Особенности современных вирусов гриппа А(H3N2) человека, циркулировавших на территории России в период 2016–2018 гг.

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Вирусы гриппа А(H3N2) демонстрируют самый высокий уровень эволюционной изменчивости по сравнению с другими вирусами гриппа, циркулирующими в человеческой популяции. Штаммы данного подтипа поражают большое количество лиц, относящимся к группам повышенного риска: детей младше трех лет, беременных женщин, лиц старше 65 лет, медицинских работников, а также лиц, имеющих хронические заболевания нервной, сердечно-сосудистой и дыхательной систем. Вирусы А(H3N2) вызывают значительное количество смертельных случаев среди лиц старше 65 лет. Штаммы данного подтипа вызывают наиболее тяжелые случаи гриппозной инфекции, сопровождающиеся серьезными осложнениями. В статье представлены результаты анализа антигенных и других биологических свойств циркулирующих вирусов гриппа человека А(H3N2) на территории России в эпидемических сезонах 2016–2018 гг. Представлены данные активности нейраминидазы (NA) современных вирусов гриппа А(H3N2), полученные MUNANA-тестом, выделенных на клеточных культурах MDCK и MDCK-Siat1, проанализирована роль аминокислотных замен в NA в зависимости от системы выделения штаммов. В связи с изменениями рецепторных свойств вирусов важным является подбор оптимальных условий выделения. Нами были выбраны клеточные культуры, рекомендованные ВОЗ, которые различаются по своим рецепторным свойствам. Проведена оценка эффективности выделения вирусов данного подтипа на клеточных линиях MDCK и MDCK-Siat1. Установлено, что эффективность выделения вирусов гриппа А(H3N2) на клеточной культуре MDCK-Siat1 составила 77,3%, а на MDCK — 71,3%. Показано, что большинство выделенных изолятов (68,6% в 2016–2017 гг. и 44,6% в 2017– 2018 гг.) имеют NA-индуцированную агглютинацию эритроцитов. Установлено, что современные российские штаммы данного подтипа не имеют существенных антигенных отличий при выделении и пассировании на различных клеточных культурах, однако возможно появление адаптационных замен в нейраминидазе. При изучении антигенных свойств вирусов гриппа А(H3N2) методом РТГА и реакцией микронейтрализации (cell-ELISA) отмечено, что большинство штаммов, выделенных в эпидемическом сезоне 2017–2018 гг., были антигенно родственны референс-штамму А/Сингапур/INFIMH-16-0019/2016 (MDCK-Siat1) и взаимодействовали с антисывороткой к нему до гомологичного титра. По результатам секвенирования установлено, что в эпидемическом сезоне 2017–2018 гг. на территории России были выявлены вирусы субклайда 3С.2а2, а также 3С.2а3 и 3С.2а1b. Таким образом, была выявлена нарастающая генетическая гетерогенность вирусов А(H3N2) на территории России.

Об авторах

П. А. Петрова

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: suddenkovapolina@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-8527-7946

Петрова Полина Александровна, младший научный сотрудник лаборатории эволюционной изменчивости вирусов гриппа

197376, Санкт-Петербург, ул. Проф. Попова, 15/17

Тел.: 8 952 233-36-21 (моб.).

Россия

Н. И. Коновалова

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Email: konovalova_nadya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7213-9306

к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории эволюционной изменчивости вирусов гриппа

Санкт-Петербург Россия

А. Д. Васильева

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Email: nastasya_vasileva_94@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6818-5548

лаборант-исследователь лаборатории эволюционной изменчивости вирусов гриппа

Санкт-Петербург

Россия

Е. М. Еропкина

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Email: elena.eropkina@gmail.com

к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории эволюционной изменчивости вирусов гриппа

Санкт-Петербург

Россия

А. А. Иванова

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Email: anna_e_svobodniy@mail.ru

м.н.с., лаборатории молекулярной вирусологии

Санкт-Петербург

Россия

А. Б. Комиссаров

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Email: a.b.komissarov@gmail.com

зав. лабораторией молекулярной вирусологии

Санкт-Петербург Россия

М. Ю. Еропкин

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Email: mikhail.eropkin@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-3306-847X

д.б.н., зав. лабораторией эволюционной изменчивости вирусов гриппа

Санкт-Петербург

Россия

Д. М. Даниленко

ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России

Email: daria.baibus@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-6174-0836

к.б.н., зам. директора по научной работе, зав. отделом этиологии и эпидемиологии гриппа и ОРВИ

