Взаимосвязь уровней мРНК генов Cxcl12, Tweak, Notch1, Yap в молекулярных механизмах фиброгенеза печени

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Недостаточная изученность молекулярных механизмов фиброза и цирроза печени не позволяет полностью понять все этапы развития этих патологий. Известно, что огромную роль в реализации функций генов и сигнальных путей играют взаимодействия между ними. Однако сведения о взаимосвязи генов и сигнальных путей недостаточны и часто противоречивы. В настоящей работе впервые детально изучена экспрессия мРНК генов Notch1, Notch2, Yap1, Tweak (Tnfsf12), Fn14 (Tnfrsf12a), Ang, Vegfa, Cxcl12 (Sdf), Nos2 и Mmp-9 на разных стадиях индуцированного тиоацетамидом фиброза печени крыс Wistar. С помощью факторного анализа получены три фактора, которые объединили высоко коррелирующие гены-мишени между собой. Первый фактор включает четыре гена: Cxcl12 (r = 0.829, р < 0.05), Tweak (r = 0.841, р < 0.05), Notch1 (r = 0.848, р < 0.05), Yap1 (r = 0.921, р < 0.05). Второй фактор описывает корреляции между генами Mmp-9 (r = 0.791, р < 0.05) и Notch2 (r = 0.836, р < 0.05). В третий фактор вошли гены Ang (r = 0.748, р < 0.05) и Vegfa (r = 0.679, р < 0.05). Гены Nos2 и Fn14 не вошли ни в один из факторов. Можно предположить, что продукты выбранных генов, классифицированных на основании уровней экспрессии их мРНК, взаимосвязаны в процессах фиброзных изменений печени крыс токсической этиологии. Полученные результаты представляют фундаментальный интерес для изучения патогенетических механизмов развития фиброза и цирроза печени.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Е. И. Лебедева

Витебский ордена Дружбы народов государственный медицинский университет

Email: lebedeva.ya-elenale2013@yandex.ru
Белоруссия, Витебск, 210009

А. Т. Щастный

Витебский ордена Дружбы народов государственный медицинский университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: lebedeva.ya-elenale2013@yandex.ru
Белоруссия, Витебск, 210009

