Влияние пандемии COVID-19 на этиологию и тяжесть респираторных вирусных инфекций у детей

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Проанализировать вклад вирусов гриппа, респираторно-синцитиального вируса (РСВ), вируса SARS-CoV-2 и других возбудителей в развитие тяжелых острых респираторных инфекций (ТОРИ) у детей разных возрастных групп в зависимости от их этиологии и эпидемического периода.

Материалы и методы. Мониторинг ТОРИ проведен на протяжении 6 последовательных эпидемических сезонов, начиная с сезона 2018–2019 гг., в 9 стационарах трех городов России с определением тяжести болезни в зависимости от ее этиологии.

Результаты. В общей выборке доля детей, госпитализированных с лабораторно подтвержденным гриппом, в период 2018–2020 г. составляла 25,7–44,7%, с РСВ-инфекцией – 25,7–26,8%, но опустилась до 0,3 и 1,7% соответственно в разгар пандемии. В последующие 3 сезона 2021–2024 гг. лабораторно подтвержденный грипп среди детей регистрировали в 4,5–20,2% случаев, РСВ-инфекцию – в 13,4–24,1% со сменой подгрупп вируса. РСВ-инфекция была наиболее тяжелой в сезон 2022–2023 гг., протекая в ряде случаев с явлениями гипертермии, гипоксии, одышки и нарушением сознания. Среди госпитализированных детей доля больных COVID-19 в 2020–2021 гг. составила 0,8–2,4%, но увеличилась до 10,6–13,6% с появлением варианта Omicron в 2022 г. при снижении в последующие годы. Представлены основные генетические линии SARS-CoV-2, циркулировавшие в Российской Федерации.

Заключение. Вирусы гриппа и РСВ преобладали в структуре вирусных патогенов, выявленных у госпитализированных детей в возрасте до 2 лет включительно. Случаи COVID-19 у детей регистрировались редко, уступая по тяжести РСВ и риновирусной инфекции.

Об авторах

Анна Адольфовна Соминина

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: anna.sominina@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0001-9671-0629

д-р мед. наук, профессор, заведующая лабораторией изучения факторов риска при гриппе и ОРВИ

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Дарья Михайловна Даниленко

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: daria.baibus@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-6174-0836

канд. биол. наук, заместитель директора по научной работе, заведующая отделом этиологии и эпидемиологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Андрей Борисович Комиссаров

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: a.b.komissarov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-1733-1255

заведующий лабораторией молекулярной вирусологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Артем Викторович Фадеев

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: artem.fadeev@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0003-3558-3261

старший научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Ксения Сергеевна Комиссарова

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: kseniya.sintsova@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-1465-5548

научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Мария Михайловна Писарева

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: maria.pisareva@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-1499-9957

канд. биол. наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Тамила Даировна Мусаева

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: tamila.musaeva@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-3050-1936

младший научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Вероника Анатольевна Едер

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: veronika.eder@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-9970-3325

канд. биол. наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Татьяна Петровна Леванюк

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: tatyana.levanyuk@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0009-0003-6888-6848

едущий программист лаборатории изучения факторов риска при гриппе и ОРВИ

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Кирилл Александрович Столяров

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: kirill@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-1765-2799

ведущий программист лаборатории эпидемиологии гриппа и ОРЗ

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Вера Зорьевна Кривицкая

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: vera.kriv@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-9146-0816

д-р биол. наук, ведущий научный сотрудник лаборатории изучения факторов риска при гриппе и ОРВИ

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Екатерина Романовна Петрова

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: ekaterina.petrova@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0003-2258-4679

научный сотрудник лаборатории изучения факторов риска при гриппе и ОРВИ

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Ольга Ивановна Афанасьева

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: olga-afanaseva57@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1229-171X

д-р мед. наук, заведующая отделением РВИ у детей

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Вероника Сергеевна Тимонина

СПб ГБУЗ «Детская городская больница Святой Ольги»

