Закономерности эпидемического распространения SARS-CoV-2 в условиях мегаполиса

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования - изучить закономерности, свойственные эпидемическому процессу COVID-19, в условиях мегаполиса, в фазах подъёма, стабилизации и снижения заболеваемости, а также оценить эффективность противоэпидемических мероприятий.

Материал и методы. Проведено комплексное изучение распространения SARS-CoV-2 в Москве с использованием эпидемиологического, молекулярно-генетического и статистического методов исследования в период пандемии COVID-19.

Результаты и обсуждение. Показано, что применение максимально жёстких организационно-ограничительных мер в масштабах Москвы, обеспечивающих разрыв механизма передачи SARS-CoV-2, и высокая дисциплина населения по исполнению режима самоизоляции позволили не допустить экспоненциального роста заболеваемости COVID-19. Анализ динамики выявления новых случаев COVID-19 показал, что эффект от применения мер по разобщению и режима самоизоляции в условиях мегаполиса наступает через временной промежуток, равный 3,5 инкубационного периода, при его максимальной длительности 14 дней. Установлено, что показатель частоты определения РНК SARS-CoV-2 среди условно здорового населения и его динамика - важные параметры мониторинга, особенно на фазах роста и стабилизации заболеваемости COVID-19, позволяющие в перспективе 1-2 инкубационных периодов (14-28 дней) прогнозировать развитие эпидемиологической ситуации. Общий коэффициент летальности, рассчитанный за период наблюдения (06.03.2020-23.06.2020) в Москве, составил 1,73%.

Заключение. В результате проведённого эпидемиологического анализа ситуации с COVID-19 в Москве определены некоторые закономерности распространения SARS-CoV-2 и оценена эффективность противоэпидемических мероприятий, направленных на разрыв механизма передачи возбудителя.

Об авторах

В. Г. Акимкин

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-4228-9044

Акимкин Василий Геннадиевич – доктор медицинских наук, акад. РАН, директор.

197101, Москва

Россия

С. Н. Кузин

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Автор, ответственный за переписку.
Email: drkuzin@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-0616-9777

Кузин Станислав Николаевич – доктор медицинских наук, профессор, зав. лаб. вирусных гепатитов .

197101, Москва

Россия

Т. А. Семененко

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6686-9011

Семененко Татьяна Анатольевна – доктор медицинских наук, профессор, руководитель отдела эпидемиологии.

123098, Москва



Россия

О. Ю. Шипулина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-4679-6772

Шипулина Ольга Юрьевна – кандидат медицинских наук, руководитель подразделения лабораторной медицины и продвижения лабораторных услуг отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии.

197101, Москва



Россия

С. Б. Яцышина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-4737-941X

Яцышина Светлана Борисовна – кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии.

197101, Москва

Россия

Е. В. Тиванова

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-1286-2612

Тиванова Елена Валерьевна – руководитель направления лабораторной медицины и продвижения лабораторных услуг отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии.

197101, Москва



Россия

А. В. Каленская

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-9126-1155

Каленская Анна Валентиновна – заместитель руководителя направления лабораторной медицины и продвижения лабораторных услуг по клиентскому сервису отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии.

197101, Москва



Россия

И. В. Соловьёва

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-3136-9500

Соловьёва Ирина Владимировна – руководитель группы обеспечения качества Клинико-диагностической лаборатории.

197101, Москва

Россия

М. А. Вершинина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8582-5199

Вершинина Марина Анатольевна – ведущий консультант по лабораторной медицине отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии.

197101, Москва



Россия

О. А. Квасова

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-4545-1804

Квасова Ольга Андреевна – врач-эпидемиолог лаборатории инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи.

197101, Москва

Россия

А. А. Плоскирева

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-3612-1889

Плоскирева Антонина Александровна – доктор медицинских наук, заместитель директора.

197101, Москва



Россия

М. В. Мамошина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-1419-7807

Мамошина Марина Васильевна – младший научный сотрудник отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии.

