Анализ клинических штаммов стрептококков группы в методами молекулярной генетики

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

В настоящей статье представлены новые данные об особенностях генома штаммов стрептококков группы В, выделенных в различных географических регионах. Продемонстрировано, что, несмотря на высокую степень гетерогенности, геном стрептококков группы в характеризуется консервативностью расположения генов. Показано, что для изучения эпидемиологии стрептококков группы В целесообразно совместное использование методов пульс-электрофореза и риботипирования. Выявлена генетическая родственность штаммов, обладающих геном bac.

Об авторах

А. В. Дмитриев

Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН

Автор, ответственный за переписку.
Email: medaj@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

Y. Y. Hu

Пекинский детский госпиталь

Email: medaj@eco-vector.com
Китай, Пекин

A. D. Shen

Пекинский детский госпиталь

Email: medaj@eco-vector.com
Китай, Пекин

A. H. Суворов

Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины РАМН

Email: medaj@eco-vector.com
Россия, Санкт-Петербург

Y. H. Yang

Пекинский детский госпиталь

Email: medaj@eco-vector.com
Китай, Пекин

Список литературы

  1. Bateman A., Eddy S. R., Chothia C. Members of the immunoglobulin superfamily in bacteria // Protein Science. 1996. Vol. 5 p 1939-1941.
  2. Blumberg H. M., Stephens D. S., Licitra C. et al. Molecular epidemiology of group B streptococcal infections: use of restriction endonuclease analysis of chromosomal DNA and DNA restriction fragment length polymorphism of ribosomal RNA genes (ribotyping) // J. Infect. Dis. 1992. Vol. 166. p 574-579.
  3. Chattelier S., Huet H., Kenzi S. et al. Genetic diversity of rRNA opérons of unrelated Streptococcus agalactiae strains isolated from cerebrospinal fluid of neonates suffering from meningitis // J. Clin. Microbiol. 1996. Vol. 34. p. 2741-2747.
  4. Dmitriev A., Suvorov A., Totolian A. Physical and genetic chromosomal maps of Streptococcus agalactiae, serotypes II and III; rRNA operon organization // FEMS Microbiol. Lett. 1998. Vol. 167. p. 33-39.
  5. Elliot J. А., Farmer K. D., Facklam R. R. Sudden increase in isolation of group в streptococci, serotype V, is not due to emergence of a new puised-ficld gel electrophoresis type // J. Clin. Microbiol. 1998. Vol. 36. p. 2115-2116.
  6. Ellis S., Kotiw M., Garland S. M. Restriction endonuclease analysis of group в streptococcal isolates from two distinct geographical regions // J. Hosp. Infect. 1996. Vol. 33. p 279-287.
  7. Ferrieri P., Cho D.S., Livdahl C. et al. DNA restriction profiles of nontypable group в streptococcal clinical isolates // Adv. Exp. Med. Biol. 1997. Vol. 41. p. 343-346.
  8. Granlund M., Oberg L., Sellin M. et al. Identification of a novel insertion element. IS 1548, in group В streptococci, predominantly in strains causing endocarditis // J. Infect. Dis. 1998. Vol. 177. P. 967-976.
  9. Gray B.M., Dillon H. C. GBS infections in mothers and their infants //Antibiot. Chemother. 1985. Vol. 35. p. 225-236.
  10. Hacker J. Pathogenicity islands and the evolution of microbes // Annu. Rev. Microbiol. 2000. Vol. 54. p. 641-679.
  11. Hauge M., Jespersgaard C., Poulsen K. et al. Population structure of Streptococcus agalactiae reveals an association between specific evolutionary lineages and putative virulence factors but not disease // Infect. Immun. 1996. Vol. 64. p.919-925.
  12. Huet H., Martin C., GeslinP. et al. Ribotyping of Streptococcus agalactiae strains isolated from vaginas of asymptomatic women // Res. Microbiol. 1993. Vol. 144. p. 457-465.
  13. Horaud T., de Cespedes G., Trieu-Cuot P. Chromosomal gentamicin resistance transposon Tn3706 in Streptococcus agalactiae B128 // Antimicrob. Agents Chemother. 1996. Vol. 40. p. 1085-1090.
  14. Jones A. L., Knoll K. M., Rubens C. E. Identification of Streptococcus agalactiae virulence genes in the neonatal rat sepsis model using signature-tagged mutagenesis // Molec. Microbiol. 2000. Vol. 37. p. 1444-1455.
  15. Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J. Molecular cloning; A laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor. NY, 1982.
  16. Rolland K., Marois C., Siquier V. et al. Genetic features of Streptococcus agalactiae strains causing severe neonatal infections, as revealed by pulsed-field gel electrophoresis and hylB gene analysis//J. Clin. Microbiol. 1999. Vol. 37. p. 1892-1898.
  17. Rubens С. E., Heggen L. M., Kuypers J. M. IS861, a group В streptococcal insertion sequence related to IS 150 and 1S3 of Escherichia coli // J. Bacteriol. 1989. Vol. 171. p. 5531-5535.
  18. Russell H., Norcross N. L., Kahn D. E. Isolation and characterization of Streptococcus agalactiae bacteriophage // J. Gen. Virol. 1969. Vol. 5 p 315-317.
  19. Spellerberg B., Martin S., Franken C. et al. Identification of a novel insertion sequence element in Streptococcus agalactiae // Gene. 2000. Vol. 241. p. 51-56.
  20. Suvorov A. N., Dmitriev A. V., Ustinovich I. A. et al. Molecular analysis of clinical group в streptococcal strains by use of a and ß gene probes // FEMS Immunol, and Med. Microbiol. 1997. Vol. 17. p. 149-154.
  21. Suvorov A. N., Ferretti J. J. Comparative analysis of chromosomal organization of group A streptococcal strains H Proceedings of XIV Lancefield International Symposium on Streptococci and Streptococcal Diseases. 2000. p. 381-384.
  22. Tenover F. C., Arbeit R D., Goering R. V. et al. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis; criteria for bacterial strain typing H J. Clin. Microbiol. 1995. Vol. 33. p 2233-2239.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Эко-Вектор, 2002



Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».