СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МЕТОДОВ ИДЕНТИФИКАЦИИ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ КЛИНИЧЕСКОГО МАТЕРИАЛА

В последнее время наблюдается значительный рост заболеваемости микобактериозами, который обуслеовлен увеличением доли иммуносупрессированных пациентов, наличием у них различных коморбидных состояний, а также совершенствованием методов диагностики. Выбор наиболее точного метода идентификации является крайне важным в определении тактики лечения пациентов.

Цель исследования — провести сравнительный анализ современных методов идентификации  НТМБ,  выделенных из клинического материала в 2015 г. в Самарской области. В работе проводилась идентификация 78 штаммов микроорганизмов. Лабораторная диагностика проводилась с использованием метода ДНК-гибридизации  и методом MALDIToF масс-спектрометрии. 

Результаты. При идентификации  микроорганизмов с использованием MALDIToF масс-спектрометрии  было выделено 16 штаммов (20,5%) M. kansasii; по 11 штаммов (14,1%) M. avium и M. fortuitum; 9 штаммов (11,5%) M. gordonae; по 3 штамма (3,8%) M. peregrinum, M. szulgai, M. chimera intracellulare group, по 2 штамма (2,6%) M. abscessus, M. septicum, M. paragordonae, M. senegalence, по 1 штамму (1,3%) M. chelonae, M. frederiksbergense, M. monacense, M. lentiflavum. При использовании метода масс-спектрометрии было идентифицировано  15 видов НТМБ,  методом ДНК-гибридизации  — 9 видов. Полное  совпадение результатов идентификации было отмечено всего у 45 (57,7%) штаммов, несовпадающие результаты выявлены у 16 штаммов (20,5%). Наиболее часто при использовании метода ДНК-гибридизации  несовпадение было выявлено у медленнорастущих культур (9 штаммов) с преобладанием микроорганизмов,  идентифицированных  как M. gordonae. Среди представителей быстрорастущих НТМБ  было выявлено 7 расхождений в идентификации, более часто среди представителей групп M. fortuitum и M. peregrinum. Особое внимание стоит обратить на идентификацию штамма M. kansasii молекулярно-генетическим методом, который масс-спектрометрией был определен как M. bovis. Обе культуры M. tuberculosis complex, которые были идентифицированы при помощи MALDI-ToF  спектрометрии, ДНК-гибридизацией  не были определены до вида. 17 (21,8%) штаммов микроорганизмов,  которые не были идентифицированы  при использовании  метода ДНК-гибридизации, идентифицированы  с помощью спектрометрии, включая медленнорастущие микроорганизмы,  не относящиеся к микобактериям 7 штаммов (9,0%): Gordonia rubriperticta, Nocardia forcinica, Tsukumurella spp., Rhodotorula mucilaginosa. Точная видовая идентификация НТМБ является основополагающей для определения тактики лечения пациентов с микобактериозами. Возможности идентификации нетуберкулезных микобактерий с использованием метода ДНК-гибридизации являются недостаточными на сегодняшний день. Внедрение новых методов, таких как MALDI-ToF спектрометрия, позволяет идентифицировать большее количество видов нетуберкулезных микобактерий, а также другие виды медленнорастущих микроорганизмов, имеющих сходства с микобактериями по культуральным и морфологическим свойствам, что значительно повышает диагностические возможности лабораторий.