Идентификация новых генов клубеньковых бактерий sinorhizobium meliloti, вовлеченных в контроль эффективности симбиоза с люцерной medicago sativa

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

С использованием Tn5-мутагенеза у штамма СХМ1-105 Sinorhizobium meliloti получено 3 мутанта, обладающих повышенной эффективностью симбиоза с люцерной. Показано, что инсерции Tn5 маркировали 2 хромосомных гена, кодирующих 5-метилтиоаденозин/S-аденозилгомоцистеин деаминазу (мутант Т4) и белок-регулятор транскрипции GntR семейства (мутант М3), а также ген биосинтеза тиамина thiC, локализованный на мегаплазмиде 2 (мутант Т795). Мутант Т795 наряду с повышенной симбиотической эффективностью проявлял сниженную способность конкурировать за образование клубеньков с родительским штаммом СХМ1-105.

Об авторах

Ольга Петровна Онищук

Государственное научное учреждение Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

Email: olony@yandex.ru
к. б. н., ведущий научный сотрудник лаборатории генетики и селекции микроорганизмов

Оксана Николаевна Курчак

Государственное научное учреждение Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

Email: genet@yandex.ru
к. б. н., старший научный сотрудник лаборатории генетики и селекции микроорганизмов

Елена Петровна Чижевская

Государственное научное учреждение Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

Email: genet@yandex.ru
к. б. н., старший научный сотрудник лаборатории генетики и селекции микроорганизмов

Евгений Евгеньевич Андронов

Государственное научное учреждение Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

Email: eeandr@yandex.ru
к. б. н., заведующий лабораторией микробиологического мониторинга и биоремедиации почв

Борис Васильевич Симаров

Государственное научное учреждение Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

Email: genet@yandex.ru
д. б. н., заведующий лабораторией генетики и селекции микроорганизмов