А. С. Бабенко

Белорусский государственный медицинский университет

Email: lebedeva.ya-elenale2013@yandex.ru
Белоруссия, Минск, 220116

Д. А. Зиновкин

Гомельский государственный медицинский университет

Email: lebedeva.ya-elenale2013@yandex.ru
Белоруссия, Гомель, 246050

Список литературы

  1. Zhang D., Zhang Y., Sun B. (2022) The molecular mechanisms of liver fibrosis and its potential therapy in application. Int. J. Mol. Sci. 23(20), 12572. doi: 10.3390/ijms232012572
  2. Graupera I., Isus L., Coll M., Pose E., Díaz A., Vallverdú J., Rubio-Tomás T., Martínez-Sánchez C., Huelin P., Llopis M., Solé C., Fondevila C., Lozano J.J., Sancho-Bru P., Ginès P., Aloy P. (2022) Molecular characterization of chronic liver disease dynamics: from liver fibrosis to acute-on-chronic liver failure. JHEP Rep. 4(6), 100482. doi: 10.1016/j.jhepr.2022.100482
  3. Kachanova O., Lobov A., Malashicheva A. (2022) The role of the Notch signaling pathway in recovery of cardiac function after myocardial infarction. Int. J. Mol. Sci. 23(20), 12509. doi: 10.3390/ijms232012509
  4. Yuan C., Ni L., Zhang C., Wu X. (2020) The role of Notch3 signaling in kidney disease. Oxid. Med. Cell Longev. 2020, 1809408. doi: 10.1155/2020/1809408
  5. Salazar J.L., Yang S.A., Yamamoto S. (2020) Post-developmental roles of notch signaling in the nervous system. Biomolecules. 10(7), 985. doi: 10.3390/biom10070985
  6. Hosseini-Alghaderi S., Baron M. (2020) Notch3 in development, health and disease. Biomolecules. 10(3), 485. doi: 10.3390/biom10030485
  7. Chen Y., Gao W.K., Shu Y.Y., Ye J. (2022) Mechanisms of ductular reaction in non-alcoholic steatohepatitis. World J. Gastroenterol. 28(19), 2088‒2099. doi: 10.3748/wjg.v28.i19.2088
  8. Vera L., Garcia-Olloqui P., Petri E., Viñado A.C., Valera P.S., Blasco-Iturri Z., Calvo I.A., Cenzano I., Ruppert C., Zulueta J.J., Prosper F., Saez B., Pardo-Saganta A. (2021) Notch3 deficiency attenuates pulmonary fibrosis and impedes lung-function decline. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 64(4), 465‒476. doi: 10.1165/rcmb.2020-0516OC
  9. Adams J.M., Jafar-Nejad H. (2019) The roles of notch signaling in liver development and disease. Biomolecules. 9(10), 608. doi: 10.3390/biom9100608
  10. Pelullo M., Zema S., Nardozza F., Checquolo S., Screpanti I., Bellavia D. (2019) Wnt, Notch, and TGF-β pathways impinge on hedgehog signaling complexity: an open window on cancer. Front. Genet. 10, 711. doi: 10.3389/fgene.2019.00711
  11. Dai Y., Hao P., Sun Z., Guo Z., Xu H., Xue L., Song H., Li Y., Li S., Gao M., Si T., Zhang Y., Qi Y. (2021) Liver knockout YAP gene improved insulin resistance-induced hepatic fibrosis. J. Endocrinol. 249(2), 149‒161. doi: 10.1530/JOE-20-0561
  12. Yu H.X., Yao Y., Bu F.T., Chen Y., Wu Y.T., Yang Y., Chen X., Zhu Y., Wang Q., Pan X.Y., Meng X.M., Huang C., Li J. (2019) Blockade of YAP alleviates hepatic fibrosis through accelerating apoptosis and reversion of activated hepatic stellate cells. Mol. Immunol. 107, 29‒40. doi: 10.1016/j.molimm.2019.01.004
  13. Zheng C., Luo J., Yang Y., Dong R., Yu F.X., Zheng S. (2021) YAP activation and implications in patients and a mouse model of biliary atresia. Front. Pediatr. 8, 618226. doi: 10.3389/fped.2020.618226
  14. He X., Tolosa M.F., Zhang T., Goru S.K., Ulloa Severino L., Misra P.S., McEvoy C.M., Caldwell L., Szeto S.G., Gao F., Chen X., Atin C., Ki V., Vukosa N., Hu C., Zhang J., Yip C., Krizova A., Wrana J.L., Yuen D.A. (2022) Myofibroblast YAP/TAZ activation is a key step in organ fibrogenesis. JCI Insight. 7(4), e146243. doi: 10.1172/jci.insight.146243