197101, Москва



Россия

М. А. Елькина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-4769-6781

Елькина Мария Александровна – младший научный сотрудник отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии.

197101, Москва



Россия

В. В. Клушкина

ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8311-8204

Клушкина Виталина Владимировна – кандидат медицинских наук, врач-эпидемилог лаборатории вирусных гепатитов.

197101, Москва Россия

Е. Е. Андреева

Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по г. Москве

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-6687-7276

Андреева Елена Евгеньевна – доктор медицинских наук, профессор, руководитель Управления Роспотребнадзора по г. Москве.

129626, Москва

Россия

А. В. Иваненко

ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в городе Москве»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-7122-017X

Иваненко Александр Валентинович – главный врач.

129626, Москва

Россия

Список литературы

  1. Lu R., Zhao X., Li J., Niu P., Yang B., Wu H., et al. Genomic characterization and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395(10224): 565-74. DOI: http://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8
  2. Romagnani P., Gnone G., Guzzi F., Negrini S., Guastalla A., Annun-ziato F., et al. The COVID-19 infection: lessons from the Italian experience. J. Public Health Policy. 2020; 41(3): 238-44. DOI: http://doi.org/10.1057/s41271-020-00229-y
  3. Sebastiani G., Massa M., Riboli E. Covid-19 epidemic in Italy: evolution, projections and impact of government measures. Eur. J. Epidemiol. 2020; 35(4): 341-5. DOI: http://doi.org/10.1007/s10654-020-00631-6
  4. Rothe C., Schunk M., Sothmann P., Bretzel G., Froeschl G., Wallrauch C., at al. Transmission of 2019-nCoV infection from an asymptomatic contact in Germany. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 970-1. DOI: http://doi.org/10.1056/NEJMc200146
  5. Holshue M.L., DeBolt C., Lindquist S., Lofy K.H., Wiesman J., Bruce H., et al. First case of 2019 novel coronavirus in the United States. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 929-36. DOI: http://doi.org/10.1056/NEJMoa2001191
  6. WHO. Coronavirus disease 2019 (COVID-19) Situation Report - 51. Available at: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200311-sitrep-51-covid-19.pdf
  7. Беляков В.Д., Дегтярев А.А., Иванников Ю.Г. Качество и эффективность противоэпидемических мероприятий. Л.: Медицина; 1981.
  8. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Шипулина О.Ю., Яцышина С.Б., Ти-ванова Е.В., Каленская А.В. и др. Эпидемиологическое значение определения РНК SARS-CoV-2 среди различных групп населения Москвы и Московской области в период эпидемии COVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020; 97(3): 197-201. DOI: http://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-197-201
  9. Lauer S.A., Grantz K.H., Bi Q., Jones F.K., Zheng Q., Meredith H.R., et al. The incubation period of coronavirus disease 2019 (Covid-19) from publicly reported confirmed cases: estimation and application. Ann. Intern. Med. 2020; 172(9): 577-82. DOI: http://doi.org/10.7326/ M20-0504
  10. Backer J.A., Klinkenberg D., Wallinga J. Incubation period of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) infections among travelers from Wuhan, China, 20-28 January 2020. Euro Surveill. 2020; 25(5) : 2000062. DOI: http://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.5.2000062
  11. Liu T., Hu J., Kang M., Lin L., Zhong H., Xiao J., et al. Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV). J. Med. Virol. 2020; 92(5): 501-11. DOI: http://doi.org/10.1101/2020.01.25.919787
  12. Read J.M., Bridgen J.R.E., Cummings D.A.T., Ho A., Jewell C.P. Novel coronavirus 2019-nCoV: early estimation of epidemiological parameters and epidemic predictions. medRxiv. 2020. DOI: http://doi.org/10.1101/2020.01.23.20018549
