Анализ клинических путей пациентов в медицинских учреждениях на основе методов жесткой и нечеткой кластеризации
- Авторы: Прокофьева Е.С.1, Зайцев Р.Д.2
-
Учреждения:
- Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
- ГК «ФОРС»
- Выпуск: Том 14, № 1 (2020)
- Страницы: 19-31
- Раздел: Анализ данных и интеллектуальные системы
- URL: https://journal-vniispk.ru/1998-0663/article/view/351568
- DOI: https://doi.org/10.17323/2587-814X.2020.1.19.31
- ID: 351568
Цитировать
Аннотация
Моделирование процессов в системе здравоохранения играет большую роль для понимания ее деятельности и служит основой для повышения эффективности работы медицинских учреждений. Задачи анализа и моделирования больших массивов данных городского здравоохранения с помощью методов машинного обучения представляют особую значимость и актуальность для развития отраслевых решений в рамках цифровизации экономики, где данные являются ключевым фактором производства. В статье рассматривается проблема автоматического анализа и определения групп клинических путей пациентов на основе методов кластеризации. Существующие в данной области работы отражают большой интерес со стороны научного сообщества к подобным исследованиям, однако имеется необходимость развития ряда методологических подходов для дальнейшего их практического применения в городских поликлинических учреждениях с учетом специфики их организации. Целью исследования является повышение качества управления и сегментации входного потока пациентов в городских медицинских учреждениях на основе методов кластерного анализа для дальнейшей разработки рекомендательных сервисов. Одним из подходов для достижения поставленной цели является разработка и внедрение клинических путей, или траекторий движения пациентов. В общем виде под клиническим путем пациента понимается траектория его движения при получении медицинской услуги в соответствующих учреждениях. Представлен подход формирования групп маршрутов пациентов при помощи иерхического агломеративного алгоритма с методом связи Уорда и аддитивной регуляризацией тематических моделей (ARTM). Проведен вычислительный эксперимент на основе данных о маршрутах пациентов с диагнозом сепсис, размещенных в открытом доступе. Особенностью предлагаемого подхода является не только автоматизация определения схожих групп траекторий пациентов, но и учет шаблонов клинических путей для формирования рекомендаций в области организации структуры медицинского учреждения. В результате сформированный подход сегментации входного гетерогенного потока пациентов в городских медицинских учреждениях на основе кластеризации состоит из следующих шагов: 1) подготовка данных медицинского учреждения в формате журнала событий; 2) кодирование маршрутов пациентов; 3) определение верхнего предела длины рассматриваемого пути; 4) иерархическая агломеративная кластеризация; 5) аддитивная регуляризация тематических моделей (ARTM); 6) выявление популярных шаблонов маршрутов пациентов. Полученные кластеры маршрутов служат основой для дальнейшей разработки имитационной модели медицинского учреждения и предоставления рекомендаций пациентам. Кроме того, эти группы могут быть положены в основу разработки системы “Robotic process automation” (RPA), симулирующей действия человека и позволяющей автоматизировать интерпретацию данных для управления ресурсами учреждения.
Об авторах
Елизавета С. Прокофьева
Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
Автор, ответственный за переписку.
Email: prokofyeva.liza@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-1322-2932
Роман Д. Зайцев
ГК «ФОРС»
Email: roman.zaitsev@fors.ru
129272, г. Москва, ул. Трифоновский тупик, д. 3
Список литературы
- Илюшин Г.Я., Лиманский В.И. Построение системы управления потоками пациентов // Системы и средства информатики. 2015. Т. 25. № 1. С. 186–197.
- Азанов В.Г. Структурно-функциональная модель управления потоками пациентов // Системы и средства информатики. 2016. Т. 26. № 1. С. 13–29.
- What is a clinical pathway? Development of a definition to inform the debate / L. Kinsman [et al.] // BMC Medicine. 2010. Vol. 8. No 31. doi: 10.1186/1741-7015-8-31.
- Pearson S.D., Goulart-Fisher D., Lee T.H. Critical pathways as a strategy for improving care: Problems and potential // Annals of Internal Medicine. 1995. Vol. 123. No 12. P. 941–948.
- Wakamiya S., Yamauchi K. What are the standard functions of electronic clinical pathways? // International Journal of Medical Informatics. 2009. Vol. 78. No 8. P. 543–550. doi: 10.1016/j.ijmedinf.2009.03.003.
- Medical guidelines presentation and comparing with electronic health record / A. Vesel [et al.] // International Journal of Medical Informatics. 2006. Vol. 75. No 3–4. P. 240–245. doi: 10.1016/j.ijmedinf.2005.07.016.
- Rojas E., Munoz-Gama J., Sepúlveda M., Capurro D. Process mining in healthcare: A literature review // Journal of Biomedical Informatics. 2016. No 61. P. 224–236. doi: 10.1016/j.jbi.2016.04.007.
- Huang Z., Lu X., Duan H. On mining clinical pathway patterns from medical behaviors // Artificial Intelligence in Medicine. 2012. Vol. 56. No 1. P. 35–50. doi: 10.1016/j.artmed.2012.06.002.
- Rakocevic G., Djukic T., Filipovic N., Milutinovi V. Computational medicine in data mining and modeling. N.Y.: Springer, 2013. doi: 10.1007/978-1-4614-8785-2.
- Ahmad M.A., Teredesai A., Eckert C. Interpretable machine learning in healthcare // Proceedings of the 2018 IEEE International Conference on Healthcare Informatics (ICHI). New York, NY, USA, 4–7 June 2018. P. 447–447. doi: 10.1109/ICHI.2018.00095.
