OPPORTUNITIES AND CHALLENGE OF SHIGELLOSIS AND SALMONELLOSIS VERIFICATION IN ADULT ACUTE DIARRHEA CASES

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

The paper suggests the frequency of enteropathogenic agents detected by different lab methods in feces of 262 adult acute diarrhea cases. The compared is the frequency results of Shigella spp. and Salmonella spp.detection by standard methods (culture and specific sera antibody finding) and PCR method. The calculated is some operational characteristics of PCR test (compared to culture test). The shown is that the frequency results of Salmonella spp. detected by standard and PCR methods are comparable, with high figures of all operational characteristics of PCR method. As to Shigella spp. detection the positive result by PCR method were obtained in 2,5 times more cases than that by standard method. However such PCR test characteristic as “positive predictive value” was quite low with the lowest figures in cases without colitis syndrome.

About the authors

E. A. Kozhukhova

Pavlov First St. Petersburg State Medical University

Author for correspondence.
Email: elko35@gmail.com
PhD (Medicine), MD, Senior Researcher, Chronic Viral Infection Laboratory of the Research Center (Branched from Infectious Diseases and Epidemiology Department), 197022, Russian Federation, St. Petersburg, L’va Tolstogo str., 6/8 Russian Federation

V. D. Ivaschenko

Pavlov First St. Petersburg State Medical University

Email: fake@neicon.ru

PhD (Medicine), MD, Senior Researcher, Chronic Viral Infection Laboratory of the Research Center (Branched from Infectious Diseases and Epidemiology Department), 197022, Russian Federation, St. Petersburg, L’va Tolstogo str., 6/8