Email: karina88888888@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-2887-0126

врач

Россия, 194156, г. Санкт-Петербург

Елена Викторовна Образцова

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: alorz@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-8762-6724

канд. мед. наук, старший научный сотрудник отделения РВИ у детей

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Екатерина Георгиевна Головачева

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России

Email: ekaterina.golovacheva@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-1934-7288

д-р мед. наук, старший научный сотрудник отделения РВИ у детей

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург

Елена Александровна Дондурей

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России; СПб ГБУЗ «Детская городская клиническая больница № 5 им. Н.Ф. Филатова»

Email: dondureyelena@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2382-9172

канд. мед. наук, старший научный сотрудник отделения РВИ у детей

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург; 192289, г. Санкт-Петербург

Евгения Викторовна Леленкова

ФБУН «Федеральный научно-исследовательский институт вирусных инфекций «Виром» Роспотребнадзора

Email: lelenkova_ev@eniivi.ru
ORCID iD: 0000-0003-2004-0977

врач-эпидемиолог

Россия, 620030, г. Екатеринбург

Ольга Григорьевна Курская

Научно-исследовательский институт вирусологии ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины»

Email: kurskaya09_@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1931-2026

канд. мед. наук, старший научный сотрудник лаборатории вирусологии

Россия, 630117, г. Новосибирск

Александр Михайлович Шестопалов

Научно-исследовательский институт вирусологии ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины»

Email: shestopalov2@ngs.ru
ORCID iD: 0000-0002-1880-8708

д-р биол. наук, профессор, директор

Россия, 630117, г. Новосибирск

Дмитрий Анатольевич Лиознов

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России; ФГБОУ «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова» Минздрава России

