Миссенс-мутация 1234C>T гена TOLL-подобного рецептора 3 при неспецифическом язвенном колите

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Поддержание кишечного гомеостаза – процесс динамического взаимодействия иммунной системы макроорганизма и местной микробиоты. Нарушенный иммунный ответ, генетическая предрасположенность и изменения в составе микробиоты приводят к хроническому воспалению в кишечнике, что является основой для развития иммунопатологии ВЗК. Резидентные кишечные вирусы также обладают иммуномодулирующим действием при ВЗК. Toll-подобные рецепторы, распознающие PAMPs, проникающие через кишечный барьер, важное звено воспалительного процесса при неспецифическом язвенном колите. Вирусная двухцепочечная РНК распознается TLR3 на эндосомах. Нашей целью было выявить ассоциацию аллелей, генотипов гена TLR3 и его гаплотипов, образованных с генами TLR2, TLR1, TLR6, с НЯК в популяции русских Челябинской области. В исследуемые группы вошли 96 пациентов больных НЯК и 86 условно здоровых лиц. ДНК было выделено из цельной крови колоночным методом, полиморфные участки генов амплифицировались методом аллель-специфической ПЦР и ПДРФ, продукты амплификации детектировались электрофорезом в 3%-ном агарозном геле с УФ-визуализацией. Был протипирован SNP 1234C>T (Leu412Phe) в гене TLR3. Оценка параметров неравновесного сцепления проводилась для указанного SNP TLR3 и SNP 1805T>G (Ser602Ile) в гене TLR1, 2258G>A (Arg753Gln) в гене TLR2, 745C>T (Ser249Pro) в гене TLR6. Анализ распределения частот встречаемости аллелей и генотипов SNP 1234C>T TLR3 показал статистически значимое повышение частоты мутантного аллеля T (p = 0,019; OR = 1,72; 95% ДИ: 1,09-2,71) и гомозиготного генотипа TT в группе больных НЯК (p = 0,011; OR = 4,72; 95% ДИ: 1,31-17,05). В результате оценки параметров неравновесного сцепления обнаружено два гаплотипа, которые могут быть факторами предрасположенности к НЯК. Это гаплотип 1234*T ~ 2258*A, образованный сцеплением мутантных аллелей SNPs 1234C>T TLR3 и 2258G>A TLR2 (р = 0,006; OR = 12,42; 95% ДИ: 1, 61-95, 97), а также гаплотип 1234*T ~ 1805*T, образованный сцеплением мутантного аллеля SNP 1234C>T TLR3 с предковым аллелем SNP 1805T>G TLR1 (р = 0,009; OR = 2,94; 95% ДИ: 1,35-6,42).

Об авторах

Эльвира Айдаровна Абубакирова

ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет»

Автор, ответственный за переписку.
Email: alveera@mail.ru

аспирант кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии биологического факультета

Россия, г. Челябинск

Дарья Сергеевна Сташкевич

ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет»

Email: alveera@mail.ru

к.б.н., доцент, декан биологического факультета

Россия, г. Челябинск

Александр Викторович Евдокимов

ФГБОУ ВО «Челябинский государственный университет»

Email: alveera@mail.ru

к.б.н., доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии биологического факультета

Россия, г. Челябинск

Список литературы

  1. Cario E., Podolsky D.K. Differential alteration in intestinal epithelial cell expression of toll-like receptor 3 (TLR3) and TLR4 in inflammatory bowel disease. Infect. Immun., 2000, Vol. 68, no. 12, pp. 7010-7017.
  2. Carriere J., Darfeuille-Michaud A., Nguyen H.T. Infectious etiopathogenesis of Crohn’s disease. World J. Gastroenterol., 2014, Vol. 20, no. 34, pp. 12102-12117.
  3. Fenton C.G., Taman H., Florholmen J., Sørbye S.W., Paulssen R.H. Transcriptional signatures that define ulcerative colitis in remission. Inflamm. Bowel Dis., 2021, Vol. 27, no. 1, pp. 94-105.
  4. Pierik M., Joossens S., van Steen K., van Schuerbeek N., Vlietinck R., Rutgeerts P., Vermeire S. Toll-Like receptor-1, -2, and -6 polymorphisms influence disease extension in inflammatory bowel diseases. Inflamm. Bowel Dis., 2006, Vol. 12, pp. 1-8.
  5. Silva M.J.A., Silva C.S., da Silva Vieira M.C., dos Santos P.A.S., Frota C.C., Lima K.V.B., Lima L.N.G.C. The relationship between TLR3 rs3775291 polymorphism and infectious diseases: a meta-analysis of case-control studies. Genes, 2023, Vol. 14, 1311. doi: 10.3390/genes14071311.
  6. Tan Y., Zou Kf., Qian W., Chen S., Hou Xh. Expression and implication of toll-like receptors TLR2, TLR4 and TLR9 in colonic mucosa of patients with ulcerative colitis. J. Huazhong Univ. Sci. Technol. (Med. Sci.), 2014, Vol. 34, pp. 785-790.
  7. Török H.P., Bellon V., Konrad A., Lacher M., Tonenchi L., Siebeck M., Brand S., de Toni E. Functional Toll-Like Receptor (TLR)2 polymorphisms in the susceptibility to inflammatory bowel disease. PLoS One, 2017, Vol. 12, no. 4, e0175180. doi: 10.1371/journal.pone.0175180.
  8. Wang H., Zhou S., Zhang J., Lei S., Zhou J. Correlations between TLR polymorphisms and inflammatory bowel disease: a meta-analysis of 49 case-control studies. Immunol. Res., 2019, Vol. 67, pp. 142-150.
  9. Yang J.Y., Kim M.S., Kim E., Cheon J.H., Lee Y.S., Kim Y., Lee S.H., Seo S.U., Shin S.H., Choi S.S., Kim B., Chang S.Y., Ko H.J., Bae J.W., Kweon M.N. Enteric viruses ameliorate gut inflammation via Toll-like receptor 3 and Toll-like receptor 7-mediated interferon-β production. Immunity, 2016, Vol. 44, no. 4, pp. 889-900.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Абубакирова Э.А., Сташкевич Д.С., Евдокимов А.В., 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».