Genetic description of root nodule bacteria of Lathyrus species growing in the territory of Republic Bashkortostan


Cite item

Full Text

Abstract

The genetic diversity and phylogeny of rhizobia isolated from nodules of 9 wild-growing Lathyrus L. species (Fabaceae) growing in Republic Bashkortostan were studied. It is shown that for the given plants is characteristic that the big variety of heterogeneous strains of root nodule bacteria. Nevertheless, it is revealed that the majority of them in phylogenetics are closely related to Rhizobium leguminosarum. However, some plant species are found out also nodule bacteria which were considered earlier unusual for Lathyrus. So, L. vernus L. Bernh. and L. sylvestris L. are found out a root nodule bacteria close to R. tropici, L. palustris L. — Agrobacterium sp., and L. gmelinii Fritsch all isolated with us bacteria from root nodules by the sequence of genes of 16S рРНК have appeared are closely related to Phyllobacterium myrsinacearum. 

Keywords

About the authors

- -

Konstantin G Ptitsyn

Institute of Biochemistry and Genetics, Ufa Research Scientific Center RAS, Ufa, Republic of Bashkortostanб RF

Email: konstantin157@yandex.ru

Albert A Muldashev

Institute of Biology of Ufa Research Scientific Center RAS, Ufa, Republic of Bashkortostanб RF

Email: vasmar@anrb.ru

Aleksei K Baymiev

Institute of Biochemistry and Genetics, Ufa Research Scientific Center RAS, Ufa, Republic of Bashkortostanб RF

Email: baymiev@mail.ru

References

  1. Алексеев Ю. Е., Галева А. Х., Губанов И. А. и др., 1989. Определитель высших растений Башкирской АССР. М.: Наука, 375 с.
  2. Баймиев Ан. Х., Птицын К. Г., Благова Д. К. и др., 2011. Генетическое разнообразие и филогения клубеньковых бактерий, вступающих в симбиоз с чиной весенней Lathyrus vernus (L.) Bernh.//Микроби-ол. Т. 80, № 1. C. 96-100.
  3. Вишнякова М. А., Бурляева М. О., Алпатьева Н. В.,Чесноков Ю. В., 2008. RAPD анализ видового поли-морфизма рода чина Lathyrus L. семейства Fabaceae Lindl//Вестник ВОГиС. Т. 12, № 4. С. 595-607.
  4. Парийская А. Н., Клевенская И. Л., 1979. Распространение в природе и возможные пути эволюции азотфиксирующего симбиоза//Успехи микробиол. Т. 14. С. 124-147.
  5. Практикум по почвоведению/Под ред. С. И. Каури-чева М.: «Колос», 1973. 279 с.
  6. Проворов Н. А., 1992. Взаимосвязь между таксономией бобовых и специфичностью их взаимодействия с клубеньковыми бактериями//Ботан. журн. Т. 77. № 8. С. 21-32.
  7. Серебряков И. Г., Экологическая морфология растений. 1962. Жизненные формы покрытосеменных и хвойных. М.: Высш. шк., 387 с.
  8. Тихонович И. А, Проворов Н. А., 2009. Симбиозы растений и микроорганизмов. С.-Пб.: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 210 с.
  9. Яковлев Г. П., 1991. Бобовые земного шара/Под. ред. Ю. Л. Меницкий. Л.: Наука, 141 с.
  10. Asmussen C., Liston A., 1998. Chloroplast DNA characters, phylogeny and classification of Lathyrus (Fabaceae)//American Journal of Botany Vol.85. P. 387-401.
  11. Brosius J., Dull T. J., Sleeter D. D., Noller H. F., 1981. Gene organization and primary structure of a ribosomal RNA operon from Escherichia coli//J. Mol. Biol. Vol. 148. P. 107-127.
  12. Kupicha F. K., 1976. The infrageneric structure of Vicia//Notes from the Royal Botanic Garden. Vol. 34, N. 3. P. 287-326.
  13. Kupicha F. K., 1983.The infrageneric structure of Lathyrus L.//Notes from the Royal Botanic Garden. Vol. 41, N. 2. P. 209-244.
  14. Mantelin S., Saux M. F., Zakhia F. et al., 2006. Emended description of thegenus Phyllobacterium and description of four novel species associated with plant roots: Phyllobacterium bourgognense sp. nov., Phyllobacterium ifriqiyense sp. nov., Phyllobacterium leguminum sp. nov. and Phyllobacterium brassicacearum sp. nov.//Int J Syst Evol Microbiol. Vol. 56. P. 827-839.
  15. Martínez E., Palacios R., Sánchez F., 1987. Nitrogenfixing nodules induced by Agrobacterium tumefaciens harboring Rhizobium phaseoli plasmids//J Bacteriol. Vol.169. N.6. P.2828-2834
  16. Martínez-Romero E., Segovia L., Mercante F. M. et al., 1991. Rhizobium tropici, a novel species nodulating Phaseolus vulgaris L. beans and Leucaena sp. trees//Int J Syst Bacteriol. Vol. 41. N 3. P. 417-426.
  17. Muglia C. I., Grasso D. H., Mario Aguilar O., 2007. Rhizobium tropici response to acidity involvesactivation of glutathione synthesis//Microbiology. Vol. 153. N 4. P. 1286-1296
  18. Śliwka J, Sobkowiak S, Lebecka R. et al., 2006. Mating type, virulence, aggressiveness and metalaxyl resistance of isolates of Phytophthora infestans in Poland//Potato Research. Vol. 49. P. 155-166.
  19. Sui X. H., Han L. L., Wang E. T. et al., 2009. Novel associations between rhizobial populations and legume species within the genera Lathyrus and Oxytropis grown in the temperate region of China//Sci China Ser CLife Sci.Vol. 52. N 2. P. 182-192.
  20. Sullivan J. T., Ronson C. W., 1998. Evolution of rhizobia by acquisition of a 500-kb symbiosis island that integrates into a phe-tRNA gene//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 95. P. 5145-5149
  21. Tsui H. P., 1984. Materiae ad Floram Lathyrorum Sinensium. Bulletin of Botanical Research Vol. 4. P. 36-60.
  22. Williams J. G., Kubelik A. R., Livak K. J. et al. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers//Nucleic Acids Res. Vol. 18. N. 22. P. 6531-6535.
  23. Young, J. P. W., Downer H. L., Eardly B. D., 1991. Phylogeny of thephototrophic Rhizobium strain BTAi1 by polymerase chain reaction-basedsequencing of a 16S rRNA gene segment//J. Bacteriol. Vol. 173. P. 2271-2277.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2011 - -., Ptitsyn K.G., Muldashev A.A., Baymiev A.K.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».