il 28B polymorphisms and the prognosis for the efficacy of antiviral therapy in viral hepatitis C patients in Uzbekistan


如何引用文章

全文:

详细

Introduction: By means of the Association for the Study of complete genome there was identified the prognostic value of polymorphisms associated with single-nucleotide substitutions (SNP) in the human genome and located in the region of the gene IL28B/IFN-L3. Hereafter also there were identified SNP in the gene IFN-L4 and there was found a correlation between the population and the spontaneous elimination of HCV infection. Methods: In the studies there was used the materialfrom 135 HCV-infected persons residing on the territory of Uzbekistan. DNA was isolated from peripheral blood mononuclear cells (PBMC), then SNP genotyping of the IFN-L3 gene region (rs8099917, rs12979860) was performed by means of three methods: Invader Plus Assay, TaqMan Assay and direct sequencing. The plot of the IFN-L4 gene (ss469415590) was sequenced. Results: Out of the 135 studied patients, who received antiviral treatment according to the standard scheme Peg-IFN-a in combination with RBVfor 24 and 48 weeks, 87,4% were belonged to the Central Asian (CA) ethnic group and 12.6% - Eastern European (EE). Among the examined cases, there no virological response to antiviral therapy was observed in 21.2% of patients from CA group and 35.3% of EE patients (p <0.32). High association of SNP rs12979860 was observed in the testing of all samples with sustained antiviral response to the therapy (OR, 5.2; 95% CI, 1.9 - 14.6; p <0.004), but the SNP rs8099917 showed a high prognostic significance only in the CA group (OR, 6.9; 95 % CI, 2.6 - 18.0; p <0.002). Allele frequencies IFNL4 SNP rs469415590 were met similarly to SNP rs12979860 in the all studied samples. Conclusions: For the prediction of the outcome ofantiviral therapy in viral hepatitis C among populations of Central Asia, SNP regions and genes IFNL3IFNL4 can be used as markers of genetic factors.

作者简介

D. Sekler

Scientific Research Institute of Virology

Email: dildora@gmail.com
канд. мед. наук, ст. науч. сотрудник, руководитель группы в проекте «Определение резистентности к препаратам АРВТ у ВИЧ-инфицированных» 7, Yangi Shahar street, Yunusabad community, Yunusabad district, Tashkent, Uzbekistan, 100133

D. Khudayberganova

Scientific Research Institute of Virology

Email: mail2dinara@gmail.com
стажер-исследователь 7, Yangi Shahar street, Yunusabad community, Yunusabad district, Tashkent, Uzbekistan, 100133

R. Latypov

Scientific Research Institute of Virology

Email: renatlatip@gmail.com
зам. директора по научно-исследовательской работе 7, Yangi Shahar street, Yunusabad community, Yunusabad district, Tashkent, Uzbekistan, 100133

G. Usmanova

Scientific Research Institute of Virology

зав. отд-нием гепатологии 7, Yangi Shahar street, Yunusabad community, Yunusabad district, Tashkent, Uzbekistan, 100133

M. Rakhmanov

Scientific Research Institute of Virology

канд. мед. наук, зам. гл. врача клиники 7, Yangi Shahar street, Yunusabad community, Yunusabad district, Tashkent, Uzbekistan, 100133

E. Musabaev

Scientific Research Institute of Virology

Email: drmusabaev@rambler.ru
доктор мед. наук, проф., директор НИИ вирусологии 7, Yangi Shahar street, Yunusabad community, Yunusabad district, Tashkent, Uzbekistan, 100133

