Метилирование генов в CD3 +-клетках при псориазе


Цитировать

Полный текст

Аннотация

C помощью микрочипов Illumina проанализирован уровень метилирования генов в CD3 +-клетках у больных псориазом относительно такового у здоровых людей. Выявлены локусы, дифференциально метилированные в CD3 +-клетках у больных псориазом и здоровых лиц. Среди наиболее метилированных локусов в CD3 +-клетках у больных псориазом выделяются гены киназ FRK, JAK1, AKAP7, DYRK1A, PRKCA, RPS6KA2. Четкое разделение образцов на две группы позволяет предположить, что по уровню метилирования исследованных генов в CD3 +-клетках можно определять предрасположенность к псориазу и, вероятно, проводить его раннюю диагностику.

Ключевые слова

Об авторах

Владимир Васильевич Соболев

ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Email: sobolew_vl@mail.ru
канд. биол. наук

Елена Валерьевна Денисова

ФГБУН Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН

врач-дерматолог

Анна Геннадьевна Соболева

ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

канд. биол. наук

Ирина Марковна Корсунская

Городская клиническая больница № 14 им. В.Г. Короленко; ГБОУ ВПО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России

д-р мед. наук, профессор

Евгений Витальевич Чекалин

ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

студент

Алена Дмитриевна Золотаренко

ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

аспирант

Сергей Александрович Брускин

ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

канд. биол. наук

Список литературы

  1. Gudjonsson J.E., Ding J., Johnston A., Tejasvi T., Guzman A.M., Nair R.P., et al. Assessment of the psoriatic transcriptome in a large sample: additional regulated genes and comparisons with in vitro models. J. Invest. Dermatol. 2010; 130(7): 1829—40. doi: 10.1038/jid.2010.36.
  2. Lowes M.A., Bowcock A.M., Krueger J.G. Pathogenesis and therapy of psoriasis. Nature. 2007; 445(7130): 866—73.
  3. Grjibovski A.M., Olsen A.O., Magnus P., Harris J.R. Psoriasis in Norwegian twins: contribution of genetic and environmental effects. J. Eur. Acad. Dermatol. Venereol. 2007; 21(10): 1337—43.
  4. Stuart P.E., Nair R.P., Ellinghaus E., Ding J., Tejasvi T., Gudjonsson J.E., et al. Genome-wide association analysis identifies three psoriasis susceptibility loci. Nat. Genet. 2010; 42(11): 1000—4. doi: 10.1038/ng.693.
  5. Hüffmeier U., Uebe S., Ekici A.B., Bowes J., Giardina E., Korendowych E., et al. Common variants at TRAF3IP2 are associated with susceptibility to psoriatic arthritis and psoriasis. Nat. Genet. 2010; 42(11): 996—9. doi: 10.1038/ng.688.
  6. Strange A., Capon F., Spencer C.C., Knight J., Weale M.E., Allen M.H., et al.; Genetic Analysis of Psoriasis Consortium & the Wellcome Trust Case Control Consortium 2. A genome-wide association study identifies new psoriasis susceptibility loci and an interaction between HLA-C and ERAP1. Nat. Genet. 2010; 42(11): 985—90. doi: 10.1038/ng.694.
  7. Zhang X.J., Huang W., Yang S., Sun L.D., Zhang F.Y., Zhu Q.X., et al. Psoriasis genome-wide association study identifies susceptibility variants within LCE gene cluster at 1q21. Nat. Genet. 2009; 41(2): 205—10. doi: 10.1038/ng.310.
  8. de Cid R., Riveira-Munoz E., Zeeuwen P.L., Robarge J., Liao W., Dannhauser E.N., et al. Deletion of the late cornified envelope LCE3B and LCE3C genes as a susceptibility factor for psoriasis. Nat. Genet. 2009; 41(2): 211—5. doi: 10.1038/ng.313.
  9. Bowcock A.M., Krueger J.G. Getting under the skin: the immunogenetics of psoriasis. Nat. Rev. Immunol. 2005; 5(9): 699—711.
  10. Antequera F., Boyes J., Bird A. High levels of de novo methylation and altered chromatin structure at CpG islands in cell lines. Cell. 1990; 62(3): 503—14.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО "Эко-Вектор", 2013


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».