Метод идентификации acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens и его суббиоваров А и В

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования — повысить диагностическую чувствительность идентификации бактерий A. baumannii bv. tryptophandestruens и определить распространенность этого биовара и его суббиоваров среди клинических изолятов A. baumannii. Объектом исследования были 210 первичных штаммов A. baumannii, выделенных в 2021–2022 гг. в бактериологической лаборатории Военно-медицинской академии имени С.М. Кирова, из них 42 — штаммы A. baumannii bv. tryptophandestruens. Бактерии биовара tryptophandestruens идентифицировали по хромогенной биотрансформации бензоата натрия на плотной питательной среде (г/л): пептон ферментативный 5,0; NaCl 5,0; FeCl3 6H2O (10% водный раствор) 0,1–1 мл; бромтимоловый синий (1,6% водный раствор) 3 мл; агар 15,0; NaOH (4% раствор) 2,6–3 мл; вода дистиллированная 1 л; все компоненты растворяли при нагревании, затем добавляли бензоат натрия (CAS 532-32-1) 1,0–2,0; корректировали рН 7,2±0,2; стерилизовали при 121°С, разливали в чашки. Бактерии суббиоваров А и В биовара tryptophandestruens идентифицировали по хромогенной биотрасформации L-триптофана, используя эту же питательную среду с L-триптофаном (1,0–2,0 г/л) вместо бензоата натрия. Обе питательные среды применяли одновременно. Исследуемые культуры A. baumannii засевали петлей на среды в виде бляшки, инкубировали аэробно при 37°С 18–24 ч, затем учитывали результат: наличие темно-коричневой зоны окраски питательной среды вокруг газона бактерий на среде с бензоатом натрия и на среде с L-триптофаном указывало на их принадлежность к суббиовару А биовара tryptophandestruens; при наличии зоны темно-коричневой окраски питательной среды вокруг газона бактерий на среде с бензоатом натрия и отсутствии зоны окраски на среде с L-триптофаном идентифицировали биовар tryptophandestruens суббиовар В. В результате исследования впервые выявлена хромогенная биотрансформация бензоата натрия (бензойной кислоты) и ее значение как маркера биовара tryptophandestruens A. baumannii. Обнаружены два суббиовара А и В биовара tryptophandestruens. Разработан метод идентификации биовара tryptophandestruens A. baumannii и его суббиоваров А и В по хромогенной биотрасформации бензоата натрия и L-триптофана, что повышает диагностическую чувствительность метода за счет выявления суббиовара В. Установлена частота распространения бактерий биовара tryptophandestruens среди первичных клинических изолятов A. baumannii в 2021–2022 гг.: из 210 штаммов A. baumannii — 42 (20,0±3,5%) — штаммы bv. tryptophandestruens, в том числе суббиовар А — 27 (12,9±2,3%), суббиовар В — 15 (7,1±1,7%).

Об авторах

Евгений Петрович Сиволодский

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ; ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: es279@yandex.ru

профессор, профессор кафедры микробиологии, старший научный сотрудник лаборатории молекулярно-биологических технологий

Россия, 194044, Санкт-Петербург, улица Академика Лебедева, 6; 197101, Санкт-Петербург, улица Мира, 14

Людмила Александровна Краева

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ; ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: lykraeva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9115-3250
SPIN-код: 4863-4001
Scopus Author ID: 23473821900
ResearcherId: H-1786-2012

доктор медицинских наук, доцент, заведующая лабораторией медицинской бактериологии, профессор кафедры микробиологии

Россия, 194044, Санкт-Петербург, улица Академика Лебедева, 6; 197101, Санкт-Петербург, улица Мира, 14

Елена Владимировна Мельникова

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ

Email: es279@yandex.ru

врач-бактериолог Центральной клинико-диагностической лаборатории

Россия, 194044, Санкт-Петербург, улица Академика Лебедева, 6

Галина Васильевна Горелова

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ

Автор, ответственный за переписку.
Email: es279@yandex.ru

врач-бактериолог, зав. Центральной клинико-диагностической лабораторией

Россия, 194044, Санкт-Петербург, улица Академика Лебедева, 6

Список литературы

  1. Белобородова Н.В., Осипов А.А., Бедова А.Ю. Биологические свойства некоторых низкомолекулярных ароматических микробных метаболитов, ассоциированных с сепсисом // Антибиотики и химиотерапия. 2013. Т. 58, № 7–8. С. 48–61. [Beloborodova N.V., Osipov A.A., Belova A.Yu. Biological properties of some sepsis-associated low molecular aromatic microbial metabolism. Antibiotiki i khimioterapiya = Antibiotics and Chemotherapy,2013, vol. 58, no. 7–8, pp. 48–61 (In Russ.)]
  2. Сиволодский Е.П., Горелова Г.В., Богословская С.П., Зуева Е.В. Селективная синтетическая питательная среда «Ацинетобактер фенилаланин агар» для выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter caicoaceticus–Acinetobacter baumannii // Инфекция и иммунитет. 2020. Т. 10, № 5. С. 591–596. [Sivolodskii E.P., Gorelova G.V., Bogoslovskaja S.P., Zueva E.V. Selective syntetic growth medium «Acinetobacter phenylalanine agar» for isolation and identification of Acinetobacter calcoaceticus–Acinetobacter baumannii complex species. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of nfection and Immunity,2020, vol. 10, no. 5, pp. 591–596. (In Russ.)] doi: 10.15789/2020-7619-ASS-1177
  3. Сиволодский Е.П., Краева Л.А., Старкова Д.А., Михайлоов Н.В., Горелова Г.А. Acinetobacter baumannii bv. Tryptophandestruens bv. nov., выделенный из клинического материала // Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11, № 5. С. 965–972. [Sivolodskii E.P., Kraeva L.A., Starkova D.A., Mikhailov N.V., Gorelova G.V. Acinetobacter baumannii bv. Tryptophandestruens bv. nov., isolated from clinical samples. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity,2021, vol. 11, no. 5, pp. 965–972 (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-ABB-1676
  4. Kurnasov O., Jablonski L., Polanuyer B., Dorrestein P., Begley T., Osterman A. Aerobic tryptophan degradation pathway in bacteria: novel kynurenine formamidase. FEMS Microbiol. Lett.,2003, vol. 227, no. 2. pp. 213–227. doi: 10.1016/S0378-1097(03)00684-0.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Сиволодский Е.П., Краева Л.А., Мельникова Е.В., Горелова Г.В., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».