ETIOLOGY OF SEASONAL INCREASING OF ENTEROVIRAL INFECTION INCIDENCE IN ARKHANGELSK OBLAST

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Abstract. The etiology of seasonal increasing of enteroviral infection incidence in Arkhangelsk oblast in 2008–2011 has been studied. The ECHO 6, ECHO 9 and ECHO 30 viruses were isolated and identified from patients with enteroviral infection in this period. The highest enteroviral infection incidence rate in Arkhangelsk oblast which was 5,1 times higher in compare with average country index was registered in 2008. It was proved by the virological and molecular biological methods that the main etiological agent caused enteroviral meningitis cases in the seasonal outbreak in 2008 was ECHO 30 virus which was very similar to the ECHO 30 strain identified in the Veliky Novgorod in 2008. In 2009 from patients in enteroviral meningitis epidemic focus the ECHO 9 viruses were isolated. These viruses were similar to the ECHO 9 strains circulated in Russia in 2009. It was established that in the period of seasonal increasing of enteroviral infection in Arkhangelsk oblast in 2010–2011 in general circulated ECHO 6 viruses which clustered in 3 separate phylogenetic groups. Viruses ECHO 6 detected in Arkhangelsk oblast in 2011 were different from viruses identified in 2010. Results of the study confirm that monitoring of viruses in case of enteroviral infection remains the one of the important types of additional measures in the frame of Global Program of poliomyelitis eradication. This monitoring is absolutely necessary to define characteristics of epidemic process of enteroviral infection.

About the authors

L. A. Shishko

ФБУЗ Центр гигиены и эпидемиологии в Архангельской области, г. Архангельск

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

N. I. Romanenkova

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

M. A. Bichurina

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Author for correspondence.
Email: poliospb@nr3854.spb.edu

д.м.н., зав. лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

Russian Federation

T. A. Gordienko

Управление Роспотребнадзора по Архангельской области, г. Архангельск

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

N. R. Rozaeva

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

L. N. Golitcina

ФБУН Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. акад. И.Н. Блохиной, г. Нижний Новгород

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

L. B. Fomina

ФБУН Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. акад. И.Н. Блохиной, г. Нижний Новгород

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

O. I. Kanaeva

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

L. V. Lialina

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

N. A. Novikova

ФБУН Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. акад. И.Н. Блохиной, г. Нижний Новгород

