetes. We can conclude that in Russian population TCF7L2 gene is associated with development of T2DM.

About the authors

A G Nikitin

ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: avialn@gmail.com
зав. лабораторией генетики ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, к.б.н.

V A Potapov

клиника новых медицинских технологий «Архимед»

врач клинической диагностики клиники новых медицинских технологий «Архимед», к.б.н.

A N Brovkin

ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

с.н.с. лаборатории генетики ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, к.б.н.

E Yu Lavrikova

ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

с.н.с. лаборатории генетики ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, к.б.н.

D S Khodyrev

ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

с.н.с. лаборатории генетики ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, к.б.н.

M Sh Shamhalova

Институт диабета ФГБУ ЭНЦ

зав. отделением диабетической нефропатии и гемодиализа Института диабета ФГБУ ЭНЦ, д.м.н.

S A Smetanina

Тюменская государственная медицинская академия

ведущий специалист терапевтического обучения пациентов с ожирением и сахарным диабетом многопрофильной клиники Тюменской государственной медицинской академии, к.м.н.

L N Suplotova

Тюменская государственная медицинская академия

проректор по лечебной работе Тюменской государственной медицинской академии, главный эндокринолог департамента здравоохранения Тюменской области, д.м.н., профессор

M V Shestakova

Институт диабета ФГБУ ЭНЦ

директор Института диабета ФГБУ ЭНЦ, д.м.н.

V V Nosikov

Государственный научный центр РФ «ГосНИИ генетика»; ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

зав. лабораторией молекулярной диагностики и геномной дактилоскопии Государственного научного центра РФ «ГосНИИ генетика»; в.н.с. лаборатории генетики ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, д.б.н., профессор

A V Averyanov

ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: averyanovav@mail.ru
заместитель генерального директора - главный врач ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, д.м.н.

