Inactivation of the gene responsible for the synthesis of gluconic acid in the genome of Pantoea brenneri

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Abstract. To study the contribution of the glucose dehydrogenase (gcd) gene product to the development of ISR priming in plants, a strain of Pantoea brenneri 3.2 with a deletion of the gcd gene was obtained. Using the Lambda Red (λ Red) phage recombination system, we obtained a marker-free mutant strain of P. brenneri 3.2 Δgcd. Inactivation of the gcd glucose dehydrogenase gene resulted in a 2.5-fold decrease in the strain’s ability to solubilize tricalcium phosphate on the solid nutrient medium NBRIP.

Full Text

Restricted Access

About the authors

A. D. Suleimanova

Kazan (Volga Region) Federal University

Author for correspondence.
Email: Aliya.kzn@gmail.com
Russian Federation, Kazan, 420008

L. V. Sokolnikova

Kazan (Volga Region) Federal University

Email: Aliya.kzn@gmail.com
Russian Federation, Kazan, 420008

D. S. Bulmakova

Kazan (Volga Region) Federal University

Email: Aliya.kzn@gmail.com
Russian Federation, Kazan, 420008

E. A. Egorova

Kazan (Volga Region) Federal University

Email: Aliya.kzn@gmail.com
Russian Federation, Kazan, 420008

M. R. Sharipova

Kazan (Volga Region) Federal University

Email: Aliya.kzn@gmail.com
Russian Federation, Kazan, 420008

References

  1. Бульмакова Д. С., Шагиева Г. И., Иткина Д. Л., Ленина О. А., Шарипова М. Р., Сулейманова А. Д. Антагонистические штаммы Pantoea brenneri как средства защиты растений // Микология и фитопатология. 2023. Т. 57. C. 352–361.
  2. Иткина Д. Л., Сулейманова А. Д., Шарипова М. Р. Pantoea brenneri AS3 и Bacillus ginsengihumi M2.11 как потенциальные агенты биоконтроля и стимуляторы роста растений // Микробиология. 2021. Т. 90. С. 204–214.
  3. Itkina D. L., Suleimanova A. D., Sharipova M. R. Pantoea brenneri AS3 and Bacillus ginsengihumi M2.11 as potential biocontrol and plant growth-promoting agents // Microbiology (Moscow). 2021. V. 90. P. 210–218.
  4. Datsenko K. A., Wanner K. A. One-step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K-12 using PCR products // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. P. 6640–6645.
  5. Hanahan D. Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids // J. Mol. Biol. 1983. V. 166. P. 557–580.
  6. Kumar A., Verma J. Does plant-microbe interaction confer stress tolerance in plants: a review // Microbiol. Res. 2018. V. 207. P. 41–52.
  7. Park J. H., Bolana N., Megharaj M., Naidua R. Isolation of phosphate solubilizing bacteria and their potential for lead immobilization in soil // J. Hazard. Mater. 2011. V. 185. P. 829–836.
  8. Paul D., Sinha S. N. Isolation and characterization of phosphate solubilizing bacterium Pseudomonas aeruginosa KUPSB12 with antibacterial potential from river Ganga, India // Ann. Agrar. Sci. 2017. V. 15. P. 130–136.
  9. Rawat P., Das S., Shankhdhar D., Shankhdhar S. C. Phosphate-solubilizing microorganisms: mechanism and their role in phosphate solubilization and uptake // J. Soil Sci. Plant Nutr. 2020. V. 21. P. 49–68.
  10. Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual. 2nd ed. NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989.
  11. Suleimanova A. D., Beinhauer A., Valeeva L. R., Chastukhina I. B., Balaban N. P., Shakirov E. V., Greiner R., Sharipova M. R. Novel glucose-1-phosphatase with high phytase activity and unusual metal ion activation from soil bacterium Pantoea sp. strain 3.5.1 // Appl. Environ. Microbiol. 2015. V. 81. P. 6790–6799.
  12. Suleimanova A., Bulmakova D., Sokolnikova L., Egorova E., Itkina D., Kuzminova O., Gizatullina A., Sharipova M. Phosphate solubilization and plant growth promotion by Pantoea brenneri soil isolates // Microorganisms. 2023. V. 11. Art. 1136. https://doi.org/10.3390/microorganisms11051136

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2. Fig. 1. Electrophoresis of PCR products at the stages of obtaining the mutant strain P. brenneri 3.2 Δgcd

Download (110KB)
Indexing metadata
3. Fig. 2. a – Growth of the native strain P. brenneri 3.2 and its mutant for the gene involved in the synthesis of gluconic acid on LB medium. *P < 0.05, **P < 0.01, ***P < 0.001; b – ability of the native and mutant strains to solubilize tricalcium phosphate.

Download (94KB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».