Лабораторная диагностика псевдотуберкулёза и кишечного иерсиниоза

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Энтеропатогенные виды Yersinia pseudotuberculosis и Yersinia enterocolitica имеют большое значение во всём мире в связи с их способностью выживать и сохранять патогенные свойства в биотической и абиотической окружающей среде. Они способны вызывать заболевания спорадического и вспышечного характера. Именно поэтому крайне важным является использование современных методов диагностики заболеваний, обусловленных этими возбудителями.

В статье проанализированы методы лабораторной диагностики энтеропатогенных иерсиний (Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica), включающие бактериологический, серологический и молекулярно-генетический. Приведены современные сведения применения метода полимеразной цепной реакции, масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS), дот-иммуноанализа. Приведена схема оптимального протокола обнаружения и идентификации иерсиний.

Сочетание классического микробиологического и молекулярно-генетического методов оперативно определяет наличие или отсутствие патогена в образце, что позволяет целенаправленно использовать бактериологическое исследование для верификации клинического диагноза, подтверждения факторов передачи и планирования противоэпидемических мероприятий.

Об авторах

Маргарита Валентиновна Чеснокова

Иркутский научно-исследовательский противочумной институт Сибири и Дальнего Востока

Автор, ответственный за переписку.
Email: mar_chumin@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5489-9363
SPIN-код: 2005-4321

д.м.н., профессор

Россия, 664047, Иркутск, ул. Трилиссера, д. 78

Валерий Тимофеевич Климов

Иркутский научно-исследовательский противочумной институт Сибири и Дальнего Востока

Email: 41vklimov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0036-0017
SPIN-код: 1382-9190

к.м.н., с.н.с.

Россия, 664047, Иркутск, ул. Трилиссера, д. 78

Татьяна Викторовна Каримова

Центр гигиены и эпидемиологии в Новосибирской области

Email: tatianakarimova357@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9099-3621
SPIN-код: 7101-4016

к.м.н.

Россия, Новосибирск

Татьяна Юрьевна Загоскина

Иркутский научно-исследовательский противочумной институт Сибири и Дальнего Востока

Email: t_y_z_@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9302-7143
SPIN-код: 5891-7130

д.м.н.

Россия, 664047, Иркутск, ул. Трилиссера, д. 78

Александр Леонидович Панин

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: alp.1952@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6411-0274
SPIN-код: 4690-3587

м.н.с.