Russian Federation

References

  1. Каджаева Э.П., Горелова А.В., Усенко Д.В., Битиева Р.Л., Шипулин Г.А., Подколзин А.Т. Этиологическая структура острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в крупный стационар Москвы // Инфекционные болезни. 2006. Т. 4, № 2. С. 34–36. [Kadjaeva E.P., Gorelov A.V., Usenko D.V., Bitieva R.L., Shipulin G.A., Podkolzin A.T. The etiologic structure of acute enteric infections in children admitted to a large hospital in Moscow. Infektsionnye bolezni = Infectious Diseases, 2006, vol. 4, no. 2, pp. 34–36. (In Russ.)]
  2. Кожухова Е.А., Беляева Т.В., Егорова С.А., Кафтырева Л.А. Течение моношигеллеза Флекснера и характеристика свойств циркулирующих в Санкт-Петербурге штаммов // Российский биомедицинский журнал Medline.ru. 2006. Т. 7. С. 499–507. [Kozhukhova E.A., Belyaeva T.V., Egorova S.A., Kaftyreva L.A. Clinical pattern of intestinal infection caused by Flexneri and characteristics of strains circulating in Saint-Petersburg. Rossiiskii biomeditsinskii zhurnal Medline.ru = Russian Biomedical Journal Medline.ru, 2006, vol. 7, pp. 499–507. (In Russ.)]
  3. Кожухова Е.А., Иващенко В.Д., Горбова И.В. Детекция энтеропатогенов для верификации острых диарей у взрослых больных // Ученые записки СПбГМУ им. академика И.П. Павлова. 2013. Т. XХ, № 2. С. 62–66. [Kozhukhova E.A., Ivaschenko V.D., Gorbova I.V. Enteropathogene detection for verification of adult acute diarrhea cases. Uchenye zapiski SPbGMU im. akademika I.P. Pavlova = The Record of the I.P. Pavlov St. Petersburg State Medical University, 2013, no. 2, pp. 62–66. (In Russ.)]
  4. Комков Б.Д., Сергевнин В.И., Сармометов Е.В., Сковородин А.Н. Роль различных путей передачи возбудителей при вспышках дизентерии Зонне и Флекснера, зарегистрированных в последние годы // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2000. № 6. С. 18–20. [Komkov B.D., Sergevnin B.I., Sarmometov E.V., Skovorodin A.N. The role of different infection transmission routes in recently registered outbreaks of dysentery caused by Sonnei and Flexneri. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni = Epidemiology and Infectious Diseases, 2000, no. 6, pp. 18–20. (In Russ.)]
  5. Лобзин Ю.В., Огарков П.И., Сиволодский Е.П., Корольков В.Ф., Речкин В.И., Семещенко И.Е., Финогеев Ю.П., Захаренко С.М., Винакмен Ю.А. Дизентерия и другие острые кишечные диарейные инфекции // Указания по диагностике, лечению и профилактике в ВС РФ. М., 2000. 197 с. [Lobzin Yu.V., Ogarkov P.I., Sivolodsky E.P., Korol’kov V.F., Rechkin V.I., Semeschenko I.E., Finogheev Yu.P., Zakharenko S.M., Vinakmen Yu.A. Dizenteriya i drugie ostrye kishechnye diareinye infektsii [Dysentery and other acute diarrheal intestinal infections]. Ukazaniya po diagnostike, lecheniyu i profilaktike v VS RF = Guidelines on diagnostics, treatment and prevention in MF of RF. Мoscow, 2000. 197 p.
  6. Онищенко Г.Г. О состоянии инфекционной заболеваемости в Российской Федерации в 2000 г. и принимаемых мерах по ее стабилизации // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2001. № 5. С. 3–7. [Onischenko G.G. On infectious disease incidence in Russian Federation in 2000 and on measures being assumed to stabilize it. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2001, no. 5, pp. 3–7. (In Russ.)]
  7. Садовникова В.Н., Ясинский А.А. Инфекционная заболеваемость в Российской Федерации (1990–2000 гг.) // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2001. № 0/01 (пилотный номер). С. 3–9. [Sadovnikova V.N., Yassinsky А.А. Infectious disease incidence in Russian Federation (1990–2000). Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika = Epidemiology and Vaccine Prevention, 2001, no. 0/01 (pilot number), pp. 3–9. (In Russ.)]
  8. Ющук Н.Д., Розенблюм А.Ю., Пархоменко Ю.Г., Ефремова Л.В., Тишкевич О.А., Карманов М.И., Каншина Н.Н., Буров В.П., Бергман Г.А. Клинико-морфологические особенности шигеллеза Флекснера у больных с отягощенным преморбидным фоном // Журнал микробиологии, эпидемиологии и имунобиологии. 2002. № 2. С. 77–79. [Iushchuk N.D., Rozenblium A.I., Parkhomenko I.G., Efremova L.V., Tishkevich O.A., Karmanov M.I., Kanshina N.N., Burov V.P., Bergman G.A. Clinical and morphological aspects of shigellosis Flexneri in patients with an aggravated premorbid state. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology 2002, no. 2, pp. 77–79. (In Russ.)]
  9. Яковлев А.А., Мусатов В.Б., Котлярова С.И., Неверов В.А., Кинго З.Н., Федуняк И.П., Лукашевич Э.Н. Возможности высокотехнологичной идентификации возбудителей острых кишечных инфекций в Санкт-Петербурге // Вестник Санкт-Петербургской медицинской академии последипломного образования. 2010. Т. 2, № 3. С. 5–8. [Yakovlev A.A., Musatov V.B., Kotlyarova S.I., Neverov V.A., Kingo Z.N., Fedunyak I.P., Lukashevich E.N. Features high-tech identification of pathogens acute intestinal infections at St. Petersburg. Vestnik Sankt-Peterburgskoi meditsinskoi akademii poslediplomnogo obrazovaniya = Herald of Saint-Petersburg Medical Academy for Postgraduate Education, 2010, no. 3, pp. 5–8. (In Russ.)]
  10. Яковлев А.А., Погромская М.Н., Федуняк И.П., Мусатов В.Б., Кутузов В.Н., Горбова И.В., Кафтырева Л.А., Коржаев Ю.Н., Петрова Л.В. Этиологическая характеристика и практические уроки крупной вспышки острой кишечной инфекции среди трудовых мигрантов // Журнал инфектологии. 2013. № 4. С. 55–60. [Yakovlev A.A., Pogromskaya M.N., Fedunyak I.P., Musatov V.B., Kutuzov V.N., Gorbova I.V., Kaftyreva L.A., Korzhaev Yu.N., Petrova L.V. Etiological characteristics and practical lessons of a major outbreak of acute intestinal infection among migrant workers. Zhurnal infektologii = Journal of Infectology, 2013, no. 4, pp. 55–60. (In Russ.)]
  11. Desai D., Faubion W.A., Sandborn W.J. Review article: biological activity markers in inflammatory bowel disease. Aliment. Pharmacol. Ther., 2007, vol. 25, iss. 3, pp. 247–255. doi: 10.1111/j.1365-2036.2006.03184.x
  12. Dutta S., Chatterjee A., Dutta P., Rajendran K., Roy S., Pramanik K.C., Bhattacharya S.K. Sensitivity and performance characteristics of a direct PCR with stool samples in comparison to conventional techniques for diagnosis of Shigella and enteroinvasive Escherichia coli infection in children with acute diarrhoea in Calcutta, India. J. Med. Microbiol., 2001, vol. 50, no. 8, pp. 667–674.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2015 Kozhukhova E.A., Ivaschenko V.D.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».