Pilot Study to Detect the Repertoires of T-Cell Receptor Gamma Chains in Patients with Juvenile Schizophrenia

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Disfunction of immune system and neuroinflammation may play a role in pathogenesis of schizophrenia. The role of adaptive immune system has to be elucidated. We present a pilot study to test the methodology of profiling of immune repertoires of the TCR gamma chain by deep sequencing using several patients with juvenile schizophrenia and unaffected control subjects. The clonotype profiles were revealed and their diversity and presumable differences in structure of CDR3 TRG region of functional clones in juvenile schizophrenia and controls were estimated. This approach is perspective for further comprehensive study of changes in adaptive immune system in representative cohorts of patients with different forms of schizophrenia.

About the authors

M. Yu. Plotnikova

Vavilov Institute of General Genetics Russian Academy of Sciences; Center for Genetics and Life Sciences, “Sirius” University

Author for correspondence.
Email: plotnikova.m.u.1996@gmail.com
Russia, 119991, Moscow; Russia, 354340, Krasnodarskiy kray, p. Sirius

A. D. Patrikeev

Vavilov Institute of General Genetics Russian Academy of Sciences

Email: plotnikova.m.u.1996@gmail.com
Russia, 119991, Moscow

A. Yu. Levchenko

Institute of Translational Biomedicine, Saint-Petersburg State University

Email: plotnikova.m.u.1996@gmail.com
Russia, 199034, Saint-Petersburg

O. Yu. Fedorenko

Mental Health Research Institute, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of Sciences

Email: plotnikova.m.u.1996@gmail.com
Russia, 634014, Tomsk

T. V. Andreeva

Vavilov Institute of General Genetics Russian Academy of Sciences; Center for Genetics and Life Sciences, “Sirius” University; Lomonosov Moscow State University

Email: plotnikova.m.u.1996@gmail.com
Russia, 119991, Moscow; Russia, 354340, Krasnodarskiy kray, p. Sirius; Russia, 119991, Moscow

E. I. Rogaev

Vavilov Institute of General Genetics Russian Academy of Sciences; Center for Genetics and Life Sciences, “Sirius” University; Lomonosov Moscow State University

Email: plotnikova.m.u.1996@gmail.com
Russia, 119991, Moscow; Russia, 354340, Krasnodarskiy kray, p. Sirius; Russia, 119991, Moscow

References

  1. Perälä J., Suvisaari J., Saarni S.I. et al. Lifetime prevalence of psychotic and bipolar I disorders in a general population // Arch. Gen. Psychiatry. 2007. V. 64. № 1. P. 19–28. https://doi.org/10.1001/ARCHPSYC.64.1.19
  2. Vallée A. Neuroinflammation in Schizophrenia: The key role of the WNT/β-catenin pathway // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. № 5. https://doi.org/10.3390/IJMS23052810
  3. Ushakov V.L., Malashenkova I.K., Kostyuk G.P. et al. The relationship between inflammation, cognitive disorders and neuroimaging data in schizophrenia // Zh. Nevrol. i Psih. im. S.S. Korsakova. 2020. V. 120. № 11. P. 70–78. https://doi.org/10.17116/JNEVRO202012011170
  4. Mikocziova I., Greiff V., Sollid L.M. Immunoglobulin germline gene variation and its impact on human disease // Genes Immun. 2021. V. 22. № 4. P. 205–217. https://doi.org/10.1038/S41435-021-00145-5
  5. Upthegrove R., Manzanares-Teson N., Barnes N.M. Cytokine function in medication-naive first episode psychosis: A systematic review and meta-analysis // Schizophr. Res. Elsevier. 2014. V. 155. № 1–3. P. 101–108. https://doi.org/10.1016/J.SCHRES.2014.03.005
  6. Fernandes B.S., Steiner J., Bernstein H.G. et al. C-reactive protein is increased in schizophrenia but is not altered by antipsychotics: Meta-analysis and implications // Mol. Psychiatry. 2015. V. 21. № 4. P. 554–564. https://doi.org/10.1038/MP.2015.87
  7. Rodrigues-Amorim D., Rivera-Baltanás T., Spuch C. et al. Cytokines dysregulation in schizophrenia: A systematic review of psychoneuroimmune relationship // Schizophr. Res. Elsevier. 2018. V. 197. P. 19–33. https://doi.org/10.1016/J.SCHRES.2017.11.023
  8. Langerak A.W., Groenen P.J.T.A., Brüggemann M. et al. EuroClonality/BIOMED-2 guidelines for interpretation and reporting of Ig/TCR clonality testing in suspected lymphoproliferations // Leukemia. 2012. V. 26. № 10. P. 2159–2171. https://doi.org/10.1038/LEU.2012.246
  9. Aliseychik M., Patrikeev A., Gusev F. et al. Dissection of the human T-cell receptor γ gene repertoire in the brain and peripheral blood identifies age- and Alzheimer’s disease-associated clonotype profiles // Front. Immunol. 2020. V. 11. https://doi.org/10.3389/FIMMU.2020.00012/PDF
  10. Bolotin D.A., Poslavsky S., Mitrophanov I. et al. MiXCR: Software for comprehensive adaptive immunity profiling // Nat. Methods. 2015. V. 12. № 5. P. 380–381. https://doi.org/10.1038/NMETH.3364
  11. Shugay M., Bagaev D., Turchaninova M.A. et al. VDJtools: Unifying post-analysis of T-cell receptor repertoires // PLoS Comput. Biol. 2015. V. 11. № 11. P. e1004503. https://doi.org/10.1371/JOURNAL.PCBI.1004503
  12. Ravens S., Schultze-Florey C., Raha S. et al. Human γδ T cells are quickly reconstituted after stem-cell transplantation and show adaptive clonal expansion in response to viral infection // Nat. Immunol. 2017. V. 18. № 4. P. 393–401. https://doi.org/10.1038/NI.3686

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2.

Download (204KB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2023 М.Ю. Плотникова, А.Д. Патрикеев, А.Ю. Левченко, О.Ю. Федоренко, Т.В. Андреева, Е.И. Рогаев

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».