Isolation and complete genome sequencing of rabies virus strain isolated from a brown bear (Ursus arctos) that attacked a human in Primorsky krai (November, 2014)

M. Yu. Shchelkanov; Щелканов М. Ю.; A. A. Deviatkin; Девяткин А. А.; V. Yu. Ananiev; Ананьев В. Ю.; E. V. Frolov; Фролов Е. В.; I. E. Dombrovskaya; Домбровская И. Э.; V. G. Dedkov; Дедков В. Г.; A. V. Ardashev; Ардашев А. В.; S. A. Kolomeets; Коломеец С. А.; I. P. Korotkova; Короткова И. П.; E. N. Lyubchenko; Любченко Е. Н.; V. V. Bandeev; Бандеев В. В.; M. N. Prosyannikova; Просянникова М. Н.; I. V. Galkina; Галкина И. В.; E. S. Ivanushko; Иванушко Е. С.; N. P. Emelyanova; Емельянова Н. П.; N. I. Baranov; Баранов Н. И.; S. A. Ulyanova; Ульянова С. А.; S. V. Aramilev; Арамилев С. В.; P. V. Fomenko; Фоменко П. В.; A. L. Surovy; Суровый А. Л.; N. A. Poroshin; Порошин Н. А.; N. N. Sokol; Сокол Н. Н.; D. V. Maslov; Маслов Д. В.; E. E. Makhinya; Махиня Е. Е.; G. A. Shipulin; Шипулин Г. А.

doi:10.18821/0507-4088-2016-61-4-180-186

Изоляция и секвенирование полноразмерного генома штамма вируса бешенства, выделенного от бурого медведя (Ursus arctos), напавшего на человека в Приморском крае (ноябрь 2014 г.)

Авторы: Щелканов М.Ю.¹^,2^,3, Девяткин А.А.⁴, Ананьев В.Ю.², Фролов Е.В.⁵, Домбровская И.Э.⁵, Дедков В.Г.⁴, Ардашев А.В.², Коломеец С.А.⁶, Короткова И.П.⁷, Любченко Е.Н.⁷, Бандеев В.В.⁸, Просянникова М.Н.², Галкина И.В.¹, Иванушко Е.С.⁹, Емельянова Н.П.⁹, Баранов Н.И.², Ульянова С.А.², Арамилев С.В.¹⁰, Фоменко П.В.¹¹, Суровый А.Л.¹², Порошин Н.А.⁵, Сокол Н.Н.⁵, Маслов Д.В.⁶, Махиня Е.Е.¹³, Шипулин Г.А.⁴
Учреждения:
1. ГАОУ ВПО «Дальневосточный федеральный университет»
2. ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Приморском крае»
3. ФГБУН «Биолого-почвенный институт» ДВО РАН
4. ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
5. ФГБУ «Приморская межобластная ветеринарная лаборатория» Россельхознадзора
6. Управление Роспотребнадзора по Приморскому краю
7. Приморская государственная сельскохозяйственная академия
8. Хасанская станция по борьбе с болезнями животных
9. ГБОУ ВПО «Тихоокеанский государственный медицинский университет»
10. АНО «Центр “Амурский тигр”»
11. Всемирный фонд дикой природы
12. “Департамент по охране, контролю и регулированию использования объектов животного мира администрации Приморского края
13. КГБУЗ «Хасанская центральная районная больница»
Выпуск: Том 61, № 4 (2016)
Страницы: 180-186
Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
URL: https://journal-vniispk.ru/0507-4088/article/view/117899
DOI: https://doi.org/10.18821/0507-4088-2016-61-4-180-186
ID: 117899

Цитировать

Полный текст

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

В ноябре 2014 г. в с. Барабаш (Хасанский район Приморского края), расположенном в непосредственной близости к национальному парку «земля леопарда», произошло нападение бурого медведя (Ursus arctos) на человека. Девиантное поведение медведя позволило предположить бешенство, которое было подтверждено после его отстрела с помощью лабораторных методов. из головного мозга медведя был изолирован штамм RABV/Ursus arctos/Russia/Primorye/PO-01/2014 (далее - PO-01). Штамм PO-01 является первым полностью секвенированным дальневосточным штаммом вируса бешенства и может считаться топотипным. PO-01 значительно отличается от вакцинного штамма RV-97 (СепеВапк EF542830), на основе которого выпускается живая аттенуированная вакцина, применявшаяся для профилактики бешенства в «Земле леопарда». Вместе с тем иммунодоминантные сайты в белках PO-01 и RV-97 отличаются незначительно, и применение вакцины может быть рекомендовано к продолжению. Анализ генома PO-01 (СепеВапк KP997032) выявил его принадлежность к евразийской генетической подгруппе генотипа 1 (уличного бешенства). Таким образом, эта генетическая подгруппа распространяется на восток вплоть до окраины материка. Расширение трансграничных охраняемых территорий России и Китая на Дальнем Востоке требует корректного учета циркуляции лиссавирусов.

