USE OF MOLECULAR GENETIC METHODS IN THE STUDY OF HEREDITARY PREDISPOSITION TO ATOPIC DISEASES INCHILDREN


Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Background. Study of the аssociations of susceptibility genes to the development of atopic diseases in children.
Materials and methods. All 325 examined children reside on the territory of the European part of Russia who
by according to surveys, Russian by nationality. Analysis of polymorphism in genes of receptors ADRB2, GRL,
ALOX5, genes of biotransformation - CYP1A1, CYP2C9, CYP2C19, GSTT1, GSTM1, NAT2 as well as the variants of
the genes MTHFR and TNFA was performed in patients suffering from atopic disease and in healthy individuals.
Using Multifactor Dimentionality Reduction method (MDR) it was defined the most significant model of genegene
interaction for the development of atopic disease
Results. Association of the development of atopic diseases with polymorphic variants of the genes: ALOX5 (VNTR)
GRL (1220A > G) TNFA (-308G > A) CYP1A1 (6235T > C) and GSTM1 was identified in surveyed children. The highrisk
alleles and genotypes of developing atopic diseases in pediatric patients were determined. Using Multifactor
Dimentionality Reduction method (MDR) it was defined the most significant model of gene-gene interaction for
the development of atopic disease, including ADRB2 (79 C >G), (46A > G), CYP2C19 (G681A) was defined.
Conclusion. There were identified polymorphic variants of genes and important gene-gene interactions associated
with development of atopic diseases in children.

About the authors

E S Tyumentseva

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

Email: e_s_t@mail.ru
Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

N V Petrova

Учреждение Российской академии медицинских наук Медико-генетический научный центрРАМН

Учреждение Российской академии медицинских наук Медико-генетический научный центрРАМН

I I Balabolkin

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

V G Pinelis

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

Учреждение Российской академии медицинских наук Научный центр здоровья детей РАМН

