The risks of cholera importation and the forecasting system in epidemiological surveillance in the Russian Federation

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Background: The risks of cholera importation into Russia are determined by the intensity of the epidemic process in endemic countries of Southeast Asia, the Eastern Mediterranean, and Africa. The assessment of risk factors for cholera importation and spread forms the basis of the risk-oriented methodology in proactive epidemiological surveillance, which ensures timely forecasting of the epidemiological situation, preparedness, and rapid response in case of its deterioration, as well as the prevention of severe consequences.

Aim: To assess the effectiveness of proactive epidemiological surveillance of cholera in Russia in 2023–2024.

Materials and methods: a risk-oriented approach was employed, based on the systematic collection of official data on global cholera incidence from sources such as the Weekly Epidemiological Record (WHO), official and regional WHO websites, internet resources including ProMED-mail post, ECDC, and other platforms. The study adhered to regulatory documents issued by the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing for 2023–2024 and utilized operational epidemiological analysis data from the Reference Center for Cholera Monitoring in Russia. Whole-genome sequencing (WGS) and genome assembly were conducted on the MiSeq (Illumina) platform, and genetic determinants were identified in WGS data using BioEdit 7.2.5 and BLASTN 2.2.29. Statistical data processing was performed using the StatSoft STATISTICA 6.1.478 Russian software.

Results: A comprehensive analysis of global cholera incidence data was conducted, providing a realistic forecast of the risks of cholera importation into Russia in 2023. The epidemic preparedness of Rospotrebnadzor and the Ministry of Health of Russia was assessed, followed by a prompt response to two imported cholera cases detected in Tambov region and Moscow in 2023, both originating from India. Timely identification of these cases, including genomic and phylogenetic characterization of the pathogens, was achieved. Infection foci were localized and eliminated, preventing further spread. Cholera monitoring in Russia continued throughout 2024, with preventive measures implemented to minimize the risks of cholera importation and spread.

Conclusions: The analysis of the 2023–2024 monitoring results demonstrated the effectiveness of the proactive epidemiological surveillance system, which relies on early identification of cholera importation risks and their precursors, forecasting, rapid response to potential complications in epidemiological situation, and control of objects and factors contributing to infection spread. The epidemiological stability regarding cholera in Russia was ensured.

About the authors

Isabella V. Savina

Rostov-on-Don Plague Control Researsh Institute

Author for correspondence.
Email: bella.moiseenko@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-6825-1135
SPIN-code: 5466-4980
Russian Federation, Rostov-on-Don

Vladimir D. Kruglikov

Rostov-on-Don Plague Control Researsh Institute

Email: kruglikov_vd@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-6540-2778
SPIN-code: 9767-2936

MD, Dr. Sci. (Medicine)

Russian Federation, Rostov-on-Don

Natalia E. Gayevskaya

Rostov-on-Don Plague Control Researsh Institute

Email: gaevskaya_ne@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-0762-3628
SPIN-code: 3143-4788

MD, Cand. Sci. (Medicine)

Russian Federation, Rostov-on-Don

Elena V. Monakhova

Rostov-on-Don Plague Control Researsh Institute

Email: monakhova_ev@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-9216-7777
SPIN-code: 3091-5680

MD, Dr. Sci. (Medicine)

Russian Federation, Rostov-on-Don

Alexey S. Vodopyanov

Rostov-on-Don Plague Control Researsh Institute

Email: vodopyanov_as@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-9056-3231
SPIN-code: 7319-3037

MD, Cand. Sci. (Medicine)

Russian Federation, Rostov-on-Don

Alexey K. Noskov

Rostov-on-Don Plague Control Researsh Institute

Email: noskov-epid@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-0550-2221
SPIN-code: 5378-3729

MD, Cand. Sci. (Medicine)

