Оценка генетического сходства новоалтайской породы лошадей с исходными породами по микросателлитным локусам ДНК

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Исследования проводили с целью сравнительной оценки аллелофонда новоалтайской породы лошадей и пород, участвовавших в её создании. В экспериментальную выборку было включено 5736 лошадей, в том числе 363 новоалтайской породы, 39 алтайской, 159 литовской тяжелоупряжной, 617 русской тяжеловозной, 288 советской тяжеловозной, 4177 орловской рысистой, 93 будённовской. Выполняли генетико-популяционный анализ с определением следующих показателей: общее число аллелей в 17 локусах, среднее число аллелей на локус, уровень полиморфности, наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, коэффициенты внутрипопуляционного инбридинга, генетического сходства и генетических дистанций. Наибольшим уровнем генетического разнообразия (154 аллеля) и полиморфности (Ае=4,909) характеризовались лошади новоалтайской породы. Анализ генетической дифференциации показал отсутствие внутрипопуляционного инбридинга в группах алтайской, литовской тяжёлоупряжной и будённовской пород. Когорты животных новоалтайской, орловской рысистой, русской и советской тяжеловозных пород отличались незначительным дефицитом гетерозигот. Для лошадей новоалтайской и тяжеловозных пород характерна высокая частота встречаемости аллеля HTG6 О, алтайской породы – HTG4 М. У новоалтайской лошади выявлен ряд локусов, идентичных по спектру аллелей с алтайской, русской и советской тяжеловозными породами. Кластерный анализ продемонстрировал высокий уровень генетического сходства лошадей новоалтайской породы с русской тяжеловозной (0,903) и алтайской (0,899) породами. с использованием новых сведений о лошадях изученных семи пород, позволяющих контролировать биоразнообразие и генетическое сходство популяций, сохранение оригинальности и гетерогенности аллелофонда лошадей разных пород, можно усовершенствовать селекционные программы в коневодстве.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

А. В. Дубровин

Всероссийский научно-исследовательский институт коневодства

Автор, ответственный за переписку.
Email: alexander.dubrovin45@yandex.ru
Россия, 391105, Рязанская обл., Рыбновский р-н, пос. Дивово, п/о Институт коневодства

Н. В. Блохина

Всероссийский научно-исследовательский институт коневодства

Email: alexander.dubrovin45@yandex.ru

доктор сельскохозяйственных наук

Россия, 391105, Рязанская обл., Рыбновский р-н, пос. Дивово, п/о Институт коневодства

А. В. Борисова

Всероссийский научно-исследовательский институт коневодства

Email: alexander.dubrovin45@yandex.ru

кандидат сельскохозяйственных наук

Россия, 391105, Рязанская обл., Рыбновский р-н, пос. Дивово, п/о Институт коневодства

