Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 61, № 9 (2025)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОБЗОРНЫЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ СТАТЬИ

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ РАЗВИТИЯ ПОЛИМОРФНОЙ ТЕРАТОЗООСПЕРМИИ У ЧЕЛОВЕКА

Клещев М.А., Осадчук А.В., Осадчук Л.В.

Аннотация

Неспецифическая (полиморфная) тератозооспермия – часто встречающееся нарушение качества эякулята у мужчин, когда доля морфологически нормальных сперматозоидов ниже референсных значений, при этом в образце эякулята встречается несколько типов морфологических аномалий сперматозоидов в различных соотношениях. Полиморфная тератозооспермия может возникать в результате влияния как негативных факторов окружающей среды и образа жизни, так и наличия патогенных вариантов некоторых генов. Однако исследованию генетических причин возникновения полиморфной тератозооспермии уделяется мало внимания. В настоящем обзоре впервые в результате анализа опубликованной литературы, а также сведений, содержащихся в базах данных Malacards, OMIM, KEGG, CTD, DisGeNET, собрана и систематизирована информация о 85 патогенных вариантах 51 гена, вызывающих развитие полиморфной тератозооспермии у человека. По данным функциональной аннотации генов и анализа опубликованной литературы, продукты этих генов участвуют в организации компонентов цитоскелета сперматиды – акроплаксомы и перинуклеарной теки, обеспечивающих формирование акросомы и взаимодействие акросомного пузырька с ядром, а также внутриклеточный транспорт молекул, регуляцию экспрессии и деградации белков, перестройку хроматина в ходе спермиогенеза. Кроме того, патогенные варианты некоторых генов приводят к снижению эффективности естественной антиоксидантной защиты клеток и, как следствие, проявлению тератозооспермии. Данные сведения могут быть полезны для диагностики и выбора тактики лечения полиморфной тератозооспермии, которая может быть обусловлена как генетическими причинами, так и влиянием негативных факторов окружающей среды и образа жизни.

Генетика. 2025;61(9):3-22
pages 3-22 views

АССОЦИАЦИИ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИЗОФОРМ APOE С ДОЛГОЛЕТИЕМ И РИСКОМ СМЕРТНОСТИ В ЧЕЛОВЕЧЕСКИХ ПОПУЛЯЦИЯХ

Абрамова М.Н., Петрова В.М., Андреева Т.В., Адрианова И.Ю., Кунижева С.С., Рогаев Е.И.

Аннотация

Влияние наследственных факторов на продолжительность жизни до 60 лет является незначительным, но возрастает в более пожилом возрасте. Выявление связи генетических вариантов с ожидаемой продолжительностью жизни и предрасположенностью к возрастным заболеваниям необходимо в контексте генетической гетерогенности популяций людей, проживающих в различных условиях среды. В этом отношении особый интерес представляет ген аполипопротеина Е (APOE). В данном обзоре анализируются роль различных аллелей/генотипов APOE в достижении определенного возраста и их ассоциация с долголетием в популяциях человека. Аллель ε4 является строго установленным генетическим фактором риска болезни Альцгеймера (БА) в популяциях Евразийского происхождения, и в большинстве групп долгожителей его частота значимо снижена по сравнению с общепопуляционной. Более редкий аллель ε2 ассоциирован со сниженным риском развития БА и с долголетием и в большинстве групп долгожителей он встречается чаще, чем у здоровых людей среднего возраста. Интересно определить, является ли различная представленность аллелей APOE у долгожителей, по сравнению с общепопуляционной, зависимой или независимой от эффекта APOE на риск БА или других заболеваний; какова роль APOE генотипа в достижении позднего возраста в африканских популяциях, проживающих в иных условиях и у которых строгая ассоциация аллеля ε4 с БА не выявлена. Рассматриваются вопросы: с какого биологического возраста аллели ε4 и ε2 значимо влияют на риск смертности, роль генетических факторов, оказывающих негативное или позитивное влияние на проявление ε4 аллеля и связанную с этим продолжительность жизни.