Russian Federation, Rostov-on-Don

References

  1. World Health Organization. Cholera, 2017. Weekly Epidemiological Record. 2018;93(38):489–500. Available from: https://iris.who.int/handle/10665/274654 Accessed: 15 Jun 2024.
  2. World Health Organization. Cholera, 2022. Weekly Epidemiological Record. 2023;98(38):431–452. Available from: https://iris.who.int/handle/10665/372986 Accessed: 15 Jun 2024.
  3. Makareiko NV. Risk-oriented approach in the implementation of control and supervision. Juridical techniques. 2019;(13):225–229. EDN: PPZLDF
  4. MUC 4.2.3745-22 “Metody laboratornoi diagnostiki kholery” (approved by the Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare on May 12, 2022). Available from: https://base.garant.ru/404729197/?ysclid=m7jeadl9qt514379224 Accessed: 15 Jun 2014. (In Russ.)
  5. MUC 4.2.4062-24 “Izmeneniya № 1 v MUK 4.2.3746-22 “Organizatsiya i provedenie laboratornoi diagnostiki kholery v laboratoriyakh razlichnogo urovnya””, (approved by the Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare on September 27, 2024). Available from: http://35.rospotrebnadzor.ru/Default.aspx?mnu=36983034eed44e1abfa31494cbc5ddf5 Accessed: 15 Jun 2024. (In Russ.)
  6. MUC 4.2.4030-24 “Izmeneniya № 1 v MUK 4.2.3745-22 “Metody laboratornoi diagnostiki kholery”” (approved by the Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare on May 31, 2024). Available from: https://fbu3hmao.ru/2024/pdf/met/MUK-4.2.4030_24.pdf Accessed: 15 Jun 2024. (In Russ.)
  7. MUC 4.2.3746-22 “Organizatsiya i provedenie laboratornoi diagnostiki kholery v laboratoriyakh razlichnogo urovnya. 4.2. Metody kontrolya. Biologicheskie i mikrobiologicheskie faktory” (approved by the Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare on May 12, 2022). Available from: https://docs.cntd.ru/document/350414419 Accessed: 15 Jun 2024. (In Russ.)
  8. Titova SV, Monakhova EV, Alekseeva LP, Pisanov RV. Molecular genetic basis of biofilm formation as a component of Vibrio cholera persistence in water reservoirs of Russian Federation. Ecological Genetics. 2018;16(4):23–32. doi: 10.17816/ecogen16423-32
  9. Resolution of the Chief State Sanitary Doctor of the Russian Federation dated 05/24/2023 No. 7 “O dopolnitel’nykh merakh po profilaktike kholery v Rossiiskoi Federatsii”. Available from: http://publication.pravo.gov.ru/document/0001202306230008 Accessed: 15 Jun 2024. (In Russ.)
  10. Popova AYu, Noskov AK, Ezhlova EB, et al. Retrospective analysis of the cholera situation in the Donbass region, Zaporozhye and Kherson regions. Public Health and Life Environment. 2023;31(11):82–93. (In Russ.) doi: 10.35627/2219-5238/2023-31-11-82-93
  11. Noskov AK, Kruglikov VD, Moskvitina EA, et al. Cholera: analysis and assessment of epidemiological situation around the world and in Russia (2013–2022). Forecast for 2023. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2023;(1):56–66. (In Russ.) doi: 10.21055/0370-1069-2023-1-56-66
  12. Africa CDC Weekly Event Based Surveillance Report, November. 2024. Available from: https://africacdc.org/download/africa-cdc-weekly-event-based-surveillance-report-november-2024/ Accessed: 15 Jun 2024.
  13. Afghanistan: Infectious Disease Outbreaks — Epidemiological Week #43 (20–26 Oct 2024). Situation Report #43. Available from: https://reliefweb.int/report/afghanistan/afghanistan-infectious-disease-outbreaks-epidemiological-week-43-20-26-oct-2024-situation-report-43 Accessed: 15 Jun 2024.
  14. Communicable disease threats report, 19–25 October 2024, week 43. Available from: https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/communicable-disease-threats-report-week-43-2024.pdf Accessed: 15 Jun 2024.
  15. Monakhova EV, Ghosh A, Mutreja A, et al. Endemic cholera in India and imported cholera in Russia: What is common? Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;(3):17–26. doi: 10.21055/0370-1069-2020-3-17-26
  16. Men’shikova YeA, Arkhangel’skaya IV, Levchenko DA, et al. Influence of temperature fluctuations of water from surface reservoirs of the city of Rostov-on-Don on the circulation of Vibrio cholera. Vestnik biotekhnologii i fiziko-khimicheskoi biologii im. Yu.A. Ovchinnikova. 2018;4(4):14–20. EDN: UYCSKY
  17. Kurbatova EM, Menshikova EA, Arkhangelskaya IV, et al. Features of seasonal circulation of Vibrio cholerae in surface water bodies of Rostov-on-Don. Bacteriology. 2019;4(2):21–26. doi: 10.20953/2500-1027-2019-2-21-26
  18. Popova AYu, Noskov AK, Ezhlova EB, et al. Epidemiological situation on cholera in the Russian Federation in 2023 and forecast for 2024. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2024;(1):76–88. (In Russ.) doi: 10.21055/0370-1069-2024-1-76-88

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2. Fig. 1. Multifactorial information monitoring of biological threats to cholera. ES – emergency situation.

Download (1MB)
3. Fig. 2. Cholera forecast, risk realization and counteraction to biological threats in the territory of the Russian Federation.

Download (1MB)
4. Fig. 3. Genomic monitoring, bioinformatics and IT technologies in the work of the Reference Center for Cholera Monitoring in the Russian Federation. API — anti-plague institution.

Download (1MB)
5. Fig. 4. Dendrogram constructed based on SNP analysis of sequences of non-toxigenic strains of Vibrio choleraе O1 isolated from surface water bodies in the constituent entities of the Russian Federation from 2005 to 2023. Strains isolated in 2023 are indicated by a bold outline.

Download (1MB)
6. Fig. 5. Comparative dynamics of Vibrio cholerae O1 strain isolation in the Russian Federation by calendar weeks. Average annual value is the value for 13 years.

Download (763KB)

Copyright (c) 2024 Eco-vector


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».