Взаимосвязь микробного биоразнообразия и клинических форм красного плоского лишая слизистой оболочки полости рта: анализ на основе 16S рРНК секвенирования

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Обоснование. Состав и изменения микробиоты могут оказывать существенное влияние на общее состояние здоровья и развитие различных заболеваний. Особую актуальность представляет проблема изменения микробиоты полости рта у пациентов с красным плоским лишаём слизистой оболочки полости рта. Изучение взаимосвязи патогенеза заболевания с составом микрофлоры полости рта позволит улучшить понимание механизмов развития патологии и разработать терапевтический подход к её лечению. Таким образом, данная тема представляет значительный интерес для широкого круга специалистов в области медицины и биологии.

Цель исследования ― детальное изучение состава микробиоты полости рта у пациентов с красным плоским лишаём слизистой оболочки полости рта для выявления возможных патогенетических микробных ассоциаций.

Материалы и методы. В исследование включены образцы мазков с поверхности слизистой оболочки рта для секвенирования ДНК от пациентов с различными формами красного плоского лишая и контрольной группы. Исследование основано на анализе показателей разнообразия микробиоты (альфа- и бета-разнообразие; относительное содержание бактериальных таксонов; выявление уникальных бактериальных таксонов). Для исследования использован метод секвенирования 16S РНК.

Результаты. Анализ выявил многообразный бактериальный состав у пациентов с красным плоским лишаём слизистой оболочки полости рта, который существенно отличается от контрольной группы, а также различия между подгруппами, особенно при типичной и эрозивно-язвенной формах заболевания. Стоит отметить, что бета-разнообразие не показало значимых различий между группами, что указывает на сходный общий состав микробиоты, несмотря на колебания в относительной численности видов. Тем не менее типичная клиническая форма заболевания демонстрирует более существенные различия в структуре микробиома по сравнению с гиперкератотической и эрозивно-язвенной формами. Более того, анализ исследуемых групп позволил установить наличие 50% общих видов микроорганизмов, а другая половина представлена уникальными видами, ассоциированными с красным плоским лишаём слизистой оболочки полости рта. В отношении подгрупп выявлено, что уникальные микроорганизмы коррелируют с типичной и эрозивно-язвенной формами соответственно, предоставляя тем самым более глубокое понимание специфики микробиологического профиля в контексте данного заболевания.

Заключение. Исследование подтвердило гипотезу о связи состава микробиоты полости рта с красным плоским лишаём слизистой оболочки полости рта, что может иметь важное значение для разработки новых терапевтических подходов.

Об авторах

Наталия Павловна Теплюк

Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)

Email: teplyukn@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5800-4800
SPIN-код: 8013-3256

д-р мед. наук, профессор

Россия, Москва

Михаил Александрович Степанов

Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)

Email: Doctor.stepanov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-1872-9487
SPIN-код: 6524-5665

канд. мед. наук, доцент

Россия, Москва

Баира Шойсороновна Дамдинова

Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова (Сеченовский Университет)

Автор, ответственный за переписку.
Email: baira_d@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4162-2928
Россия, Москва

Степан Владимирович Тощаков

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: stepan.toshchakov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-7549-3450
SPIN-код: 8994-5224

канд. биол. наук

Россия, Москва

Сергей Александрович Носков

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: sergey.noskov.2001@icloud.com
ORCID iD: 0009-0006-1578-1382
Россия, Москва

Нина Алексеевна Тутубалина

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: nina.tutubalina@gmail.com
ORCID iD: 0009-0004-7016-3670
Россия, Москва