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Adeolu M., Alnajar S., Naushad S., Gupta RS. Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov // Int J Syst Evol Microbiol. 2016. Vol. 66, N 12. Р. 5575−5599. doi: 10.1099/ijsem.0.001485
  2. Сомова Л.М., Андрюков Б.Г., Тимченко Н.Ф., Псарева Е.К. Псевдотуберкулез как персистентная инфекция: этиопатогенетические предпосылки // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019. № 2. С. 110−119. doi: 10.36233/0372-9311-2019-2-110-119
  3. Savin C., Frangeul L., Ma L., et al. Draft genome sequence of a clinical strain of yersinia enterocolitica (ip10393) of bioserotype 4/O:3 from France // Genome Announc. 2013. Vol. 1, N 1. Р. e00150-12. doi: 10.1128/genomeA.00150-12
  4. Шурыгина И.А., Чеснокова М.В., Климов В.Т. и др. Псевдотуберкулез. Новосибирск: Наука, 2003. 320 с.
  5. Fredriksson-Ahomaa M., Korkeala H. Low occurrence of pathogenic Yersinia enterocolitica in clinical, food, and environmental samples: a methodological problem // Clin Microbiol Rev. 2003. Vol. 16, N 2. Р. 220−229. doi: 10.1128/CMR.16.2.220-229.2003
  6. Black R.E., Jackson R.J., Tsai T., et al. Epidemic Yersinia enterocolitica infection due to contaminated chocolate milk // N Engl J Med. 1978. Vol. 298, N 2. Р. 76−79. doi: 10.1056/NEJM197801122980204
  7. Tacket C.O., Ballard J., Harris N., et al. An outbreak of Yersinia enterocolitica infections caused by contaminated tofu (soybean curd) // Am J Epidemiol. 1985. Vol. 121, N 5. Р. 705−711. doi: 10.1093/aje/121.5.705
  8. Abraham M., Pai M., Kang G., et al. An outbreak of food poisoning in Tamil Nadu associated with Yersinia enterocolitica // Indian J Med Res. 1997. Vol. 106. Р. 465−468.
  9. Swaminathan B., Harmon M.C., Mehlman I.J. Yersinia enterocolitica // J Appl Bacteriol. 1982. Vol. 52, N 2. Р. 151−183. doi: 10.1111/j.1365-2672.1982.tb04838.x
  10. Чеснокова М.В. Псевдотуберкулез в Сибири: теоретические и прикладные аспекты эпидемиологии, лабораторной диагностики и профилактики: Автореф. дис. … докт. мед. наук. Иркутск, 2004. 42 с.
  11. Martínez P.O., Fredriksson-Ahomaa M., Sokolova Y., et al. Prevalence of enteropathogenic Yersinia in Estonian, Latvian, and Russian (Leningrad region) pigs // Foodborne Pathog Dis. 2009. Vol. 6, N 6. Р. 719−724. doi: 10.1089/fpd.2008.0251
  12. Fukushima H., Matsuda Y., Seki R., et al. Geographical heterogeneity between Far Eastern and Western countries in prevalence of the virulence plasmid, the superantigen Yersinia pseudotuberculosis-derived mitogen, and the high-pathogenicity island among Yersinia pseudotuberculosis strains // J Clin Microbiol. 2001. Vol. 39, N 10. Р. 3541−3547. doi: 10.1128/JCM.39.10.3541-3547.2001
  13. Niléhn B. Studies on Yersinia enterocolitica with special reference to bacterial diagnosis and occurrence in human acute enteric disease, 1969 // APMIS. 2007. Vol. 115, N 5. Р. 578−588; discussion 589-591. doi: 10.1111/j.1600-0463.2007.apm_725.x
  14. Landgraf M., Iaria S.T., Falcão D.P. An improved enrichment procedure for the Isolation of Yersinia enterocolitica and related species from milk // J Food Prot. 1993. Vol. 56, N 5. Р. 447−450. doi: 10.4315/0362-028X-56.5.447
  15. Fondrevez M., Labbé A., Houard E., et al. A simplified method for detecting pathogenic Yersinia enterocolitica in slaughtered pig tonsils // J Microbiol Methods. 2010. Vol. 83, N 2. Р. 244−249. doi: 10.1016/j.mimet.2010.09.012
  16. Fredriksson-Ahomaa M. Isolation of enteropathogenic Yersinia from non-human sources // Adv Exp Med Biol. 2012. N 954. Р. 97−105. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_12
  17. Carniel E. The Yersinia high-pathogenicity island // Int Microbiol. 1999. Vol. 2, N 3. Р. 161−167.
