Дейтерозамещение и удерживание зарядов в ионах органических и биоорганических соединений. 1. Апамин

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

В настоящей работе продолжено развитие нового метода, позволяющего обнаружить различные структурные формы исследуемых биомолекул или органических соединений при разделении масс-спектров дейтероводородного (H/D) обмена многозарядных (z > 1) или однозарядных (z = 1) ионов. Суть метода разделения – наилучшая аппроксимация полученных при электрораспылении растворов электролитов масс-спектров линейной комбинацией некоторого числа H/D/z-распределений при независимой замене подвижных атомов H на D и независимом удерживании некоторого числа носителей заряда. Апробация метода выполнена на примере апамина, полипептида из 18 аминокислот с молекулярной массой около 2025.886 Да. Проанализировано соответствие полученных масс-спектральных компонент структурным формам апамина, образовавшимся в процессе дейтерообмена при напуске газа, содержащего ND3, и при отсутствии такого потока.

Об авторах

В. В. Разников

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

М. О. Разникова

Федеральный исследовательский центр проблем химической физики и медицинской химии Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Черноголовка, Россия

А. Р. Пихтелев

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

С. В. Филатов

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

И. В. Сулименков

Федеральный исследовательский центр химической физики им. Н.Н. Семёнова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: raznikova.mari@yandex.ru
Москва, Россия