Email: poliospb@nr3854.spb.edu
Russian Federation

References

  1. Авросьева Т.В., Поклонская Н.В., Безручко А.А., Фисенко Е.Г. Молекулярная характеристика и филогенетический анализ энтеровирусов, вызвавших вспышки и сезонные подъемы заболеваемости в разных регионах Республики Беларусь // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2006. — № 3. — С. 17–21.
  2. Бичурина М.А., Пьяных В.А., Новикова Н.А., Леонова Н.П., Клевцова Г.А., Романенкова Н.И., Иванова Т.Г., Голицына Л.Н., Фомина Л.Б, Розаева Н.Р., Цейц О.Е., Луковникова Л.Б., Канаева О.И., Епифанова Н.В. Сезонный подъем заболеваемости энтеровирусным менингитом в Новгородской области // Инфекция и иммунитет. — 2012. — Т. 2, № 4. — С. 747–752.
  3. Голицына Л.Н., Фомина С.Г., Новикова Н.А. Молекулярно-генетические варианты вируса ECHO 9, идентифицированные у больных серозным менингитом в России в 2007–2009 гг. // Вопр. вирусологии. — 2011. — № 6. — С. 37–42.
  4. Лукашев А.Н., Иванова О.Е., Еремеева Т.П., Лашкевич В.А., Черненко К.Е. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 30 на территории России и стран СНГ // Вопр. вирусологии. — 2004. — № 5. — С. 12–16.
  5. Лукашев А.Н., Резник В.И., Иванова О.Е., Еремеева Т.П., Каравенская Т.Н., Перескокова М.А., Лебедева Л.А., Лашкевич В.А., Михайлов М.И. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 6 — возбудителя вспышка серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. // Вопр. вирусологии. — 2008. — № 1. — С. 16–21.
  6. Новикова Н.А., Голицына Л.Н., Фомина С.Г. Молекулярный мониторинг неполиомиелитных энтеровирусов на территории России 2008–2011 гг. // Инфекция и иммунитет. — 2012. — Т. 2. — № 1–2: Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации: материалы X съезда Всерос. науч.-практ. о-ва эпидемиологов, микро биологов и паразитологов. — С. 533.
  7. Онищенко Г.Г., Новикова Н.А., Ефимов Е.И., Княгина О.Н., Петров Е.Ю., Новиков Д.В., Голицына А.Н., Калашникова Н.А., Епифанова Н.В., Погодина Л.В. Сезон энтеровирусного серозного менингита в Нижнем Новгороде в 2007 г.: молекулярно-эпидемиологические аспекты // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2009. — № 2. — С. 24–30.
  8. Резник В.И., Кожевникова Н.В., Каравянская Т.Н., Воронцова Г.М., Перескокова М.А., Иванова О.Е., Еремеева Т.П., Лукашев А.Н. Эпидемиологическая и этиологическая характеристика энтеровирусных инфекций в Хабаровском крае // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2007. — № 5. — С. 32–37.
  9. Романенкова Н.И., Бичурина М.А., Розаева Н.Р. Надзор за полиомиелитом и энтеровирусной инфекцией на ряде территорий Российской Федерации // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2011. — № 6. — С. 32–36.
  10. Сейбиль В.Б., Фролочкина Т.И. Серозный менингит // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. — 2006. — № 1. — С. 87–92.
  11. Сергиев В.П. Ликвидация полиомиелита в Европейском регионе ВОЗ // Вакцинация. — 2002. — № 6 (24). — С. 2.
  12. Энтеровирусные инфекции: руководство для врачей. — СПб., 2012. — 432 с.
  13. Bailly J.L., Mirand A., Henquell C., Archimbaud C., Chambon M., Charbonne F., Traore O., Peigue-Lafeuille H. Phylogeography of circulating populatios of human echovirus 30 over 50 years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene // Infect. Genet. Evol. — 2009. — N 9. — Р. 699–708.
  14. CDC. Outbreaks of aseptic meningitis associated with echovirus 9 and 30 and preliminary surveillance reports on enterovirus activity — United States, 2003 // Morbid. Mortal. Wkly Rep. — 2003. — Vol. 52. — P. 761–764.
  15. Certification of poliomyelitis eradication — European Region // Morbid. Mortal. Wkly Rep. — 2002. — Vol. 51. — P. 572–574.
  16. Domingo E., Escarmis C., Sevilla N. Basic concepts in RNA virus evolution // Faseb. J. — 1996. — N 10. — P. 859 –864.
  17. Fares W., Rezig D., Seghier M. Phylogenetic analysis of complete VP1 sequences of echoviruses 11 and 6: high genetic diversity and circulation of genotypes with a wide geographical and temporal range // J. Med. Microbiol. — 2011. — N 60. — Р. 1017–1025.
  18. Laboratory support for activities aimed at the global eradication of poliomyelitis by the year 2000. Plan of Action // WHO. — 1995. — 15 p.
  19. Lashkevich V.A., Koroleva G.A., Lukashev A.N. Enterovirus uveitis // Rev. Med. Virol. — 2004. — N 14. — P. 241–254.
  20. Oberste M.S, Maher K., Kennet M.L. Molecular epidemiology and genetic diversity of echovirus type 30 (E 30): genotypes correlate with temporal dynamics of E30 isolation // J. Clin. Microbial. — 1999. — Vol. 37. — P. 3928–3933.
  21. Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens // Clin. Microbiol. — 2006. — Vol. 44. — P. 2698–2704.
  22. Plan of action for global eradication of poliomyelitis // WHO, 1993. — 17 p.
  23. Polio laboratory manual. — WHO, Geneva, 2004. — 157 p.
  24. Rotbart M.A., Brennan P.J., Fife K.H. Enterovirus meningitis in adults // Clin. Infect. Dis. — 1998. — Vol. 27. — P. 896–898.
  25. Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0 // Mol. Biol. Evol. — 2007. — Vol. 24. — P. 1596–1599.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2014 Shishko L.A., Romanenkova N.I., Bichurina M.A., Gordienko T.A., Rozaeva N.R., Golitcina L.N., Fomina L.B., Kanaeva O.I., Lialina L.V., Novikova N.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».