Генетика. 2025;61(9):23-39
pages 23-39 views

АНТИРЕСТРИКТАЗЫ: СТРУКТУРЫ, ФУНКЦИИ И ПЕРСПЕКТИВЫ ПРИМЕНЕНИЯ

Кудрявцева А.А., Уткина А.А., Манухов И.В.

Аннотация

Системы рестрикции-модификации (RM) играют важную роль в защите прокариот от проникновения чужеродной ДНК. Гены белков антирестрикции, таких как ArdA и ArdB, зачастую являются первыми генами, входящими в клетку при заражении. Недавние исследования показали, что ДНК-мимикрирующие белки ArdA обладают специфичностью по отношению к RM-системам, а значит могут имитировать вполне определенные последовательности ДНК. Более того, такая специфичность может быть реализована с помощью недавно открытых очень маленьких ДНК-мимикрирующих белков sArdA. Это позволяет сделать выводы о перспективности применения таких ДНК-мимикрирующих “почти пептидов” для специфичного взаимодействия с ДНК-связывающими белками в целях точной регуляции внутриклеточных процессов. Другой класс антирестрикционных белков ArdB, напротив, по-видимому представляет собой универсальный ДНК-связывающий агент, стабильно ингибирующий рестрикционную активность всех известных RM-систем I-типа, а также CRISPR/Cas3, что может быть применено для повышения эффективности трансформации для трудно трансформируемых штаммов.

Генетика. 2025;61(9):40-46
pages 40-46 views

МОЛЕКУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА

ВЛИЯНИЕ ВЫЗВАННОГО РНК-ИНТЕРФЕРЕНЦИЕЙ НОКДАУНА ГЕНА АКТИНА НА СМЕРТНОСТЬ РЫЖЕГО ТАРАКАНА Blattella germanica

Кошерова К.А., Рощина Н.В., Симоненко А.В., Муха Д.В.

Аннотация

В настоящее время особую актуальность приобретает разработка экологически чистых биоинсектицидов для борьбы с насекомыми – вредителями сельскохозяйственных культур и синантропными видами насекомых. Одним из перспективных подходов является использование двуцепочечной РНК, комплементарной жизненно важному гену насекомого, для нокдауна этого гена посредством механизма РНК-интерференции и последующей обусловленной этим гибели насекомого. С использованием Drosophila melanogaster в качестве модельного объекта из шести генов-паралогов актина был отобран один ген, Actin 5C, нокдаун которого в большинстве тканей дрозофилы приводил к гибели насекомого. Методом микроинъекции под кутикулу рыжего таракана Blattella germanica была введена двуцепочечная РНК, комплементарная гену Actin 5C этого насекомого. Было показано, что РНК-интерференция этого гена приводит к гибели тараканов в течение нескольких недель. Обсуждены перспективы использования в качестве инсектицида двуцепочечной РНК, комплементарной гену Actin 5C.

Генетика. 2025;61(9):47-55
pages 47-55 views

ГЕНЕТИКА РАСТЕНИЙ

НОВЫЕ МАРКЕРЫ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОПУЛЯЦИОННОЙ СТРУКТУРЫ ЕЛЕЙ СИБИРСКОЙ И ЕВРОПЕЙСКОЙ

Семериков В.Л.

Аннотация

На основе митохондриального генома ели европейской были разработаны праймеры для амплификации шести минисателлитных и одного микросателлитного локуса. Их тестирование на шести популяциях ели сибирской и северного кластера ели европейской (120 деревьев) выявили от трех до семи аллелей. Мультилокусная комбинация шести минисателлитов в сумме дала 27 гаплотипов. Популяции имели от двух до девяти гаплотипов, но почти не имели общих, они разделились (RCT = 0.77) на три группы – Европейская Россия, Урал и популяция ели сибирской (Алтай). В популяции, расположенной на верхнем пределе лесной растительности на Южном Урале, гаплотипы располагались не случайно, что демонстрирует возможность использования разработанных маркеров для выделения групп родственных по материнской линии деревьев, а также исследования процесса расселения деревьев на не занятых лесом территориях. В популяции из южного кластера ели европейской (Карпаты, 24 дерева) только один из маркеров имел устойчивую амплификацию и был изменчив (шесть аллелей).