参考

  1. Hanafiah K.M., Groeger J., Flaxman A.D., Wiersma S.T. Global epidemiology of hepatitis C virus infection: New estimates of age-specific antibody to hepatitis C virus seroprevalence. Hepatology. 2013; 57: 1333-42.
  2. Bernhardt S., Rutter K., Stattermayer A. 1 F., Ferenci P. Revisiting the predictors of a sustained virologic response in the era of direct-acting antiviral therapy for hepatitis C virus. Clin. Infect. Dis. 2013; 56: 118-22.
  3. Ghany M.G., Strader D.B., Thomas D.L., Seeff L.B. Diagnosis, management,and treatment of hepatitis C: an update. Hepatology. 2009; 49: 1335-74.
  4. Tanaka Y., Nishida N., Sugiyama M., Tokunaga K., Mizokami M. lambda- interferons and the single nucleotide polymorphisms: A milestone to tailor-made therapy for chronic hepatitis C. Hepatol. Res. 2010; 40: 449-60.
  5. Hayes C.N., Imamura M., Aikata H., Chayama K. Genetics of IL28B and HCV-response to infection and treatment. Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol 2012; 9: 406-17.
  6. Hayes C.N., Kobayashi M., Akuta N., Suzuki F., Kumada H. et al. HCV substitutions and IL28B polymorphisms on outcome of peg-interferon plus ribavirin combination therapy. Gut. 2011; 60: 261-7.
  7. Ge D., Fellay J., Thompson A.J., Simon J.S., Shianna K.V. et al. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatmentinduced viral clearance. Nature. 2009; 461: 399-401.
  8. Suppiah V., Moldovan M., Ahlenstiel G., Berg T., Weltman M. et al. IL28B is associated with response to chronic hepatitis C interferon-alpha and ribavirin therapy. Nat. Genet. 2009; 41: 1100-4.
  9. Tanaka Y., Nishida N., Sugiyama M., Kurosaki M., Matsuura K. et al. Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-alpha and ribavirin therapy for chronic hepatitis C. Nat. Genet. 2009; 41: 1105-9.
  10. Rauch A., Kutalik Z., Descombes P.1., Cai T., Di Iulio J. et al. Genetic variation in IL28B is associated with chronic hepatitis C and treatment failure: a genome wide association study. Gastroenterology. 2010; 138: 1337-8.
  11. Prokunina-Olsson L., Muchmore B., Tang W., Pfeiffer R.M., Park H. et al. A variant upstream of IFNL3 (IL28B) creating a new interferon gene IFNL4 is associated with impaired clearance of hepatitis C virus. Nat. Genet. 2013; 45: 164-71.
  12. Clark P.J., Thompson A.J., McHutchison J.G. IL28B genomicbased treatment paradigms for patients with chronic hepatitis C infection: the future of personalized HCV therapies. Am. J. Gastroenterol. 2011; 106: 38-45.
  13. Clark P.J., Thompson A.J. Host genomics and HCV treatment response. J. Gastroenterol. Hepatol. 2012; 27: 212-22.
  14. Stattermayer A.F., Strassl R., Maieron A., Rutter K., Stauber R. et al. Polymorphisms of interferon-74 and IL28B - effects on treatment response to interferon/ribavirin in patients with chronic hepatitis C. Aliment. Pharmacol. Ther. 2014; 39: 104-11.
  15. Covolo L., Bibert S., Donato F., Bochud P.-Y., Lagging M. et al. The novel ss469415590 variant predicts virological response to therapy in patients with chronic hepatitis C virus type 1 infection. Aliment. Pharmacol. Ther. 2013; 1-9.
  16. Franco S., Aparicio E., Parera M., Clotet B., Tural C. et al. IFNL4 ss469415590 variant is a better predictor than ILF3 (IL28B) rs12979860 of pegylated interferon-alpha/ribavirin therapy failure in hepatitis C virus/HIV-1 coinfected patients. AIDS. 2013; 131-6.
  17. Kramer B., Nischalke H.D., Boesecke 1 C., Ingiliz P., Voigt E. et al. Variation in IFNL4 genotype and response to interferon-based therapy of hepatitis C in HIV positive patients with acute and chronic hepatitis C. AIDS. 2013; 6: 27-9.
  18. Bibert S., Roger T., Calandra T., Bochud M., Cerny A. et al. IL28B expression depends on a novel TT/-G polymorphism which improves HCV clearance prediction. J. Exp. Med. 2013; 210: 1109-16.
  19. Nozawa Y., Umemura T., Katsuyama Y., Shibata S., Kimura T. et al. Genetic polymorphism in IFNL4 and response to pegylated interferon-a and ribavirin in Japanese chronic hepatitis C patients. Tissue. Antigens. 2014; 83: 45-8.
  20. Fujino H., Imamura M., Nagaoki Y., Kawakami Y., Abe H. et al Predictive value of the IFNL4 polymorphism on outcome of telaprevir, peginterferon, and ribavirin therapy for older patients with genotype 1b chronic hepatitis C. J. Gastroenterol. 2013.
  21. Ruzibakiev R., Kato H., Ueda R., Yuldasheva N., Hegay T. et al. Risk factors and seroprevalence of hepatitis B virus, hepatitis C virus, and human immunodeficiency virus infection in uzbekistan. Intervirology. 2001; 44: 327-32.
  22. Kurbanov F., Tanaka Y., Avazova D., Khan A., Sugauchi F. et al. Detection of hepatitis C virus natural recombinant RF1_2k/1b strain among intravenous drug users in uzbekistan. Hepatol. Res. 2008; 38: 457-64.
  23. Kurbanov F., Tanaka Y., Sugauchi F., Kato H., Ruzibakiev R. et al. Hepatitis C virus molecular epidemiology in Uzbekistan. J. Med Virol. 2003; 69: 367-75.
  24. Ito K., Higami K., Masaki N., Sugiyama M., Mukaide M. et al. The rs8099917 polymorphism, when determined by a suitable genotyping method, is a better predictor for response to pegylated a 1 lpha interferon/ribavirin therapy in Japanese patients than other single nucleotide polymorphisms associated with interleukin-28B. J. Clin. Microbiol. 2011; 49: 1853-60.
  25. Lindh M., Lagging M., Norkrans G., Hellstrand K. A model explaining the correlations between IL28B-related genotypes, hepatitis C virus genotypes, and viral RNA levels. Gastroenterology. 2010; 139: 1794-6.
  26. Fischer J., Bohm S., Scholz M., Muller T., Witt H. et al. Combined effects of different IL28B gene variants on the outcome of dual combination therapy in chronic HCV type 1 infection. Hepatology. 2012; 55: 1700-10.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载

版权所有 © Eco-vector, 2014


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».