  13. Riou J., Althaus C.L. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020. Euro Surveill. 2020; 25(4): 2000058. DOI: http://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25A2000058.
  14. Shen M., Peng Z., Xiao Y., Zhang L. Modelling the epidemic trend of the 2019 novel coronavirus outbreak in China. bioRxiv. 2020. DOI: http://doi.org/10.1101/2020.01.23.916726
  15. Wu J.T., Leung K., Leung G.M. Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study. Lancet. 2020; 395(10225): 689-97. DOI: http://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30260-9
  16. Randolph H.E., Barreiro L.B. Herd Immunity: Understanding COVID-19. Immunity. 2020; 52(5): 737-41. DOI: http://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.04.012
  17. Verity R., Okell L.C., Dorigatti I., Winskill P., Whittaker C., Imai N., et al. Estimates of the severity of coronavirus disease 2019: a model-based analysis. Lancet Infect. Dis. 2020; 20(6): 669-77. DOI: http://doi.org/10.1016/S1473
  18. Wu J.T., Leung K., Bushman M., Kishore N., Niehus R., de Salazar P.M., et al. Estimating clinical severity of COVID-19 from the transmission dynamics in Wuhan, China. Nat. Med. 2020; 26(4): 506-10. DOI: http://doi.org/10.1038/s41591-020-0822-7-3099(20)30243-7
  19. Puca E., Civljak R., Arapovic J., Popescu C., Christova I., Raka L., et al. Short epidemiological overview of the current situation on Covid-19 pandemic in Southeast European (SEE) countries. J. Infect. Dev. Ctries. 2020; 14(5): 433-7. DOI: http://doi.org/10.3855/jidc.12814
  20. Abdollahi E., Champredon D., Langley J.M., Galvani A.P., Moghadas S.M. Temporal estimates of case-fatality rate for COVID-19 outbreaks in Canada and the United States. CMAJ. 2020; 192(25): E666-70. DOI: http://doi.org/10.1503/cmaj.200711
  21. Xu S., Li Y. Beware of the second wave of COVID-19. Lancet. 2020; 395(10233): 1321-2. DOI: http://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30845-X
  22. de Brouwer R., van Veldhuisen D.J., de Boer R.A. Surviving the first COVID-19 wave and learning lessons for the second. Eur. J. Heart Fail. 2020; 22(6): 975-7. DOI: http://doi.org/10.1002/ejhf.1938
  23. Vogel L. Is Canada ready for the second wave of COVID-19? CMAJ. 2020; 192(24): E664-5. DOI: http://doi.org/10.1503/cmaj.1095875
  24. Ceylan Z. Estimation of COVID-19 Prevalence in Italy, Spain, and France. Sci. Total Environ. 2020; 729: 138817. DOI: http://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.138817
  25. Li Q., Guan X., Wu P., Wang X., Zhou L., Tong Y., et al. Early transmission dynamics in Wuhan, China, of novel coronavirus-infected pneumonia. N. Engl. J. Med. 2020; 382(13): 1199-207. DOI: http://doi.org/10.1056/NEJMoa2001316
  26. Chatterjee A., Gerdes M.W., Martinez S.G. Statistical Explorations and Univariate timeseries analysis on COVID-19 datasets to understand the trend of disease spreading and death. Sensors (Basel). 2020; 20(11): 3089. DOI: http://doi.org/10.3390/s20113089
  27. Abdollahi E., Champredon D., Langley J.M., Galvani A.P., Moghadas S.M. Temporal estimates of case-fatality rate for COVID-19 outbreaks in Canada and the United States. CMAJ. 2020; 192(25): E666-70. DOI: http://doi.org/10.1503/cmaj.200711
  28. Львов Д.К., Альховский С.В. Истоки пандемии COVID-19: экология и генетика коронавирусов (Betacoronavirus: Coronaviridae) SARS-CoV, SARS-CoV-2 (подрод Sarbecovirus), MERS-CoV (подрод Merbecovirus). Вопросы вирусологии. 2020; 65(2): 62-70. DOI: http://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-2-62-70

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А., Шипулина О.Ю., Яцышина С.Б., Тиванова Е.В., Каленская А.В., Соловьёва И.В., Вершинина М.А., Квасова О.А., Плоскирева А.А., Мамошина М.В., Елькина М.А., Клушкина В.В., Андреева Е.Е., Иваненко А.В., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».