Список литературы

  1. Kaltashov I.A., Abzalimov R.R. // J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008. V. 19. № 8. P. 1239. https://doi.org/10.1016/j.jasms.2008.05.018
  2. Frimpong A.K., Abzalimov R.R., Uversky V.N., Kaltashov I.A. // Proteins. 2010. V. 78. № 3. P. 714. https://doi.org/10.1002/prot.22604
  3. Разникова М.О., Разников В.В. // Хим. физика. 2001. Т. 20. № 4. С. 13.
  4. Raznikov V.V., Raznikova M.O., Sulimenkov I.V. // Anal. Bioanal. Chem. 2019. V. 411. № 24. P. 6409. https://doi.org/10.1007/s00216-019-02019-2
  5. Степанов В.М. Молекулярная биология. Структура и функции белков. М.: Наука, 2005.
  6. Masson G.R., Burke J.E., Ahn N.G. et al. // Nature Methods. 2019. V. 596. P. 595. https://doi.org/10.1038/s41592-019-0459-y
  7. Abzalimov R.R., Kaltashov I.A. // J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006. V. 17. № 11. P. 1543. https://doi.org/10.1016/j.jasms.2006.07.017.
  8. Xiao H., Hoerner J.K., Eyles S.J. et al. // Protein Sci. 2005. V. 14. № 2. P. 543. https://doi.org/10.1110/ps.041001705
  9. Kostyukevich Y., Acter T., Zherebker A. et al. // Mass Spectrom. Rev. 2018. V. 37. № 6. P. 1. https://doi.org/10.1002/mas.21565
  10. Разникова М.О., Разников В.В. // Хим. физика. 2005. Т. 24. № 1. С. 13.
  11. Raznikov V.V., Raznikova M.O. // Eur. J. Mass Spectrom. 2009. V. 15. P. 367.
  12. Разникова М.О., Разников В.В. // Молекуляр. биология. 2015. Т. 49. № 5. С. 817. https://doi.org/10.7868/S0026898415050146
  13. Разникова М.О., Разников В.В. // Хим. физика. 2018. Т. 37. № 4. С. 59. https://doi.org/10.7868/S0207401X18040076
  14. Разников В.В., Разникова М.О., Придатченко М.Л. // Масс-спектрометрия. 2016. Т.13. № 2. С. 124.
  15. Разников В.В., Зеленов В.В., Апарина Е.В., Сулименков И.В., Разникова М.О. // Масс-спектрометрия. 2020. Т. 17. №. 2. С. 103. https://doi.org/10.25703/MS.2020.17.26
  16. Kostyukevich Y., Kononikhin A., Popov I., Nikolaev E. // Anal. Chem. 2013. V. 85. P. 5330. https://doi.org/10.1021/ac4006606
  17. Dodonov A.F., Kozlovski V.I., Soulimenkov I.V. et al. // Eur. J. Mass Spectrom. 2000. V. 6. № 6. P. 481. https://doi.org/10.1255/ejms.378
  18. Raznikov V.V., RaznikovaM.O., Sulimenkov I.V., Zelenov V.V. // Anal. Bioanal. Chem. 2023. V. 415. № 12. P. 2193. https://doi.org/10.1007/s00216-023-04625-7
  19. Dempsey C.E. // Biochemistry. 1986. V. 25. P. 3904. https://doi.org/10.1021/bi00361a025
  20. Suvorina M.Y., Surin A.K., Dovidchenko N.V., Lobanov M.Y., Galzitskaya O.V. // Biochemistry (Moscow). 2012. V. 77. P. 616. https://doi.org/10.1134/S0006297912060089
  21. Wang F, Tang X. // Biochemistry. 1996. V. 35. P. 4069. https://doi.org/10.1021/bi9521304
  22. Крамер Г. Математические методы статистики. М.: Мир, 1975.
  23. Raznikov V.V., Raznikova M.O. // Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes. 1985. V. 63. P. 157. https://doi.org/10.1016/0168-1176(85)80023-9
  24. Raznikov V.V., Raznikova M.O. // Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes. 1991. V. 103. P. 67. https://doi.org/10.1016/0168-1176(91)80079-3
  25. Дубовицкий В.А., Иржак В.И. // Высокомолекуляр. соединения. Б. 2005. Т.47. № 1. С. 121.
  26. Kuzmenkov A.I., Peigneur S., Nasburg J.A. et al. // Front. Pharmacol. 2022. V. 13. 977440. https://doi.org/10.3389/fphar.2022.977440
  27. Разников В.В., Разникова М.О., Сулименков И.В., Зеленов В.В. // Масс-спектрометрия. 2023. Т. 20. № 2. С. 77. https://doi.org/10.25703/MS.2023.20.08
  28. Chen S.H., Russell D.H. // J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2015. V. 26. № 9. P. 1433. https://doi.org/10.1007/s13361-015-1191-1
  29. Purves R.W., Barnett D.A., Guevremont R. // Int. J. Mass Spectrom. 2000. V. 197. P. 163. https://doi.org/10.1016/S1387-3806(99)00240-7
  30. Москаленко И.В., Тихонов И.В. // Хим. физика. 2022. Т. 41. № 7. С. 18. https://doi.org/10.31857/S0207401X22070123
  31. Шайтан К.В. // Хим. физика. 2023. T. 42. № 6. С. 40. https://doi.org/10.31857/S0207401X23060109
  32. Шишкина Л.Н., КозловМ.В., КонстантиноваТ.В., СмирноваА.Н., ШвыдкийВ.О. // Хим. физика. 2023. T. 42. № 1. С. 28. https://doi.org/10.31857/S0207401X23010107
  33. Смирнова А.Н., Швыдкий В.О., Шишкина Л.Н. // Хим. физика. 2021. T. 40. № 7. С. 43. https://doi.org/10.31857/S0207401X21070104
  34. Яковлева М.А., Радченко А.Ш., Костюков А.А. и др. // Хим. физика. 2022. Т. 41. № 2. С. 20. https://doi.org/10.31857/S0207401X22020169
  35. Васильева А.Д., Юрина Л.В., Азарова Д.Ю. и др. // Хим. физика. 2022. Т. 41. № 2. С. 51. https://doi.org/10.31857/S0207401X22020145
  36. Зеленов В.В., Апарина Е.В. // Хим. физика. 2024. Т. 43. № 6. С. 53. https://doi.org/10.31857/S0207401X24060069

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».