E S Tumentseva

Children Health Research Centre

Children Health Research Centre

N V Petrova

Research Centre for Medical Genetics, Russian Academy of Medical Sciences

Research Centre for Medical Genetics, Russian Academy of Medical Sciences

I I Balabolkin

Children Health Research Centre

Children Health Research Centre

V G Pinelis

Children Health Research Centre

Children Health Research Centre

References

  1. Risch N.J. Searching genetic determinants in the new millennium. Nature. 2000, v. 405, p. 847-856.
  2. Hirschhorn J.N., Lohmueller K., Byrne E., Hirschhorn К. A comprehensive review of genetic association studies. Genet. Med. 2002, v. 4, No. 2, p. 45-61.
  3. Lohmueller K.E., Pearce C.L., Pike M. et al. Meta-analysis of genetic association studies supports a contribution of common variants to susceptibility to common disease. Nature Genet. 2003, v. 33, p. 177-182.
  4. Баранов В.С., Баранова Е.С., Иващенко Т.Э., Асеев М.В. Геном человека и гены «предрасположенности»: введение в предиктивную медицину. СПб., «Интермедика». 2000, 263 с.
  5. Полоников А.В. Полиморфизм генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков и их комплексное влияние на предрасположенность к мультифакториальным заболеваниям. Автореферат диссертации д-ра мед. наук. М., 2006, 48 с.
  6. Cooper R.S. Gene-environment interactions and the etiology of common complex disease. Ann. Intern. Med. 2003, v. 139. p. 437-440.
  7. Глотов А.С., Наседкина Т.В., Иващенко Т.Э. и cоавт. Создание биочипа для анализа полиморфизма в генах системы биотрансформации. Мол. биол. 2005, т. 39, № 3, с. 403-412.
  8. Баранов В.С. Генетический паспорт - основа индивидуальной и предиктивной медицины. СПб., «Издательство Н-Л». 2009, 528 с.
  9. Богорад А.Е.. Фармакогенетика бронхиальной астмы. Рос. Аллергол. жур. 2005, № 4, с. 9-16.
  10. Брянцева О.Н., Тихомиров Е.Е., журкова Н.В. и соавт. Полиморфизм гена β2-адренергического рецептора и эффективность бронхолитической терапии у детей с бронхиальной астмой. Педиатрическая фармакология. 2007, № 3, с. 35-39.
  11. Anderson W., Kalberg С., Edwards L. et al. Effects of polymorphisms in the promoter region of 5-lipoxygenase and LTC4 synthase on the clinical response to zafirlukast and fluticasone. Eur. Resp. J. 2000, v. 16 (Suppl B), р. 183S.
  12. Mathew C.C. The isolation of high molecular weight eucariotic DNA. Methods in Molecular biology. Ed. Walker J.M. N.Y.: Human press. 1984, v. 2, p. 31-34.
  13. Gra O., Mityaeva O., Berdichevets I. et al. Microarray-Based Detection of CYP1A1, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, GSTT1, GSTM1, MTHFR, MTRR, NQO1, NAT2, HLA-DQA1, and AB0 Allele Frequencies in Native Russians. Gen.Test. Mol. Biom. 2010, v. 14, No. 3, p. 329-342.
  14. Herb F., Thye T., Niemann S. et al. ALOX5 variants associated with susceptibility to human pulmonary tuberculosis. Hum. Mol. Genet. 2008, v. 17, No. 7, p. 1052-1060.
  15. Федорова Ю.Ю., Карунас А.С., Нургалиева А.Х. и cоавт. Роль полиморфных вариантов генов системы биотрансформации в развитии аллергических заболеваний у татар. Мед. ген. 2010, № 6, с. 28-35.
  16. Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б., Рудко А.А. и соавт. Полиморфизм генов CYP2E1, CYP2C19, GSTT1, GSTM1, GSTP1 в развитие атопической бронхиальной астмы и туберкулеза. Гены народонаселения и патология: сборник научных трудов. Вып. 8. Томск, 2007, с. 55-57.
  17. Макарова О.Г., Сафронова В.А., Вавилин и соавт. Показатели атопии у детей с бронхиальной астмой возрастают с накоплением нуль-аллелей глутатион-S-трансферазы М1. Бюл. эксп. биол. 2004, т. 138, с. 520-522.
  18. Brasch-Andersen Ch., Christiansen L., Tan Q. et al. Possible gene dosage of glutathione-S-transferases on atopic asthma. Using real-time PCR for quantification of GSTM1 and GSTT1 gene copy numbers. Hum. Mutat. 2004, v. 24, No. 3, p. 208-214.
  19. Lam S., Chan H., Le Riche J.С. et al. Release of leukotrienes in patients with bronchial asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 1988, v. 81, p. 711-717.
  20. Anderson W., Kalberg С., Edwards L. et al. Effects of polymorphisms in the promoter region of 5-lipoxygenase and LTC4 synthase on the clinical response to zafirlukast and fluticasone. Eur. Resp. J. 2000, v. 16 (Suppl B), p. 183S.
  21. Останкова Ю.В., Иващенко Т.Э., Келембет Н.А. и cоавт. Ассоциация полиморфизма промоторной части гена TNFα с развитием атопической бронхиальной астмы. Экологичекая генетика. 2005, т. 3, с. 3-11.
  22. Shin Y.D., Park B.L., Kim L.H. et al. Association of tumor necrosis factor polymorphisms with asthma and serum total IgE. Hum. Mol. Genet. 2004, v. 13, No. 4, p. 397-403.
  23. Hahn L.W., Ritchie M.D., Moore J.H. Multifactor dimentionality reduction software for gene-gene and gene-environment interactions. Bioinformatics. 2003, v. 19, No. 3, p. 376-382.
  24. Ritchie M.D., Hahn L.W. Roodi N. et al. Multifactor-dimentionality reduction reveals high-order interactions among estrogen-metabolism genes in sporadic breast cancer. A. J. Hum. Genet. 2001, v. 69, p. 138-147.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2011 Pharmarus Print Media

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».