О методических ошибках оценивания начальных скоростей ферментативных реакций и способах их коррекции (на примере лактатдегидрогеназы)

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Представлен универсальный алгоритм расчета начальных скоростей ферментативных реакций в «нулевой» момент времени по кинетической кривой расхода субстрата или накопления продукта при проведении прямых кинетических измерений активности ферментов. Исследование выполнено на примере коммерческого препарата лактатдегидрогеназы и стандартного биохимического набора реагентов. Предлагаемый подход позволяет практически исключить систематическую ошибку измерений, с одинаковой точностью определять начальную скорость реакции независимо от уровня активности ферментов, сократить до одной минуты время выполнения анализов, а также расширить сферу применения стандартных наборов реагентов для исследования образцов ферментов разного происхождения при решении широкого круга задач. Алгоритм не может применяться при использовании в аналитической процедуре систем сопряженных ферментов, поскольку на кинетических кривых в этом случае имеется длительная начальная лаг-фаза.

Об авторах

А. Ю Лянгузов

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: andrey.lyanguzov@spbu.ru
Санкт-Петербург, Россия

Н. М Малыгина

Санкт-Петербургский государственный университет;Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Санкт-Петербург, Россия

Т. А Петрова

Санкт-Петербургский государственный университет

Санкт-Петербург, Россия

Список литературы

  1. Spinreact, https://www.spinreact.com. Дата обращения: 10.05.2023.
  2. M. Meerkin, in Tietz cinical guide to laboratory tests, Ed. by A. H. B. Wu (W.B. Saunders Company, Danvers, 2006), pp. 648-б5о.
  3. A. Chang, L. Jeske, S. Ulbrich, et al., Nucl. Acids Res., 49, D498 (2021).
  4. Enzyme Nomenclature, http://www.enzyme-data-base.org/contents.php. Дата обращения: 10.05.2023.
  5. L. S. Vidal, C. L. Kelly, P. M. Mordaka, and J. T. Heap, Biochim. Biophys. Acta: Proteins Proteomics, 1866, 327 (2018).
  6. UV WinLab Software 6.0.4 (PerkinElmer Lambda 35), http://www.perkinelmer.com. Дата обращения: 10.05.2023.
  7. R Project, https://www.r-project.org. Дата обращения: 10.05.20223.
  8. N. M. Malygina, T. A. Petrova, A. Yu. Lianguzov, and A. M. Ivanov, Dokl. Biochem. Biophys., 488, 311 (2019).
  9. Products/Clinical Biochemistry/Enzymes, https://www.spinreact.com/en/products-list/clinical-biochemistry/enzymes.html. Дата обращения: 10.05.2023.
  10. W. W. Cleland, Anal. Biochem., 99, 142 (1979).
  11. A. Yu. Lyangusov, T. A. Petrova, and V. E. Stefanov. Dokl. Biochem. Biophys., 424, 49 (2009).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2023

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).