Comparative analysis of the interleukin-28b gene alleles in patients with hepatitis C monoinfection and combined HIV/hepatitis C infection

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Aim. To identify the frequency and to perform the comparative analysis of IL-28B genotypes distribution in patients with hepatitis C (HCV) mono-infection and combined HIV/HCV infection. Methods. 101 patients (65% - males, average age 33.85±0.62 years) were included in the study. The first group (n=58) - patients with HCV mono-infection, second (n=43) - patients with combined HIV/HCV infection. Single nucleotides polymorphism at rs8099917 and rs12979860 locuses of IL-28B gene was performed using the «AmpliSens Genoscreen-IL28V-FL» reagent kit in the viral hepatitis laboratory of the molecular diagnostics department, CSRIE, Moscow. The baseline activity of HCV infection was determined by RNA-HCV viral load >400 000 copies/mL and alanine aminotransferase level (ALT). In the first group high RNA-HCV viral load (>400 000 copies/mL) was observed in 30 (51.7%) patients, mean ALT level was 72.79±9.85 U/L; in the second group high HCV-RNA viral load was detected in 35 (81.4%) patients, mean ALT level was 85.46±7.73 U/L. In the group with combined infection 26 (60.5%) of patients received antiretroviral therapy (ART); in 14 (53.8%) of them there was no detectable viral load. The median absolute number of CD4+ lymphocytes was 0.400±0.04 cells/μL, median percentage - 25.41%±2.41. In 17 (39.5%) treatment-naïve patients the viral load was low (<10 000 copies/mL), in 11 (64.8%) of these patients mean CD4+ count was 0.470±0.04 cells/μL (25.33%±2.15); the term of HIV antibodies detection was 6.89±0.53 years. The sensitivity of the PCR method for the qualitative detection of HCV-RNA was 111.1 copies/mL, quantitative - 275 copies/mL, for HIV-RNA - 150 copies/mL. Results. In patients with HCV mono-infection the rate of unfavorable IL-28B CT and TT rs12979860 genotypes and ТG and GG rs8099917 genotypes was 45 (77.6%) и 26 (44.8%) correspondingly, favorable СС rs12979860 and ТТ rs8099917 genotypes were registered in 13 (22.4%) and 32 (55.1%) patients correspondingly. In patients with HIV/HCV infection (n=43) unfavorable IL-28B CT and TT rs12979860 genotypes and ТG and GG rs8099917 genotypes were detected in 20 (46.5%) и 13 (30.2%) of cases, and favorable СС rs12979860 and ТТ rs8099917 genotypes - in 23 (53.5%) and 30 (69.8%) of cases correspondingly. Conclusion. Results show that favorable CC rs12979860 and TT rs8099917 genotypes of the IL-28B and their combination are found quite frequently in patients with mixed HCV/HIV infection, particularly in patients with HCV genotype 3, these patients also had more significant inflammatory reaction and high HCV RNA viral load compared to HCV mono-infected patients.

About the authors

V K Fazylov

Kazan State Medical University, Kazan, Russia

E R Manapova

Kazan State Medical University, Kazan, Russia

Email: elveram@yandex.ru

S V Tkacheva

Kazan State Medical University, Kazan, Russia

F M Yakupova

Kazan State Medical University, Kazan, Russia

A T Beshimov

Republican Centre for AIDS and Infectious Diseases Treating and Prevention, Kazan, Russia

References

  1. Козина А.Н., Абрамов Д.Д., Климова Е.А. и др. Возможности персонифицированного подхода к лечению гепатита С на основании разработанных генетических тестов определения варианта полиморфизма гена ИЛ-28В человека // Леч. врач. - 2011. - №10. - С. 39-43.
  2. Aparicio E., Parera M., Franco S. et al. IL28B SNP rs8099917 is strongly associated with pegylated interferon-alpha and ribavirin therapy treatment failure in HCV/HIV-patients // PLoS ONE. - 2010. - Vol. 5, N 10. - P. 13771.
  3. Chung R.T., Andersen J., Volberding P. et al. Peginterferon alfa-2a plus ribavirin versus interferon alfa-2a plus ribavirin for chronic hepatitis C in HIV-coinfected persons // N. Engl. J. Med. - 2004. - Vol. 351. - P. 451-459.
  4. Conjeevaram H.S., Fried M.W., Jeffers L.J. et al. Peginterferon and ribavirin treatment in African American and Caucasian American patients with hepatitis C genotype 1 // Gastroenterology. - 2006. - Vol. 131. - P. 470-477.
  5. Ge D., Fellay J., Thompson A.J. et al. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance // Nature. - 2009. - Vol. 461, N 7262. - P. 399-401.
  6. Hadziyannis S.J., Sette H.Jr., Morgan T.R. et al. Peginterferon-alpha2a and ribavirin combination therapy in chronic hepatitis C: a randomized study of treatment duration and ribavirin dose // Ann. Intern. Med. - 2004. - Vol. 140, N 5. - P. 346-355.
  7. Jeffers L.J., Cassidy W., Howell C.D. et al. Peginterferon alfa-2a (40 kD) and ribavirin for black American patients with chronic HCV genotype 1 // Hepatology. - 2004. - Vol. 39. - P. 1702-1708.
  8. Labarga P., Barreiro P., Mira J.A. et al. Impact of IL28B polymorphisms on response to peginterferon plus ribavirin in HIV-HCV coinfected patients with prior non-response or relapse // AIDS. - 2011. - Vol. 25. - P. 1131-1133.
  9. Liu C.H., Liu C.J., Lin C.L. et al. Pegylated interferon-alpha-2a plus ribavirin for treatment-naive Asian patients with hepatitis C virus genotype 1 infection: a multicentre, randomized controlled trial // Clin. Infect. Dis. - 2008. - Vol. 47. - P. 1260-1269.
  10. McCarthy J., Li J., Thompson A. et al. Replicated association between an IL28B gene variant and a sustained response to pegylated interferon and ribavirin // Gastroenterology. - 2010. - Vol. 138. - P. 2307-2314.
  11. Rallón N.I., Naggie S., Benito J.M. et al. Association of a single nucleotide polymorphism near the interleukin-28B gene with response to hepatitis C therapy in HIV/hepatitis C virus-coinfected patients // AIDS. - 2010. - Vol. 24, N 8. - P. 23-29.
  12. Rallon N.I., Soriano V., Naggie S. et al. IL28B gene polymorphisms and viral kinetics in HIV/hepatitis C virus-coinfected patients treated with pegylated interferon and ribavirin // AIDS. - 2011. - Vol. 25. - P. 1025-1033.
  13. Rauch A., Kutalik Z., Descombes P. et al. Genetic variation in IL28B is associated with chronic hepatitis C and treatment failure: a genome-wide association study // Gastroenterology. - 2010. - Vol. 138, N 4. - P. 1338-1345.
  14. Rodriguez-Torres M., Jeffers L.J., Sheikh M.Y. et al. Peginterferon alfa-2a and ribavirin in Latino and non-Latino whites with hepatitis C // N. Engl. J. Med. - 2009. - Vol. 360. - P. 257-267.
  15. Zobair M.Y., Birerdinc A., Estep M. et al. The impact of IL28B genotype on the gene expression profile of patients with chronic hepatitis C treated with pegylated interferon alpha and ribavirin // J. Translat. Med. - 2012. - Vol. 10. - P. 25.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

© 2013 Fazylov V.K., Manapova E.R., Tkacheva S.V., Yakupova F.M., Beshimov A.T.

Creative Commons License

This work is licensed
under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.




Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».