Genetic variability of the Mongolian gerbil Meriones unguiculatus in the Northwestern part of the range

Мұқаба

Дәйексөз келтіру

Толық мәтін

Ашық рұқсат Ашық рұқсат
Рұқсат жабық Рұқсат берілді
Рұқсат жабық Тек жазылушылар үшін

Аннотация

The variability of two mitochondrial genome markers: cytochrome b gene (cytb) and I subunit of cytochrome oxidase gene (COX1) was studied for the first time in populations of the north-western part of the Meriones unguiculatus range. Phylogenetic and phylogeographic analyses were carried out on the basis of both our own and molecular data deposited in the world databases. The level of genetic variability and differentiation of the Mongolian gerbil in the studied region based on COX1 polymorphism were assessed. It has been suggested that the populations of the northwestern part of the range of M. unguiculatus were formed due to rapid expansion from one or several small ancestral populations from the east to the west in the Middle Holocene.

Толық мәтін

Рұқсат жабық

Авторлар туралы

A. Blekhman

Koltzov Institute of Developmental Biology of RAS

Email: rusmarmot@yandex.ru
Ресей, Moscow, 119334

N. Golovchan

Pirogov Russian National Research Medical University

Email: rusmarmot@yandex.ru

медико-биологический факультет

Ресей, Moscow, 117997

S. Ondar

Tuvan State University

Email: rusmarmot@yandex.ru
Ресей, Kyzyl, 667000

O. Brandler

Koltzov Institute of Developmental Biology of RAS

Хат алмасуға жауапты Автор.
Email: rusmarmot@yandex.ru
Ресей, Moscow, 119334

Әдебиет тізімі

  1. Павлинов И.Я., Дубровский Ю.А., Россолимо О.Л. и др. Песчанки мировой фауны. М.: Наука, 1990. 368 с.
  2. Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: Наука, 1995. 522 с.
  3. Лисовский А.А., Шефтель Б.И., Савельев Е.Г. и др. Млекопитающие России: список видов и прикладные аспекты. Сб. тр. Зоол. музея МГУ. Т. 56. М.: Тов. науч. изд. КМК, 2019. 191 с.
  4. Allen G.M. Natural History of Central Asia: The mammals of China and Mongolia II. N.Y.: Am. Museum of Nat. History, 1940. 1350 p.
  5. Gulotta E.F. Meriones unguiculatus // Mammalian Species. 1971. № 3. P. 1–5.
  6. Liang J., Zhou L., Zhao T. et al. Genetic variation and geographicial differentiation of Cytochrome b gene of Clawed jird (Meriones unguiculatus) // Acta Theriologica Sinica. 2007. V. 27. № 2. P. 138–145.
  7. Wang Y.N., Liu W., Wang G.M. et al. Genetic consequences of group living in Mongolian gerbils // J. Hered. 2011. V. 102. № 5. P. 554–561.
  8. Wang G., Liu W., Wang Y. et al. Restricted dispersal determines fine-scale spatial genetic structure of Mongolian gerbils // Current Zoology. 2017. V. 63. № 6. P. 687–691.
  9. Aljanabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt extraction of high quality genomic DNA for PCR based techniques // Nucl. Ac. Res. 1997. V. 25 (22). https://doi.org/10.1093/nar/25.22.4692
  10. Jaarola M., Searle J.B. Phylogeography of field voles (Microtus agrestis) in Eurasia inferred from mitochondrial DNA sequences // Mol. Ecol. 2002. V. 11. P. 2613–2621.
  11. Edgar R.C. MUSCLE: Multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput // Nucl. Ac. Res. 2004. V. 32. № 5. P. 1792–1797. https://doi.org/10.1093/nar/gkh340
  12. Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms // Mol. Biol. and Evol. 2018. V. 35. P. 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
  13. Nei M. Molecular Evolutionary Genetics. N.Y.: Columbia Univ. Press, 1987. 512 p.
  14. Hudson R.R., Slatkin M., Maddison W.P. Estimation of levels of gene flow from DNA sequence data // Genetics. 1992. V. 132. № 2. P. 583–589.
  15. Rozas J., Ferrer-Mata A., Sánchez-DelBarrio J.C. et al. DnaSP v.6: Sequence polimorphism analysis of large datasets // Mol. Biol. Evol. 2017. V. 34. № 12. P. 3299–3302.
  16. Spӧri Y., Flot J.F. HaplowebMaker and CoMa: Two web tools to delimit species using haplowebs and conspecificity matrices // Methods Ecol. Evol. 2020. V. 11. P. 1434–1438. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13454
  17. Банников А.Г. Млекопитающие Монгольской Народной Республики. М.: Изд-во АН СССР, 1954. 669 с.
  18. Соколов В.Е., Орлов В.Н. Определитель млекопитающих Монгольской Народной Республики. М.: Наука, 1980. 103 с.
  19. Smith A.T., Xie Y., Hoffmann R.S. et al. A Guide to the Mammals of China. New J. Princeton Univ. Press, 2010. 544 p.
  20. Lissovsky A.A., Sheftel B.I., Stakheev V.V. et al. Creating an integrated information system for the analysis of mammalian fauna in the Russian Federation and the preliminary results of this information system // Russ. J. Theriology. 2018. V. 17. № 2. P. 85–90.
  21. Avise J. Phylogeography: The History and Formation of Species. Harvard Univ. Press, 2000. 464 p.
  22. Gerlach G., Jueterbock A., Kraemer P. et al. Calculations of population differentiation based on GST and D: Forget GST but not all of statistics // Mol. Ecol. 2010. V. 19. P. 3845–3852.
  23. An C.B., Chen F.H., Barton L. Holocene environmental changes in Mongolia: A review // Glob Planet Chang. 2008. V. 63. № 4. P. 283–289.
  24. Khenzykhenova F., Dorofeyuk N., Shchetnikov A. et al. Palaeoenvironmental and climatic changes during the Late Glacial and Holocene in the Mongolia and Baikal region: A review // Quaternary International. 2021. V. 605. P. 300–328.

Қосымша файлдар

Қосымша файлдар
Әрекет
1. JATS XML
Жүктеу
2. Fig. 1. Localization of the studied populations and genetic variability of Meriones unguiculatus. a – range and collection points of the original samples (blue comb – range boundary, circles – locations of the samples used, numbers 1–9 – local population numbers according to Table 1); b – ML dendrogram of COX1 sequences; c – phylogenetic network of COX1 haplotypes, the sizes of circles are proportional to the number of sequences, notches on the branches indicate the number of substitutions, the sizes of sectors are proportional to the number of samples of a given haplotype in geographic populations; d – ML dendrogram of cytb sequences; bootstrap support values ​​of at least 70 are indicated at the branch nodes of the dendrograms. Sequences without geographic localization are not highlighted in color on the dendrograms. Haplotype designations correspond to Table 1.

Жүктеу (1MB)
Метадеректер

© Russian Academy of Sciences, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».