ROLE OF POLYMORPHIC VARIANTS OF THE GENES TNFA, TSLP IN THE OCCUPATIONAL ASTHMA DEVELOPMENT


Cite item

Full Text

Abstract

The aim of the study was to find possible associations of polymorphic variants rs1800629 of gene TNFA and rs1837253 of gene TSLP with the development of occupational asthma. The analysis of polymorphism of cytokine genes was carried out by means of polymerase chain reaction of DNA synthesis in 83 patients and 195 control subjects. Genomic DNA was isolated from whole blood samples using standard phenol/chloroform extraction techniques. Statistical analysis was performed using χ test as amended by Yeats and odds ratios with 95 % confidence intervals. As a result, it found that in patients with occupational asthma allele C and genotype CC polymorphic locus rs1837253 TSLP gene occurs more frequently (OR = 1.91, 95 % CI 1.11-3.28; p = 0,026 и OR = 2.48, 95 % CI 1.29-4.77; p = 0.010 respectively) than in the control group. The analysis of the association of polymorphic locus rs1800629 TNFA gene with occupational asthma did not reveal statistically significant results. The received data suggest the possible involvement of rs1837253 polymorphism TSLP gene in the formation of occupational asthma.

About the authors

G F Mukhammadiyeva

Ufa Research Institute of Occupational Health and Human Ecology

Email: ufniimt@mail.ru
кандидат биологических наук, заведующий лабораторией молекулярногенетических исследований отдела токсикологии и генетики 450106, г. Уфа, ул. Степана Кувыкина, д. 94

