Вирус Эпштейна–Барр (Orthoherpesviridae: Lymphocryptovirus) у этносов России: распространенность типов ВЭБ (ВЭБ-1 и ВЭБ-2), варианты гена LMP1 и злокачественные опухоли

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Открытие двух типов вируса Эпштейна–Барр (ВЭБ) ‒ ВЭБ-1 и ВЭБ-2 ‒ стимулировало изучение их распространенности в популяциях и связи со злокачественными опухолями.

Цель исследования. Изучить персистенцию ВЭБ-1 и ВЭБ-2 среди этносов России, проанализировать ПЦР-продукты гена LMP1 в изолятах вируса и оценить вклад типов ВЭБ в заболеваемость злокачественными новообразованиями.

Материалы и методы. Изоляты ВЭБ, амплифицированные из смывов ротовой полости представителей республик Адыгея, Калмыкия, Татарстан и Московской области (МО), изучали методом гнездной ПЦР на принадлежность к ВЭБ-1 и ВЭБ-2. Ампликоны LMP1, полученные с помощью ПЦР в реальном времени из ДНК вирусных изолятов, подвергали классификации и секвенированию на автоматическом секвенаторе ДНК ABI PRISM 3100-Avant (США), а результаты секвенирования анализировали с помощью программ Chromas 230 и Vector NT (Invitrogen, США). Достоверность полученных данных оценивали с помощью статистических пакетов Statistica for Windows 10.0.

Результаты. Показатели распространенности ВЭБ-1 и ВЭБ-2 у представителей четырех этносов сравнивали с уровнями заболеваемости некоторыми опухолями у населения трех республик и МО. Доминирующая персистенция трансформирующего in vitro ВЭБ-1 у представителей Татарстана и МО коррелировала среди населения этих территорий с высокой заболеваемостью раком желудка и лимфомами. Напротив, преобладающее инфицирование не трансформирующим in vitro ВЭБ-2 представителей Адыгеи и обоими типами вируса примерно у одинакового процента представителей Калмыкии коррелировало с более низкой заболеваемостью вышеуказанными опухолями населения этих республик. Различия между показателями заболеваемости указанными новообразованиями в сравниваемых этнических популяциях были статистически недостоверными (р > 0,05). Обнаруженные варианты LMP1 не отражали ни уровень персистенции типов ВЭБ, ни частоту возникновения опухолей.

Заключение. Инфицированность этносов ВЭБ-1 и ВЭБ-2 может существенно различаться под влиянием разных факторов. Преобладание в популяции трансформирующего in vitro ВЭБ-1 не увеличивает заболеваемость опухолями за счет случаев, ассоциированных с доминирующим типом вируса.

Об авторах

Владимир Эдуардович Гурцевич

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: gurtsevitch-vlad-88@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1840-4364

д-р мед. наук, профессор, главный научный консультант лаборатории вирусного канцерогенеза, НИИ канцерогенеза ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Россия, 115478, г. Москва

Александра Кирилловна Лубенская

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Email: lubenskoy.96@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-3953-7449

научный сотрудник, лаборатория вирусного канцерогенеза, НИИ канцерогенеза ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Россия, 115478, г. Москва,

Наталья Борисовна Сенюта

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Email: nat.senyuta@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-8915-8274

канд. мед. наук, научный консультант лаборатории вирусного канцерогенеза, НИИ канцерогенеза ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Россия, 115478, г. Москва

Ксения Валерьевна Смирнова

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России; ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов»; ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова» Минздрава России

Email: skv.lab@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6209-977X

канд. биол. наук, заведующая лабораторией вирусного канцерогенеза, НИИ канцерогенеза ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, РУДН, ФГАОУ ВО «РНИМУ им. Н.И. Пирогова» Минздрава России