Список литературы

  1. Хатамов А. У., Женихова Н. И. Ветеринарно-санитарная экспертиза конины // Молодёжь и наука. 2021. № 3. URL: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=46358321 (дата обращения: 15.01.2024)
  2. Зеленченкова А. А. Мясная продуктивность лошадей башкирской породы, выращенных в условиях пастбищного содержания тверской области // Коневодство и конный спорт. 2016. № 2. С. 30–32.
  3. Stanislawczyk R., Rudy M., Gil M. Quality characteristics of horse meat as influence by the age of horse // International Journal of Food Properties. 2020. Vol. 23. No. 1. P. 864–877. doi: 10.1080/10942912.2020.1764579.
  4. Никонова А. И. Генеалогическая структура и методы разведения новоалтайской породы // Коневодство и конный спорт. 2012. № 4. С. 4–7.
  5. Дубровин А. В., Гавриличева И. С. Генетическая характеристика линий новоалтайской породы лошадей // Коневодство и конный спорт. 2023. № 5. С. 23–25. doi: 10.25727/HS.2023.5.60152.
  6. Genetic structure and genome-wide association study of the traditional Kazakh horses / A. Pozharskiy, A. Abdrakhmanova, I. Beishova, et al. // Animal. 2023. Vol. 17. No. 9. P. 100926. URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1751731123002239?via%3Dihub (дата обращения: 15.01.2024). doi: 10.1016/j.animal.2023.100926.
  7. A review on SNP and other types of molecular markers and their use in animal genetics / A. Vignal, D. Milan, M. SanCristobal, et al. // Genetics Selection Evolution. 2002. No. 34. Р. 275–305. doi: 10.1051/gse:2002009.
  8. The Genetic Diversity of Horse Native Breeds in Russia. / M. Atroshchenko, N. Dementieva, Y. Shcherbakov, et al. // Genes. 2023. Vol. 14. No. 12. P. 2148. URL: https://www.mdpi.com/2073–4425/14/12/2148 (дата обращения: 15.01.2024). doi: 10.3390/genes14122148.
  9. ДНК маркеры и «микросателлитный код» / В. И. Глазко, Г.Ю Косовский, Т. Т. Глазко и др. // Сельскохозяйственная биология. 2023. Т. 58. № 2. С. 223–248. doi: 10.15389/agrobiology.2023.2.223rus.
  10. Генетическая характеристика лошадей тракененской породы с использованием данных полиморфизма микросателлитных локусов ДНК / А. Н. Рудак, А. И. Герман, Ю. И. Герман и др. // Актуальные проблемы интенсивного развития животноводства. 2022. № 25–1. С. 23–30.
  11. Вдовина Н. В., Юрьева И. Б. Мониторинг генетической структуры мезенской породы лошадей по микросателлитам ДНК // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021. Т. 25. № 2. С. 202–207.
  12. Калашникова Л. А., Новиков А. А., Семак М. С. Развитие генетической экспертизы племенной продукции в животноводстве // Зоотехния. 2022. № 11. С. 25–28.
  13. Додохов В. В., Павлова Н. И., Калашникова Л. А. Полиморфизм микросателлитных локусов ДНК у оленей чукотской породы // Аграрный научный журнал. 2020. № 9. С. 49–53. doi: 10.28983/asj.y2020i9pp49-53.
  14. Галинская Т. В., Щепетов Д. М., Лысенков С. Н. Предубеждения о микросателлитных исследованиях и как им противостоять // Генетика. 2019. Т. 55. № 6. С. 617–632. doi: 10.1134/S0016675819060043.
  15. Зайцева М. А. Особенности полиморфизма сателлитной ДНК у лошадей заводских и местных пород // Вестник Рязанского государственного агротехнологического университета им. П. А. Костычева. 2011. № 2 (10). С. 9–12.
  16. Why and how to switch to genomic selection: lessons from plant and animal breeding experience / A. Fugeray-Scarbel, C. Bastien, M. Dupont-Nivet, et al. // Frontiers in Genetics. 2021. Vol. 12. doi: 10.3389/fgene.2021.629737. URL: https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2021.629737/full (дата обращения: 25.01.2024).
  17. Оценка генетического разнообразия в популяциях тувинских лошадей по локусам систем крови и микросателлитным ДНК / Р. Б. Чысыма, Л. А. Храброва, А. М. Зайцев и др. // Сельскохозяйственная биология. 2017. Т. 52. № 4. С. 679–685. doi: 10.15389/agrobiology.2017.4.679rus.
  18. Калинкова Л. В., Зайцев А. М., Иванов Р. В. Генетическая структура локальной популяции лошадей якутской породы по генам MC1R, ASIP, DMRT3 и MSTN // Сельскохозяйственная биология. 2022. Т. 57. № 2. С. 272–282. doi: 10.15389/agrobiology.2022.2.272rus.
  19. Генетическое разнообразие мезенской породы лошадей (Еquus Ferus Сaballus) по микросателлитной ДНК / И. Б. Юрьева., Г. Р. Свищёва, Н. В. Вдовина и др. // Генетика. 2018. Т. 54. № 13. с 64–69. doi: 10.1134/S0016675818130210.
  20. Genetic Characterization of Mangalarga Marchador Breed Horses Based on Microsatellite Molecular Markers / M. M. Baena, S. Diaz, R. S. Moura, et al. // J. Equine Vet Sci. 2020. Vol. 95. P. 103231. URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0737080620303221?via%3Dihub. (дата обращения: 25.01.2024). doi: 10.1016/j.jevs.2020.103231.
  21. Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов MSTN, CAST, PRLR с хозяйственно-полезными качествами лошадей вятской породы / Н. Ф. Белоусова, С. П. Басс, С. А. Зиновьева и др. // Международный вестник ветеринарии. 2023. № 1. С. 234–247. doi: 10.52419/issn2072-2419.2023.1.234.
  22. Никонова А. И. Новая порода лошадей // Коневодство и конный спорт. 2000. № 6. С. 6–8.
  23. Блохина Н. В., Царёва М. А. Анализ генетической структуры новоалтайской породы лошадей с учётом аллелофонда базовых пород // АгроЗооТехника. 2019. Т. 2. № 2. С. 4–12. doi: 10.15838/alt.2019.2.2.4.
  24. Храброва Л. А., Блохина Н. В. Сравнительная оценка аллелофонда новоалтайской лошади с породами, участвовавшими в её создании // Коневодство и конный спорт. 2019. № 4. С. 20–22. doi: 10.25727/HS.2019.4.34285.
  25. Juras R., Cothran E. G. Microsatellites in Lithuanian native horse breeds: Usefulness for parentage testing // Biologija. 2004. No. 4. Р. 6–9.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Дендрограмма генетических дистанций между лошадьми новоалтайской породы и породами, участвовавшими в её создании.

Скачать (226KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».