Association of genotypes of biotransformation enzymes with susceptibility to chronic pulmonary tuberculosis

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Background. Now it is well-known that the pulmonary tuberculosis is a multifactorial disease in which forming a certain role belongs as factors external the environment, and genetic to factors.

Aim. In this study, the association of genes of xenobiotic biotransformation enzymes: NAT2 [590G>A (rs1799930)], CYP2E1 [9896C>G (rs2070676)], ABCB1 [3435T>C (rs1045642)], GSTM1 (E/D) and GSTT1 (E/D) with susceptibility to torpid pulmonary tuberculosis was carried out.

Materials and methods. 123 people suffering from torpid pulmonary tuberculosis were included in the study. Genomic DNA was isolated using Arrow Blood DNA 500 reagent kits from whole blood (at the NorDiag Arrow station). Next, the polymerase chain reaction was staged in real time using sets of reagents for SNPs genotyping.

Results. The study showed an association of gene polymorphisms of xenobiotic biotransformation enzymes with susceptibility to torpid pulmonary tuberculosis, including certain clinical forms of pulmonary tuberculosis.

Conclusion. During the conducted research it was established that implementation of results of genotyping of enzymes of biotransformation of xenobiotics in practice of the doctor of the phthisiatrician for the purpose of forming of risk groups of suffering from tuberculosis lungs which have a susceptibility probability to this disease that perhaps in the future will provide the individualized approach to prevention and treatment of these patients is necessary.

About the authors

Maxim A. Alymenko

Kazan State Medical Academy – Branch Campus of the Russian Medical Academy of Continuous Professional Education; Moscow Financial and Industrial University „Synergy“

Author for correspondence.
Email: maxim.alymenko@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-7341-3648

Cand. Sci. (Med.)

Russian Federation, Kazan; Moscow

Ravil Sh. Valiev

Kazan State Medical Academy – Branch Campus of the Russian Medical Academy of Continuous Professional Education

Email: ravil.valiev@tatar.ru
ORCID iD: 0000-0001-8353-8655

D. Sci. (Med.), Prof.

Russian Federation, Kazan

Nail R. Valiev

Kazan State Medical Academy – Branch Campus of the Russian Medical Academy of Continuous Professional Education

Email: nailvaliev@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-6702-6243

Cand. Sci. (Med.)

Russian Federation, Kazan

Natalya P. Balobanova

Moscow Financial and Industrial University „Synergy“

Email: Balobanova.np@yandex.ru

Cand. Sci. (Biol.)

Russian Federation, Moscow

Alexander V. Batishchev

Moscow Financial and Industrial University „Synergy“

Email: bat-a-v@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-4872-0608

Cand. Sci. (Econ.)

Russian Federation, Moscow

Irina N. Tragira

National Medical Research Center of Tuberculosis and Infectious Diseases

Email: habicheva72@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6370-779X

Department Head

Russian Federation, Moscow

Viacheslav A. Lipatov

Kursk State Medical University

Email: drli@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6121-7412

D. Sci. (Med.), Prof.

Russian Federation, Kursk

Alexey V. Polonikov

Kursk State Medical University

Email: polonikov@rambler.ru
ORCID iD: 0000-0001-6280-247X

D. Sci. (Med.), Prof.

Russian Federation, Kursk

Vladislav M. Kolomiets

Kursk State Medical University

Email: vlacom@mail.ru
ORCID iD: 0009-0002-2042-4460

D. Sci. (Med.), Prof.

Russian Federation, Kursk

Svetlana N. Volkova

Ivanov Kursk State Agrarian University

Email: volkova_47@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7247-2432

D. Sci. (Agric.), Prof.

Russian Federation, Kursk

Galina S. Mal

Kursk State Medical University

Email: mgalina.2013@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-2723-781X

D. Sci. (Med.), Prof.

Russian Federation, Kursk

Vera A. Ragulina

Kursk State Medical University

Email: lev.ivanowa@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9461-9255

Cand. Sci. (Biol.)