  18. Fukushima H., Gomyoda M., Tsubokura M., Aleksić S. Isolation of Yersinia pseudotuberculosis from river waters in Japan and Germany using direct KOH and HeLa cell treatments // Zentralbl Bakteriol. 1995. Vol. 282, N 1. Р. 40−49. doi: 10.1016/s0934-8840(11)80795-4
  19. Koujitani E., Horisaka T., Nomura Y., et al. Immuno-magnetic separation and agar layer methods for the isolation of freeze-injured Yersinia enterocolitica O:8 from water // J Vet Med Sci. 2006. Vol. 68, N 3. Р. 195−199. doi: 10.1292/jvms.68.195
  20. Fukushima H., Shimizu S., Inatsu Y. Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis detection in foods // J Pathog. 2011. Vol. 2011. Р. 735308. doi: 10.4061/2011/735308
  21. Aulisio C.C., Mehlman I.J., Sanders A.C. Alkali method for rapid recovery of Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis from foods // Appl Environ Microbiol. 1980. Vol. 39, N 1. Р. 135−140. doi: 10.1128/aem.39.1.135-140.1980
  22. Fukushima H., Tsubokura M., Otsuki K., et al. Epidemiological study of Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis infections in Shimane Prefecture, Japan // Zentralbl Bakteriol Mikrobiol Hyg B. 1985. Vol. 180, N 5-6. Р. 515−527.
  23. Weagant S.D. A new chromogenic agar medium for detection of potentially virulent Yersinia enterocolitica // J Microbiol Methods. 2008. Vol. 72, N 2. Р. 185−190. doi: 10.1016/j.mimet.2007.11.019
  24. Ценева Г.Я., Мессорош В.Г., Куляшова Л.Б., и др. Эффективность применения питательных сред для выделения иерсиний // Клиническая лабораторная диагностика. 1993. № 3. С. 73−74.
  25. Ito T., Suzuki T., Kawase J., et al. Yersinia enterocolitica bacteremia and enterocolitis in a previously healthy 20-month-old girl // J Infect Chemother. 2012. Vol. 18, N 5. Р. 756−759. doi: 10.1007/s10156-011-0353-8
  26. Van Damme I., Berkvens D., de Zutter L. Effect of sampling and short isolation methodologies on the recovery of human pathogenic Yersinia enterocolitica from pig tonsils // Foodborne Pathog Dis. 2012. Vol. 9, N 7. Р. 600−606. doi: 10.1089/fpd.2012.1128
  27. Niskanen T., Laukkanen R., Murros A., et al. Characterisation of non-pathogenic Yersinia pseudotuberculosis-like strains isolated from food and environmental samples // Int J Food Microbiol. 2009. Vol. 129, N 2. Р. 150−156. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2008.11.015
  28. Sharma N.K., Doyle P.W., Gerbasi S.A., Jessop J.H. Identification of Yersinia species by the API 20E // J Clin Microbiol. 1990. Vol. 28, N 6. Р. 1443−1444. doi: 10.1128/jcm.28.6.1443-1444.1990
  29. Linde H.J., Neubauer H., Meyer H., et al. Identification of Yersinia species by the Vitek GNI card // J Clin Microbiol. 1999. Vol. 37, N 1. Р. 211−214. doi: 10.1128/JCM.37.1.211-214.1999
  30. Bogdanovich T., Carniel E., Fukushima H., Skurnik M. Use of O-antigen gene cluster-specific PCRs for the identification and O-genotyping of Yersinia pseudotuberculosis and Yersinia pestis // J Clin Microbiol. 2003. Vol. 41, N 11. Р. 5103−5112. doi: 10.1128/JCM.41.11.5103-5112.2003
  31. Laird W.J., Cavanaugh D.C. Correlation of autoagglutination and virulence of yersiniae // J Clin Microbiol. 1980. Vol. 11, N 4. Р. 430−432. doi: 10.1128/jcm.11.4.430-432.1980
  32. Bhaduri S., Turner-Jones C., Lachica R.V. Convenient agarose medium for simultaneous determination of the low-calcium response and Congo red binding by virulent strains of Yersinia enterocolitica // J Clin Microbiol. 1991. Vol. 29, N 10. Р. 2341−2344. doi: 10.1128/jcm.29.10.2341-2344.1991
  33. Zink D.L., Feeley J.C., Wells J.G., et al. Plasmid-mediated tissue invasiveness in Yersinia enterocolitica // Nature. 1980. Vol. 283, N 5743. Р. 224−226. doi: 10.1038/283224a0