T G Kutlina

Ufa Research Institute of Occupational Health and Human Ecology

D O Karimov

Ufa Research Institute of Occupational Health and Human Ecology

A B Bakirov

Ufa Research Institute of Occupational Health and Human Ecology

A U Shagalina

Ufa Research Institute of Occupational Health and Human Ecology

E F Idiyatullina

Ufa Research Institute of Occupational Health and Human Ecology

References

  1. Бакумов П.А., Ковальская Е.Н., Зернюкова Е.А., Кочетова Е.И., Алексеев Е.Г. Профессиональная бронхиальная астма // Лекарственный вестник. 2014. № 1 (53). С. 18-30.
  2. Иващенко Т.Э., Останкова Ю.А., Баранов В.С. Анализ полиморфизма гена фактора некроза опухоли-а у больных с атопической бронхиальной астмой // Медицинская генетика. 2005. Т. 4, № 5. С. 195.
  3. Сеитова Г.Н., Букреева Е.Б., Кремис И.С., Пузырев В.П. Ассоциация полиморфных вариантов генов цитокинов (TNF и IL8) с развитием хронической обструктивной болезни легких // Бюллетень сибирской медицины. 2010. Т. 9, № 3. С. 91-97.
  4. Черкашина И.И., Никулина С.Ю., Логвиненко Н.И. Максимов В.Н., Либердовская Е.Д. Клинико-генетический анализ больных бронхиальной астмой // Пульмонология. 2009. № 2. С. 77-81.
  5. Albuquerque R.V., Hayden C.M., Palmer L.J., Laing I.A., Rye P.J., Gibson N.A., Burton P.R., Goldblatt J., Lesouëf P.N. Association of polymorphisms within the tumour necrosis factor (TNF) genes and childhood asthma // Clin. Exp. Allergy. 1998. Vol. 28, N 5. P. 578-584.
  6. Allakhverdi Z., Comeau M.R., Jessup H.K., Yoon B.R., Brewer A., Chartier S., Paquette N., Ziegler S. F., Sarfati M., Delespesse G. Thymic stromal lymphopoietin is released by human epithelial cells in response to microbes, trauma, or inflammation and potently activates mast cells // Exp. Med. 2007. Vol. 204, N 2. P. 253-258.
  7. Almomani B., Hawwa A.F., Millership J.S., Heaney L., Douglas I., McElnay J.C., Shields M.D. Can certain genotypes predispose to poor asthma control in children? A pharmacogenetic study of 9 candidate genes in children with difficult asthma // PLoS One. 2013. Vol. 8, N 4. P. e60592.
  8. Aoki T., Hirota T., Tamari M., Ichikawa K., Takeda K., Arinami T., Shibasaki M., Noguchi E. An association between asthma and TNF-308G/A polymorphism: meta-analysis // J. Hum. Genet. 2006. Vol. 51, N 8. P. 677-685.
  9. Bucková D., Holla L. I., Vasků A. Znojil V., Vächa J. Lack of association between atopic asthma and the tumor necrosis factor alpha-308 gene polymorphism in a Czech population // J Investig Allergol Clin Immunol. 2002. Vol. 12, N 3. P. 192-197.
  10. Fan H.M., Wang Z., Feng F.M., Zhang K.L., Yuan J.X., Sui H., Qiu H.Y., Liu L.H., Deng X.J., Ren J.X. Association of TNF-alpha-238G/A and 308 G/A gene polymorphisms with pulmonary tuberculosis among patients with coal worker’s pneumoconiosis // Biomed Environ Sci. 2010. Vol. 23, N 2. P. 137-145.
  11. He J.Q., Hallstrand T.S., Knight D., Chan-Yeung M., Sandford A., Tripp B., Zamar D., Bossé Y., Kozyrskyj A.L., James A., Laprise C., Daley D. A thymic stromal lymphopoietin gene variant is associated with asthma and airway hyperresponsiveness // J Allergy Clin Immunol. 2009. Vol. 124, N 2. P. 222-229.
  12. Huang H., Nie W., Qian J., Zang Y., Chen J., Lai G., Ye T., Xiu Q. Effects of TNF-а polymorphisms on asthma risk: a systematic review and meta-analysis // J Investig Allergol Clin Immunol. 2014. Vol. 24, N 6. P. 406-417.
  13. Hunninghake G.M., Soto-Quiros M.E., Avila L., Kim H.P., Lasky-Su J., Rafaels N., Ruczinski I., Beaty T.H., Mathias R.A., Barnes K.C., Wilk J.B., O’Connor G.T., Gauderman W.J., Vora H., Baurley J. W., Gilliland F., Liang C., Sylvia J.S., Klanderman B. J., Sharma S. S., Himes B. E., Bossley C. J., Israel E., Raby B.A., Bush A., Choi A.M., Weiss S.T., Celedon J.C. TSLP polymorphisms are associated with asthma in a sex-specific fashion // Allergy. 2010. Vol. 65, N 12. Р. 1566-1575.
  14. Kim H.B., Kang M.J., Lee S.Y., Jin H.S., Kim J.H., Kim B.S., Jang S.O., Lee Y.C., Sohn M.H., Kim K.E., Hong S.J. Combined Effect of Tumour Necrosis FactorAlpha and Interleukin-13 Polymorphisms on Bronchial Hyperresponsiveness in Korean Children with Asthma // Clin. Exp. Allergy. 2008. Vol. 38, N 5. P. 774-780.
  15. Kroeger K.M., Carville K.S., Abraham L.J. The -308 tumor necrosis factor-a promoter polymorphism effects transcription // Mol Immunol. 1997. Vol. 34, N 5. P. 391-399.
  16. Liu Y.J., Soumelis V., Watanabe N., Ito T., Wang Y.H., Malefyt Rde. W., Omori M., Zhou B., Ziegler S. F. TSLP: anepithelial cell cytokine that regulates T cell differentiation by conditioning dendritic cell maturation // Annu Rev Immunol. 2007. N 25. P. 193-219.
  17. Randolph A.G., Lange C., Silverman E.K. Lazarus R., Weiss S.T. Extended haplotype in the tumor necrosis factor gene cluster is associated with asthma and asthma-related phenotypes // Am J Respir Crit Care Med. 2005. Vol. 172, N 6. P. 687-692.
  18. Sandford A.J., Chan H.W., Wong G.W., Lai C.K., Chan-Yeung M. Candidate Genetic Polymorphisms for Asthma in Chinese School-children from Hong Kong // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2004. Vol. 8, N 5. P. 519-527.
  19. Shin H.D., Park B.L., Kim L.H., Jung J.H., Wang H.J, Kim Y.J, Park H.S., Hong S.J., Choi B.W., Kim D.J., Park C.S. Association of tumor necrosis factor polymorphisms with asthma and serum total IgE // Hum Mol Genet. 2004. Vol. 13, N 3. P. 397-403.
  20. Ying S., O’Connor B., Ratoff J., Meng Q., Fang C., Cousins D., Zhang G., Gu S., Gao Z., Shamji B., Edwards M. J., Lee T. H., Corrigan C. J. Expression and cellular provenance of thymic stromal lymphopoietin and chemokines in patients with severe asthma and chronic obstructive pulmonary disease // J. Immunol. 2008. Vol. 181, N 4. P. 2790-2798.
  21. Zhang S., Wang C., Xi B., Li X. Association between the tumour necrosis factor-a-308G/A polymorphism and chronic obstructive pulmonary disease: an update // Respirology. 2011. Vol. 16, N 1. P. 107-115.
  22. Zhang Y., Zhang J., Tian C., Xiao Y., He C., Li X., Bogati A., Huang J., Fan H. The -308 G/A polymorphism in TNF-a gene is associated with asthma risk: an update by meta-analysis // J Clin Immunol. 2011. Vol. 31, N 2. P. 174-185.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2017 Human Ecology


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».