Ключевые слова

вирус бешенства, генотип 1, генетические группы, бурый медведь, Приморский край

Список литературы

Львов Д.К., ред. Медицинская вирусология. М.: МИА; 2008.
Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013.
L’vov D.K., Shchelkanov M.Yu., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic Viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. Elsevier Academic Press; 2015.
Белик Е.В., Дудников С.А., Бельчихина А.В., Лядский М.М., Дудорова М.В. Эпизоотическая ситуация по бешенству на территории Владимирский области (2005-2009). Информационно-аналитический обзор. Владимир: ВНИИЗЖ; 2010.
Kuzmin I.V., Botvinkin A.D., McElhinney L.M., Smith J.S., Orciari L.A., Hughes G.J. et al. Molecular Epidemiology of terrestrial Rabies in the former Soviet Union. J. Wildl. Dis. 2004; 40 (4): 617-31.
Чупин С.А., Чернышова Е.В., Метлин А.Е. Генетическая характеристика полевых изолятов вируса бешенства, выявленных на территории Российской Федерации в период 2008-2011 г. Вопросы вирусологии. 2013; 58 (4): 44-9.
Хисматуллина Н.А., Гулюкин А.М., Гулюкин М.И., Иванов А.В., Сабирова В.В., Южаков А.Г. и др. Два случая гидрофобии в Республике Татарстан: прижизненная и постмортальная лабораторная диагностика. Вопросы вирусологии. 2015; 60 (2): 18-24.
Сидорова Д.Г., Сидоров Г.Н., Полещук Е.М., Колычев Н.М. Бешенство в Восточной Сибири в XX - начале XXI веков. Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра Сибирского отделения РАМН. 2007; (Приложение 3): 168-72.
Ботвинкин А.Д. Смертельные случаи заболевания людей бешенством в Евразии после контактов с рукокрылыми. Plecotus et al. 2011; (14): 75-86.
Leonova G.B., Belikov S.I., Kondratov I.G., Krylova N.V., Pavlenko E.V., Romanova E.V. et al. A fatal case of bat lyssavirus infection in Prymorye Territory of the Russian Far East. WHO Rabies Bulletin Europe. 2009; 33 (4): 5-8.
Liu Y., Zhang S., Zhao J., Zhang F., Hu R. Isolation of Irkut Virus from a Murina leucogaster Bat in China. PLoS Negl. Trop. Dis. 2013; 7 (3): e2097.
Инструкция по применению Антирабического лиофилизированного иммуноглобулина, меченного флуоресцеинизотиоцианатом (ФИТЦ-иммуноглобулин). Владимир: ФГБУ «ВНИИЗЖ»; 2011.
ГОСТ 26075-2013. Методы лабораторной диагностики бешенства. Межгосударственный стандарт. М.: Стандартинформ; 2014.
Назаров Н.А., Михайлина Н.М., Рыбаков С.С., Метлин А.Е., Чепуркин А.В., Молодкин А.В. и др. Разработка твердофазного непрямого сэндвич-варианта иммуноферментного анализа для диагностики бешенства животных. Труды Федерального центра охраны здоровья животных. 2006; 4: 117-24.
Reed L.J., Muench H. A simple method of estimating fifty percent endpoints. Amer. J. Hyg. 1938; 27: 493-7.
Poleshchuk E.M., Deviatkin A.A., Dedkov V.G., Sidorov G.N., Ochkasova J.V., Hodjakova I.A. et al. Complete genome sequences of four virulent rabies virus strains isolated from rabid animals in Russia. Genome Announc. 2013; 1 (3): e00140-13.
Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Mol. Biol. Evol. 2013; 30 (12): 2725-9.
Lubchenko E. Rabies control in eastern Russian Ussuriysk region. WHO Rabies Bulletin Europe. 2008; 32 (1): 7-8.
Метлин А.Е. Молекулярно-биологические характеристики полевых изолятов и аттенуированных штаммов вируса бешенства: Дисс. … канд. вет. наук. Владимир; 2004.
Liu Y., Zhang S., Zhao J., Zhang F., Li N., Lian H. et al. Fox- and raccoon-dog-associated rabies outbreaks in northern China. Virol. Sin. 2014; 29 (5): 308-10.
Zhu H., Chen X., Shao X., Ba H., Wang F., Wang H. et al. Characterization of a virulent dog-originated rabies virus affecting more than twenty fallow deer (Dama dama) in Inner Mongolia, China. Infect. Genet. Evol. 2015; 31: 127-34.
Nadin-Davis S.A., Simani S., Armstrong J., Fayaz A., Wandeler A.I. Molecular and antigenic characterization of rabies viruses from Iran identifies variants with distinct epidemiological origins. Epidemiol. Infect. 2003; 131 (1): 777-90.
Pant G.R., Lavenir R., Wong F.Y., Larrous F., Bhatta D.R., Bourhy H. et al. Recent emergence and spread of an Arctic-related phylogenetic lineage of rabies virus in Nepal. PLoS Negl. Trop. Dis. 2013; 7 (11): e2560.

Дополнительные файлы

Доп. файлы

Действие

1. JATS XML

Скачать

Имя пользователя
Пароль
Запомнить меня

Забыли пароль?	Регистрация

Имя пользователя
Пароль
Запомнить меня

Забыли пароль?	Регистрация

Полный текст

Аннотация

Ключевые слова

Об авторах

М. Ю. Щелканов

А. А. Девяткин

В. Ю. Ананьев

Е. В. Фролов

И. Э. Домбровская

В. Г. Дедков

А. В. Ардашев

С. А. Коломеец

И. П. Короткова

Е. Н. Любченко

В. В. Бандеев

М. Н. Просянникова

И. В. Галкина

Е. С. Иванушко

Н. П. Емельянова

Н. И. Баранов

С. А. Ульянова

С. В. Арамилев

П. В. Фоменко

А. Л. Суровый

Н. А. Порошин

Н. Н. Сокол

Д. В. Маслов

Е. Е. Махиня

Г. А. Шипулин

Список литературы

Дополнительные файлы