References

  1. Пузырев Валерий Павлович. Патологическая анатомия генома человека. Новосибирск: Наука, Сибирское предприятие РАН. 1997.
  2. Grant Richard W, Moore Allan F, Florez Jose C. Genetic architecture of type 2 diabetes: recent progress and clinical implications. Diabetes Care. 2009. 32 (6), 1107-14.
  3. Parikh Hemang, Lyssenko Valeriya, Groop Leif C. Prioritizing genes for followup from genome wide association studies using information on gene expression in tissues relevant for type 2 diabetes mellitus. BMC Med Genomics. 2009; 2: 72.
  4. Florez J C. Newly identified loci highlight beta cell dysfunction as a key cause of type 2 diabetes: where are the insulin resistance genes? Diabetologia. 2008. 51 (7), 1100-10.
  5. Jin Tianru, Liu Ling. The Wntsignaling pathway effector TCF7L2 and type 2 diabetes mellitus. Mol. Endocrinol. 2008. 22 (11), 2383-92.
  6. Maiese Kenneth, Li Faqi, Chong Zhao Zhong, Shang Yan Chen. The Wnt signaling pathway: aging gracefully as a protectionist? Pharmacol. Ther. 2008. 118 (1), 58-81.
  7. Grant Struan FA, Thorleifsson Gudmar, Reynisdottir Inga, et al. Variant of transcription factor 7like 2 (TCF7L2) gene confers risk of type 2 diabetes. Nat. Genet. 2006. 38 (3), 320-323.
  8. Cauchi Stéphane, Meyre David, Dina Christian, et al. Transcription factor TCF7L2 genetic study in the French population: expression in human betacells and adipose tissue and strong association with type 2 diabetes. Diabetes. 2006. 55 (10), 2903-2908.
  9. Groves Christopher J, Zeggini Eleftheria, Minton Jayne, et al. Association analysis of 6,736 U.K. subjects provides replication and confirms TCF7L2 as a type 2 diabetes susceptibility gene with a substantial effect on individual risk. Diabetes. 2006. 55 (9), 2640-44.
  10. Saxena Richa, Gianniny Lauren, Burtt Noël P, et al. Common single nucleotide polymorphisms in TCF7L2 are reproducibly associated with type 2 diabetes and reduce the insulin response to glucose in nondiabetic individuals. Diabetes. 2006. 55 (10), 2890-95.
  11. Scott Laura J, Bonnycastle Lori L, Willer Cristen J, et al. Association of transcription factor 7like 2 (TCF7L2) variants with type 2 diabetes in a Finnish sample. Diabetes. 2006. 55 (9), 2649-53.
  12. Zhang Cuilin, Qi Lu, Hunter David J, et al. Variant of transcription factor 7like 2 (TCF7L2) gene and the risk of type 2 diabetes in large cohorts of U.S. women and men. Diabetes. 2006. 55 (9), 2645-48.
  13. Chandak G R, Janipalli C S, Bhaskar S, et al. Common variants in the TCF7L2 gene are strongly associated with type 2 diabetes mellitus in the Indian population. Diabetologia. 2007. 50 (1), 63-67.
  14. Marzi C, Huth C, Kolz M, et al. Variants of the transcription factor 7like 2 gene (TCF7L2) are strongly associated with type 2 diabetes but not with the metabolic syndrome in the MONICA/KORA surveys. Horm. Metab. Res. 2007. 39 (1), 46-52.
  15. Bodhini Dhanasekaran, Radha Venkatesan, Dhar Monalisa, Narayani Nagarajan, Mohan Viswanathan. The rs12255372(G/T) and rs7903146 (C/T) polymorphisms of the TCF7L2 gene are associated with type 2 diabetes mellitus in Asian Indians. Metab. Clin Exp. 2007; 56 (9): 1174-78.
  16. Horikoshi M, Hara K, Ito C, et al. A genetic variation of the transcription factor 7like 2 gene is associated with risk of type 2 diabetes in the Japanese population. Diabetologia. 2007. 50 (4), 747-51.
  17. Humphries Steve E, Gable David, Cooper Jackie A, et al. Common variants in the TCF7L2 gene and predisposition to type 2 diabetes in UK European Whites, Indian Asians and AfroCaribbean men and women. J. Mol. Med. 2006. 84 (12), 1005-1014.
  18. Lewis Joshua P, Palmer Nicholette D, Hicks Pamela J, et al. Association analysis in african ameri cans of Europeanderived type 2 diabetes single nucleotide polymorphisms from wholegenome association studies. Diabetes. 2008. 57 (8), 2220-2225.
  19. Helgason Agnar, P
  20. Schäfer S A, Tschritter O, Machicao F, et al. Impaired glucagonlike peptide1induced insulin secretion in carriers of transcription factor 7like 2 (TCF7L2) gene polymorphisms. Diabetologia 2007; 50 (12): 2443-2450.
  21. Kirchhoff K, Machicao F, Haupt A, et al. Polymorphisms in the TCF7L2, CDKAL1 and SLC30A8 genes are associated with impaired proinsulin conversion. Diabetologia. 2008. 51 (4), 597-601.
  22. Chimienti Fabrice, Devergnas Séverine, Pattou François, et al. In vivo expression and functional characterization of the zinc transporter ZnT8 in glucoseinduced insulin secretion. J Cell Sci. 2006;119:4199-4206.
  23. Dunn Michael F. Zincligand interactions modulate assembly and stability of the insulin hexamer a review. Biometals. 2005. 18 (4), 295-303.
  24. Matthews DR, Hosker JP, Rudenski A S, et al. Homeostasis model assessment: insulin resistance and betacell function from fasting plasma glucose and insulin concentrations in man. Diabetologia 1985; 28 (7):412-19.
  25. Johns MB, PaulusThomas JE. Purification of human genomic DNA from whole blood using sodium perchlorate in place of phenol. Anal Biochem 1989; 180 (2): 276-8.
  26. Калькулятор для расчета статистики в исследованиях «случай-контроль» [http://genexp.ru/ calculator_or.php].
  27. Pearson Ewan R, Donnelly Louise A, Kimber Charlotte, et al. Variation in TCF7L2 influences therapeutic response to sulfonylureas: a GoDARTs study. Diabetes. 2007. 56 (8), 2178-2182.
  28. Lindi Virpi I, Uusitupa Matti I J, Lindström Jaana, et al. Association of the Pro12Ala polymorphism in the PPARgamma2 gene with 3year incidence of type 2 diabetes and body weight change in the Finnish Diabetes Prevention Study. Diabetes. 2002. 51 (8), 2581-86.
  29. Salonen Jukka T, Uimari Pekka, Aalto JuhaMatti, et al. Type 2 diabetes wholegenome association study in four populations: the DiaGen consortium. Am. J. Hum. Genet. 2007. 81 (2), 338-45.
  30. Freathy Rachel M, Timpson Nicholas J, Lawlor Debbie A, et al. Common variation in the FTO gene alters diabetesrelated metabolic traits to the extent expected given its effect on BMI. Diabetes. 2008. 57 (5), 1419-26.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2014 Nikitin A.G., Potapov V.A., Brovkin A.N., Lavrikova E.Y., Khodyrev D.S., Shamhalova M.S., Smetanina S.A., Suplotova L.N., Shestakova M.V., Nosikov V.V., Averyanov A.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».