Species identification of Caucasian rock lizards in the Jradzor population (Armenia) based on microsatellite genotyping data

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

A characteristic feature ofCaucasian rock lizards is the diversity of parthenogenetic species andthe ongoing processes of interspecific hybridization in the zones ofsympatry of unisexual and bisexual species with the formation ofpolyploid hybrids. This is the reason for the interest instudying the species composition of various, especially mixed, populations ofDarevskia. According to the preliminary description of the morphologicalcharacteristics of lizards from the previously unstudied Jradzor population ofArmenia, it was assumed that only unisexual individuals live init, but the affiliation of the species was questioned. Inthe present work, microsatellite genotyping of lizards from this population(n = 24) was carried out using locus-specific PCR andsubsequent full-length sequencing of the identified alleles. As a result,the species composition of this sample was established, including individualsof the parthenospeciesDarevskia dahli,D. unisexualis,andD. armeniaca. Individuals identified asD. dahlihave the same alleles from the studied loci as inother populations of Armenia. However, the multilocus genotypes formed bythe alleles are different. The individual identified asD. armeniacacarries the most common multilocus genotype. In D. unisexualisindividuals,a new allele (allele B) was identified at the Du281locus, which reflects the phenomenon of intraspecific polymorphism of parthenogeneticspecies. Thus, an unusual feature of the Jradzor population isthe sympatric habitation of three and possibly four parthenogenetic speciesofDarevskia, if the presence of D. uzzellii in Armenia is further confirmed.

About the authors

D. O. Odegov

Institute of Gene Biology of the Russian Academy of Sciences

34/5 Vavilov str., Moscow, 117334 Russia

V. A. Parshukova

Russian State Agrarian University — Moscow Agricultural Academy named after K.A. Timiryazev