Санкт-Петербург Россия

Список литературы

  1. Даниленко Д.М., Коновалова Н.И., Прокопец А.В., Бильданова Е.Р., Еропкин М.Ю., Соминина А.А. Возможности использования поликлональных крысиных антисывороток в антигенном анализе вирусов гриппа человека // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2013. № 1 (68). С. 73–79.
  2. Australian Influenza Surveillance Report and Activity Updates – 2017.
  3. CDC: Influenza Activity in the United States During the 2017–18 Season and Composition of the 2018–19 Influenza Vaccine.
  4. Gulati S., Smith D.F., Cummings R.D., Couch R.B., Griesemer S.B., George K.S., Webster R.G., Air G.M. Human H3N2 influenza viruses isolated from 1968 to 2012 show varying reference for receptor substructures with no apparent consequences for disease or spread. PLoS One, 2013, vol. 8: 6. doi: 10.1371/journal.pone.0066325
  5. Koel B.F., Burke D.F., Bestebroer T.M., van der Vliet S., Zondag G.C., Vervaet G., Skepner E., Lewis N.S., Spronken M.I., Russell C.A., Eropkin M.Y., Hurt A.C., Barr I.G., de Jong J.C., Rimmelzwaan G.F., Osterhaus A.D., Fouchier R.A., Smith D.J. Substitutions near the receptor binding site determine major antigenic change during influenza virus evolution. Science, 2013, vol. 342, pp. 976–979. doi: 10.1126/science.1244730
  6. Lin Y., Gregory V., Collins P., Kloess J., Wharton S., Cattle N., Lackenby A., Daniels R., Hay A. Neuraminidase receptor binding variants of human influenza A (H3N2) viruses resulting from substitution of aspartic acid 151 in the catalytic site: a role in virus attachment? J. Virol., 2010, vol. 84, no. 13, pp. 6769–6781. doi: 10.1128/JVI.00458-10
  7. Lin Y., Wharton S.A., Whittaker L., Dai M., Ermetal B., Lo J., Pontoriero A., Baumeister E., Daniels R.S., McCauley J.W. The characteristics and antigenic properties of recently emerged subclade 3C.3a and 3C.2a human influenza A(H3N2) viruses passaged in MDCK cells. Influenza Other Respir. Viruses, 2017, vol. 11, no. 3, pp. 263–274. doi: 10.1111/irv.12447
  8. Lin Y., Xiong X., Wharton S.A., Martin S.R., Coombs P.J. Evolution of the receptor binding properties of the influenza A(H3N2) hemagglutinin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2012, vol. 109, no. 52, pp. 21474–21479. doi: 10.1073/pnas.1218841110
  9. Manual for the laboratory diagnosis and virological surveillance of influenza. WHO Press, 2011.
  10. Matrosovich M., Matrosovich T., Carr J., Roberts N.A., Klenk H. Overexpression of the α-2,6-sialyltransferase in MDCK cells increases influenza virus sensitivity to neuraminidase inhibitors. J. Virol., 2003, vol. 77, no. 15, pp. 8418–8425. doi: 10.1128/JVI.77.15.8418-8425.2003
  11. Mohr P.G., Deng Y.M., McKimm-Breschkin J.L. The neuraminidases of MDCK grown human influenza A(H3N2) viruses isolated since 1994 can demonstrate receptor binding. Virology J., 2015, no. 12: 67. doi: 10.1186/s12985-015-0295-3
  12. Namura D, Nguyen H.T., Sleeman K., Levine M., Mishin V.P., Yang H., Guo Z., Okomo-Adhiambo M., Xu X., Stevens J., Gubareva L.V. Cell culture-selected substitutions in influenza A(H3N2) neuraminidase affect drug susceptibility assessment. Antimicrob. Agents Chemother., 2013, vol. 57, no. 12, pp. 6141–6146. doi: 10.1128/AAC.01364-13
  13. Nicholls J.M., Bourne A.J., Chen H., Guan Y., Peiris J.S. Sialic acid receptor detection in the human respiratory tract: evidence for widespread distribution of potential binding sites for human and avian influenza viruses. Respir. Res., 2007, vol. 8: 73. doi: 10.1186/1465-9921-8-73
  14. Skowronski D.M., Sabaiduc S., Chambers C., Eshaghi A., Gubbay J.B. Krajden M., Drews S.J., Martineau C., De Serres G., Dickinson J.A., Winter A.L., Bastien N., Li Y. Mutations acquired during cell culture isolation may affect antigenic characterization of influenza A(H3N2) clade 3C.2a viruses. Eurosurveillance, 2016, vol. 21, no. 3: 30112. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2016.21.3.30112
  15. Smith D.J., Lapedes A.S., de Jong J.C., Bestebroer T.M., Rimmelzwaan G.F., Osterhaus A.D., Fouchier R.A. Mapping the antigenic and genetic evolution of influenza virus. Science, 2004, vol. 305, pp. 371–376. doi: 10.1126/science.1097211
  16. Xiong X., McCauley J.W., Steinhauer D.A. Receptor binding properties of the influenza virus hemagglutinin as a determinant of host range. Curr. Top. Microbiol. Immunol., 2014, vol. 385, pp. 63–91. doi: 10.1007/82_2014_423
  17. Xue K.S, Greninger A.L., Pérez-Osorio A., Bloom J.D. Cooperating H3N2 influenza virus variants are not detectable in primary clinical samples. mSphere, 2018, vol. 3, no. 1: e00552-17. doi: 10.1128/mSphereDirect.00552-17
  18. Xue K.S., Hooper K.A., Ollodart A.R., Dingens A.S., Bloom J.D. Cooperation between distinct viral variants promotes growth of H3N2 influenza in cell culture. Microbiol. Infec. Dis., 2016, no. 5: e13974. doi: 10.7554/eLife.13974
  19. WHO Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2019 southern hemisphere influenza season.
  20. Worldwide influenza centre WHO CC for Reference & Research on Influenza Annual report. The Francis Crick Institute. February, 2017.
  21. Worldwide influenza centre WHO CC for Reference & Research on Influenza Annual report. The Francis Crick Institute. February, 2018.
  22. Worldwide influenza centre WHO CC for Reference & Research on Influenza Annual report. The Francis Crick Institute. September, 2018.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Петрова П.А., Коновалова Н.И., Васильева А.Д., Еропкина Е.М., Иванова А.А., Комиссаров А.Б., Еропкин М.Ю., Даниленко Д.М., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».