Список литературы

  1. Roopashree M.R., Gondhalekar R.V., Shashikanth M.C., et al. Pathogenesis of oral lichen planus: A review // J Oral Pathol Med. 2010. Vol. 39, N 10. Р. 729–734. doi: 10.1111/j.1600-0714.2010.00946.x
  2. Федеральные клинические рекомендации по ведению больных красным плоским лишаем. Москва: Российское общество дерматовенерологов и косметологов, 2015. 19 с.
  3. Чуйкин С.В., Акмалова Г.М., Чернышева Н.Д. Особенности клинического течения красного плоского лишая с локализацией на слизистой оболочке полости рта // Клиническая дерматология и венерология. 2015. Т. 14, № 3. С. 72–75. doi: 10.17116/klinderma201514372-75
  4. Теплюк Н.П., Степанов М.А., Дамдинова Б.Ш., Лазарева П.И. Этиология, клинические проявления и микробиота красного плоского лишая слизистой оболочки полости рта: обзор научной литературы // Российский журнал кожных и венерических болезней. 2023. Т. 26, № 6. С. 553–562. EDN: IMYRHA doi: 10.17816/dv569013
  5. Jung W., Jang S. Oral microbiome research on oral lichen planus: Current findings and perspectives // Biology. 2022. Vol. 11, N 5. Р. 723. doi: 10.3390/biology11050723
  6. Yu F.Y., Wang Q.Q., Li M., et al. Dysbiosis of saliva microbiome in patients with oral lichen planus // BMC Microbiol. 2020. Vol. 20, N 1. Р. 75. doi: 10.1186/s12866-020-01733-7
  7. Bornstein M.M., Hakimi B., Persson G.R. Microbiological findings in subjects with asymptomatic oral lichen planus: A cross-sectional comparative study // J Periodontol. 2008. Vol. 79, N 12. Р. 2347–2355. doi: 10.1902/jop.2008.080303
  8. Свитич О.А., Теплюк Н.П., Степанов М.А., и др. Изучение взаимосвязи между красным плоским лишаем слизистой оболочки полости рта и заболеваниями пародонта: значение микробиоты пародонтальных патогенов и гигиены полости рта // Российский журнал кожных и венерических болезней. 2024. Т. 27, № 1. С. 45–54. EDN: CKPMVN doi: 10.17816/dv624269
  9. Zaatout N. Presence of non-oral bacteria in the oral cavity // Arch Microbiol. 2021. Vol. 203, N 6. Р. 2747–2760. doi: 10.1007/s00203-021-02300-y
  10. Brooke J.S. Stenotrophomonas maltophilia: An emerging global opportunistic pathogen // Clin Microbiol Rev. 2012. Vol. 25, N 1. Р. 2–41. doi: 10.1128/CMR.00019-11

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Анализ альфа-разнообразия бактериального состава слизистой оболочки полости рта в зависимости от наличия болезни по индексам Чао1 и Шеннона.

Скачать (336KB)
3. Рис. 2. Анализ альфа-разнообразия бактериального состава слизистой оболочки полости рта при разных формах красного плоского лишая слизистой оболочки полости рта с использованием индексов Чао1 и Шеннона.

Скачать (392KB)
4. Рис. 3. Кривая разреживания вариантов последовательностей ампликонов.

Скачать (631KB)
5. Рис. 4. Представленность бактериальных типов полости рта: сравнение между основной (О-Г) и контрольной (К-Г) группой (a); анализ для типичной, эрозивно-язвенной и гиперкератотической клинических форм (b). (Десять самых распространённых таксонов).

Скачать (421KB)
6. Рис. 5. Представленность бактериальных филумов полости рта на уровне семейства: сравнение между основной (О-Г) и контрольной (К-Г) группой (a); анализ для типичной, эрозивно-язвенной и гиперкератотической клинических форм (b). (Десять самых распространённых таксонов).

Скачать (515KB)
7. Рис. 6. Представленность бактериальных типов полости рта на уровне родов: сравнение между основной (О-Г) и контрольной (К-Г) группой (a); анализ для типичной, эрозивно-язвенной и гиперкератотической клинических форм (b). (Десять самых распространённых таксонов).

Скачать (523KB)
8. Рис. 7. Бета-разнообразие у пациентов основной (О-Г) и контрольной (К-Г) групп с применением метода PCoA (главных координат).

Скачать (662KB)
9. Рис. 8. Бета-разнообразие в зависимости от формы заболевания с использованием метода PCoA (главных координат).

Скачать (249KB)
10. Рис. 9. Диаграмма Венна: для основной (О-Г) и контрольной (К-Г) групп (a); согласно клинической форме заболевания (b).

Скачать (273KB)
11. Рис. 10. Дифференциальная представленность ASV между пациентами основной (О-Г) и контрольной (К-Г) групп с использованием линейного дискриминантного анализа (LDA).

Скачать (246KB)
12. Рис. 11. Дифференциальная представленность ASV между типичной и гиперкератотической формой красного плоского лишая слизистой оболочки полости рта на основе линейного дискриминантного анализа (LDA).

Скачать (440KB)

© Эко-Вектор, 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».