  15. Wang M., Xie Z., Xu J., Feng Z. (2020) TWEAK/Fn14 axis in respiratory diseases. Clin. Chim. Acta. 509, 139‒148. doi: 10.1016/j.cca.2020.06.007
  16. Dwyer B.J., Jarman E.J., Gogoi-Tiwari J., Ferreira-Gonzalez S., Boulter L., Guest R.V., Kendall T.J., Kurian D., Kilpatrick A.M., Robson A.J., O’Duibhir E., Man T.Y., Campana L., Starkey Lewis P.J., Wigmore S.J., Olynyk J.K., Ramm G.A., Tirnitz-Parker J.E.E., Forbes S.J. (2021) TWEAK/Fn14 signalling promotes cholangiocarcinoma niche formation and progression. J. Hepatol. 74(4), 860‒872. doi: 10.1016/j.jhep.2020.11.018
  17. Zhang Y., Zeng W., Xia Y. (2021) TWEAK/Fn14 axis is an important player in fibrosis. J. Cell. Physiol. 236(5), 3304‒3316. doi: 10.1002/jcp.30089
  18. Lin Y., Dong M.Q., Liu Z.M., Xu M., Huang Z.H., Liu H.J., Gao Y., Zhou W. (2022) A strategy of vascular-targeted therapy for liver fibrosis. J. Hepatology. 76(3), 660‒675. doi: 10.1002/hep.32299
  19. Lefere S., Devisscher L., Geerts A. (2020) Angiogenesis in the progression of non-alcoholic fatty liver disease. Acta Gastroenterol. Belg. 83(2), 301‒307.
  20. Yang L., Yue W., Zhang H., Zhang Z., Xue R., Dong C., Liu F., Chang N., Yang L., Li L. (2022) Dual targeting of angipoietin-1 and von Willebrand factor by microRNA-671-5p attenuates liver angiogenesis and fibrosis. Hepatol. Commun. 6(6), 1425‒1442. doi: 10.1002/hep4.1888
  21. Friedman S.L., Pinzani M. (2022) Hepatic fibrosis 2022: unmet needs and a blueprint for the future. Hepatology. 75(2), 473‒488. doi: 10.1002/hep.32285
  22. Ray P., Stacer A.C., Fenner J., Cavnar S.P., Meguiar K., Brown M., Luker K.E., Luker G.D. (2015) CXCL12-γ in primary tumors drives breast cancer metastasis. Oncogene. 34(16), 2043‒2051. doi: 10.1038/onc.2014.157
  23. Cui L.N., Zheng X.H., Yu J.H., Han Y. (2021) Role of CXCL12-CXCR4/CXCR7 signal axis in liver regeneration and liver fibrosis. Zhonghua Gan Zang Bing Za Zhi. 29(9), 900‒903. doi: 10.3760/cma.j.cn501113-20200721-00403
  24. Chiraunyanann T., Changsri K., Sretapunya W., Yuenyongchaiwat K., Akekawatchai C. (2019) CXCL12 G801A polymorphism is associated with significant liver fibrosis in HIV-infected Thais: a cross-sectional study. Asian Pac. J. Allergy Immunol. 37(3), 162‒170. doi: 10.12932/AP-160917-0162
  25. Zhang J., Li Y., Liu Q., Li R., Pu S., Yang L., Feng Y., Ma L. (2018) SKLB023 as an iNOS inhibitor alleviated liver fibrosis by inhibiting the TGF-beta/Smad signaling pathway. RSC Adv. 8(54), 30919‒30924. doi: 10.1039/c8ra04955f
  26. Ahmad N., Ansari M.Y., Haqqi T.M. (2020) Role of iNOS in osteoarthritis: рathological and therapeutic aspects. J. Cell Physiol. 235(10), 6366‒6376. doi: 10.1002/jcp.29607
  27. Kashfi K., Kannikal J., Nath N. (2021) Macrophage reprogramming and cancer therapeutics: role of iNOS-derived NO. Cells. 10(11), 3194. doi: 10.3390/cells10113194
  28. Tsomidis I., Notas G., Xidakis C., Voumvouraki A., Samonakis D.N., Koulentaki M., Kouroumalis E. (2022) Enzymes of fibrosis in chronic liver disease. Biomedicines. 10(12), 3179. doi: 10.3390/biomedicines10123179
  29. Lachowski D., Cortes E., Rice A., Pinato D., Rombouts K., Hernandez A.D.R. (2019) Matrix stiffness modulates the activity of MMP-9 and TIMP-1 in hepatic stellate cells to perpetuate fibrosis. Sci. Rep. 9(1), 7299. doi: 10.1038/s41598-019-43759-6
  30. Maltais L.J., Blake J.A., Chu T., Lutz C.M., Eppig J.T., Jackson I. (2002) Rules and guidelines for mouse gene, allele, and mutation nomenclature: a condensed version. Genomics. 79(4), 471‒474. doi: 10.1006/geno.2002.6747