Email: dlioznov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3643-7354

д-р мед. наук, профессор, директор

Россия, 197022, г. Санкт-Петербург; 197022, г. Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Puig-Barberà J., Tormos A., Trushakova S., Sominina A., Pisareva M., Ciblak M.A., et al. The Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN): a new platform to describe the epidemiology of severe influenza. Influenza Other Respir. Viruses. 2015; 9(6): 277–86. https://doi.org/10.1111/irv.12335
  2. Puig-Barberà J., Mira-Iglesias A., Burtseva E., Cowling B.J., Serhat U., Ruiz-Palacios G.M., et al. Influenza epidemiology and influenza vaccine effectiveness during the 2015-2016 season: results from the Global Influenza Hospital Surveillance Network. BMC Infect. Dis. 2019; 19(1): 415. https://doi.org/10.1186/s12879-019-4017-0
  3. Baselga-Moreno V., Trushakova S., McNeil S., Sominina A., Nunes M.C., Draganescu A., et al. Influenza epidemiology and influenza vaccine effectiveness during the 2016–2017 season in the Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN). BMC Public Health. 2019; 19(1): 487. https://doi.org/10.1186/s12889-019-6713-5
  4. Puig-Barberà J., Tormos A., Sominina A., Burtseva E., Launay O., Ciblak M.A., et al. First-year results of the Global Influenza Hospital Surveillance Network: 2012-2013 Northern hemisphere influenza season. BMC Public Health. 2014; 14: 564. https://doi.org/10.1186/1471-2458-14-564
  5. Puig-Barberà J., Burtseva E., Yu H., Cowling B.J., Badur S., Kyncl J., et al. Influenza epidemiology and influenza vaccine effectiveness during the 2014–2015 season: annual report from the Global Influenza Hospital Surveillance Network. BMC Public Health. 2016; 16(Suppl. 1): 757. https://doi.org/10.1186/s12889-016-3378-1
  6. Simon B., Pichon M., Valette M., Burfin G., Richard M., Lina B., et al. Whole genome sequencing of A(H3N2) influenza viruses reveals variants associated with severity during the 2016–2017 season. Viruses. 2019; 11(2): 108. https://doi.org/10.3390/v11020108
  7. WHO. Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2024–2025 northern hemisphere influenza season; 2024. Available at: https://who.int/news/item/23-02-2024-recommendations-announced-for-influenza-vaccine-composition-for-the-2024-2025-northern-hemisphere-influenza-season
  8. WHO. Global influenza strategy 2019–2030; 2019. Available at: https://who.int/publications/i/item/9789241515320
  9. Соминина А.А., Даниленко Д.М., Комиссаров А.Б., Писарева М.М., Мусаева Т.Д., Столяров К.А. и др. Изменения в этиологической инфраструктуре тяжелых острых респираторных вирусных инфекций у детей и взрослых под влиянием пандемии СOVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024; 101(3): 327–41. https://doi.org/10.36233/0372-9311-532
  10. Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Воронина О.Л., Игнатьева А.В., Мукашева Е.А., Панова А.Д. и др. Особенности циркуляции возбудителей ОРВИ на фоне появления и широкого распространения SARS-CoV-2 в 2018–2021 годы. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2022; 21(4): 16–25. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-4-16-26 https://elibrary.ru/rnyfoi
  11. Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Панова А.Д., Мукашева Е.А., Краснослободцев К.Г., Кириллова Е.С. и др. Свойства вирусов гриппа, вызвавших эпидемические подъемы заболеваемости в России и странах мира в 2022-2023 гг. Эффективность вакцинопрофилактики. Вопросы вирусологии. 2024; 69(1): 42–55. https://doi.org/10.36233/0507-4088-211
  12. Соминина А.А., Даниленко Д.М., Столяров К.А., Карпова Л.С., Бакаев М.И., Леванюк Т.П. и др. Интерференция SARS-CoV-2 с другими возбудителями респираторных вирусных инфекций в период пандемии. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021; 20(4): 28–139. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-4-28-39 https://elibrary.ru/cdrnsj
  13. Olsen S.J., Azziz-Baumgartner E., Budd A.P., Brammer L., Sullivan S., Pineda R.F., et al. Decreased influenza activity during the COVID-19 pandemic – United States, Australia, Chile, and South Africa, 2020. MMWR Morb. Mortal. Wkly Rep. 2020; 69(37): 1305–9. https://doi.org/10.15585/mmwr.mm6937a6
  14. Adlhoch C., Mook P., Lamb F., Ferland L., Melidou A., Amato-Gauci A.J., et al. Very little influenza in the WHO European Region during the 2020/21 season, weeks 40 2020 to 8 2021. Euro Surveill. 2021; 26(11): 2100221. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.11.2100221
  15. Meslé M.M.I., Sinnathamby M., Mook P., Pebody R., Lakhani A., Zambon M., et al. Seasonal and inter-seasonal RSV activity in the European Region during the COVID-19 pandemic from autumn 2020 to summer 2022. Influenza Other Respir. Viruses. 2023; 17(11): e13219. https://doi.org/10.1111/irv.13219
  16. Sominina A., Danilenko D., Komissarov A.B., Pisareva M., Fadeev A., Konovalova N., et al. Assessing the intense influenza A(H1N1)pdm09 epidemic and vaccine effectiveness in the post-COVID season in the Russian Federation. Viruses. 2023; 15(8): 1780. https://doi.org/10.3390/v15081780
  17. Cohen L.E., Hansen C.L., Andrew M.K., McNeil S.A., Vanhems P., Kyncl J., et al. Predictors of severity of influenza-related hospitalizations: results from the Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN). J. Infect. Dis. 2024; 229(4): 999–1009. https://doi.org/10.1093/infdis/jiad303
  18. Карпова Л.С., Волик К.М., Столяров К.А., Поповцева Н.М., Столярова Т.П., Соминина А.А. и др. Особенности эпидемического процесса при гриппе A(H1N1)pdm09 и A(H3N2) в России с 2009 по 2017 г. Вопросы вирусологии. 2018; 63(4): 177–84. https://doi.org/10.18821/0507-4088-2018-63-4-177-184 https://elibrary.ru/ymvmwl
  19. Попова А.Ю., Смирнов В.С., Егорова С.А., Дрозд И.В., Миличкина А.М., Дашкевич А.М. и др. Закономерности в развитии коллективного иммунитета к SARS-CoV-2 в ходе пандемии COVID-19. Медицинская иммунология. 2023; 25(4): 759–66. https://doi.org/10.15789/1563-0625-PIT-2867
  20. Кривицкая В.З., Синцова К.С., Петрова Е.Р., Сверлова М.В., Сорокин Е.В., Царева Т.Р. и др. Генетическая и антигенная характеристика штаммов респираторно-синцитиального вируса, выделенных в Санкт-Петербурге в 2013–2016 гг. Вопросы вирусологии. 2017; 62(6): 273–82. https://doi.org/10.18821/0507-4088-2017-62-6-273-282 https://elibrary.ru/zuqevd
  21. Schobel S.A., Stucker K.M., Moore M.L., Anderson L.J., Larkin E.K., Shankar J., et al. Respiratory Syncytial Virus whole-genome sequencing identifies convergent evolution of sequence duplication in the C-terminus of the G gene. Sci. Rep. 2016; 6: 26311. https://doi.org/10.1038/srep26311
  22. Rosas-Salazar C., Chirkova T., Gebretsadik T., Chappell J.D., Peebles R.S. Jr., Dupont W.D., et al. Respiratory syncytial virus infection during infancy and asthma during childhood in the USA (INSPIRE): a population-based, prospective birth cohort study. Lancet. 2023; 401(10389): 1669–80. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(23)00811-5
  23. Gilbert B.E., Patel N., Lu H., Liu Y., Guebre-Xabier M., Piedra P.A., et al. Respiratory syncytial virus fusion nanoparticle vaccine immune responses target multiple neutralizing epitopes that contribute to protection against wild-type and palivizumab-resistant mutant virus challenge. Vaccine. 2018; 36(52): 8069–78. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2018.10.073
  24. Sun M., Lai H., Na F., Li S., Qiu X., Tian J., et al. Monoclonal antibody for the prevention of respiratory syncytial virus in infants and children: a systematic review and network meta-analysis. JAMA Netw. Open. 2023; 6(2): e230023. https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2023.0023