  34. Kapperud G. Yersinia enterocolitica in food hygiene // Int J Food Microbiol. 1991. Vol. 12, N 1. Р. 53−65. doi: 10.1016/0168-1605(91)90047-s
  35. Kapperud G., Vardund T. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica in food, water, and feces by nested polymerase chain reactions and immunomagnetic separation // Contrib Microbiol Immunol. 1995. Vol. 13. Р. 130−133.
  36. Skurnik M., Wolf-Watz H. Analysis of the YopA gene encoding the Yop1 virulence determinants of Yersinia spp // Mol Microbiol. 1989. Vol. 3, N 4. Р. 517−529. doi: 10.1111/j.1365-2958.1989.tb00198.x
  37. Wang R.F., Cao W.W., Cerniglia C.E. A universal protocol for PCR detection of 13 species of foodborne pathogens in foods // J Appl Microbiol. 1997. Vol. 83, N 6. Р. 727−736. doi: 10.1046/j.1365-2672.1997.00300.x
  38. Lambertz S.T., Nilsson C., Hallanvuo S. TaqMan-based real-time PCR method for detection of Yersinia pseudotuberculosis in food // Appl Environ Microbiol. 2008. Vol. 74, N 20. Р. 6465−6469. doi: 10.1128/AEM.01459-08
  39. Wren B.W., Tabaqchali S. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica by the polymerase chain reaction // Lancet. 1990. Vol. 336, N 8716. Р. 693. doi: 10.1016/0140-6736(90)92191-j
  40. Vishnubhatla A., Fung D.Y., Oberst R.D., et al. Rapid 5’ nuclease (TaqMan) assay for detection of virulent strains of Yersinia enterocolitica // Appl Environ Microbiol. 2000. Vol. 66, N 9. Р. 4131−4135. doi: 10.1128/AEM.66.9.4131-4135.2000
  41. Wannet W.J., Reessink M., Brunings H.A., Maas H.M. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica by a rapid and sensitive duplex PCR assay // J Clin Microbiol. 2001. Vol. 39, N 12. Р. 4483−4486. doi: 10.1128/JCM.39.12.4483-4486.2001
  42. Sandery M., Stinear T., Kaucner C. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica in environmental waters by PCR // J Appl Bacteriol. 1996. Vol. 80, N 3. Р. 327−332. doi: 10.1111/j.1365-2672.1996.tb03227.x
  43. Fukushima H., Tsunomori Y., Seki R. Duplex real-time SYBR green PCR assays for detection of 17 species of food- or waterborne pathogens in stools // J Clin Microbiol. 2003. Vol. 41, N 11. Р. 5134−5146. doi: 10.1128/JCM.41.11.5134-5146.2003
  44. Thisted Lambertz S., Danielsson-Tham M.L. Identification and characterization of pathogenic Yersinia enterocolitica isolates by PCR and pulsed-field gel electrophoresis // Appl Environ Microbiol. 2005. Vol. 71, N 7. Р. 3674−3681. doi: 10.1128/AEM.71.7.3674-3681.2005
  45. Rossen L., Nørskov P., Holmstrøm K., Rasmussen O.F. Inhibition of PCR by components of food samples, microbial diagnostic assays and DNA-extraction solutions // Int J Food Microbiol. 1992. Vol. 17, N 1. Р. 37−45. doi: 10.1016/0168-1605(92)90017-w
  46. Stephan R., Cernela N., Ziegler D., et al. Rapid species identification and subtyping of Yersinia enterocolitica by MALDI-TOF mass spectrometry // J Microbiol Methods. 2011. Vol. 87, N 2. Р. 150−153. doi: 10.1016/j.mimet.2011.08.016

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. Схема выявления и идентификации энтеропатогенных иерсиний. Примечание. ПЦР — полимеразная цепная реакция, DIA — дот-иммуноанализ, Y.ptbc — Yersinia pseudotuderculosis, Y.ent — Yersinia enterocolitica, МФА — метод флюоресцирующих антител, inv — ген инвазивности, HPI — остров высокой патогенности иерсиний, YAPI — адгезивный остров патогенности иерсиний, pYV — плазмида вирулентности Y. pseudotuderculosis, ymp — ген токсина суперантигена А/С Y. pseudotuderculosis, ail — ген адгезии-инвазии Y. enterocolitica, yst A — ген энтеротоксина А, yst В — ген энтеротоксина B, VNTR — вариабельное число тандемных повторов, PFGA — электрофорез в пульсирующем поле.

Скачать (592KB)
Метаданные

© ООО "Эко-вектор", 2022


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».