Генетика. 2025;61(9):56-63
pages 56-63 views

ЧУЖЕРОДНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЛОКУСЫ ВЛИЯЮТ НА СОДЕРЖАНИЕ МИНЕРАЛЬНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ В ЗЕРНЕ СИНТЕТИЧЕСКОЙ ЛИНИИ ПШЕНИЦЫ

Леонова И.Н., Адонина И.Г., Виниченко Н.А., Салина Е.А., Шумный В.К.

Аннотация

Синтетические интрогрессивные линии являются важным источником генетических локусов для улучшения минерального состава зерна мягкой пшеницы (T. aestivum L.). Гибридная линия 1102, полученная в результате сложной схемы гибридизации с участием видов Aegilops speltoides, Aegilops tauschii и Secale cereale, была использована для картирования локусов, ассоциированных с содержанием в зерне десяти макро- и микроэлементов, а также тяжелых металлов – Ca, Mg, K, Cu, Fe, Zn, Mn, Cd, Cr и Pb. Оценка родительских образцов, использованных для создания картирующей популяции (сорт мягкой пшеницы Лютесценс 85 и линия 1102), в лабораторных и полевых условиях показала в среднем достоверное увеличение содержания микроэлементов Cu, Mn, Zn, Fe в зерне линии 1102, по сравнению с сортом Лютесценс 85, в 1.45, 1.44, 1.65 и 1.83 раза соответственно. В результате генотипирования F2–3-популяции маркерами SNP было локализовано 11 генетических локусов в хромосомах 2А, 2В, 3A, 3В, 4В, 5А, и 6А, достоверно ассоциированных с содержанием в зерне Ca, Mg, Zn, Fe, Pb и Cr. Сравнение паттернов амплификации маркеров SNP у родительских образцов позволяет предположить, что локусы QZn.1102-icg-2A, QCa.1102-icg-3A, QCr.1102-icg-3B и QCr.1102-icg-4B могут иметь чужеродное происхождение. Совокупность полученных результатов указывает на то, что синтетическая линия 1102 может содержать генетические локусы, способствующие накоплению в зерне таких токсичных металлов, как свинец и хром.

Генетика. 2025;61(9):64-77
pages 64-77 views

ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ

МАЛОИНВАЗИВНЫЙ СПОСОБ МОНИТОРИНГА ВОЗРАСТ-АССОЦИИРОВАННЫХ ИЗМЕНЕНИЙ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ У РЫБ Nothobranchius guentheri

Володин В.В., Гладыш Н.С., Булавкина Е.В., Снежкина А.В., Алипер Г.М., Крысанов Е.Ю., Гречишкина П.С., Фадеев В.С., Кудрявцев А.А., Никифоров-Никишин Д.Л., Кочетков Н.И., Москалев А.А., Краснов Г.С., Кудрявцева А.В.

Аннотация

Рыбы из рода Nothobranchius являются уникальным модельным объектом генетики долголетия благодаря короткой продолжительности жизни. Они особенно перспективны для тестирования геропротекторов. Однако небольшой размер рыб не позволяет в динамике оценивать показатели, отражающие скорость старения и ответ на экспериментальные воздействия, на одной и той же особи. Целью исследования было разработать подход для малоинвазивного мониторинга возраст-зависимых изменений на модели N. guentheri. Было проведено секвенирование транскриптомов хвостовых плавников самок и самцов N. guentheri различных возрастов, в том числе регенерировавших после резекции. Проведен анализ дифференциальной экспрессии генов. Профили экспрессии генов в хвостовых плавниках N. guentheri, регенерировавших однократно или двукратно, несущественно различаются при сопоставлении с интактными плавниками. Полученные результаты открывают новые перспективы для малоинвазивного мониторинга возраст-зависимых изменений в организме на молекулярно-генетическом уровне, в том числе при исследовании потенциальных геропротекторов.