49 Timiryazevskaya str., Moscow, 127550 Russia

M. S. Arakelyan

Yerevan State University

1 Alek Manukyan str., Yerevan, 0025 Armenia

A. F. Grigoryan

Shirak State University named after M. Nalbandyan

4 P. Sevak str., Gyumri, 3126 Armenia

A. P. Ryskov

Institute of Gene Biology of the Russian Academy of Sciences

34/5 Vavilov str., Moscow, 117334 Russia

I. A. Martirosyan

Institute of Gene Biology of the Russian Academy of Sciences

Email: irena-m@yandex.ru
34/5 Vavilov str., Moscow, 117334 Russia

References

  1. Аракелян М.С.Процессы видообразования в симпатрических популяциях двуполых видов скальных ящериц родаDarevskia// Биолог. журн. Армении. 2012. Т. 3. № 64.C. 117–127.
  2. Галоян Э.А., Кропачев И.И., Петросян В.Г. и др.Исследования однополых позвоночных видов рептилий при И.С. Даревском и посленего // Зоологический журнал.2024.Том 103. № 12.С. 4–24.
  3. Даревский И.С.Скальные ящерицы Кавказа (систематика, экология и филогения полиморфной группы кавказских ящериц подродаArchaeolacerta). Ленингр. отд., Л.:Наука, 1967. 214 с.
  4. Arakelyan M.S., Danielyan F.D., Corti C., Sindaco R., Leviton A.E.Herpetofauna ofArmenia and Nagorno-Karabakh. Contributions to Herpetology // Society for the Study of Amphibians and Reptiles. 2011.V. 27. 181 p.
  5. Arakelyan M., Spangenberg V., Petrosyan V.et al.Evolution of parthenogenetic reproduction in Caucasian rock lizards:A review // Current Zoology. 2023. V. 69. Iss. 2.P. 128–135.
  6. Arribas O.J.Phylogeny and relationships of the mountain lizardsof Europe and Near East (ArchaeolacertaMerttens, 1921, sensulato) and their relationships among the Eurasian Lacertid lizards //Rus. J. Herpetol. 1999. V. 6. № 1. P. 1–22.
  7. Candan K., Kornilios P., Ayaz D. etal.Cryptic genetic structure within Valentin’s Lizard,Darevskia valentini(Boettger, 1892) (Squamata, Lacertidae), with implications for systematics and originsof parthenogenesis // Systematics and Biodiversity. 2021. V. 19. № 7. P. 665–681.
  8. Danielyan F., ArakelyanM., Stepanyan I.Hybrids ofDarevskia valentini,D. armeniacaandD. unisexualisfrom asympatric population in Armenia // Amphibia-Reptilia. 2008. V. 29. P. 487–514.
  9. Dedukh D., Altmanová M., Petrosyan R. et al.Premeiotic endorep-lication is themechanism of obligate parthenogenesis in rock lizards of the genusDarevskia// Biol. Lett. 2024.V. 20. № 9. P. 20240182.
  10. FreitasS., Rocha, S., Campos, J. et al.Parthenogenesis through theice ages: A biogeographic analysis of the parthenogenetic rock lizards(genusDarevskia) // Mol. Phylogenet. Evol. 2016. V. 102.P. 117–127.
  11. Galoyan E.A., Sopilko N.G., Kovalyeva A.V. et al.Love bites: Males of lizards prefer to mate with conspecifics,but do not disdain parthenogens // Biological Journal of theLinnean Society. 2024. V. 145 (1). P. blae057.
  12. Girnyk A.E.,Vergun A.A., Semyenova S.K. et al.Multiple interspecific hybridization andmicrosatellite mutations provide clonal diversity in the parthenogenetic rock lizardDarevskia armeniaca// BMCGenomics. 2018. V. 19. P. 979.
  13. Kocher T.D., Thomas W.K., Meyer A. et al.Dynamics of mitochondrialDNA evolution in animals: Amplification and sequencing with conserved primers// Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989. V. 86. № 16. P. 6196–6200.
  14. Korchagin V.I., Badaeva T.N., Tokarskaya O.N. et al.Molecular characterization of allelicvariants of (GATA)nmicrosatellite loci in parthenogenetic lizardsDarevskiaunisexualis(Lacertidae) // Gene. 2007. V. 392. № 1–2. P. 126–133.
  15. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C. etal.MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms// Molecular Biology and Evolution. 2018. V. 35. P. 1547–1549.
  16. Moritz C., UzzellT., Spolsky C.H. etal.The maternal ancestry and approximate age of parthenogeneticspecies of Caucasian rock lizards (Lacerta: Lacertidae) // Genetica.1992. V. 87. P. 53–62.
  17. Petrosyan V.G., Osipov F.A.,Bobrov V.V. et al.New records and geographic distribution ofthe sympatric zones of unisexual and bisexual rock lizards ofthe genusDarevskiain Armenia and adjacent territories // BiodiversData J. 2020. V. 8. P. e56030.
  18. Ryskov A.P., Osipov F.A.,Omelchenko A.V. et al.The origin of multiple clones inthe parthenogenetic lizard speciesDarevskia rostombekowi// PLoS One. 2017.12: e0185161.
  19. Spangenberg V., Arakelyan M, Simanovsky S.A. et al.Tendency towards clonality: Deviations of meiosis in parthenogenetic Caucasian rock lizards //Biology ofReproduction. 2025. Art.no. ioaf091.
  20. Tarkhnishvili D., Yanchukov A., Şahin M.K.et al.Genotypic similarities among the parthenogeneticDarevskiarock lizardswith different hybrid origins //BMC Evol Biol.2020. V.20. P. 122.
  21. Uetz P.(editor).The Reptile Database, http://www.reptile-database.org (accessed on April 15, 2025).
  22. Vergun A.A., Martirosyan I.A., Semyenova S.K.et al.Clonal diversity and clone formation in the parthenogeneticCaucasian rock LizardDarevskia dahli// PLoS One. 2014. V.9. P. e100067.
  23. Vergun A.A., Girnyk A.E., Korchagin V.I. etal.Origin, clonal diversity, and evolution of the parthenogenetic lizardDarevskia unisexualis// BMC Genomics. 2020. V.21. P. 351.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».