Biochip Analyzer as an Equipment Component in “Lab-on-Chip” Technology

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

A specially developed wide-field digital microarray analyzer was used for quantitative estimation of weak signals from biochip cells with the fluorescence intensity comparable to that of the substrate material. Luminescence intensity of the different material surfaces that could serve as substrates for biochip matrices used in medical diagnostics was measured in the spectral range of the cyanine dye Cy5 (λex = 645 nm, λem = 665 nm). It was shown that the developed digital microarray analyzer allowed recording the dye Cy5 on a substrate made of black polybutylene terephthalate (black crastin) with concentration of 3 or more molecules/μm2.

About the authors

V. E Barsky

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Email: victorbarsky@gmail.com
Moscow, Russia

D. A Yurasov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

G. M Detkov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

S. A Polyakov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

R. A Miftakhov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

G. F Shtylev

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

I. Yu Shishkin

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

V. E Kuznetsova

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

V. E Shershov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

V. A Vasiliskov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

O. A Zasedateleva

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

A. V Chudinov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Moscow, Russia

References

  1. https://www.rsc.org/journals-books-databases/aboutjournals/lab-on-a-chip/
  2. Ozer T., McMahon C., and Henry C. S. Advances in paper-based analytical devices. Ann. Rev. Anal. Chem., 13 (1), 85–109 (2020). doi: 10.1146/annurev-anchem- 061318-114845
  3. http://www.moslabo.ru/production/oborudovanie-ipribory-dlya-laboratorii-molekulyarnoj-biologii/
  4. Колчинский А., Грядунов Д., Лысов Ю., Михайлович В., Наседкина Т., Турыгин А., Рубина А., Барский В. и Заседателев А. Молекуляр. биология, 38, 4–13 (2004)
  5. http://www.biochip.ru/lab/apps/tb-biochip.html#:~:tex
  6. http://www.biochip-imb.ru/index.php/test-systems/pathogens/9-hcv-biochip
  7. Fesenko D. O., Chudinov A. V., Surzhikov S. A., and Zasedatelev A. S. Biochip-based genotyping assay for detection of polymorphisms in pigmentation genes associated with cutaneous melanoma. Genet. Test. Mol. Biomarkers, 20 (4), 208–212 (2016). doi: 10.1089/gtmb.2015.0272
  8. Shaskolskiy B., Kravtsov D., Kandinov I., Gorshkova S., Kubanov A., Solomka V., Deryabin D., Dementieva E., and Gryadunov D. Comparative whole-genome analysis of Neisseria gonorrhoeae isolates revealed changes in the gonococcal genetic island and specific genes as a link to antimicrobial resistance. Front. Cell. Infect. Microbiol., 12, 831336 (2022). doi: 10.3389/fcimb.2022.831336
  9. Фесенко Д. О., Ивановский И. Д., Иванов П. Л., Земскова Е. Ю., Поляков С. А., Фесенко О. Е., Филиппова М. А. и Заседателев А. С. Универсальная панель инсерционно-делеционных полиморфизмов ChipID106 для генетической идентификации личности и биочип на ее основе. Молекуляр. биология, 57 (4), 632–646 (2023). doi: 10.31857/S0026898423040067
  10. Фесенко Д. О., Ивановский И. Д., Иванов П. Л., Земскова Е. Ю., Агапитова А. С., Поляков С. А., Фесенко О. Е., Филиппова М. А. и Заседателев А. С. Биочип для генотипирования полиморфизмов, ассоциированных с цветом глаз, волос, кожи, группой крови, половой принадлежностью, основной гаплогруппой Y-хромосомы, и его использование для исследования славянской популяции. Молекуляр. биология, 56 (5), 860–880 (2022).
  11. Lysov Y., Barsky V., Urasov D., Urasov R., Cherepanov A., Mamaev D., Yegorov Y., Chudinov A., Surzhikov S., Rubina A., Smoldovskaya O., and Zasedatelev A. Microarray analyzer based on wide field fluorescent microscopy with laser illumination and a device for speckle suppression. Biomed. Opt. Express, 8 (11), 4798–4808 (2017). doi: 10.1364/BOE.8.004798
  12. http://www.biochip-imb.ru/index.php/biochip-reader/imageware
  13. https://www.moslabo.ru/production/oborudovanie-ipribory-dlya-laboratorii-molekulyarnoj-biologii/sistemy-vizualizacii-kletok-dlya-laboratorii/bioscience-media-fluorowatcher-fluorescentnyj-imedzher-dlya-fotografirovaniya-svetyashchihsya-molekul/

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».