Список литературы

  1. Ибрагимова М. В., Румянцева М. Л., Онищук О. П. с соавт. (2006). Симбиоз клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti с люцерной Medicago sativa в условиях засоления. Микробиология. Т. 75 (1): С. 94-100.
  2. Кожемяков А. П., Тихонович И. А. (1998). Использование инокулянтов бобовых и биопрепаратов комплексного действия в сельском хозяйстве. Докл. РАСХН. № 6: С. 7-10.
  3. Лакин Г. Ф. (1990). Биометрия (4-е издание). М.: Высш. школа.
  4. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. (1984). Методы генной инженерии. Пер. с англ. М.: Мир.
  5. Онищук О. П., Курчак О. Н., Шарыпова Л. А. c соавт. (2001). Анализ различных типов конкурентоспособности у Tn5-мутантов клубеньковых бактерий люцерны (Sinorhizobium meliloti). Генетика. Т. 37 (9): С. 1-6.
  6. Онищук О. П., Шарыпова Л. А., Курчак О. Н. c соавт. (2005). Выявление генов Sinorhizobium meliloti, влияющих на синтез поверхностных полисахаридов и конкурентоспособность. Генетика. Т. 41 (12): С. 1617-1623.
  7. Проворов Н. А., Воробьев Н. И. (2012). Генетические основы эволюции растительно-микробного симбиоза. Под ред. И. А. Тихонович. СПб.: Информ-Навигатор.
  8. Проворов Н. А., Жуков В. А., Курчак О. Н. с соавт. (2013). Совместная миграция клубеньковых бактерий и бобовых растений в новые местообитания: механизмы коэволюции и практическое значение (обзор). Прикладная биохимия и микробиология. Т. 49 (3): С. 229-235.
  9. Федоров С. Н., Симаров Б. В. (1987). Получение мутантов с измененными симбиотическими свойствами у Rhizobium meliloti под действием УФ-лучей. С.-х. биология. № 9: С. 44-49.
  10. Чижевская Е. П., Кроль Е. А., Онищук О. П. с соавт. (1998). Физическое и генетическое картирование мутаций симбиотической эффективности на мегаплазмиде-2 штамма СХМ1 Rhizobium meliloti. Генетика. Т. 34 (9): С. 1220-1227.
  11. Чижевская Е. П., Онищук О. П., Андронов Е. Е., Симаров Б. В. (2011). Использование метода сайт-направленного мутагенеза для изучения функций гена SMb20332 у клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti. С.-х. биология. № 3: С. 55-60.
  12. Юргель С. Н., Шарыпова Л. А., Симаров Б. В. (1998) Tn5-мутации Rhizobium meliloti, вызывающие повышение редокс-потенциала свободноживущих клеток и эффективности их симбиоза с люцерной. Генетика. Т. 34 (6): С. 737-741.
  13. Barnet M. J., Fisher R. F., Jones T. et al. (2001). Nucleotide sequence and predicted functions of the entire Sinorhizobium meliloti pSymA megaplasmid. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S.A. V. 98 (17): P. 9883-9888.
  14. Beringer J. E. (1974). R1 transfer in Rhizobium leguminosarum. J. Gen. Microbiol. V. 84: P. 188-198.
  15. Capela D., Barloy-Hubler F., Gouzy J. et al. (2001). Analysis of the chromosome sequence of the legume symbiont Sinorhizobium meliloti strain 1021. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. V. 98 (17): P. 9877-9882.
  16. Finan T. M., Kunkel B., De Vos G. F. et al. (1986). Second symbiotic megaplasmid in Rhizobium meliloti carrying exopolysaccharide and thiamine synthesis genes. J. Bacteriol. V. 167 (1): P.66-72.
  17. Finan T. M., Weidner S., Wong K. et al. (2001). The complete sequence of the 1,638-kb pSymB megaplasmid from the N2-fixing endosymbiont Sinorhizobium meliloti. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S.A. V. 98 (17): P. 9889-9894.
  18. Meade H. M., Long S. R., Ruvkun G. B. et al. (1982). Physical and genetic characterization of symbiotic and auxotrophic mutants of Rhizobium meliloti induced by transposon mutagenesis. J. Bacteriol. V. 149 (1): P. 114-122.
  19. Olah B., Kiss E., Györgypal Z. et al. (2001). Mutation in the ntr gene, a member of the vap gene family, increase the symbiotic efficiency of Sinorhizobium meliloti. MPMI. V. 14 (7): P. 887-894.
  20. Pobigailo N., Szymczak S., Nattkemper T. W., Becker A. (2008). Identification of genes relevant to symbiosis and competitiveness in Sinorhizobium meliloti using signature-tagged mutants. MPMI. V. 21 (2): P. 219-231.
  21. Sharypova L. A., Onischchuk O. P., Chesnokova O. N., et al. (1994). Isolation and characterization of Rhizobium meliloti Tn5 mutants showing enhanced symbiotic effectiveness. Microbiology. V. 140: P. 463-470.
  22. Sharypova L. A., Pretorius-Guth I.-M., Simarov B. V., Puhler A. (1992). Genetic improvement of Rhizobium strains. In: G. F. Hong (Ed.). The nitrogen fixation and its research in China. Berlin: Springer-Verlag. P. 266-285.
  23. Sharypova L. A., Simarov B. V. (1995). Identification of genes affecting symbiotic effectiveness of Rhizobium meliloti. In: I. A. Tichonovich et al. (Eds.). Nitrogen fixation: Fundamental and applications. Dordrecht: Kluwer Acad. Publ. P. 371-376.
  24. Sharypova L. A., Yurgel S. N., Keller M. et al. (1999). The eff-482 locus of Sinorhizobium meliloti CXM1-105 that influences symbiotic effectiveness consists of three genes encoding an endoglucanase, a transcriptional regulator and an adenylate cyclase. Molec.Gen.Genet. V. 261: P. 1032-1044.
  25. Simon R., Priefer U., Pühler A. (1983) Vector plasmids for in vitro manipulations of gram-negative bacteria. In: A. Pühler, editor. Molecular genetics of the bacteria-plant interaction. Springer-Verlag. Berlin. Heidelberg: P. 98-106.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Онищук О.П., Курчак О.Н., Чижевская Е.П., Андронов Е.Е., Симаров Б.В., 2014

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».