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Основные генетические линии SARS-CoV-2 (по классификации Pangolin), циркулировавшие в Российской Федерации в 2020–2024 гг. у детей в возрасте 0–17 лет. По оси ординат – процент данной линии от общего числа секвенированных в этом квартале последовательностей SARS-CoV-2; по оси абсцисс – год и квартал исследований. n ≤ 5 – совокупность разных линий варианта Omicron, частота каждой из которых не превышала 5% в общей структуре выделенных вариантов.

Скачать (303KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Возрастные отличия в этиологии ТОРИ у детей, госпитализированных в общие отделения для ОРВИ (ОТД) и в Отделения интенсивной терапии и реанимации (ОРИТ) за 6-летний период наблюдений. По оси ординат – частота обнаружения данного возбудителя в процентах от общего числа обследованных детей указанной возрастной группы, по оси абсцисс – сезоны.

Скачать (811KB)
Метаданные

© Соминина А.А., Даниленко Д.М., Комиссаров А.Б., Фадеев А.В., Комиссарова К.С., Писарева М.М., Мусаева Т.Д., Едер В.А., Леванюк Т.П., Столяров К.А., Кривицкая В.З., Петрова Е.Р., Афанасьева О.И., Тимонина В.С., Образцова Е.В., Головачева Е.Г., Дондурей Е.А., Леленкова Е.В., Курская О.Г., Шестопалов А.М., Лиознов Д.А., 2025

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».