Метод фенотипической идентификации бактерий Acinetobacter seifertii

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования: повысить точность видовой идентификации Acinetobacter seifertii фенотипическим методом. Объекты исследования: 5 штаммов A. seifertii (3 выделены в микробиологической лаборатории Военно-медицинской академии, 2 штамма получены из Института имени Пастера (Санкт-Петербург)). Также изучали клинические штаммы группы A. baumannii (группы Ав), выделенные в Военно-медицинской академии в 2023–2024 гг.: A. baumannii (n = 152), из них 37 штаммов биовара tryptophandestruens, A. nosocomialis (n = 12), A. pittii (n = 6), 3 штамма A. calcoaceticus из реки Невы. Вид указанных штаммов определяли методом MALDI-ToF масс-спектрометрии. Принадлежность штаммов к группе Ав устанавливали таксономическими тестами. Биовар A. baumannii bv. tryptophandestruens определяли по хромогенной реакции на питательной среде с бензоатом натрия. Уреазу быстрой активности выявляли микрообъемным методом с учетом через 3 часа. Утилизацию D-ксилозы в качестве единственного источника углерода определяли на питательной среде, содержащей (г/л): D-ксилоза 2,0; NH4CI 5,0; NH4NO3 1,0; Na2SO4 2,0; K2HPO4 3,0; KH2PO4 1,0; MgSO4 0,1; бромтимоловый синий 1,6% водный раствор 4 мл; агар бактериологический 15,0; вода дистиллированная 1 л; рН 7,2±0,2; стерилизация при 112°С 20 мин. Исследовали чистую культуру бактерий, у которой предварительно выявлены признаки группы Ав и рост на питательной среде с ацетатом натрия (контроль отсутствия ауксотрофности). Агаровую культуру бактерий суспендировали в 0,1 мл 0,85% раствора хлорида натрия, засевали одну петлю взвеси бактерий штрихом на питательную среду с D-ксилозой и среду без D-ксилозы (контроль), инкубировали аэробно при 30°С 24–48 часов. Отсутствие роста бактерий на среде с D-ксилозой и среде без D-ксилозы при наличии их роста на питательной среде с ацетатом натрия указывает на принадлежность к виду A. seifertii. Исследования показали: все штаммы A. seifertii не утилизируют D-ксилозу, а все штаммы других видов группы Ав утилизируют D-ксилозу. Бактерии A. seifertii не утилизируют L-арабинозу, однако 29,6±3,7% штаммов A. baumannii не утилизируют L-арабинозу, в том числе все 37 штаммов биовара tryptophandestruens, что определяет ненадежность этого теста для идентификации A. seifertii. Большинство штаммов A. seifertii (4 из 5) имеют уреазу быстрой активности, что указывает на их близость к виду A. nosocomialis. Разработан метод идентификации бактерий A. seifertii по совокупности фенотипических признаков бактерий группы Ав с тестом на утилизацию D-ксилозы. Установлено, что использование теста на утилизацию D-ксилозы совместно с выявлением уреазы быстрой активности позволяет точно идентифицировать бактерии A. seifertii и A. nosocomialis среди других видов группы Ав.

Об авторах

Е. П. Сиволодский

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ

Email: lykraeva@yandex.ru

д.м.н., профессор кафедры микробиологии 

Россия, Санкт-Петербург

Л. А. Краева

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ; ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Автор, ответственный за переписку.
Email: lykraeva@yandex.ru

д.м.н., зав. лабораторией медицинской бактериологии ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; профессор кафедры микробиологии ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Россия, Санкт-Петербург; Санкт-Петербург

Е. В. Мельникова

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ

Email: lykraeva@yandex.ru

зав. лабораторией микробиологии Центральной клинико-диагностической лаборатории 

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Сиволодский Е.П., Зуева Е.В. Способ фенотипической идентификации бактерий Acinetobacter nosocomialis // Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11, № 3. С. 591–596. [Sivolodskii E.P., Zueva E.V. Menhod for phenotypic identification of Acinetobacter nosocomialis bacteria. Infektsiya i immunitet = Russian of Journal of Infection and Immunity, 2021, vol. 11, no. 3, pp. 591–596. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-MFP-1422
  2. Сиволодский Е.П., Краева Л.А., Мельникова Е.В. Горелова Г.В. Метод идентификации Acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens и его суббиоваров А и В // Инфекция и иммунитет. 2023. Т. 13, № 3. С. 591–595. [Sivolodskii E.P., Kraeva L.A., Melnikova E.V., Gorelova G.V. Method of Identification of Acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens and its subbiovars A and B. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2023, vol. 13, no. 5, pp. 591–595. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-MFI-9379
  3. Сиволодский Е.П., Краева Л.А., Старкова Д.А., Михайлов Н.В., Горелова Г.В. Acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens выделенный из клинического материала // Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11, № 5. С. 965–972. [Sivolodskii E.P., Kraeva L.A., Starkova D.A., Mikhailov N.V., Gorelova G.V. Acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens bv. nov. isolated from clinical simplex. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2021, vol. 11, no. 5, pp. 965–972. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-ABB-1676
  4. Cerezales C., Xantopoulou K., Ertel J., Bustamante Z., Seifert H., Gallego L., Higgins P.G. Identification of Acinetobacter seifertii isolated from Bolivian hospitals. J. Med. Microbiol., 2018, vol. 67, no. 6, pp. 834–837. doi: 10.1099/jmm.0.00075
  5. Cosgaya C., Mari-Almirall M., Van Assche A., Fernandez-Orth D., Mosqueda N., Telli M., Huys G., Higgins P.G., Seifertii H., Lievens D. Roca I., Vila J. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int. J. Sys. Evol. Microbiol., 2016, vol. 66, no. 10, pp. 4105–4111. doi: 10.1099.0.001318
  6. Kishii K., Kikuchi K., Tomido J.,Kawamura Y., Yoshido A., Okuzumi K., Moriva K. The first cases of human bacteremia caused by Acinetobacter seifertii in Japan. J. Infect.Chemother., 2015, vol. 22, no. 5, pp. 342–345. doi: 10.1016/j.jiac.2015.12.002
  7. Li L.H., Yang Y.S., Sun J.R., Huang T.W., Huang W.C., Chen F.J., Wang Y.C., Kuo T.H., Kuo S.C., Chen T.L., Lee Y.T.; ACTION study group. Clinical and molecular characterization of Acinetobacter seifertii in Taiwan. J. Antimicrob. Chemother., 2021, vol. 76, no. 2, pp. 312–321. doi: 10.1093/jac/dkaa432
  8. Nemec A., Krizova I., Maixnerova M., Sedo O., Brisse S., Higgins P.G., Acinetobacter seifertii sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex, isolated from human clinical specccimens. Int. J. Sys. Evol. Microbiol., 2015, vol. 65, no. 3, pp. 934–942. doi: 10.1099/iijs.0.000043

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Сиволодский Е.П., Краева Л.А., Мельникова Е.В., 2025

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».