- Clinical pathways: effects on professional practice, patient outcomes, length of stay and hospital costs: Cochrane database of systematic reviews and meta-analysis / T. Rotter [et al.] // Evaluation & the Health Professions. 2010. Vol. 35. No 1. P. 3–27. doi: 10.1177/0163278711407313.
- Prodel M. Process discovery, analysis and simulation of clinical pathways using health-care data / Université de Lyon, 2017. [Электронный ресурс]: https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01665163/document (дата обращения 25.11.2019).
- Discovery of clinical pathway patterns from event logs using probabilistic topic models / Z. Huang [et al.] // Journal of Biomedical Informatics. 2014. No 47. P. 39–57. doi: 10.1016/j.jbi.2013.09.003.
- Lin F., Chou S., Pan S., Chen Y. Mining time dependency patterns in clinical pathways // International Journal of Medical Informatics. 2001. Vol. 62. No 1. P. 11–25. doi: 10.1016/S1386-5056(01)00126-5.
- Cote M.J., Stein W.E. A stochastic model for a visit to the doctor’s office // Mathematical and Computer Modelling. 2007. Vol. 45. No 3–4. P. 309–323. doi: 10.1016/j.mcm.2006.03.022.
- Zhang Y., Padman R., Patel N. Paving the cowpath: Learning and visualizing clinical pathways from electronic health record data // Journal of Biomedical Informatics. 2015. No 58. P. 186–197.
- Blei D.M., Ng A.Y., Jordan M.I. Latent Dirichlet allocation // The Journal of Machine Learning Research. 2003. No 3. P. 993–1022.
- Fernández-Llatas C., Benedi J.-M., García-Gómez J.M., Traver V. Process mining for individualized behavior modeling using wireless tracking in nursing homes // Sensors (Basel). 2013. Vol. 13. No 11. P. 15434–15451. doi: 10.3390/s131115434.
- van der Aalst W.M.P. Process mining: Discovery, conformance and enhancement of business processes. Springer, 2011. doi: 10.1007/978-3-642-19345-3.
- van der Aalst W.M.P. Process mining and simulation: A match made in heaven! // Proceedings of the 50th Computer Simulation Conference (SummerSim 2018). Bordeaux, France, 9–12 July 2018. doi: 10.22360/summersim.2018.scsc.005.
- van der Aalst W.M.P. Process mining: Data science in action. Berlin: Springer-Verlag, 2016.
- van der Aalst W.M.P. Process mining manifesto // Business Process Management Workshops. Springer, 2011. P. 169–194. doi: 10.1007/978-3-642-28108-2_19.
- Fernández-Llatas C., Meneu T., Benedi J.M., Traver V. Activity-based process mining for clinical pathways computer aided design // Proceedings of the 2010 Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology. Buenos Aires, Argentina, 31 August – 4 September 2010. P. 6178–6181. doi: 10.1109/IEMBS.2010.5627760.
- Kovalchuk S.V., Funkner A.A., Metsker O.G., Yakovlev A.N. Simulation of patient flow in multiple healthcare units using process and data mining techniques for model identification // Journal of Biomedical Informatics. 2018. No 82. P. 128–142.
- Williams R., Buchan I., Prosperi M., Ainsworth J. Using string metrics to identify patient journeys through care pathways // Proceedings of the AMIA Annual Symposium, Washington, DC, USA, 15–19 November 2014. P. 1208–1217.
- Kaufmann L., Rousseeuw P. Clustering by means of medoids // Data analysis based on the L1-norm and related methods. 1987. P. 405–416.
- Ward J.H. Hierarchical grouping to optimize an objective function // Journal of the American Statistical Association. 1963. Vol. 58. No 301. P. 236–244.
- Зайцев Р.Д., Бритков В.Б. Применение языка R для многомерной кластеризации временных рядов с целью анализа динамики научно-технического развития // Труды Второй молодежной научной конференции «Задачи современной информатики». Москва, 29–30 октября 2015 г. М.: ФИЦ ИУ РАН. С. 92–98.
- Ferreira L., Hitchcock D. A comparison of hierarchical methods for clustering functional data // Communications in Statistics – Simulation and Computation. 2009. No 38. P. 1925–1949. doi: 10.1080/03610910903168603.
- Коннов И.В., Кашина О.А., Гильманова Э.И. Решение задачи кластеризации методами оптимизации на графах // Ученые записки Казанского университета. Сер. Физико-математические науки. 2019. Т. 161. Кн. 3. С. 423–437. doi: 10.26907/2541-7746.2019.3.423-437.
- Boytsov L. Indexing methods for approximate dictionary searching // Journal of Experimental Algorithmics. 2011. Vol. 16. No 1. Article No 1.1. doi: 10.1145/1963190.1963191.
- Rousseeuw P.J. Silhouettes: A graphical aid to the interpretation and validation of cluster analysis // Journal of Computational and Applied Mathematics. 1987. No 20. P. 53–65. doi: 10.1016/0377-0427(87)90125-7.
- Huang Z., Lu X., Duan H., Fan W. Summarizing clinical pathways from event logs // Journal of Biomedical Informatics. 2013. Vol. 46. No 1. P. 111–127. doi: 10.1016/j.jbi.2012.10.001.
- Vorontsov K.V., Potapenko A.A. Tutorial on probabilistic topic modeling: Additive regularization for stochastic matrix factorization // AIST’2014, Analysis of Images, Social Networks and Texts. Communications in Computer and Information Science. Springer, 2014. P. 265–267.
Дополнительные файлы