  31. Everhart J.E., Wright E.C., Goodman Z.D., Dienstag J.L., Hoefs J.C., Kleiner D.E., Ghany M.G., Mills A.S., Nash S.R., Govindarajan S., Rogers T.E., Greenson J.K., Brunt E.M., Bonkovsky H.L., Morishima C., Litman H.J. (2010) HALT-C Trial Group. Prognostic value of Ishak fibrosis stage: findings from the hepatitis C antiviral long-term treatment against cirrhosis trial. Hepatology. 51(2), 585‒594. doi: 10.1002/hep.23315
  32. Лебедева Е.И., Щастный А.Т., Бабенко А.С. (2022) Динамика стабильности экспрессии генов sdha, hprt, prl3d1 и hes1 в рамках моделирования фиброза печени крыс. Молекуляр. медицина. 20(2), 53–62. doi: 10.29296/24999490-2022-02-08
  33. Sharma N., Shaikh T.B., Eedara A., Kuncha M., Sistla R., Andugulapati S.B. (2022) Dehydrozingerone ameliorates thioacetamide-induced liver fibrosis via inhibition of hepatic stellate cells activation through modulation of the MAPK pathway. Eur. J. Pharmacol. 937, 175366. doi: 10.1016/j.ejphar.2022.175366
  34. Chandrashekar D.V., DuBois B.N., Rashid M., Mehvar R. (2023) Effects of chronic cirrhosis induced by intraperitoneal thioacetamide injection on the protein content and Michaelis-Menten kinetics of cytochrome P450 enzymes in the rat liver microsomes. Basic Clin. Pharmacol. Toxicol. 132(2), 197‒210. doi: 10.1111/bcpt.13813
  35. Shareef S.H., Al-Medhtiy M.H., Al Rashdi A.S., Aziz P.Y., Abdulla M.A. (2023) Hepatoprotective effect of pinostrobin against thioacetamide-induced liver cirrhosis in rats. Saudi J. Biol. Sci. 30(1), 103506. doi: 10.1016/j.sjbs.2022.103506
  36. Walther C.P., Benoit J.S. (2021) Tubular kidney biomarker insights through factor analysis. Am. J. Kidney Dis. 78(3), 335‒337. doi: 10.1053/j.ajkd.2021.03.016
  37. Muthiah M.D., Huang D.Q., Zhou L., Jumat N.H., Choolani M., Chan J.K.Y., Wee A., Lim S.G., Dan Y.Y. (2019) A murine model demonstrating reversal of structural and functional correlates of cirrhosis with progenitor cell transplantation. Sci. Rep. 9(1), 15446. doi: 10.1038/s41598-019-51189-7
  38. Ezhilarasan D. (2023) Molecular mechanisms in thioacetamide-induced acute and chronic liver injury models. Environ. Toxicol. Pharmacol. 104093. doi: 10.1016/j.etap.2023.104093
  39. Лебедева Е.И., Щастный А.Т., Бабенко А.С. (2022) Взаимное снижение уровня мРНК ANG и VEGF при прогрессирующем ангиогенезе венозной системы печени крыс Wistar в экспериментальном циррозе. Молекуляр. медицина. 20(2), 53‒61.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Фрагменты печени крыс контрольной группы (а) и крыс с индуцированным циррозом через 3 (б), 5 (в), 9 (г), 11 (д) и 17 нед. (е) после начала эксперимента. Окраска по Маллори. ×40 (а, б, д, е); ×20 (в, г). а – Центральная вена (стрелка); б – фиброзная соединительная ткань (стрелки); в – фиброзные септы между портальными зонами (стрелки); г – ложная печеночная долька (выделена овальной рамкой); д – ложные печеночные дольки (стрелки); е – выраженная деструкция печени.

Скачать (1MB)
Метаданные
3. Рис. 2. График извлеченных факторов в трехмерных координатах.

Скачать (163KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Изменение уровней экспрессии мРНК генов первого фактора при моделировании фиброза и цирроза печени крыс.

Скачать (213KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Изменение уровней экспрессии мРНК генов второго фактора при моделировании фиброза и цирроза печени крыс.

Скачать (158KB)
Метаданные
6. Рис. 5. Изменение уровней экспрессии мРНК генов третьего фактора при моделировании фиброза и цирроза печени крыс.

Скачать (134KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».