СОПРЯЖЕННЫЕ СИМБИОТИЧЕСКИЕ ПОПУЛЯЦИИ. ЧАСТЬ I: АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ РИЗОБИАЛЬНОГО КОМПОНЕНТА


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В статье приводятся результаты изучения сопряженной коллекции бобово-ризобиальной симбиотической системы (коллекция растений-хозяев люцерны и донника и выделенных из этих растений ризобий). Анализ таких коллекций делает возможным понимание коэволюционных процессов в симбиотической системе. Приведены результаты анализа ризобиального компонента симбиотической системы: определен генетический полиморфизм по 6 геномным локусам - хромосомным и симбиотическим. Проведен анализ таких популяционных характеристик, как таксономическая структура популяции, гетерогенность популяции по участкам ризобиального генома, дифференциация популяции по отдельным участкам генома, а также неравновесие по сцеплению между генетическими маркерами. Проанализированы различия между ризобиями, выделенными из различных растений-хозяев, а также между клубеньковыми и почвенными изолятами.

Об авторах

Алексей Николаевич Мунтян

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: genet@yandex.ru

Евгений Евгеньевич Андронов

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: eeandr@gmail.com

Виктория Спартаковна Белова

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: genet@yandex.ru

Марина Львовна Румянцева

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: genet@yandex.ru

Борис Васильевич Симаров

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, РФ

Email: genet@yandex.ru

Список литературы

  1. Маниатис Т., 1. Фрич Э., Сэмбрук Д., 1984. Молекулярное клонирование. М., Мир, 480 с.
  2. Островерхова Г. П., Островерхова Н. В., 2007. Коадаптивная система «гриб-мицетофаг»: эколого-филогенетический аспект//Вестник Томского государственного университета. Биология. Т. 1. С. 31-40.
  3. Проворов Н. А., 2001а Генетико-эволюционные основы учения о симбиозе//Журн. общ. биологии. Т. 62. № 6. C. 472-495
  4. Проворов Н. А., Симаров Б. В., 1984 б. Специфичность взаимодействия клубеньковых бактерий люцерны с разными видами растений-хозяев//С.-х. биология. Т. 19. № 7. С. 70-74.
  5. Румянцева М. Л., Симаров Б. В., Онищук О. П. и др., 2011. Биологическое разнообразие клубеньковых бактерий в экосистемакх и агроценозах. Теоретические основы и методы/под ред. Румянцевой М. Л. и Симарова Б. В. СПб: Инновационный центр защиты растений. 104 с.
  6. Тихонович И. А., Проворов Н. А., 2009. Симбиоз растений и микроорганизмов: молекулярная генетика агросистем будущего. Спб: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 210 с.
  7. Andronov E. E., Roumiantseva M. L., Onichtchouk O. P. et al., 2003. Symbiotic and genetic diversity of Rhizobium galegae isolates collected from the Galega orientalis gene center in the Caucasus//Appl. & Env. Microbiol. Vol. 69. № 2. P. 1067.
  8. Andronov E. E., Roumyantseva M. L., Sagoulenko V. V. et al., 1999. Effect of the host plant on the genetic diversity of a natural population of Sinorhizobium meliloti//Rus. J. of Genetics. Vol 35. № 10. P. 1358-1366.
  9. Andronov E. E., Roumiantseva M. L., Simarov B. V., 2001. Genetic diversity of a natural population of Sinorhizobium meliloti revealed in analysis of cr yptic plasmids and ISRm2011-2 fingerprints//Rus. J. of Genetics. Vol. 37. № 5. P. 494-499.
  10. Behringer, J. E., 1974. R‑factor transfer in Rhizobium leguminosarum//J. Gen. Microbiol. Vol. 84. P. 188-198.
  11. Bromfield E. S. P., Barran L. R., Wheatcroft R., 1995. Relative genetic structure of a population of Rhizobium meliloti isolated directly from soil and from nodules of alfalfa (Medicago sativa) and sweet clover (Melilotus alba)//Molecular Ecology. Vol. 4. № 2. P. 183-188.
  12. Hammer, O., Harper, D. A. T., Ryan P. D., 2001. PA ST: Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis//Palaeontologia Electronica. Vol. 4. № 1. P. 9. URL: http://palaeoelectronica. org/2001_1/past/issue1_01.htm
  13. Kosier B., Puhler A., Simon R., 1993. Monitoring the diversity of Rhizobium meliloti field and microcosm isolates with a novel rapid genotyping method using insertion elements//Molec. Ecol. Vol. 12. P. 35-46.
  14. Laguerre G., Mavingui P., Allard M. et al., 1996. Typing of Rhizobia by PCR DNA fingerprinting and PCR-restriction fragment length polymorphism analysis of chromosomal and symbiotic gene regions: application to Rhizobium leguminosarum and its different biovars. Appl. & Env. Microbiol. Vol. 62. № 6. P. 2029-2036.
  15. Maynard Smith J. M., Smith N. H., O'Rourke M. et al., 1993. How clonal are bacteria?//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 90. № 10. P. 4384-4388.
  16. Nei M., 1972. Genetic distance between populations//Am. Nat. Vol. 106. P. 283-292.
  17. Roumiantseva M. L., Andronov E. E., Sagulenko V. V. et al., 2004. Instability of cryptic plasmids in strain Sinorhizobium meliloti P108 in the course of symbiosis with alfalfa Medicago sativa//Rus. J. of Genetics. Vol. 40. № 4. P. 356-362.
  18. Schneider S., Rosslie D., Excoffier L., 1997. Arlequin ver 2.000: A software for population genetics data analysis//Genetics and Biometry Laboratory, University of Geneva, Geneva.
  19. Wexler M., Gordon, D. M. & Murphy, P. J., 1996. Genetic relationships among rhizopine-producing Rhizobium strains//Microbiology. Vol. 142. P. 1059-1066.
  20. Young J. P. V., Demetriou L., Apte R. G. 1987 Rhizobium population genetics: enzyme polymorphism in Rhizobium leguminosarum from plants and soil in a Pea Crop. Appl. Environ. Microb. Vol. 53. P. 397-402.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Мунтян А.Н., Андронов Е.Е., Белова В.С., Румянцева М.Л., Симаров Б.В., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».