Russian Federation, Kursk

References

  1. Туберкулез у взрослых. Клинические рекомендации. 2022 г. [Tuberkulez u vzroslykh. Klinicheskie rekomendatsii. 2022 g. (in Russian)].
  2. Можокина Г.Н., Казаков А.В., Елистратова Н.А., Попов С.А. Ферменты биотрансформации ксенобиотиков и персонификация режимов лечения больных туберкулезом. Туберкулез и болезни легких. 2016;94(4):6-12 [Mozhokina GN, Kazakov AV, Elistratova NA, Popov SA. Biotransformation enzymes for xenobiotics and personalization of treatment regimens for tuberculosis patients. Tuberculosis and Lung Diseases. 2016;94(4):6-12 (in Russian)]. doi: 10.21292/2075-1230-2016-94-4-6-12
  3. Белушкина Н.Н., Чемезов А.С., Пальцев М.А. Генетические исследования мультифакториальных заболеваний в концепции персонализированной медицины. Профилактическая медицина. 2019;22(3):26-30 [Belushkina NN, Chemezov AS, Pal'tsev MA. Genetic studies of multifactorial diseases in the concept of personalized medicine. Profilakticheskaya Meditsina. 2016;94(4):6-12 (in Russian)]. doi: 10.17116/profmed20192203126
  4. Ozhegova DS, Freidin MB, Pusyrev VP. Using the bioinformatic tools to choose the SNPs with highly possible phenotypic effect. Eur J Hum Gen. 2008;16:397.
  5. Рембовский В.Р., Могиленкова Л.А. Процессы детоксикации при воздействии химических веществ на организм. СПб. 2017 [Rembovskii VR, Mogilenkova LA. Protsessy detoksikatsii pri vozdeistvii khimicheskikh veshchestv na organizm. Saint Petersburg. 2017 (in Russian)].
  6. Щербо С.Н., Щербо Д.С., Соколова Н.А., и др. Генетическая предрасположенность и устойчивость к некоторым инфекционным заболеваниям. IV. Туберкулез. Медицинский алфавит. 2022;1(6):7-10 [Shcherbo SN, Shcherbo DS, Sokolova NA. Genetic predisposition and resistance to certain infectious diseases. IV. Tuberculosis. Medical alphabet. 2022;1(6):7-10 (in Russian)]. doi: 10.33667/2078-5631-2022-6-7-10
  7. Юнусбаева М.М., Карунас А.С., Бикмаева А.Р., и др. Исследование полиморфных локусов ряда генов цитокинов (TNFA, IL1B, IL1RA) и генов детоксикации ксенобиотиков (CYP1A1, CYP2E1, GSTM1) у больных инфильтративным туберкулезом легких. Пульмонология. 2008;(3):59-63 [Yunusbaeva MM, Karunas AS, Bikmaeva AR, et al. Genetic analysis of polymorphic loci of cytokine genes (TNFA, IL1B, IL1RA) and genes of detoxification (CYP1A1, CYP2E1, GSTM1) in patients with infiltrative pulmonary tuberculosis. Pulmonologiya. 2008;(3):59-63 (in Russian)]. doi: 10.18093/0869-0189-2008-0-3-59-63
  8. Забродский П.Ф., Мандыч В.Г. Иммунотоксикология ксенобиотиков: монография. Саратов. 2007 [Zabrodskii PF, Mandych VG. Immunotoksikologiia ksenobiotikov: мonografiia. Saratov. 2007 (in Russian)].
  9. Алыменко М.А., Валиев Р.Ш., Валиев Н.Р., и др. Ассоциация полиморфных вариантов генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков и цитокинов с деструкцией легочной ткани у больных туберкулезом. Туберкулез и болезни легких. 2022;100(8):25-30 [Alymenko MA, Valiev RSh, Valiev NR, et al. Association of Polymorphic Gene Variants of Xenobiotic Biotransformation Enzymes with Lung Tissue Destruction in Tuberculosis Patients. Tuberculosis and Lung Diseases. (in Russian)]. doi: 10.21292/2075-1230-2022-100-8-25-30
  10. Алыменко М.А., Валиев Р.Ш., Полоников А.В., и др. Ассоциация полиморфных вариантов генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков с восприимчивостью к заболеваемости туберкулезом легких. Туберкулез и болезни легких. 2022;100(6):17-22 [Alymenko MA, Valiev RSh, Polonikov AV, et al. Association of polymorphic gene variants of xenobiotic biotransformation enzymes with susceptibility to pulmonary tuberculosis. Tuberculosis and Lung Diseases. 2022;100(6):17-22 (in Russian)]. doi: 10.21292/2075-1230-2022-100-6-17-22

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2. Fig. 1. Distribution of TL patients by gender in the study group.

Download (57KB)
Indexing metadata
3. Fig. 2. The structure of clinical forms of torpid-current TL.

Download (55KB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2024 Consilium Medicum

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».