Геном Linaria dalmatica содержит гомологгена rolC Agrobacterium rhizogenes

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Горизонтальный перенос генов в ядерный геном растений — редкое явление. На сегодняшний день известны его примеры только у некоторых видов Nicotiana и Linaria. В геноме льнянки Linaria dalmatica (L.) Mill. впервые описана последовательность, на 94% сходная с таковой гена rolC Agrobacterium rhizogenes. Обсуждается значение гена rolC и Т-ДНК в эволюции льнянки, а также их роль в происхождении видов растений.

Об авторах

Ольга Андреевна Павлова

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: olgunja_@mail.ru
аспирант

Татьяна Валерьевна Матвеева

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: radishlet@gmail.com
к. б. н., с. н. с., кафедра генетики и биотехнологии

Людмила Алексеевна Лутова

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: la.lutova@gmail.com
д. б. н., профессор, кафедра генетики и биотехнологии

Список литературы

  1. Дрейпер Дж., Скотт Р., Армитидж Ф., Дьюри Г. и др., 1991. Генная инженерия растений / ред. Дрейпер Дж., Скотт Р., Армитидж Ф., Уолден Р. Москва: Мир, 408 с.
  2. Andersson J. O., 2005. Lateral gene transfer in eukaryotes // Cellular and Molecular Life Sci. Vol. 62. P. 1182–197.
  3. Andersson J. O., 2009. Gene transfer and diversification of microbial eukaryotes // Annu. Rev. Microbiol. Vol. 63. P. 177–193.
  4. Aoki S., Syono K., 1999. Synergistic function of rolB, rolC, ORF13 and ORF14 of TL-DNA of Agrobacterium rhizogenes in hairy root induction in Nicotiana tabacum // Plant Cell Physiol. Vol. 40. P. 252–256.
  5. Britton M., Escobar M. A., Dandecar A. M., 2007. The oncogenes of Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes // Agrobacterium: From Biology to Biotechnology / Eds. T. Tzifra, V. Citovsky. New York, Springer. P. 523–563.
  6. Dellaporta S. L., Wood J., Hicks J. B., 1983. Plant DNA Мini Рreparation // Molecular Biology of Plants // Plant Molecular Biology Reporter. Vol. 1. P. 19–21.
  7. Doolittle W. F., 1999. Lateral genomics // Trends Cell Biol. Vol. 9. P. M5–M9.
  8. Faiss M., Strnad M., Redig P. et al., 1996. Chemically induced expression of the rolC-encoded beta-glucosidase in transgenic tobacco plants and analysis of cytokinin metabolism: rolC does not hydrolyze endogenous cytokinin glucosides in planta // Plant J. Vol. 10. P. 33–46.
  9. Fenn K., Conlon C., Jones M. et al., 2006. Phylogenetic relationships of the Wolbachia of nematodes and arthropods // PLoS Pathogens. Vol. 2. P. 0887–0899.
  10. Furner I. J., Huffman G. A., Amasino R. M. et al., 1986. An Agrobacterium transformation in the evolution of the genus Nicotiana // Nature. Vol. 319. P. 422–427.
  11. Gladyshev E. A., Meselson M., Arkhipova I. R., 2008. Massive horizontal gene transfer in bdelloid rotifers // Science. Vol. 320. P. 1210–1213.
  12. Gogarten J. P., Townsend J. P., 2005. Horizontal gene transfer, genome innovation and evolution // Nat. Rev. Microbiol. Vol. 3. P. 679–687.
  13. Hotopp-Dunning J. C., Clark M. E., Oliveira D. C., 2007. Widespread lateral gene transfer from intracellular bacteria to multicellular eukaryotes // Science. Vol. 317. P. 1753–1756.
  14. Huang J., Mullapudi N., Lancto C. A. et al., 2004. Phylogenomic evidence supports past endosymbiosis, intracellular and horizontal gene transfer in Cryptosporidium parvum // Genome Biol. Vol. 5. Article R88.
  15. Intrieri M. C., Buiatti M., 2001. The horizontal transfer of Agrobacterium rhizogenes genes and the evolution of the genus Nicotiana // Mol. Phylogenet. Evol. Vol. 20. P. 100–110.
  16. Koonin E. V., Makarova K. S., Aravind L., 2001. Horizontal gene transfer in prokaryotes: quantification and classification // Annu. Rev. Microbiol. Vol. 55. P. 709–742.
  17. Matveeva T. V., Bogomaz D. I., Pavlova O. A. et al., 2012. Horizontal gene transfer from Agrobacterium to the plant Linaria in nature // Mol. Plant Microbe Interact. Vol. 25. P. 1542–1551.
  18. Matveeva, T. V., Lutova, L. A., Bogomaz, D. I., 2006. Search for T-DNA-Like Sequences in Plant Genomes, Using Real-Time PCR with Degenerate Primers and Probe // Biotechnology in the Agriculture and Food Industry. Ed. Zaikov G. E. New York, Nova Science Publishers. P. 101–104.
  19. Meyer A. D., Ichikawa T., Meins F., 1995. Horizontal gene transfer: regulated expression of a tobacco homologue of the Agrobacterium rhizogenes rolC gene // Mol. Gen. Genet. Vol. 249. P. 265–273.
  20. Mohajjel-Shoja H., Clément B., Perot J. et al., 2011. Biological activity of the Agrobacterium rhizogenes-derived trolC gene of Nicotiana tabacum and its functional relation to other plast genes // Mol. Plant Microbe Interact. Vol. 24. P. 44–53.
  21. Murashige T., Skoog F., 1962. A revised medium for rapid growth and bioassay with tobacco tissue culture // Physiol. Plant. Vol. 15. P. 165–170.
  22. Nilsson O., Olssen O., 1997. Getting to the root: the role of the Agrobacterium rhizogenes rol genes in the formation of hairy roots // Physiologia plantarum. Vol. 100. P. 463–473.
  23. Ochman H., Lawrence J. G., Groisman E. A., 2000. Lateral gene transfer and the nature of bacterial innovation. // Nature. Vol. 405. P. 299–304.
  24. Ricard G., McEwan N. R., Dutilh B. E. et al., 2006. Horizontal gene transfer from bacteria to rumen ciliates indicates adaptation to their anaerobic, carbohydrates-rich environment // BMC Genomics. Vol. 7. P. 1–13.
  25. Riker A. J., Banfield W. M., Wright W. H. et al., 1930. Studies on infectious hairy root of nursery apple trees // J. Agr. Res. Vol. 41. P. 507–540.
  26. Sambrook J., Russell D. W., 2001. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor (NY), Cold Spring Harbor Lab. Press. 2344 p.
  27. Suc J. P., 1984. Origin and evolution of the Mediterranean vegetation and climate in Europe // Nature. Vol. 307. P. 429–432.
  28. Suzuki K, Yamashita I, Tanaka N., 2002. Tobacco plants were transformed by Agrobacterium rhizogenes infection during their evolution // Plant J. Vol. 32. P. 775–787.
  29. White F. F., Garfinkel D. J., Huffman G. A. et al., 1983. Sequence homologous to Agrobacterium rhizogenes T-DNA in the genome of uninfected plants // Nature. Vol. 301. P. 348–350.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Павлова О.А., Матвеева Т.В., Лутова Л.А., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».