Россия, 115478, г. Москва; 117198, г. Москва; 117997, г. Москва

Список литературы

  1. Shannon-Lowe C., Rickinson A. The global landscape of EBV-associated tumors. Front. Oncol. 2019; 9: 713. https://doi.org/10.3389/fonc.2019.00713
  2. Graham B.S., Lynch D.T. Burkitt Lymphoma. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023.
  3. Tsao S.W., Tsang C.M., Lo K.W. Epstein-Barr virus infection and nasopharyngeal carcinoma. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2017; 372(1732): 20160270. https://doi.org/10.1098/rstb.2016.0270
  4. Bei J.X., Zuo X.Y., Liu W.S., Guo Y.M., Zeng Y.X. Genetic susceptibility to the endemic form of NPC. Chin. Clin. Oncol. 2016; 5(2): 15. https://doi.org/10.21037/cco.2016.03.11
  5. Su W.H., Hildesheim A., Chang Y.S. Human leukocyte antigens and Epstein–Barr virus-associated nasopharyngeal carcinoma: old associations offer new clues into the role of immunity in infection-associated cancers. Front. Oncol. 2013; 3: 299. https://doi.org/10.3389/fonc.2013.00299
  6. Rickinson A.B., Young L.S., Rowe M. Influence of the Epstein-Barr virus nuclear antigen EBNA 2 on the growth phenotype of virus-transformed B cells. J. Virol. 1987; 61(5): 1310–7. https://doi.org/10.1128/jvi.61.5.1310-1317.1987
  7. Romero-Masters J.C., Huebner S.M., Ohashi M., Bristol J.A., Benner B.E., Barlow E.A., et al. B cells infected with Type 2 Epstein–Barr virus (EBV) have increased NFATc1/NFATc2 activity and enhanced lytic gene expression in comparison to Type 1 EBV infection. PLoS Pathog. 2020; 16(2): e1008365. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008365
  8. Correa R.M., Fellner M.D., Alonio L.V., Durand K., Teyssié A.R., Picconi M.A. Epstein–Barr virus (EBV) in healthy carriers: Distribution of genotypes and 30 bp deletion in latent membrane protein-1 (LMP-1) oncogene. J. Med. Virol. 2004; 73(4): 583–8. https://doi.org/10.1002/jmv.20129
  9. Srivastava G., Wong K.Y., Chiang A.K., Lam K.Y., Tao Q. Coinfection of multiple strains of Epstein–Barr virus in immunocompetent normal individuals: reassessment of the viral carrier state. Blood. 2000; 95(7): 2443–5.
  10. Van Baarle D., Hovenkamp E., Kersten M.J., Klein M.R., Miedema F., van Oers M.H. Direct Epstein–Barr virus (EBV) typing on peripheral blood mononuclear cells: no association between EBV type 2 infection or superinfection and the development of acquired immunodeficiency syndrome-related non-Hodgkin’s lymphoma. Blood. 1999; 93(11): 3949–55.
  11. Sixbey J.W., Shirley P., Chesney P.J., Buntin D.M., Resnick L. Detection of a second widespread strain of Epstein–Barr virus. Lancet. 1989; 2(8666): 761–5. https://doi.org/10.1016/s0140-6736(89)90829-5
  12. Edwards R.H., Seillier-Moiseiwitsch F., Raab-Traub N. Signature amino acid changes in latent membrane protein 1 distinguish Epstein–Barr virus strains. Virology. 1999; 261(1): 79–95. https://doi.org/10.1006/viro.1999.9855
  13. Cheung S.T., Leung S.F., Lo K.W., Chiu K.W., Tam J.S., Fok T.F., et al. Specific latent membrane protein 1 gene sequences in type 1 and type 2 Epstein-Barr virus from nasopharyngeal carcinoma in Hong Kong. Int. J. Cancer. 1998; 76(3): 399–406. https://doi.org/10.1002/(sici)1097-0215(19980504)76:3<399::aid-ijc18>3.0.co;2-6
  14. Oshima M., Azuma H., Okuno A. High prevalence of Epstein-Barr virus type A strain with the 30 b.p. deletion of the latent membrane protein-1 gene in a Japanese population. Pediatr. Int. 1999; 41(5): 490–5. https://doi.org/10.1046/j.1442-200x.1999.01122.x
  15. Khanim F., Yao Q.Y., Niedobitek G., Sihota S., Rickinson A.B., Young L.S. Analysis of Epstein–Barr virus gene polymorphisms in normal donors and in virus-associated tumors from different geographic locations. Blood. 1996; 88(9): 3491–501.
  16. Смирнова К.В., Сенюта Н.Б., Ботезату И.В., Душенькина Т.Е., Лубенская А.К., Фроловская А.А. и др. Вирус Эпштейна–Барр у этнических татар: инфицированность и сиквенсные варианты онкогена LMP1. Успехи молекулярной онкологии. 2018; 5(3): 65–74. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2018-5-3-65-74 https://elibrary.ru/vloxpu
  17. Hahn P., Novikova E., Scherback L., Janik C., Pavlish O., Arkhipov V., et al. The LMP1 gene isolated from Russian nasopharyngeal carcinoma has no 30-bp deletion. Int. J. Cancer. 2001; 91(6): 815–21. https://doi.org/10.1002/1097-0215(200002)9999:9999<:aid-ijc1122>3.0.co;2-w
  18. Hassan R., White L.R., Stefanoff C.G., de Oliveira D.E., Felisbino F.E., Klumb C.E., et al. Epstein–Barr virus (EBV) detection and typing by PCR: a contribution to diagnostic screening of EBV-positive Burkitt’s lymphoma. Diagn. Pathol. 2006; 1: 17. https://doi.org/10.1186/1746-1596-1-17
  19. Salahuddin S., Khan J., Azhar J., B. Whitehurst C., Qadri I., Shackelford J., et al. Prevalence of Epstein–Barr Virus Genotypes in Pakistani Lymphoma Patients. Asian Pac. J. Cancer Prev. 2018; 19(11): 3153–9. https://doi.org/10.31557/APJCP.2018.19.11.3153
  20. Каприн А.Д., Старинский В.В., Шахзадова А.О., ред. Злокачественные новообразования в России в 2020 году (заболеваемость и смертность). М.; 2021.
  21. Young L.S., Yao Q.Y., Rooney C.M., Sculley T.B., Moss D.J., Rupani H., et al. New type B isolates of Epstein–Barr virus from Burkitt’s lymphoma and from normal individuals in endemic areas. J. Gen. Virol. 1987; 68(Pt. 11): 2853–62. https://doi.org/10.1099/0022-1317-68-11-2853

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Соотношение ВЭБ-1 и ВЭБ-2 в смывах полости рта представителей четырех этносов: адыгейцев, калмыков, татар и славян.

Скачать (375KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Показатели заболеваемости опухолями с ВЭБ-ассоциированными случаями среди населения республик Адыгея, Калмыкия, Татарстан и Московской области.

Скачать (547KB)
Метаданные

© Гурцевич В.Э., Лубенская А.К., Сенюта Н.Б., Смирнова К.В., 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».