Генетика. 2025;61(9):78-85
pages 78-85 views

ОСТРОВНАЯ ПОПУЛЯЦИЯ ОДИЧАВШИХ ЛОШАДЕЙ: ПРОИСХОЖДЕНИЕ И ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ

Воронкова В.Н., Солошенкова Э.А., Столповский Ю.А., Спасская Н.Н.

Аннотация

Впервые методами генетического анализа установлено происхождение одичавшей популяции лошадей (Equus caballus), обитающей в границах Государственного природного биосферного заповедника “Ростовский” (Ростовская область, Россия), от донской породы, с возможным вкладом генома буденновской породы. Проведена количественная оценка генетических параметров популяции и их сравнительный анализ с данными по другим породам лошадей, разводимым на территории России. Установлено, что островная популяция характеризуется сниженными значениями аллельного разнообразия, включая число эффективных аллелей (Ne = 2.97, Na = 4.59), пониженным уровнем наблюдаемой гетерозиготности (Ho = 0.59), а также выраженной генетической гомогенностью, что свидетельствует о высокой степени изоляции и инбридинга. Ключевыми факторами, лимитирующими генетическое разнообразие группировки, являются: ограниченный пул основателей, географическая изоляция, препятствующая генному обмену, низкая эффективная численность, а также многократные демографические депрессии в ее истории. Полученные данные подчеркивают влияние длительной изоляции и стохастических процессов (дрейф генов, эффект основателя) на формирование уникальной генетической структуры островных популяций.

Генетика. 2025;61(9):86-95
pages 86-95 views

ГЕНЕТИКА ЧЕЛОВЕКА

АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФНОГО МАРКЕРА rs73064425 ГЕНА LZTFL1 С РАЗВИТИЕМ ТЯЖЕЛОЙ ФОРМЫ COVID-19 И РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ЧАСТОТ ЕГО АЛЛЕЛЕЙ В МИРЕ

Корнеева Р.А., Трифонова Е.А., Бочарова А.В., Гусарова А.А., Бабовская А.А., Гавриленко М.М., Габидулина Т.В., Жилякова О.В., Колесников Н.А., Степанов В.А.

Аннотация

На сегодняшний день этиологические основы особенностей течения COVID-19 до конца не изучены, предполагается участие множества факторов, в том числе генетических. В настоящей работе проведен репликативный анализ ранее установленной по результатам GWAS ассоциации варианта rs73064425 гена LZTFL1 с тяжестью течения COVID-19. Полученные данные свидетельствуют о наличии ассоциации между однонуклеотидным изменением rs73064425 гена LZTFL1 и тяжелой формой COVID-19 в популяции русских г. Томска. Обсуждаются возможные механизмы вовлечения изученного SNV в патогенетику заболевания. Обнаружена вариабельность частот рискового аллеля Т rs73064425 в популяциях мира.

Генетика. 2025;61(9):96-105
pages 96-105 views

МЕТОДИКИ

РАЗРАБОТКА МЕТОДА МУЛЬТИПЛЕКСНОГО ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ТЯЖЕСТЬЮ ТЕЧЕНИЯ COVID-19

Бочарова А.В., Трифонова Е.А., Корнеева Р.А., Гусарова А.А., Степанов В.А.

Аннотация

COVID-19 – тяжелая острая респираторная инфекция, вызванная вирусом SARS-CoV-2. Исследования в области генетики организма-хозяина способствуют открытию новых геномных маркеров прогрессирования коронавирусной инфекции. В представленной статье разработан метод мультиплексного генотипирования однонуклеотидных полиморфных вариантов генов, ассоциированных с тяжестью течения COVID-19, основанный на многолокусной ПЦР и MALDI-TOF-масс-спектрометрии молекул ДНК. Охарактеризованы частоты 45 однонуклеотидного полиморфизма генов-кандидатов COVID-19 в популяционной выборке русских г. Томска. Полученные результаты сопоставлены с данными для мировых популяций из проекта “1000 геномов”.

Генетика. 2025;61(9):106-118
pages 106-118 views

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».